Os10g0174800
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Structured Information
| Gene Name |
Os10g0174800 |
|---|---|
| Description |
EGF-like calcium-binding domain containing protein |
| Version |
NM_001070775.1 GI:115481293 GeneID:4348193 |
| Length |
5704 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0174800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:4879537..4885240 |
| Sequence Coding Region |
4879537..4880540,4883690..4883875,4884241..4884496,4884566..4885240 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:4879537..4885240 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:4879537..4885240 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgttgatgatcctgccctgtagattgctgctgcgtctagtcctcgcaacccttctgattttggctgctagtacagatcaacatgtagccacgctgccgccgataacacttccaggctgcatcgacaagtgcggcaacatcagcatacccttcccgttcggcacgaagcagagcagttgcttccttccaggcttcgaggtcacctgcaacgacacattcagtccacctcgcctcttcctcggaaattctaatcctggagacaggcaaaactatcaggaatttgaagagcgctactacttgacgacggaggaaggcatgccgacacatctcatgactgatgattttttgttcatggagctgatgagcataaacctcacagagggcgtagcacgggcatatggccctgtgagctcggattgcagcctcaacgacacatatcatttggtgaagaggcagatgacgggcttggccgggccattcctcatctccacgcgcaatgctctcacagccgtcggctggaacatggaagcaaacctcgcgagatcggtgcgtggatccggcttcctcaagacctgtggtgtgcggctcgggcaacctgaatttgcaacgaatgggtcatgcctgggaggaggctgctgccagggtgaaatcactcaaggcattggctctatcgcgaaggactggtacaacttcacttcgccggacctctattccgacaacttctccaagaaatatccaaagggtgtcccgctagtgattgacttcgccatcagggatggtttttgcccagcggcaggccaggcgccgccggcgaactatgcttgtgtcagcagcaacagctcatgcgtcaacgtgaccaacggtgatggttacatctgcaactgtagtaagggatatgatgggaatccttacatacctaacggatgtcatgatattgatgaatgtgccctccgagatagccatcctgagctccgagtcctgtatccttgttcaagaaatggaatctgcatgaacagaccaggcggatatgattgtccatgcaaacgtggaatgagcggtgatggcaaagcaggaacttgctcagagaaatttcctttacaggctaagattgttgtaggtgcaataggtggtctctttattgtcgcagtccttgtgttccttgcacttgttcacagagagaaaaggaagatgagagaattttttgaaaagaatggtggtcctatattagaaaaagtcaacaacataaagatattcaagaaagaagaactcaaaccaattctgaaagctagcaatattattggaaaaggtggattcggagaggtttacaaaggccgtcttgctgataacaaactggtggccgtaaagaagtccatcaaagtcaatgctgcacaaaaggatcaatttgcaaacgagatcatcatccaatcccgagtcatccataagaacattgtcaagctgataggttgttgcgtagaagttgatatcccaattttagtatatgaatttatcactaatggcagtctcgatgacattcttcacggtagtaacggagaacctctcagtttggatttacgtttggatattgctgccgaatcagccgaaggtctggcatatatgcattcgaaaaccaccaatacaatcctgcatggtaatgttaaaccagctaacatacttttggatgacaactttgttccaaagatatctgattttgggatttcgaggctaattgccgtagataaaaatcaacacacagataaagtcattggtgacatgagttatatggatccagtttacctacaaacaggactattaacgaagaaaagtgatgtctacagttatggggttgttctcttggagctcatcagcaggaagaaggccacatattctgacaacaatagcttagttcggaattttctagatgctcacaaagagaaaaggaaagcaactgagctgtttgataaggatatcacgctggcagaagacttggacgttcttgatggtctcgtgaggattgctgtggaatgtttaaaccttgacgtggatcaacgaccagaaatgacaaaagtaacagacgatcttttcatcttgatgaaatctcgagctaaagagaccaagcagtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLMILPCRLLLRLVLATLLILAASTDQHVATLPPITLPGCIDKC GNISIPFPFGTKQSSCFLPGFEVTCNDTFSPPRLFLGNSNPGDRQNYQEFEERYYLTT EEGMPTHLMTDDFLFMELMSINLTEGVARAYGPVSSDCSLNDTYHLVKRQMTGLAGPF LISTRNALTAVGWNMEANLARSVRGSGFLKTCGVRLGQPEFATNGSCLGGGCCQGEIT QGIGSIAKDWYNFTSPDLYSDNFSKKYPKGVPLVIDFAIRDGFCPAAGQAPPANYACV SSNSSCVNVTNGDGYICNCSKGYDGNPYIPNGCHDIDECALRDSHPELRVLYPCSRNG ICMNRPGGYDCPCKRGMSGDGKAGTCSEKFPLQAKIVVGAIGGLFIVAVLVFLALVHR EKRKMREFFEKNGGPILEKVNNIKIFKKEELKPILKASNIIGKGGFGEVYKGRLADNK LVAVKKSIKVNAAQKDQFANEIIIQSRVIHKNIVKLIGCCVEVDIPILVYEFITNGSL DDILHGSNGEPLSLDLRLDIAAESAEGLAYMHSKTTNTILHGNVKPANILLDDNFVPK ISDFGISRLIAVDKNQHTDKVIGDMSYMDPVYLQTGLLTKKSDVYSYGVVLLELISRK KATYSDNNSLVRNFLDAHKEKRKATELFDKDITLAEDLDVLDGLVRIAVECLNLDVDQ RPEMTKVTDDLFILMKSRAKETKQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4701..5704#1366..1551#745..1000#1..675#atgttgatgatcctgccctgtagattgctgctgcgtctagtcctcgcaacccttctgattttggctgctagtacagatcaacatgtagccacgctgccgccgataacacttccaggctgcatcgacaagtgcggcaacatcagcatacccttcccgttcggcacgaagcagagcagttgcttccttccaggcttcgaggtcacctgcaacgacacattcagtccacctcgcctcttcctcggaaattctaatcctggagacaggcaaaactatcaggaatttgaagagcgctactacttgacgacggaggaaggcatgccgacacatctcatgactgatgattttttgttcatggagctgatgagcataaacctcacagagggcgtagcacgggcatatggccctgtgagctcggattgcagcctcaacgacacatatcatttggtgaagaggcagatgacgggcttggccgggccattcctcatctccacgcgcaatgctctcacagccgtcggctggaacatggaagcaaacctcgcgagatcggtgcgtggatccggcttcctcaagacctgtggtgtgcggctcgggcaacctgaatttgcaacgaatgggtcatgcctgggaggaggctgctgccagggtgaaatcactcaaggcattggctctatcgcggtgtccttcctacggcagaacaactctttgtgagggattactccctgttcctacggcatggtggtggagaaggactggtacaacttcacttcgccggacctctattccgacaacttctccaagaaatatccaaagggtgtcccgctagtgattgacttcgccatcagggatggtttttgcccagcggcaggccaggcgccgccggcgaactatgcttgtgtcagcagcaacagctcatgcgtcaacgtgaccaacggtgatggttacatctgcaactgtagtaagggatatgatgggaatccttacatacctaacggatgtcatggtgcgttctcctcctctctgtaactctacatccatatattatcgttcttgatgacattgatgtgatatactcactccgtattttaatgtacgacgccgttgactttttgacaaacgtttgacctttcgttttattcaaaaattttatgtaattataatttattttattgtgacttgatttatcatcaaatgctctttaagcatgacataagtatttttatatttgcataaaatttttgaataagatgaatggtcaaacgttggttaaaaagttaacggcgtcatacattaaaatatggagggagtataacaatattacaccatgagtacacggatatgtgaaaattaattgctgtttgcgcacagatattgatgaatgtgccctccgagatagccatcctgagctccgagtcctgtatccttgttcaagaaatggaatctgcatgaacagaccaggcggatatgattgtccatgcaaacgtggaatgagcggtgatggcaaagcaggaacttgctcagagaaatttcctttacaggctaagattgttgtaggtacgtgacattatattcgcggtgatatttttctgccatcatgaaggaactcataatgcatggatacaaatcccttcatcaacaacttcgtttcgaaaagaaccgttctacatatatactattgctttacagtcaagaaaacacttcgtttcgaaatacatctaatgatcctagaaaataaccattctactatgatctaagcatttataatgattatacaagaatgcaatatgtagctttgtaatagctctacttggctgagttagacaaactaagttgggaactcatctctcacgtacgcaaaacgaagcgactcattagtgcatgattaattaaatattagctattttttaaaatggattaatatgatttttaaaataacttttctatataatttttttaaaaaatacgcaccgtttaaccgtttaggagacgtacgagtgaaagacaagtgggatgaagttgagaacactgagtagagaacgcaacccgtaattgataggctcacaaatttttgggagcatatggtgtggtacaagggcacttgtcccgggtggactttattcttgtagaacccttttacagtactccaacatacctctagggatgtaacaggctacaattgttactagtatatttttcctaagaaaaatataattgctcctttcatttaatatatcacagaaaaaattaaaaagaccaacgctcattaattgcccttccataactcaattatgcaagcttgtagaagttaggaactatagatatgtattgaaatgaagatgagcacgtcaatttattcttaaaatatgtatatgtgaaatcatacatgaatataatttaaatactgtacatcacaatttttttactatacatttaaattagaaatcgcataatacttttctaagtgtctatatattttagtgttctcaaatcagattagaaaagacttgcctttatggtccagtcttgattttaaatatgattgagatttgattcaaacaaattatattcagggtgctaaacataattggcatatttgtatttcaaatttgtaaacagaaatatgtgatatagttttacaaattacaccacgtgtcctatgaacagtgttaattttaatggcacattaagggatatatttcattccttattctgaggtattacctccaaccagataagggcatgtaaaaagctagagttcgatttaggctcttagttaatacatatcacttagagcaagtcatatcagctcctatatgttgctcataaaatttgccacataggattagataatgacgtagaggaaagaagttaggagagaaaataagccattcctcatgcaagggataacttccacataattttcaagcaaagtgcacgatggtgttagggtttgtgtattagatgtgatacgttgtacttgttacctcttaattaatgagtagatgatatgatttaaattagaggtgacatcaacctccactgtaaaacttgcttttagagactttttctataataattaagacaacaaaacatcttacccattaatgcacgaaagtaagtttttattaccctagtttccttttctttaaccccatgcaataaaattttatctaataaatgctaagagtcgactaaaaccgttgtaatgcgtagcaactatgtttccctttccttcccctctctcttccacatcggaaaaagagcccgttattagataccgttatacttttttttaagataataataccgttgtgcatgccctaatagatcacacgtaccattgcttcctagtataatgaacggcgaaaaaaaaactgagctccttaaaaacttcattttattaagataaccataagggtgaattatatttttatataaactcagtcaaacgtttgatttacggccagacgtgcttatatggtcttcaaagaaaaaactgtgtactcggctgtactcgccagcatataccagaggatcccctcgacgaggctgctgcccaggttcccgtcgttgtggatagaactgcagcctgattcccacactgagcagatcagtcctctgtctagcataagattgatatggactgggagttcgtaatccagacgcccacaaagctctattacttttccttccctcttgtctcatccctgagttggtgaatttaatcaatggcagcacggtttagtaattcggtccgttgtgtcaggtttgatgtaggctacatataaaaacaaaacaaaaaaaaaaacagatcagcttacaaggatttgcttttgggaactgttctcttttagatcgatcttggaccatcattggcaagaatggattcagggactaattttagtccctatcacatcagatgtttggatactaatttagagtattaaacatatattaacaataaaactaattgtataaatgagagctaattcgcgagataactttttaagcttaattaattcataattaacacaagtttactgtagcatcacataggctaatcatggattaattaggctcaatagatttgtcccgcgaattagtccagggttatggaatttgttttatcattagtctacgtttaatacttttaattagtatcaaaaatccgatgtgacagagactaaaaattagtccctggatccaaacataccctcagttgttgactagaggtttttagtttgcgacggtggcgagcaggacaagttcccagtatgctttggtgtggcctccggacttgtaggaacggagattaactccctcaaggatgatgtttatactattaagtacctcttcttcaaaagttgtgctgtttttttctttgaagagcataaaagcacatctcgtatttgtagtacccttggtaaatgtaacgagcattttcaaggtgattctatatgatattttaaaattttaatgtattaaagatttatccatgtaccacatttagtatttacaagttaattagtcattgacatccaagcaatttaaaattttgttattcatttactctaaacagtatagaaacaataaaaatatcattgtaaaactcaatccgtcagtttaatatttatagcttcatgatacattattgtggttcgtttcaatgatattgagtactctattatatattccacatgcaggtgcaataggtggtctctttattgtcgcagtccttgtgttccttgcacttgttcacagagagaaaaggaagatgagagaattttttgaaaagaatggtggtcctatattagaaaaagtcaacaacataaagatattcaagaaagaagaactcaaaccaattctgaaagctagcaatattattggaaaaggtggattcggagaggtttacaaaggccgtcttgctgataacaaactggtggccgtaaa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|
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