Os10g0382300

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os10g0382300

Description

Similar to Signal peptide containing large protein with proline stretches

Version

NM_001071023.1 GI:115481789 GeneID:4348507

Length

9145 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os10g0382300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:12683508..12692652

Sequence Coding Region

12683508..12683906,12683983..12684084,12687003..12687083,12687503..12687612,12687707..12687840
,12687910..12688010,12689682..12689787,12689922..12690238,12690327..12690509
,12690637..12690834,12691690..12692007,12692382..12692474

Expression

GEO Profiles:Os10g0382300

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>attcatcatcccccacctgtttccccccacgccaccgcgatggacacgccgcctccacctcctccgccgccgccgccgacgccgacgcagtcgtcgccgccggtgaactgggacgcgctcgacgccctcgtgctcgacttcgccagatccgaccgcctcctcctcccgccggcctccccgtcgccgccctcctccccgtcctcgtcctccaccaccaccgccacctcctcctcctcctcggcgccctcgccgtcctcctcctaccgctcgcgcctcctcatccgccgcgcccgcaccgcgctcgaggagggggacgtcgacgccgcgctcgcgctcctccgggcccacgcccccgccgcgctcctcgaccaccgcctcctcttccacctccacaagcagagattcgtggagcttgtgaggaggggcacggaggcggacagggaggcggcgctggactgcctccgcacggcactggcgccctgtgcgctggatgcctacccggaagcttatgaggagttcaagcatatactgctagtattgatatatgacaaagatgatcaatcatcccctgtagcaaatgagtggtctataaagaagcgatttgagcttgctggattgctatcatccatattgagaactcatttacaagcttatgatcctattctatcaatgacattacggtacttgataagcatccacaaactactttgctcgcgccaaggaatttcttcgcctatatctaatctgactgaaaggctgctgtttgatgaccgtgatccacctgcagttcctcaggaatgctcgctagaagcgccaccatttgatgaggtagatgtgcaagccctagcacatgctgtggagttgacaagacaaggggctgttgacagtttgaagtttgcgaaaggagatttatttcaagcgtttcagaatgaattgtgccgaatgaagctggatctgccacttctggataaacttatacacgagtactgtatatacaggggaatagttgaaggtggttcccatgtccttcctggattgcaaagcaataaccaaagtaatgatgtcaatttcgtagataaacaggaagacagtactgaaacacggattgattttgaaatgactaacaatcagaatggaaattgtagcaccagtgatacttcccatcatgattcctggtccaggagattacgtagggttagaagtagtgcatcggggcaacgaaggcggaagagatggagaggacgggtagatgatctggattatggttgtgagaccccattggatgcaaataaacatgctattttatgttctgctcttgacatggatgaagatgatatgatagttaaaccagacttgatggcagatactggtttgcctgattctagatgtaatcaagatcagaaatatgaagttattttagagatgagggatctcacacgcaaaggaatggcttcaaaagttgttgaagagataaacaacatggatcctgatttcttcttgaaaaaccctattcttctatttcagctgaaacaggttgaatttcttaagctagtagcttctggtgatcacggagctgctctcaaggttgcatccactcatctggggcctcttgctgccagtaaccaagctttactgaaacctttgaaggaaactttagtaacactaattcaaccctgtgaagatgtactcacaaagtcagtttcattacccgttcttgcaagttctctccagattgcaatgagcaggaggcttggtattgaagaacctcagttaatgaagataattagaacaacacttcacacgcacagcgaatggtttaagcttcagatgtgcaaggaccgttttgagcactttttgaagattgattctctaaaagaggttgatccatctgcggggagtcacaatatgtccaaggttcttacagatgaatgtgctaatggatcttctcaaatcacaacatgctctagtggcaaggtgctagatgaaggtagtagccctcaggagtcatcagaagttacctgtgatgaaaacgccatactcaaggtcatggaatttcttgctttgccaagggctgacgcgatccaactgcttatgcaatatggtgggaatgccgaggaagtcatccaacagatcttttcgtag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>IHHPPPVSPHATAMDTPPPPPPPPPPTPTQSSPPVNWDALDALV LDFARSDRLLLPPASPSPPSSPSSSSTTTATSSSSSAPSPSSSYRSRLLIRRARTALE EGDVDAALALLRAHAPAALLDHRLLFHLHKQRFVELVRRGTEADREAALDCLRTALAP CALDAYPEAYEEFKHILLVLIYDKDDQSSPVANEWSIKKRFELAGLLSSILRTHLQAY DPILSMTLRYLISIHKLLCSRQGISSPISNLTERLLFDDRDPPAVPQECSLEAPPFDE VDVQALAHAVELTRQGAVDSLKFAKGDLFQAFQNELCRMKLDLPLLDKLIHEYCIYRG IVEGGSHVLPGLQSNNQSNDVNFVDKQEDSTETRIDFEMTNNQNGNCSTSDTSHHDSW SRRLRRVRSSASGQRRRKRWRGRVDDLDYGCETPLDANKHAILCSALDMDEDDMIVKP DLMADTGLPDSRCNQDQKYEVILEMRDLTRKGMASKVVEEINNMDPDFFLKNPILLFQ LKQVEFLKLVASGDHGAALKVASTHLGPLAASNQALLKPLKETLVTLIQPCEDVLTKS VSLPVLASSLQIAMSRRLGIEEPQLMKIIRTTLHTHSEWFKLQMCKDRFEHFLKIDSL KEVDPSAGSHNMSKVLTDECANGSSQITTCSSGKVLDEGSSPQESSEVTCDENAILKV MEFLALPRADAIQLLMQYGGNAEEVIQQIFS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..399#476..577#3496..3576#3996..4105#4200..4333#4403..4503#6175..6280#6415..6731#6820..7002#7130..7327#8183..8500#8875..8967#attcatcatcccccacctgtttccccccacgccaccgcgatggacacgccgcctccacctcctccgccgccgccgccgacgccgacgcagtcgtcgccgccggtgaactgggacgcgctcgacgccctcgtgctcgacttcgccagatccgaccgcctcctcctcccgccggcctccccgtcgccgccctcctccccgtcctcgtcctccaccaccaccgccacctcctcctcctcctcggcgccctcgccgtcctcctcctaccgctcgcgcctcctcatccgccgcgcccgcaccgcgctcgaggagggggacgtcgacgccgcgctcgcgctcctccgggcccacgcccccgccgcgctcctcgaccaccgcctcctcttccacctccacaagcaggtacccgtgcctctcctccggttcctcctgtgcccatccctgcgcgcgctcgtctaaattttgttcctcgctgcagagattcgtggagcttgtgaggaggggcacggaggcggacagggaggcggcgctggactgcctccgcacggcactggcgccctgtgcgctggatgcctacccggtgagtgatgcttcgcctccatattctcctcctctcacttgaaactgctgtaattgcttccattttggggacgtttagggagccaaattatgtaggtgatcgtgaatttggtgctgggataccctcacccagtggtttgcggcatgccatccatttgtgtggccctagtgttcattcactggtttttgatttggtcgggcttggattgagttaactagtcaccatatgtaagttgttggatcatatgagtagtgcatgaaggttgcgattgggcttgcagctatttgttaaccagcaaacatttgttaatagtctgcttaacacaattttgtggcggtcaaacataaggtgaatgactgaatgtgtgttcccaagtaggattctaactttggccagtagcacatgacatggaggtgtatatacctgagttactgtttgcgatactatcataaagttagctctatcaccaatcatgcttgccaggtagttttgctagtgtaagaaccaaacaactagcaaaaacttgttgtcaaagtgaaataaccaaatggttggacaaggcaaggaaagcatagcttccacgggctagttttcttctcagctccctgttgctcctcatggccaagtaccaagcatatccttagtgttttgtttgagtacagttgccttagtgagtttaccaaatggttgggcagtttctatgcctttctcatgctaacagcagtaggagccggtatcatatgtctcaatttatgccatatgcaatccattgtgtattcaaacaaagcgttggtgttgactatcataaaataatccaataaaggtattaacataatcactatagcacaccactcaaccagtagttactgctttactggtatttgttgttgggccctgtgttctcctaggccttagttaggtgcttgcctgcctcctaggtcctgatgtatgcctaggctggaaaagtcatataggcaccactgaaggttaaccttaaccaaaagagttataggagaatatactgctaccaatctaccatgtttgtgactgaatcttctttcatgtcaaaaaactgtaccgctaccatgttttgtaccacaatcatacagaaaggtggtatcatgtggaacctacctgctgaaatactcacttgaccctctttcattgtaaacagctatacatttttgttaccgtaaattaatgtattggaattatattagaaggcaggaagagctctcttcacttaccttaagtttagttatacttctttttgcttacaagaagcacaaaggccatgctaattgctaaatgaggatgtgaatactattcaatggactcatcgttatggacttacggctctgtaccatgtcatggtcctacttgatgtggttctaaaattcattatcataacatcttgtttcttgcctattccagcctggtggcgggagtttttaaatatattataagggtctacattaaacataaatactgcttctgttgtgttttagaaggcgcattttattttcaaaaattgtgcagattaaaccttggccattgatttctttatacctatggaaccaatatgagaacactttgaaattttagtacactacatgtacttctaatttgactaatttttggtcaaaatatgcaaagttgacattgtgaaatcaaaatgcacccctttaaattcaacagagggagtaccaaaaataccaggtttggccaaaagaagtacatttggattctggcccctatcctgcatgaagctatggtcatcatgtacgaggcagggtagttatctttttattgaggacccagtatattgagatatacagattggatttttcattcactggcttttaacgtactaaaatggatggcctcctgctaaacttttcaatttgcctgtattcagtcacctatcaatgtaatgcattttatgcttcaaatatgctgtctacctacataataagtgcataagcattcgagcttcgcaagatataatgcagtggccaaggttggcaatatagcctactgaatggcatacttcaaggtctgtccaagagctttgttgcatatttcggaggggtgttttcttgagaggaaaaggcctggttttttaaaacaaaacgggaagccctaagttttatatgttgataacaaaactttatcgctctctgtagcattatctttcatgttacatctttcctagcggagagatattatgcacttaccacatacttatcttagaaataatgtaagtgtcacctttatcattctatagcatttctttcctgttgcatgtttactttctagcgggtgatattatgcactaaccttgcacttatcttaaaaataatatagcatcaatctggtgcacttcttgcatgttagaatgggttggtgtccattatagacaaacacatattgttgacgctaactaacggtattaacctgtaatgttagtacaaaaggatatgcattcatgtgatgatgtgaacaattcacagctatggaaactcagataggtttcagactattttgtgacatttgaatgtgcacatgtatactaatttttgttcaagatcatagtacaccctcatgccagaaatatttgatgtttaggacaaatttggtcaaacttttggaactctgaccatcagtaattcctcaaatgcttagttttaagaaaatggtatgcatagatttgcctctaaaagtactataataatatcataaacttattatattttataaaattattctaatataaaattgatgttcaaaatttaacagtttgactgaatcttgtcctaaacgtcaaatacttatgacttgaaggagtagtcttgttttgtttgtttggatctttcataatgaatattggaaatttgacatgttggtatgctctgaaggaagcttatgaggagttcaagcatatactgctagtattgatatatgacaaagatgatcaatcatcccctgtagcaaatgaggtatgcatgatcatctgtccatgttatgtgttgcaggctttttaacagaagaatgtgaactttttaacttgttcttagcattttcatttgagcatattaacttctttacatggcaacttcatgtacttttgacattaatagattcaagaggaaaaaaagcttgtaattattattatctctctttttcagagttgtatctttcattgattggatgctttaccattttaccaactattcttttatcgagtataccatgtccactgcttctctcaactatgtttaaaattacagagtttgttgatttacatccttgaacactttttagtgtattataggaaagctgttcttatttcagatacaacacttttttatcgaaagatacaacatatttcatctggttaaaatgttctgctctgcagtggtctataaagaagcgatttgagcttgctggattgctatcatccatattgagaactcatttacaagcttatgatcctattctatcaatgacattacggtacttgataaggtagcttgcgcactacaccattttgacatttaacagtagtttcttaggctactttctctgcaatattctgacaatcatacaatattttgaaaagcatccacaaactactttgctcgcgccaaggaatttcttcgcctatatctaatctgactgaaaggctgctgtttgatgaccgtgatccacctgcagttcctcaggaatgctcgctagaagcgccaccatttgatgaggcaagcacttcttataatgatttaccaatattatgctccatgtacaaacttttaatatttgaatgtcaggtagatgtgcaagccctagcacatgctgtggagttgacaagacaaggggctgttgacagtttgaagtttgcgaaaggagatttatttcaagcgtttcaggttgtattgcaaatttaaaatttaagtatggagttcagctatgatatggaattgccctttttctagttttaaagtaatgtaaatacactattaatattattattgtcaatgggtactgtattactgttaagagataaatatttattcagtccacctgaccacctatgattttagacaatagacaattgcccttgctgtgccaggaatccatttcagagtttactttttagtatgagcagcaagcagttcccaacgtgtcgtaagcgaagtttcaagttgctgacaatgcccaccagtcaatagcttcatccctgtcccaagaagagaaaaatctggatgcctgcctgatgatggtac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External Link(s)

NCBI Gene:Os10g0382300, RefSeq:Os10g0382300