Os10g0565300

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os10g0565300

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001071951.1 GI:115483497 GeneID:4349418

Length

6942 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os10g0565300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:22788251..22795192

Sequence Coding Region

22788611..22788952,22789317..22789425,22789543..22789595,22789704..22789904,22790013..22790288
,22790368..22790526,22791345..22791704,22791783..22792004,22792822..22792948
,22793742..22793878,22793970..22794147,22794520..22794686

Expression

GEO Profiles:Os10g0565300

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgcaaaatgatacagatacaggtgctggactattggaacttattgttgaacttggagttgttggagtctctttgattgatcataaaccgagagagcttttgtacttacatctgcagaagctttttatttcatacatgactggttacaattctggtaccactagcaggtttaagttaattattggccatatgcaactagataatcagttgccattgtctataatgcctgttgctttggcaactgagagcatgcctgactcaaaccatcctgtatttaaagcaaacatcgccgtaagcaatgtaacttcaaatggtattcaagtctatccacatgtctatatccgggtaactgatcaaacatggaggttgaatattcatgaacctattatttgggcattggttgatttctacagcaatcttcgttttgtcagcaccaacaacatctcaactgtaacagaagtggatcctgagatacgaatagagcttgttgatatatcggagataaggttgaaaatatctctggaaactgcgcctactcaaagaccacgtggtgtccttggcatatggagccctgtcctatcagctgtaggcaatgcacttaagattcaggtgcatctgcgtaaggtcatgcacagaagtcgttacatgcggaagagttccatcattcccgcaatcacgaaccgaatcaagagagatctgatccacaatcctctgcacctaatattttcagtagattttcttggagtgacaaaatcaactttgtcatcacttagtaaagggtttgcagagctctctactgatgggcaatttcttcagctgagatcaaagcaggtttggtcaaggagaataactggtgttggtgatggactagttcaagggactgaagcatttgctcagggtttggcttttggggtttctggtgttctaagaaagccagtcgagagtgcccgacagtatggtgcaattggcattgcacatggtcttggccgtgcttttgtggggtttattgtccaacccttaagtggggcctttgatttcttctcattgacagttgatggaattagtgccagctttatgagatgcgtggatattctgaataataaacatgtccctcagaggattagagatcctcgtgctatacaccgagatggtataataagagagtacgacaaagtacaagctgcgggccagatggccctttacctagcagaggctagcagatattttgcatgcacagatttatttcgggaaccttcaaagtatgcatggtcagattactatgaagatcattttatcgtacaaaatcagaaggttgctttggtaacaaacaaacgagtgatactgcttcagtgcgtggatctagataaaatggataagaagccttcgaaaatactttgggacgttccttgggaagatgtgcttgcattggagctggcaaaagctgggtatcaaaggccttctcacgtaatcatacatctgaagaattttaggagatctgaaaactttgtaaggcttataaagtgcaacgttgatgaggagcatgaacctcaggctcttctactttgttcttcaattcgaaagatgtggagatctcaccaggcagatatgaaagttgtacccttgaaggttcctgggggccagcacgatgtatatttcgcatttgatgaagatatgagggagttccacagttttgctaggcctttgctaagcccaaggggagcagcaagtaatgttgaggagcgactcattaacgatacagttaacttccagaacatgtggagcagtgaacaagaaattcgaagcagatgcaaactactttcaaagcaggttgcagatgatggaagggtgtttagtatctggaggcctctctgccctagtgggtatgtctcaatcggagatattgctcatgttggcattcatccaccacatgttgctgctgtctacaaaaatgtgggtggaaatttcgctctgccacttggctatgacctggtttggagaaactgtggtgaggattacaggaatcctgtatcaatatggtttccacggccacctgaaggatacgtagctctcggatgcgtggctgtatctgcttttgaggagccccctctcgactctgccttctgtgttagtgagagatttgcggaagatgcagtatacgaggagcaaattgtatgggcttcgtcagatgcctacccatggggatgctatgtttaccaagttcagagcaagtcactgcaattcatggcgatgcggcggccaaaagaagagtgtgagctaaaacctaagaaggtatcagagtcttatgcccagcaagcattggagaggtcctga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MQNDTDTGAGLLELIVELGVVGVSLIDHKPRELLYLHLQKLFIS YMTGYNSGTTSRFKLIIGHMQLDNQLPLSIMPVALATESMPDSNHPVFKANIAVSNVT SNGIQVYPHVYIRVTDQTWRLNIHEPIIWALVDFYSNLRFVSTNNISTVTEVDPEIRI ELVDISEIRLKISLETAPTQRPRGVLGIWSPVLSAVGNALKIQVHLRKVMHRSRYMRK SSIIPAITNRIKRDLIHNPLHLIFSVDFLGVTKSTLSSLSKGFAELSTDGQFLQLRSK QVWSRRITGVGDGLVQGTEAFAQGLAFGVSGVLRKPVESARQYGAIGIAHGLGRAFVG FIVQPLSGAFDFFSLTVDGISASFMRCVDILNNKHVPQRIRDPRAIHRDGIIREYDKV QAAGQMALYLAEASRYFACTDLFREPSKYAWSDYYEDHFIVQNQKVALVTNKRVILLQ CVDLDKMDKKPSKILWDVPWEDVLALELAKAGYQRPSHVIIHLKNFRRSENFVRLIKC NVDEEHEPQALLLCSSIRKMWRSHQADMKVVPLKVPGGQHDVYFAFDEDMREFHSFAR PLLSPRGAASNVEERLINDTVNFQNMWSSEQEIRSRCKLLSKQVADDGRVFSIWRPLC PSGYVSIGDIAHVGIHPPHVAAVYKNVGGNFALPLGYDLVWRNCGEDYRNPVSIWFPR PPEGYVALGCVAVSAFEEPPLDSAFCVSERFAEDAVYEEQIVWASSDAYPWGCYVYQV QSKSLQFMAMRRPKEECELKPKKVSESYAQQALERS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6241..6582#5768..5876#5598..5650#5289..5489#4905..5180#4667..4825#3489..3848#3189..3410#2245..2371#1315..1451#1046..1223#507..673#ataaaagctgagatacgtggctatgaggaaggttcaagattcttgattgtatttcgtttggggccatcagatggaccaatcaggtagtaagagattttaatggcttgcataaacatgattcttatttatctaactatgaccctactatcatgtctgcatgcaggattgagaaccggacaagtagtacaactatcagtgctcgacagtctggtttgggagaggattcttggatacaagtgaaaccactttcaaccaaaaaatattcttgggatgacccatatggacatacaacttttgatgttagcatccagcaaggagatgttactttctttcagtgtgttgacctggaaaaccctgatgaatgttccgctggttttagagaacatcacctcaagctcagtatagttgagactgctgatgttaagattttgaagtttgctgattacccaagaagacaagagggagggtacagatctgatctgggtgatcaccaagcctcgccagttatgcaaaatgatacagatacaggtgctggactattggaacttattgttgaacttggagttgttggagtctctttgattgatcataaaccgagagagcttttgtacttacatctgcagaagctttttatttcatacatgactggttacaattctggtaccactagcaggtatagtgacgactacatcaactatgtttgtacttatgcatggttgatgaaaatatttttttttcactaaagcaaagagcatatccatcagttggaaaattctgaaaatacttattgctttgaccttggttgttcattttgtaaaattatttagtccttgaagctgacgttttgacaaaagatgtggtaaagacagattcatagctctagtgatctagtcataccagagcagctgttttgtagccgtcaatctgaataatggttaaatggttaagaatgagcatagcttggaaacaagtctcttagctcctttgtcttatgctattgttgtatgcaccattgagttttttctgatgatatataatatttcaggtttaagttaattattggccatatgcaactagataatcagttgccattgtctataatgcctgttgctttggcaactgagagcatgcctgactcaaaccatcctgtatttaaagcaaacatcgccgtaagcaatgtaacttcaaatggtattcaagtctatccacatgtctatatccgggtaatgttgttgctgagttttctgagaagcaaagctatacaccatttattataatactaaagatggaacattcttggatttttttttctaggtaactgatcaaacatggaggttgaatattcatgaacctattatttgggcattggttgatttctacagcaatcttcgttttgtcagcaccaacaacatctcaactgtaacagaagtggatcctgagatacgaatagagtaagcaagtcacgtcactgttaaaatttagtagcaaatgttagatgtagaatcttgttgctgacgtatctttatatttgagttgtttctgttattaatgcagagttgtgcactaataattagcaccaaaatccgaagttctggatttgcagaacattttatcctgatatagatagatggtttacgttttctacgaacagcactcagatcatgatttaagatgttagtttgaagactggctcagtaacatagtttctctgtgcttgtaaaaatagcacttttgccagtttgatttccttcacatatcaatttgattccacttagaaagaaatcagcatttccatgttatggtgggtggtgtatgacttggttgcagtttcattttctttcgtagaatcctttgtgctgaagaatgggtgtgatatgctactctttgattatggatccagataaatctaggcccgtatatagccttcacccttagaaaaggacaagaaagatgccagctgatcttccttttcttttttgttggccactctacctattctgctctaaacaagcaccactccacatctccactttgtgtgttcattctactcccacctaatgcagtggtagaactgtacaagaatcaataaccataaaacgcttgctaactatttgccttcaggtagtctgctccattgtagtggtcttcttatttagttcatatgataacttcttttagtacacatatgtttgagttaacacagataccacatggtatactgacaaattattttacaaattacaggcttgttgatatatcggagataaggttgaaaatatctctggaaactgcgcctactcaaagaccacgtggtgtccttggcatatggagccctgtcctatcagctgtaggcaatgcacttaagattcaggtaaaatgatgttatttactgggcaaagaattcaagaaccagactgtaataacttcaatacaccaaacatcatgtttcttggctattacctgccttatcccagttagataagttaagatctttctgtgctagtttcatcagaatctagtactctttgagtaacttatgaagttcaatgccactacatcaaaactgtttgaaacttcttgattctttttcctcctttttatagaaagggaaaggtgtgccatattgtctagtgactgtcagcacccacttgcctatttatttaaaaatcaattcccccttttttctcggtggcatcagtgtaggctatcatgtgtggtggataactcttttcatagcagatcaatctgatagagtgttcttcggtggttcctgtcccattgactttaaataagttttaactttggttgtgcaagaatatttcatctggttgggtgcaagtcaagtagtactgatagatcaaaccatgagctgcgtcggtgtggtttcataaagaagataacgatatctaggcttactggacatgcttactgtaatcaagagcaagcttaatggcttagcttttatttcttgaatgacgatctgagctgaatacgttgaccctggtgctgagagcagaggcaattttcacctttggtattctatctaaacaatgtaggataccagtataagagggttaatcttgcagatgtttttatttctaacagttcatttctgaactatcgaatgtatttgcagtcacttatttagtttcatgaactgaaaattcttccattgatgtttgcctcaggtgcatctgcgtaaggtcatgcacagaagtcgttacatgcggaagagttccatcattcccgcaatcacgaaccgaatcaagagagatctgatccacaatcctctgcacctaatattttcagtagattttcttggagtgacaaaatcaactttgtcatcacttagtaaagggtttgcagagctctctactgatgggcaatttcttcagctgagatcaaagcaggtaaaacatctgctctggtggttcaccatccctgtttatattaaccacaccaggcaattcaagttaagtgtgtttcaggtttggtcaaggagaataactggtgttggtgatggactagttcaagggactgaagcatttgctcagggtttggcttttggggtttctggtgttctaagaaagccagtcgagagtgcccgacagtatggtgcaattggcattgcacatggtcttggccgtgcttttgtggggtttattgtccaacccttaagtggggcctttgatttcttctcattgacagttgatggaattagtgccagctttatgagatgcgtggatattctgaataataaacatgtccctcagaggattagagatcctcgtgctatacaccgagatggtataataagagagtacgacaaagtacaagctgcgggccaggtacatgattttcccttatttgtttttaagaaattgtattatagatatgtaaaatttgcgaaatggtgcacagagtaatagagttgccacttaagtatgttgaacaccctgttctgctgaaacttacagctattcctgaaaatgatgctctaaaaatacctctacctcaaaatagtttcctttcaccgtcaattgtgttatgtaaatcctcgcaaaaaaatattgttatggatatatcagaatgagggtgcttggtagggaggagaaaaagatatgtaagagacattaagggaagacgagacctaaaagaactttatatcccatgtttcgttattcttagtctggccagcagcctttttaaggctggcttctacctcttaacaacttttaagcagtagattgtgcttcttatctctagtacaaattccttctagttgtctacaatgcaactcctaaatgtttatatctaacagtagcctttatgctacatcacttctgtctttctttttgccatgtgagtggcatttccgccttattgagtggctgcagcacatgatagtgcgaattaggccagcccataacagttccgactaggcctgtagcctccacccacgacagatgtatttgtttttcttgataaacagttgcatagtaggttctgcaagtatgctgcagtagaaaatgatggttaacattatgtgctagccttctgataactgtttcaaggagcgatagtttttgtttcatagtactggttttacttcagtcaatgaatattgttgatgctatacacttaatttgagcattcaattgtccagatggccctttacctagcagaggctagcagatattttgcatgcacagatttatttcgggaaccttcaaagtatgcatggtcagattactatgaagatcattttatcgtacaaaatcagaaggttgctttggtaacaaacaaacgagtgatactgcttcaggtgaggcctctttctgtctgattctcatagt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External Link(s)

NCBI Gene:Os10g0565300, RefSeq:Os10g0565300