Os10g0575200
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Structured Information
| Gene Name |
Os10g0575200 |
|---|---|
| Description |
Similar to Rme-8 homologue (Fragment) |
| Version |
NM_001072011.1 GI:115483617 GeneID:4349486 |
| Length |
9702 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0575200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:23316730..23326431 |
| Sequence Coding Region |
23317070..23317297,23317434..23317502,23317972..23318095,23318448..23318572,23319070..23319531 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:23316730..23326431 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggctatagtttatgaacaacataacaaagttattggacctttcgatggcacagcacatattactgttctcttggacagaacagatgatagggcattaagacatcgcttgctactactgttaaaggccttgatgaacgacctttcaaatgttgaagtgtgtgttttggttggaggatgtgttttggctgttgatatgttaactgtcgctcatgaagcatctgagcggacagctattcctttgcagtctaacctgatcgcggcaactgcatttatggaacctctgaaagagtggatgtatattgacaaagacggtaaacaagttggccctctagaaaaggatgctatcagaaggctatggtcaaagaagtcaattgattggaccaccaaatgttgggcttctggtatgtctgactggaaaagattacgtgatatccgggaactccgttgggcacttgctgttaaagtgcctgttcttactcctagtcagattggggatgctgcattgtctatattacacagtatggcatctgcacattctgatcttgatgatgcaggagagatagtgacaccaactcctagggtgaaacgtatattgtcaagtccaagatgccttcctcatgttgctcaggctatgcttactggggaaccaagcattgttgaagcagctgcctcattacttaaggctattgtcacaagaaaccccaaagctatgattcgactatatagtaccggtgccttttactttgcattggcatatcccggttcaaatctcctatcgatcgcacaactcttttcagccacacatactcatcaggcatttcatggtggtgaagaggcagcagtatcttcatcattgcctttggcaaagcgcagtgtactaggtggactgctcccagaatcattgttgtatgtcttagaacgcagtggaccttcagcttttgctgccgcaatggtgtctgattctgacacgccagagattatatggacccacaagatgcgggcggagcatctaattcgtcaggtcctgcagcatctcggtgactttcctcagaaattggctcaacattgtcattcattgtatgattatgctcctatgccacctgtgacctacccgaatctgaaagatgagatgtggtgccaccgatactacctccggaacctatgtgacgagattaggtttcctaactggcccattgttgaacatgtagagtttttgcagtcattgttggcaatgtggcgtgaagagttaactcgtcgtccaatggatctatctgaagaagatgcttgtaagatactggagatctctcttgatgatcttgtccttggtgagaacggcagtagcaagcagtcatctgagttaagttcgggcaatttgacaaacaacattgaaaacattgacgaagagaagcttaagcgccaataccgtaagctggcaataaaataccatccagataagaatcctgagggaagagaaaagtttgttgctgtgcaaaaggcttacgaacgattgcaggcaagtatgcagggactgcagggaccacaagtttggaggctgctactcttactcagggcacagtgcatcttgtacaagagatatggacatgtcttggaaccattcaagtatgctggttatccaatgttgctaaatgcagtcactgtagataaggatgatagcaattttctttcatctgagagagcccctcttttgatagctgcttcagagctaatttggctgacatgcgcatcatcttcattaaatggcgaagagctcatacgggatggtggtatcccattgttggcaacacttctttctcgttgcatgtgcattgttcagcccacaaccccagcaaatgaaccggcagcaagaatagtcaccaacataatgcatacatttgcggttctcagccagtttgagtcaggaagggctgagattcttaagtttggtggccttgttgaggatattgtgcacagtacagaacttgaatttgttccatcggctgtggatgctgcactgcaaacagctgctaatatatcagtgtcatcagaattgcaaagttctctgctcgcggctggatttttatggtatgtgttgcctctattgcttcagtacgattcaacagcagaagagaatgcaacaagtgaagcacatggtgttggtgcaagggtgcagattgctaaaaatctgcatgctgtacatgcaactcaggctctgtcaaggctttgtggtcttggtggtgatggaataagcccatctaatcaatctgcttttgatgcactaagagcgcttcttactccgaagcttgctgatatgctgagaaaccacccacctaaagaactgttgtcaaatctgaatgcaaatttggagtcaccagagatcatatggaattcttccaccagaggcgagctcctcaaatttgtagaccagcagcgtgctagccaaggacctgatggttcatatgatttgacggaatcacattgtttcacataccaagctttatcaaaagaactgaatgttggtaatgtgtacttgagagtttacaacaaccaaccagattatgaaataagtgaccaggaaggtttttgcatcgcgctgcttaaatttatagcagagctagtacagaagtggaattcattaagtttggatgaaaatatgatgcatcaatgtggtacagctattgagacatcagtcactgaaaatggtgatatcagtggttcaacgaatgaaggaaaagaagaagattcattggaaaaacacaatagaggagtaacagatggagattctgaagtgattatgaacctccgaagtgggctaacatcactacagaatcttctaaccagtaatccaggattggctgctgtttttgcttccaaggaacggttgacacctctttttgaatgtcttgcgctacctgttcctcctgaaagcaacatcccacaaatttgcctaagcgttctttctctcctgacgaagcatgcgccttgtttggaagccatggttgcagaaagaacaagtctcattttgcttttccagatactgcactgcaatcgttcttgcagggatggagcccttactgtcctctattctttagccagcacaccggagctggcctgggctgctgccaagcatggtggtgtagtgtacattctagaacttatgttaccacttgaagaggaaatccctatgcagcaaagagctgcagctgcatcattattgggcaaacttgttgggcagccaatgcatggtcccagggtggcaatcacacttgctagattcttacctgatggtttggtttctgcaattagagatgggcctggtgaagctgttgtttcatgtcttgaacagaccacagaaacccctgaacttgtatggacacccgcaatggcagcttctctttctgcgcagttgtcaaccatggccacagacctctaccaagagcagatgaaagggcgtgttgttgattgggatgtgcctgaacaagcatctggccagcatgtaatgaaggatgagccacaggttggaggtatttatgtgagactcttcctaaaggatcccaagtttccattgagaaaccctaaaaggttcctagaagggctgctagatcagtatgtctcatcagttgctgccacacactatgaggcgaatgctgttgatccagagcttccgttgctgctttctgctgcattggtttcattgttgcgtgttcatccagcccttgcagaccatgttggttacctaggttatgttccaaagctggtttcagctatggcatatgagggtagacgggacactatggcatccggacaaaccacaagtaggttgcaagcggaacctagcaatcaagagaactcggcggactctaccgtgcagactccacaagaacgtgtccggcttagttgtttgcgagtgctgcatcagctggcttccagcactacttgtgcagaagctatggcagccacaagtgcaggaactcctcaggttgttccattgcttatgaaagcaattggatggcaaggtggaagtatactggcactagagacactaaagcgtgttgttggtgctggcaatcgggctagagatgcacttgttgcacaggggctaaaggttggccttgttgaagtactgcttggtattcttgattggcgagctggtggcaggcagggactgtgtaaccaaatgaagtggaatgaatcagaggcttcaattgggcgtgttttggcagtggaggtgcttcatgcttttgcaacggaaggcgcacactgtgctaaagttcgtgaaattctgaattcttctgatgtatggagtgcttacaaggaccagaagcacgatttattcctcccatccaatgcacagtcttctgctgctggagttgcagggctcattgagagctcatcgtcaagactgacctacgcccttactgcaccaccacctcagcctgccttggtccggctaccttctacagctccagcgctaccatcggctcctgcaaatcccagtgggcggcattcttatcagcattcatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAIVYEQHNKVIGPFDGTAHITVLLDRTDDRALRHRLLLLLKAL MNDLSNVEVCVLVGGCVLAVDMLTVAHEASERTAIPLQSNLIAATAFMEPLKEWMYID KDGKQVGPLEKDAIRRLWSKKSIDWTTKCWASGMSDWKRLRDIRELRWALAVKVPVLT PSQIGDAALSILHSMASAHSDLDDAGEIVTPTPRVKRILSSPRCLPHVAQAMLTGEPS IVEAAASLLKAIVTRNPKAMIRLYSTGAFYFALAYPGSNLLSIAQLFSATHTHQAFHG GEEAAVSSSLPLAKRSVLGGLLPESLLYVLERSGPSAFAAAMVSDSDTPEIIWTHKMR AEHLIRQVLQHLGDFPQKLAQHCHSLYDYAPMPPVTYPNLKDEMWCHRYYLRNLCDEI RFPNWPIVEHVEFLQSLLAMWREELTRRPMDLSEEDACKILEISLDDLVLGENGSSKQ SSELSSGNLTNNIENIDEEKLKRQYRKLAIKYHPDKNPEGREKFVAVQKAYERLQASM QGLQGPQVWRLLLLLRAQCILYKRYGHVLEPFKYAGYPMLLNAVTVDKDDSNFLSSER APLLIAASELIWLTCASSSLNGEELIRDGGIPLLATLLSRCMCIVQPTTPANEPAARI VTNIMHTFAVLSQFESGRAEILKFGGLVEDIVHSTELEFVPSAVDAALQTAANISVSS ELQSSLLAAGFLWYVLPLLLQYDSTAEENATSEAHGVGARVQIAKNLHAVHATQALSR LCGLGGDGISPSNQSAFDALRALLTPKLADMLRNHPPKELLSNLNANLESPEIIWNSS TRGELLKFVDQQRASQGPDGSYDLTESHCFTYQALSKELNVGNVYLRVYNNQPDYEIS DQEGFCIALLKFIAELVQKWNSLSLDENMMHQCGTAIETSVTENGDISGSTNEGKEED SLEKHNRGVTDGDSEVIMNLRSGLTSLQNLLTSNPGLAAVFASKERLTPLFECLALPV PPESNIPQICLSVLSLLTKHAPCLEAMVAERTSLILLFQILHCNRSCRDGALTVLYSL ASTPELAWAAAKHGGVVYILELMLPLEEEIPMQQRAAAASLLGKLVGQPMHGPRVAIT LARFLPDGLVSAIRDGPGEAVVSCLEQTTETPELVWTPAMAASLSAQLSTMATDLYQE QMKGRVVDWDVPEQASGQHVMKDEPQVGGIYVRLFLKDPKFPLRNPKRFLEGLLDQYV SSVAATHYEANAVDPELPLLLSAALVSLLRVHPALADHVGYLGYVPKLVSAMAYEGRR DTMASGQTTSRLQAEPSNQENSADSTVQTPQERVRLSCLRVLHQLASSTTCAEAMAAT SAGTPQVVPLLMKAIGWQGGSILALETLKRVVGAGNRARDALVAQGLKVGLVEVLLGI LDWRAGGRQGLCNQMKWNESEASIGRVLAVEVLHAFATEGAHCAKVREILNSSDVWSA YKDQKHDLFLPSNAQSSAAGVAGLIESSSSRLTYALTAPPPQPALVRLPSTAPALPSA PANPSGRHSYQHS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9135..9362#8930..8998#8337..8460#7860..7984#6901..7362#6477..6820#5771..6116#5236..5685#4126..4417#3662..4006#3343..3566#2614..3105#2121..2513#1436..1576#970..1332#558..683#tggtggaaaacacacctgttggatctggcaggctactgtgcaactggtatggattttggagagcattcagtcttgatcacaatagagcagacttgatatggaatgaacgcactagacaagaattaagggaggcattgcaagctgaagttcatagccttgatgttgagaaagaacgaactgatgacattgtccctggaagttcagtcactgaggatgccagtgatagtgaaaccttaccacgaatttcatggaattatgttgagttttcagttagctaccctagcttgtccaaagaagtctgtgtgggccaatactatctgcggcttcttcttgaaagtggaagcaattaccgagcacaggatttcccactgcgtgatcctgttgccttttttagagctctgtatcaccgcttcttgtgcgatgcagacattggtcttactgtggatggtgcagtccctgatgaactgggttcatctgatgattggtgtgacttgggaagattggatggttttggtgggggaggaggttcttctgtaagagaactttgttcaagggcaatggctatagtttatgaacaacataacaaagttattggacctttcgatggcacagcacatattactgttctcttggacagaacagatgatagggcattaagacatcgcttgctactactgttaaaggttggttgtactctagctgaattacctctttgcacttctcccattttcttttgtatcagcaaataagatgggcataagtatactagatatgggaatgtcgacaagttctattcatgtggactttgctgcacgtacaccagaagtccagaattcataaacgcgatgatatagctctagaacatgttcatgacttcagactactataaaaaactaatatgattttgctgacctaacatactttttttctgagaaatctgcctgagtaagtttcttcatgtttttgtaggccttgatgaacgacctttcaaatgttgaagtgtgtgttttggttggaggatgtgttttggctgttgatatgttaactgtcgctcatgaagcatctgagcggacagctattcctttgcagtctaacctgatcgcggcaactgcatttatggaacctctgaaagagtggatgtatattgacaaagacggtaaacaagttggccctctagaaaaggatgctatcagaaggctatggtcaaagaagtcaattgattggaccaccaaatgttgggcttctggtatgtctgactggaaaagattacgtgatatccgggaactccgttgggcacttgctgttaaagtgcctgttcttactcctagtcaggtattgaatctacagcctggtatcaaaccgacatgcaaacatgcacgacaattttattttactcatcaattaacacttatgcaaaatgtatttctatttacagattggggatgctgcattgtctatattacacagtatggcatctgcacattctgatcttgatgatgcaggagagatagtgacaccaactcctagggtgaaacgtatattgtcaagtccaagatgccttcctcatgttgctcaggtacttagttccaaatttgcttcccctatcatgcggggactagtttgtgtatgatgacctagctatattattatttggccatgtgtataagaagagctttcatacccttaatttacaactgatagcttaggctatggttagaagcatggatgttaagcataatgcaacaattaagatatgctgatgaagtatctttccttaatacaacagtgctgaaaattatagctcctttttttttttttggaaaattactgtaggacagtctcctatagtgtgtgtatatatattgtaatttacagaatttacaaatttgcagtcaaacaataaattatagttcattggcactgccagacaaccaatagtcccaaggagacttggttatattctcgacaagctgttcttacatgtataaatttcatgctttaactcctcaatgttctgttcattctttcatattatttctttcttgcttttggatagttttatttttgtctacttctattatcgaacactgacaggaaatgataaatttgaaatggtataggctatgcttactggggaaccaagcattgttgaagcagctgcctcattacttaaggctattgtcacaagaaaccccaaagctatgattcgactatatagtaccggtgccttttactttgcattggcatatcccggttcaaatctcctatcgatcgcacaactcttttcagccacacatactcatcaggcatttcatggtggtgaagaggcagcagtatcttcatcattgcctttggcaaagcgcagtgtactaggtggactgctcccagaatcattgttgtatgtcttagaacgcagtggaccttcagcttttgctgccgcaatggtgtctgattctgacacgccagagattatatggacccacaagatgcgggcggagcatctaattcgtcaggtatttaccaccctagttatttgttaaaatgtttactttgagatcatgagtttttaatctaattttcaaattgttctgtccatacgactggctttctcaggtcctgcagcatctcggtgactttcctcagaaattggctcaacattgtcattcattgtatgattatgctcctatgccacctgtgacctacccgaatctgaaagatgagatgtggtgccaccgatactacctccggaacctatgtgacgagattaggtttcctaactggcccattgttgaacatgtagagtttttgcagtcattgttggcaatgtggcgtgaagagttaactcgtcgtccaatggatctatctgaagaagatgcttgtaagatactggagatctctcttgatgatcttgtccttggtgagaacggcagtagcaagcagtcatctgagttaagttcgggcaatttgacaaacaacattgaaaacattgacgaagagaagcttaagcgccaataccgtaagctggcaataaaataccatccagataagaatcctgagggaagagaaaagtttgttgctgtgcaaaaggcttacgaacgattgcaggtatactcatttcttcctcggatgatatcctgcaatctttcacatactcatttttttagttaaagttgaattatcttattgattagctaagcttaactacaaatgaatgcagttggaactcttggtttttatgtgaaaaaggagagtcccttaagttttttttttcttttcaatgcacccttttaacatatggttttacactgctgggtaatcactaaatatattatctacatgcaggcaagtatgcagggactgcagggaccacaagtttggaggctgctactcttactcagggcacagtgcatcttgtacaagagatatggacatgtcttggaaccattcaagtatgctggttatccaatgttgctaaatgcagtcactgtagataaggatgatagcaattttctttcatctgagagagcccctcttttgatagctgcttcagagctaatttggctgacgtaagtgaagacaaactgactttacctatgtttttttaagataatgtttactttgattgaatatcaactggattatgtgcttcatgctttgttagatgcgcatcatcttcattaaatggcgaagagctcatacgggatggtggtatcccattgttggcaacacttctttctcgttgcatgtgcattgttcagcccacaaccccagcaaatgaaccggcagcaagaatagtcaccaacataatgcatacatttgcggttctcagccagtttgagtcaggaagggctgagattcttaagtttggtggccttgttgaggatattgtgcacagtacagaacttgaatttgttccatcggctgtggatgctgcactgcaaacagctgctaatatatcagtgtcatcagaattgcaaagttctctgctcgcggctggatttttatggtaatgccttgctatcctaattgcaattactattattaatctggatagatagattagggaatggcatactgaaatcccaagttatgtgaatgatatatctaattaagatttactcgcaggtatgtgttgcctctattgcttcagtacgattcaacagcagaagagaatgcaacaagtgaagcacatggtgttggtgcaagggtgcagattgctaaaaatctgcatgctgtacatgcaactcaggctctgtcaaggctttgtggtcttggtggtgatggaataagcccatctaatcaatctgcttttgatgcactaagagcgcttcttactccgaagcttgctgatatgctgagaaaccacccacctaaagaactgttgtcaaatctgaatgcaaatttggagtcaccagaggtaatagattaaatttcatttgtattacatgcctggagtgttccatcaatccaatgatcattgtcattagtatatctttgaaatttttgcattttgttcctcaccataacctgcatcatctgtgattgttatgtgcagacaaacacatgcaagagcgtgttaagctcaatttagggaattatcattagagtggattttttttcgacatgctaaaaatcgtagcgatgatagttgaatacacattctcagattactcctgactgggcatggcactcttgtttttctctttgtgaaatgaacataagaccgactaattcatttatccatacaatttgcttcatcaatatttatcatgttcttgattataagttgcttcatcaatatttgctttatatg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