Os08g0220600
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0220600 |
|---|---|
| Description |
Fibronectin, type III domain containing protein |
| Version |
NM_001067803.1 GI:115475342 GeneID:4344961 |
| Length |
9012 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0220600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:7338071..7347082 |
| Sequence Coding Region |
7338316..7339217,7339391..7339716,7340059..7340723 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:7338071..7347082 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacccgggaaaacacaatggaatgagtctgaaggacagaagagaattagtatatgaagtttcacaatggccacaaggtgcctctgagattttacaatgttggactcgcagagatcttcttgagcttatctgtgctgagttgggcaaggagaggaaatacactaatgttccaaaatctaaaatgattgcttatctgttaaaattagttttacgaaagaatggacagccaaaggatgataatgcaaatgcttcaattttggggcagaataacaaagatgacacagagaagaaagaaaatgaggaacagccacatcatttcagcagaagtgcaaagtctgactcatcaatgtgcagagaggcccaagctggtagcacagcggtatgccgaaatgttgcatgccaggctactttgaactctggagatgcgtattgcaagcgttgctcttgctgcatttgccataaatatgatgagaacaaagatcctagcttatggttggtttgcagctctgatacaccgtactctggctattcatgcggcacatcatgccacctaaagtgtgctctaaagaataaaaaagctggcattttcaagaatgggtgcaacaagaagtcagatggtagtttttactgtgtttggtgtgggaagatgaactggctaatgaggaatctgcgtaagcagctggcaattgcaagagaatctagaagagttgatgtactgtgtgagcgtttgtcactgactcataaaatggtgaaagggtctgaacgttacagggaactggcaaacataatcaactcagctgtgaaaatacttgagaaagaagttggttgtgcattagatcaagtgtctgcaatcacggggcggggcatcgtgaaccggctttgttgtggtgctgatgttcaaaaactttgttcatgtgcactagaaatggtagactccacattgagtagcaccctggacttcgaaacaaacaataatctggaagcgccaggtccccagcctcaagtattttttgtggagattactccattttctgtgcttgttgtattgaagtaccaggataatatcgctgaggagattgatggttgcaaagtttggcaccgaagtgcaaacatggccaactatccagcagagcccacttgccacgttcttagaccaaatacaaggagtcttttttcaggtctaagcccttctactgagtatttcttcaaggttttgccttttggctgttcacagggatatggcgaatgggaggtaaaatgctctacacgaagccttaaccatggcagcagccagtgctcaacacagaattccgagagtatgtccatcaaggaggatttggagcagcatcagaaaaatgagttgaatctgaagaacaagcagtggtggggcattcaatatgactcaccctcggcaaactcgaatgagaacgatgtgtgtcctgacctgcaccctaagcgagctaagctcgcaaagttggacggtgcaagtgacaacgacgaaagccagttgctgccaacatcagaagttttaccattcatgagctctaattcttcactttcagaagttccaagcaaacctgactgggttagcagcaccccagattccgcctgcaagaaccatgttgagaggcagtatgaatacagtgtgaaggtcattagatggctggagcatgaagggcacatggacaaggatttccgcgtgaagttcctcacatggtttagcctgaaggcgtcggcacaggagcgacgcattgtgaacgccttcgtagatgctctggtgagtgatcctgcgagcctggtagcacaactgattgattcgtttatggaggttgtctgcagcaaggagaagcctgctcagccgaatggtgggtgctgcaacctttggcattag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDPGKHNGMSLKDRRELVYEVSQWPQGASEILQCWTRRDLLELI CAELGKERKYTNVPKSKMIAYLLKLVLRKNGQPKDDNANASILGQNNKDDTEKKENEE QPHHFSRSAKSDSSMCREAQAGSTAVCRNVACQATLNSGDAYCKRCSCCICHKYDENK DPSLWLVCSSDTPYSGYSCGTSCHLKCALKNKKAGIFKNGCNKKSDGSFYCVWCGKMN WLMRNLRKQLAIARESRRVDVLCERLSLTHKMVKGSERYRELANIINSAVKILEKEVG CALDQVSAITGRGIVNRLCCGADVQKLCSCALEMVDSTLSSTLDFETNNNLEAPGPQP QVFFVEITPFSVLVVLKYQDNIAEEIDGCKVWHRSANMANYPAEPTCHVLRPNTRSLF SGLSPSTEYFFKVLPFGCSQGYGEWEVKCSTRSLNHGSSQCSTQNSESMSIKEDLEQH QKNELNLKNKQWWGIQYDSPSANSNENDVCPDLHPKRAKLAKLDGASDNDESQLLPTS EVLPFMSSNSSLSEVPSKPDWVSSTPDSACKNHVERQYEYSVKVIRWLEHEGHMDKDF RVKFLTWFSLKASAQERRIVNAFVDALVSDPASLVAQLIDSFMEVVCSKEKPAQPNGG CCNLWH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7866..8767#7367..7692#6360..7024#acgatcttggttcgcttcgtgcgactcctcctcctcttgcgccggtgccgacctcgcctcgcctcgcctgcgtcgcgtcgatctcgccagcggcggcgccagccggccggcgtctgctgcgtcctccgcatcctcgctcgccggtgagcatccatggccatgctcattctcatctcgctctacccgcgctgtttttttcgaattcgcgttagccctagcttttcttctagatctggaagcagcttttctctttgcactttttgcgttagcccttgcaataacaatagtaacagtttaatctgttcccaatagagaattttggggttcaaccgaaccctcatgtcccagctaggtccgcccctgtcagtgcgactgccttgttgcaacttttttttttgtttttggttatactcctatcaactattcctgagtgtacaatgcgataagattttgttcccttccctgcagagagttggggtcaagcaaagttggttgttttttactcgaatgtcgtgaggaacaccgaggaatcctccagtttcgcatggtagggtccaatgcctttttctgactaaaaagctgttggttttgttaagtgttgttatcaccattttatgaaatgtttacatgtgcccaacaacttagtattatcgttttctccaaccatgcagagacccatatgttgaacaaaggtgaagctgtgctgtggagacctgataaaattttctaataatgcttgtgcaaatgaagaatactgttcatctcacgctattcctgtgttctttctcaagaatgctttgctcctattcttttattgaaatcaatttgtgttattatcttcccattcgtaaggtgctgactagttcacttttttatgtcatagagtaggaaggttctctgtactgcaagtgtttggatttcctcgagccgaatgagctttcactggtggatgtggtaataaaagtccctgttttcaggtatacgctgactgtagtgttttggggatatacgctacactaataatagagaacacatacaaattaatccctataagtgaactggaactactgtgttattagtgtgttggccagatttggatgactaaggtcaaatgctaaaaatcatttggaatctttcaaaaaaggaccatttggattactattccgtacatgctctcaggcccttccacgttctacttttctaatggcataagtaatgtatctgccttgatttgcaccaccaatatcagctaatactttagttcctgttccatctcctgaaaacaatggtccttcaatttcgcagtatcagtcctttcactgtatgctttcctacccaagcttctccttcatatatttaaaagaatgggtaaatatagaacagaataaagtggctacactatggatcagtccggtgaacaattattgtgacacagtttttttcccaataaactgggcatgtcttgtgaaacagagtgatctctgtctttatgatagacaaataactatgttggagtttgctagaactacttgtaaggaagatgccattaagtgaccacctgaaatcgtgttgtagtgtcattccataacatttatttaagatttctccaatggaagttgtatctaaatatgcctaatattttgcatatgtagtgtttgctctttggaattataaatcattctaggatgctgttccaatcagtttgggaagctcaggttttcatcaaagacgattagtaaaatttctgtcagtctgcaaaatttgtggtatggtaaaattcctttaaagtatagaaaatttaagctgacaaacaaaagttagggccattgtatattacatcaaaagattgtttcattctgttgctatcaatcttaaataacgatttcagggtgcaggatccaggttcccattgggccacgtggcactttacaaatttttgtaaggctactctgaaattgtgccacgtggcctcccctatgcatatttaaactgcattctcctgtccactgaactgttaggaaaactctggagtcaataaatcacctttgcctgacccttgtgaagaagttagagatgtaacccatccgaagtctctagaaaaattaaggtattacatggtccttcacgtgtattaagtataggcagtcaaaaaggtaaaattctctacacgcacaaactatttcagtactcacatagtcacatattgatttccaagaccttggatgctttaacttttcaagactggttttaacttttaatacaaagagtaatcttttatatatggctctgcgtattaagctgacaattagagtcatttgcctaaaaagttacgccttaaataaatttcgtaattttcctataggttgacaaattctgtaaatcatactaattcaaaagacacatcttccaaagtatttgttcaaggtatgtatatacgcttaaacaaattaatcttccattagcaaaatttgttttcaggttgaattataattatacaccagacaagtacagctagctaaatgcggcagagaagaattagccatgcataaactaattaaccatattactctatttgttgataatattgctctaattatgttccattgtacctatgattagcttatattatttttaagatgtggggggtatcgtatatgagactacagaggggactaggtgacactggtagattagcacaagaaatgtctcttagagagacttgtcaaaaactatatcctttagttttcagtccactaatcatctaatcttactaattattaataggtgttaatcactctgtctaatggaagagaaaaacaaaggtttgaaagtaaataggcaagtactacacataattttgctttctgtattaattcttttacaatgcttaaatctttacataaatacggttattattacaggttaatcgttcgtcaaccttttcaaaattcattaaataggttcttctaaatctacaagtgtatagattttttttaaagaaaagaaattatcaagtactgcatttgaaactttaaacaacaacaacaataattgttctaaataagtaaatatatcatagctataagttggtgtgccgatggtgcgccaattttctacgatatggaagcggcgaattgggaaaggatagggtggtgagattttatatttgtttctaatttttagggtattcagtgtaatgttggactactctataaatttgaaaaacatatggactaaagtaagaaatatgattgcccgacatgaaaaatcaaagctatctctagagttactttgcattatgggataaacaaatttgagacatgttacctcatcctacatgatactttgaggtcctttataggagggtcttgcactatgaatgtccaaagagaggtggtatagctatagttttccgaattatacatatggagctacgaattatgacatctaaatggtgtactacttgcaatagaagatatggaggcgtgtccctatccattcacatgtggctcttcaaatagcacgtgaactttgttgccctctcgtagtcatgacaatattttcgactactgagaagataagcaaatattgagaaaaaaaagagagagcgtggtagatatacaaatgataagatttttaaccatcaaaataatggatttaataatcctaaagtaaaagaaatagagagaatttaaaaggttataattaggccgaaagaaaataaaaatatgggaagaaggaaaagaacaaaatattttccatttctttcataaccagttaaaaaaacaatccaactgttagggcaattgtaagaaacctctaattattgaagtcccaaacgattttcatataaaacttcgccttttagccttatcttattaataataatcaaattgaccatcaaccaacatatatttgacatcattctttttttcctctgtaatttaaatatttacaaatataatgttttcataaaattgaaaaactgctaaaagatctctttaaaatgttacgcttttacgaataacaataaatagtacgtgtagtataaatatggtttgctatatggatggtgcgctaacggcgcaccaattttctagtgttatctaattgctgatcgatcctgatcgccaagggaccgatcaggtcaattcatcgtcgatcagccttgattcatcgtcgatcagccttgattaatcgacctgatcgatactatgtataccagaacctatattctatatagtgcacagtataaagcaatcacagtgcataattgatggcaggatggtcaattacttgccgtagtataaagcaatcattgtataaagcaaccagcagtagtagcacatcttcacatgtgctaaaccctaagacttgttctaaaaatgatcataggtgctctgatcagacgattaatcgcgcctgattgacgattaaccggacgatcagatttctgatcgaatgaatgtccctaatcggattcaggggattgatcaggacaattaattgcgattaatcggacgatcagataacactgattgctatagcaatagcagttgctttcctctctccagtctccaccataggttgtgtggagtccacccaagaatttctcttgttcccttgttcactctttctttttttcttcgtccgtgtttatctacttttgttgaatcgacagttgttcaaaatcttggatttgttggccagttggtagactcatggtttttaaggcagtaaggcgtcctaaggcgaccccggactgccttatcgccatagcggtaagacgtaaggcgaggcgacaccttaggcactccatactaattaggtggcaaacaaaataatctaatatgctagcaaatcaaagttgcattttaagagcagtacaacgcgcatatatataccttgttcttggcaactcttgagcccactagatggttataataattactt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|
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