Os08g0292600

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Structured Information

Gene Name	Os08g0292600
Description	Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type domain containing protein
Version	NM_001068001.1 GI:115475739 GeneID:4345190
Length	4793 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os08g0292600, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 8
Location	Chromosome 8:11816319..11821111
Sequence Coding Region	11817181..11817952,11820669..11820880
Expression	GEO Profiles:Os08g0292600
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008401:11816319..11821111 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008401:11816319..11821111 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggtgttgccttcatcaaataccagggccacttcttccatggcttaccctgtttccctgagcagcctccaccaccaccccaacaaccaccatgctttttttcttccctcgaaaacaaaccatgataatactcataaacctattgaatcctctagaatttctagacggtctctcatcttcctccctgtcctcccttctcttctatacgcttcatcatcccctgccttagatgacgcaaacattccatccacctctgccattgataccaccatcacagatcggatcttcatggacttcagtgtctgccctagctactttcgctctgaccgcactttaggagctgagcttgctacatgtcctgattctgaacctcttggtcgtgtaatttttggtttgtatggtcgactcctccccctcactactgccaacttcaaagctgcttgcacttctgctgcataccggggaacacttgtccacaagctccttcagggccagttcttcgttgctggccgccaaggtcctcggcgtgacaggggcgaggtccaacctcccaccggacttgtgaggaatgctgagactattgaccctaaagcatttgaactaaagcatgcaaggcctggcaccctctcattgtgccttggacagaacgatgacgatgatgacatcaagctcaatcctaattatcacaatgttgaattcttggttaccactggaccagggccctgcccagagcttgatggacagaacattgtctttggaactgtattggaaggaatgaatgttataaccagcattgcaactattcctacctataaaccagctgaaaggatccgcttcttcaatgattttgcccagttgattggtgatgaaagagctcaaactgctcgagcgttgtgggatcgcccgctaaaaactgtttatatcagtgattgcggagagctaaaagtgaccaaaccatcactttcccctccaagtctgccataa</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MVLPSSNTRATSSMAYPVSLSSLHHHPNNHHAFFLPSKTNHDNT HKPIESSRISRRSLIFLPVLPSLLYASSSPALDDANIPSTSAIDTTITDRIFMDFSVC PSYFRSDRTLGAELATCPDSEPLGRVIFGLYGRLLPLTTANFKAACTSAAYRGTLVHK LLQGQFFVAGRQGPRRDRGEVQPPTGLVRNAETIDPKAFELKHARPGTLSLCLGQNDD DDDIKLNPNYHNVEFLVTTGPGPCPELDGQNIVFGTVLEGMNVITSIATIPTYKPAER IRFFNDFAQLIGDERAQTARALWDRPLKTVYISDCGELKVTKPSLSPPSLP</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>863..1634#4351..4562#gttctcctccgctccttgcgccgccgccaagacgagcggagggccgggcggcgatctccatctggcaagcagagcagcggaggggaggaggggatcctggtgcgtcctctttctgatccatctctctctctctctctctctctctctcccaccccaccgggacctggaatttgcttgcgttcgtgaatttgatagccttaaacctctcttatttcaagtaataacagtttgtttgtttacctaaaagttcgggggttcaaccgaacccccatgccccaagttggatccgcccctggtttgaattgctgaaacataatttcgagctagttaaacgaagagacaacatgcctggaaatgtaaaaaaaaagtatgctgatttgaatttgattgttggaactgccctataggaaactggtaaattttagaacaaaaaaccttgcttatagtaaaatcgtgaatggatgatatgcaaagacatggtgagaaatattcactcgctcatactacaactacttaagaggaccatatttgctcactctggaatagctgctgacctgctgtgaccatcatacaccccctcaccgcaatgcaggttccatttgaagtaatcggagaatggtatgttgagaattagattaaagcttccattttaaaattgtaattgtttgggctgtcagctatttgccattattcacaagtgataattgtgaccctacaacgaagaggctaacagtaggttttagaatttcagtaatgttatatctcaaaagccaactattacatttgcagggaaggatattagtgattttctactgctgtttcgtcagaaggacaagaactgaagaattcagttagcaacagtatggtgttgccttcatcaaataccagggccacttcttccatggcttaccctgtttccctgagcagcctccaccaccaccccaacaaccaccatgctttttttcttccctcgaaaacaaaccatgataatactcataaacctattgaatcctctagaatttctagacggtctctcatcttcctccctgtcctcccttctcttctatacgcttcatcatcccctgccttagatgacgcaaacattccatccacctctgccattgataccaccatcacagatcggatcttcatggacttcagtgtctgccctagctactttcgctctgaccgcactttaggagctgagcttgctacatgtcctgattctgaacctcttggtcgtgtaatttttggtttgtatggtcgactcctccccctcactactgccaacttcaaagctgcttgcacttctgctgcataccggggaacacttgtccacaagctccttcagggccagttcttcgttgctggccgccaaggtcctcggcgtgacaggggcgaggtccaacctcccaccggacttgtgaggaatgctgagactattgaccctaaagcatttgaactaaagcatgcaaggcctggcaccctctcattgtgccttggacagaacgatgacgatgatgacatcaagctcaatcctaattatcacaatgttgaattcttggttaccactggaccagggccctgcccagagcttgatggacagaacattgtctttggaactgtattggaaggttagttgctttcattttctgaacttttactaaatggttcttgcacactttgtgttaaattctgtcttgcaagaatttcaatgtctttccctcgaacaagttgggatttgacctgtgcgtaatctactaatgcaaggttggcatgattaaattcatgcataaatctattttctttggttcaaacagagaaaaataaaatgtatttcaaaccgtttcattttttgtcaagtataattatatgacatcttccattctccttttggtatagttatatacacttgctaaggtaaacatgttttcattgaagtaatcaacattagtacataacagagaagaaaaaaaatgcaaattttgcagctttgcatgagtattaacaaaataacaaacagttgtgtccgtattctggctaggacttcatccatgcagaacataaagttagatgttttattattaccaatttctgcaagtaatataagcttgtaaagaaattgtcattttatttcttcctttttgttgtctcaacaccaaggatggttatcacactaagattaattcttttttttttcttctctgcacttcaccacagtataactcatcatcaattcctgccatggtttgttctaacaatgtgccacattgtcaataaacaacaccagagagtgtatcatcctcatatagtcaaatttggtgcatacttcattgtttttccctgttctgatttattagatctctggtggttatcagaagtagattgaactaaaccaagcaactcatcaatgagatttatactgccactgaacatgtcaccccaaaagagaatctacttctagctaatttaagactgacatgtctgctttgacagtttgatttgtaatttaataaactttacaacaacaaccagggcagtagttaactacaaagcagttcatatttaagttttatgcatcaagaacttaaaagcacggcccttctatccccaaaaaagcacatgcccacgttctgcatctgcatgcccatgcggcatgctctcatgcacatgcatgggcagacgcaacaaatgcatgcgcacatacaactatataacttatattcacatgacacttgaggcacactaatgcttgtcattaggacccattgccacttgaagtgtaatagtgttactcatttgaactgaactagctacttagtctcagtttcagtatttgattattaccaacagttttttcttaagcatccatttttcttcttctataagcaactttgattgtcaagttctgcattcacatgcacacataggcgactaaaacagactttcaagcactgagttaaacaagtgtattaattggatatattccagtggaattgacatgaagcttcaattttgtacgagttgctttctgttgtcttaatggaaactagtattgccactgtatgattaatgatgatattgttgattcagattaacagaaagcggctaattcgaaagattttacatgataatttgtacatatgtaatttgtaactattatatagttttaatatatcgcagtagcagtctctcctgctgttttcatcgtcaaaaaaaaaaaaaactgttttctccgcaattcctttttttaactatttggtcttgcaacttgtgtttttatcagattatttctgcacgattggcagtccattcaattcaaggttgaaattttttacagaagagctaatgtgttaatagtataaatcaagtggatacttctagcataatagagaactgtcttgatttccttgcccaaaaaaaaagaggaccgagtggtttttaatctatttctgattaagtcagtgtatgaaaaaaaaaatcagctaccacttatctttctttcatgaagaaccccctttttcttaacaaagcatactctccgtatagccatggaagtatatattaattacataaaacagaaagactgtatgacattttttttgtgaatatgtaaaggtagccattactatctttttattagcctcatttttcttgagcaaatgagaaaaaagtataaaatacaaaaagtcaaatcatgtggtgaacgattatgttctcaatagtgctttcattaaagtgtttgggaccatgtattgttgggtagcattgccatactccactgatatgtggttgagaatggtgatgtggatgcacatttaaggccgatagtttgatgctgcttctttttttctccaagtggcagatttatcacatgtggataatagatattaggttcatctgtttggaatgcatatgtacagtgaaagatgtactatggcaccgacatcttatgaaataatttagagatcacattgtcttatgaacatattgaatatggttaaaacttgtgaatatcagattatcagttcagtataaattaatttacttctggagtttatctgtattgaaatttattccgtaaattgtatctgttaactgtagtagtgctgcagaaactctgcctgaggcagtccatatcttttctccttttactacattgtagactaccgtagaccatatgatcctgccattcttaacatgcatgcaattgaagcaatttggctatgatacttactagattgcccagtaaatatatgctaattttaggaaaatagttgttatgcattaacagtcccccgactaaattagtctaatcttttcgtaatgtttatttaatttattgtgcaggaatgaatgttataaccagcattgcaactattcctacctataaaccagctgaaaggatccgcttcttcaatgattttgcccagttgattggtgatgaaagagctcaaactgctcgagcgttgtgggatcgcccgctaaaaactgtttatatcagtgattgcggagagctaaaagtgaccaaaccatcactttcccctccaagtctgccataaaaaaccacagaggcaattttgtgtacctacacttattcttctccctccaatgtcaactgtatatatgccatctagtattaactgacatctgctgtgtttctggcccaaaatgtgtacgacgggtctctgattcatcgaagtaaatatattacagtgctgtgcaaaattcttgacctgtcagctttcatcttggataaccgttgagactatgatgctaatgattagcttctc</dnaseqindica>
External Link(s)	NCBI Gene:Os08g0292600, RefSeq:Os08g0292600