Os08g0308100
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os08g0308100 |
|---|---|
| Description |
Similar to TGF-beta receptor-interacting protein 1 |
| Version |
NM_001068043.1 GI:115475823 GeneID:4345234 |
| Length |
6696 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0308100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:12994971..13001666 |
| Sequence Coding Region |
12995449..12995524,12996704..12996783,12996901..12996987,13000013..13000102,13000206..13000325 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:12994971..13001666 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:12994971..13001666 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaggccgatcctgatgaaggggcacgagcgcccgctcacgttcctccggtacaaccgcgacggggacctcctcttctcctgcgccaaggaccacacccccaacgtctggttcgccgacaacggcgaccgcctcggcacctaccgcggccacaacggcgccgtctggtcctgcgacgtctcccgcgactccacccgcctcatcaccggcagcgccgaccagaccgccaagctctgggacgtgcagaccgggagggagctcttcaccttccgcttcgacgcccccgcccgctccgttgaatttgccattggcgacggcctcgccgtcatcaccaccgacaacttcatggagaacgtgcccaccgcccaggtcaagcgcatcgccgaggaccccgatgaccagtcggaggagtctcttctcgtgattactggcatcaaggggaggatcaacagggccgtgtgggggccgttgaacaggactatcatcaccgccggtgaggatgctaccatccgcatttgggacacagagactggacaatgtctgaaggagtcagacaaagagcaaggacatcagaaaacaattacttcactttcaaaatctgcagattggtcgcatttcctaacaggctccttggataagtctgctaagctatgggatacaagaactctgacgctgatcaagacatatgtcactgagcgacctgttaatgctgttgacatttctcctcttcttgaccatgtggttattggaggtggtcaagatgcgatgaatgtgactatgacagatcgtcgtgcaggaaaatttgaagcgaaattttttcacaagattttgcaagaggaaattggtggtgttaaaggccattttggaccaattaacgcgctggcatttaatcctgatgggcggagcttttcgagtggtggtgaagatggatatgtaaggctgcaccattttgattctgactacttcaacatcaagatttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRPILMKGHERPLTFLRYNRDGDLLFSCAKDHTPNVWFADNGDR LGTYRGHNGAVWSCDVSRDSTRLITGSADQTAKLWDVQTGRELFTFRFDAPARSVEFA IGDGLAVITTDNFMENVPTAQVKRIAEDPDDQSEESLLVITGIKGRINRAVWGPLNRT IITAGEDATIRIWDTETGQCLKESDKEQGHQKTITSLSKSADWSHFLTGSLDKSAKLW DTRTLTLIKTYVTERPVNAVDISPLLDHVVIGGGQDAMNVTMTDRRAGKFEAKFFHKI LQEEIGGVKGHFGPINALAFNPDGRSFSSGGEDGYVRLHHFDSDYFNIKI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6143..6218#4884..4963#4680..4766#1565..1654#1342..1461#622..749#148..547#gccagcacaaaatccccaatccacccgcgagctagggtttttccgcgccgccgcaccccactcgacccagatcccccaacctcctcttcctaaccctaccacccttcctccccggcggcggcgagaagcagtagcccgacagcgaagatgaggccgatcctgatgaaggggcacgagcgcccgctcacgttcctccggtacaaccgcgacggggacctcctcttctcctgcgccaaggaccacacccccaacgtctggttcgccgacaacggcgaccgcctcggcacctaccgcggccacaacggcgccgtctggtcctgcgacgtctcccgcgactccacccgcctcatcaccggcagcgccgaccagaccgccaagctctgggacgtgcagaccgggagggagctcttcaccttccgcttcgacgcccccgcccgctccgttgaatttgccattggcgacggcctcgccgtcatcaccaccgacaacttcatggagaacgtgcccaccgcccaggtcaagcgcatcgccgaggaccccgatgaccgtaagacgcgtctccggtctccttctagttggaagcttctggatgtgttctaaagtgtgtggttgtggatgcagagtcggaggagtctcttctcgtgattactggcatcaaggggaggatcaacagggccgtgtgggggccgttgaacaggactatcatcaccgccggtgaggatgctaccatccgcatttgggacacagaggttagctcggattacctatttgcactagttctaccgaccattggtgctacttctactcatcactagtactaggtgcttggtgctcgtcaggaatataccatttgcttataattatggacatgtttgcttataattatgaacacgtagttctcttgtataggatcatttgacgtacctggactgacaagtgaagtttgatagttaaatatgttgccggatatgattgaaaaatcactgataagcatgtgtgattgtcacagtttgttattgatggcaacattatgcattaacaagacaaatgttaactcgttgaaccggcgataaataccttgcaggcttctcgatttaaattgactctgggaatatatataggcaatggcaaaatggtgttttgtgttgtttgcacactaaccgaaaacatgctacatttaatgcataaatgcataacgtatactttccaggttatatgttgccatttgaccttgtattatattatacatgcaagctatctaactgtgggggaatgtacatgcttctcggtcaactttatcatggtaatgttttacattctgtttggttttggcatgtacagactggacaatgtctgaaggagtcagacaaagagcaaggacatcagaaaacaattacttcactttcaaaatctgcagattggtcgcatttcctaacaggctccttggataagtctgctaaggtgatattttgttgaagctgctagcataatcatgtcttcaattgtttgtactttgtacttcaaatatgattatttactgacatgcacattgctatctggatagctatgggatacaagaactctgacgctgatcaagacatatgtcactgagcgacctgttaatgctgttgacatttctcctcttcttgaccatgtatgtgcctatgtcacaatacgtaatattcttctataggtgcaattcttttataatcacgttacatatggtcatgccttaagttacttggttttatgtcttgctaattggatgtgttcccaatatgttattgtttggatagaaatgcctatggcctccatttctttattttgctttgaagaaaacttctttatttgttgaagttggatattacttcattttttcgatgattttggctgtcacaatttttttcttagttttgagtcgttttctttctatgattagtttactataagacagtagagcaacaaatgatccattcacatacttattatctgcaattagtacttctacatgtatagataacaatgaatatacagcgggaagtgcaaagcacctatgtactgtccagcacatcttttgaccctggatttaccccaattctatataatttatttgagtaatgttggctgtcatggatttgtatttgtactaacactggaaaaatgtctaattggccacatctgtattgttcacctgtaatttattactgtaacgagtagtcagtcttgttctcactagtaatatgcccatgctaatgctacggaaccattatatttttgaaaaaaactatgaaaattgtcatgttagtgaaaacaatgttcatatgtccaattgagattttaattcgatttaagttgtatatgaaatatatttaacgcaaagagcagtaattatattgcctgaagataatgattcatgaccatcgataattatatagaatcgcgtcaatatacattatacgagggcaatatatatgcacaataaaaagaatggtgggaagttattccattaattcgttccaagtccaaaaataaagcatttgatacaatatagaatataacctacaactaattaactaatcctaactttgaatatttggtattgacttagaaattcttaggttctctatcaaggggtgcaagttggctggcccactaacccacttatagtaactgagtaacctggcgggttacccacttgtttgtactattagtgggtttgcgggccggcccacttgcacccttaatttctaataatacctattataggctggggaaatcctaataacacctttaagttggaggttgggatgcttgggtgtgaggaaggcaggtcacatgctgtcaggaatcaggaacttcagtccatgggaaccattagtgcgtccatcttaatggttcaccaaaaataagctttattagccatcacgaaggtgtaaaataaaatctttttacttcatctaccaaaagcagtggatggcagaaacatcaaccttcggtcagttcatgcatcttgaaaaatataaggcttgatgacattttatatgcacggataatttaacctgccattaatcattatcttggccctagcttatttgtattccacaaatttctgaagcagaagaagcatctctgcatatttatcctcatagttctgaatacacataggtaaaagagaaatgcattcttcagtcttggtgagacaaaatgaacagttaagaagattaggttcctttactatggacttaaccaaaacacaatttattactacacagctttagtaccgctaatatcatcaatccattttgtctattatctttgctgttacagcattgctgcaaattactcatcagttgtgacaagaaaagctgtattttctttgagtgatggcagtttaaatttataggaacatgagcatgccattctcaagtaagatatcatctacaatgtacaggagactggtcatatgcacattatctttttgtcagtagtacctttctggctttctcccaaaattcatggcagaaccagagtaggacaatgataattataaaaattataccttcattggattgacttatagcacatacaaatagaaaggttaggcactgcaatttagtagtatttaactgttgatctagaaagcaatggggaaacgatatagctagataagggtcagggttgccatggaggtgatgccatggtgcccaattctggatgtttcaacctttgaataggagaatctagttttcccaaataaatcttaaacctaataacaaactgcagccatgtcatatcggaccaacatcagtgagctcaataacaaaatgtggcgactcgtggatgccacagaggatcgttgccggcatggttttggacgatgggggagctatgccagtagtgatcttgaatgtcgggacctggcagcagccgcggcagagtgagagagtaagaggcggcactacggatcggggtcggcggtggttgttgaggcgtcgatgcagggttgacatctggtctccgatcggcggcaccccgcgtctgtgcaaccggattcggcgacggtgatgggatataggatattagggtttggcggagaaggcgtgatttgggggagaagtggggctgccggggctgggggggtgaagtgatagaggattatcgggtgcgggggaattgataggtgtggccatgtggtggtggggggcaccggtgcgggtgagtgaggggtacgatctaggctgttgaataatagtattgataaatattagctgttgcatttgtaagatgtaagaaatgtgagtctaaaaatgagggatgagtaaaatgagttgttgaattgtagggtaggctcgtatttcaactactaaccataagggcatcaccaatgtatatggcaaaagtgatccatatagatggggcccacataaagagactttaactatagcaaccttcacaatgtatatatatatagcaaatagtattaggaggagagaagaagtagagacaaataatatattttattctctatgggtagcccatatgcttatgggtagcttttgttatttctttgctatggactagttccacaatgttgctaggtagttgaatgaaatattatattgcttatggaccacttttggactacattgtggatgccctaagaaatcttgttgtgttaggtggttattggaggtggtcaagatgcgatgaatgtgactatgacagatcgtcgtgcaggaaaatttgaagcgaaattttttcacaaggtcagttcttcgcacatagtttccatcttatgttttagtgagaacaatgatcgtgtggttatcttttcaaagttatattttgctgttcaagaatgagagttctatatttttctttagattttgcaagaggaaattggtggtgttaaaggccattttggaccaattaacgcgctggcatttaatcctgatgggcggaggtaatattcttaatacatgtatttgtatttacgttctgcccctgcacttatgttcttgattagctttttcccatatttgtgtgctttttgctcaatgattaacccatgcaccatggcaatacacgctattctgaatcatattaagatgccataaacattatgagagcagattctattttgtattttatctgaccatgtagatttttaatacattcttgtggttctagtggttattatgttcccatgggcatctctccttttacttgaagctcttacttttgtattgttgtacaacaactcatcattcacctttgccattttaatccaccacctctctagttttgtcccttaaattgattcattggtcatgtttgccatagttgttctctattgaattcttatgctgctgtttgtacatatgagaaccatgccatgtccaatatttaatttgataacctgttagtgcacaattgagttgcattcttagatgtttgaagtgttgtttatgtctaatgattttgaagctcaatgcaatcaagttggttttatacgctattctgattggagtgtttttttattaggacttatgagagctatctttcctcccaacatcggattaattaattatttgccacttttacggatggtgataaatgatttgccattggacccacatgtcatagacacatgagggcccacatgtcatagacagcgagtggcaaataattaattgccacatcttaaaagtggcctagagttaaatgtcccaggtgtttttgtattgattcaatgtatgtgcaggagtcttcattactattccaatgcatttttcattgggagccactattactgtatctgaaaattgtatagtatttcagcataaaagaagtttaaaaaattgtaaattagatttgacgatatctcagtgggggcaccgctggccttctaatgattgctgtatactttgattttatctcagggtggctcaatgattgttgccaatcacatttggtcatatatgctattctgatttctattggtgaaaacgaatttatgagagctgctttatgtgatgactagttctcttcaagcatgttttttttctctcatgtgatggttaattaaagtgtttttgctttgagcttcagttattcatatctatgatgcgatgttaaacagcttttcgagtggtggtgaagatggatatgtaaggctgcaccattttgattctgactacttcaacatcaagatttaaacctagaagttctgaaactctgaggtaaaatgcccttcggcagcaaagctaatacactgcatcttactgagttcttttttttttttcttttgcaactagtgaagtttccatttgcaattatttgtgatatactccgtattagacagtgtaccgttgggcgttggcctaaccagcttttcttgaacttgtctccaggctgcacttgagaaaggccaaaggtataccttctggttgggcattgttgtttaatctccatcaatctccgtcgtgtggagagtctcaggtgcagtgtttagcaactgatggagtacttgtcggactttcttgttgcactggacatccagctttatagatgcttgagagattttgtacattcagcaatcgaaggctccttatactgcaaaactagcttaatttgcttttcatcattcttggttcacttcttccatatatcaagttttgggcagatgatttgtct</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
