Os08g0509400
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0509400 |
|---|---|
| Description |
Similar to Amygdalin hydrolase isoform AH I precursor (EC 3.2.1.117) |
| Version |
NM_001068737.1 GI:115477211 GeneID:4345996 |
| Length |
6786 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0509400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:25348155..25354940 |
| Sequence Coding Region |
25348422..25348587,25350820..25350928,25351268..25351370,25351493..25351523,25352829..25353425 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:25348155..25354940 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>agctcgatcgtcggcagccaggctaatcttgccatggatcgtcggctccttctctctgctctactgttcatcgctctggcttgcagctccaaccgcgtccatggcgcactcaacaggcacagcttccccgaggggttcctcttcggcaccggcacctccgcgtatcagtacgagggtgctgtcgacaagcgaggtcagaacatctgggacaccttcagccgcattccaggtaaaatcgcagatggtagcaatgcagatatagcgaatgacttctatcatcggtacaaggaggatttgaacctcatcaccgcgatgaacatggattccttccggttctccattgcatggagcaggattttaccaaatggaaccattagtggaggaataaacaaagaaggggtcgaattctacaacagcctcatcaacgaggtcatagctaaaggactgaagccttttgtcacaattttccactttgacactccacaggctttggaggataaatatggcggcttcttgagcgaaaacatcgtgaaggactacgtggattatgcggacctttgcttcagcctgttcggcgaccgcgtgaagctatggaacacgttcaacgagccgacgatcttctgcatgaacggctacgccaccggcatcatggcgccggggcggtgctcgccgtacgcgtcggcgtcgtgcgccgccggcggcgactccggcagggagccgtacgtggcggggcaccacctcctcgtcgcccacgccgaggccgtccgcctgtacagggccaggtaccgggcggcgcacggcggcgaggtcggcatcacgcaggtgtcgcactggttcgagccgtacgacgccggctccgccgccgaccggcgcgcgcggcggcgcgccctcgacttcatgctcgggtggttcatgcaccccgtggcgcacggcgagtacccgccggcgatgaggaggctcgtcggcggccggctgccggcgttcaccgccgagcagtcggagatgctcaggggttcgttcgacttcatcggcctcaactactacacctccaactacgccgtggccgcgccaccgcccaacaagctccacccttcctacctgactgacaattgggtcaacgcgacaggttaccgcaatagcatcccgattggtccaccggcttacacgccgatcttctttaactatccgccggggctacgcgagctgctgctgtacgtcaagaggagatacaacaatcccaccatctacatcaccgagaacggcactgacgaggcgaataacagcacgatccccatatccgaggcgctcaaggacgagacgcggatcggcttccactacaagcacctccagttcgtgcacaaggccatccaggagggtgtgaaggtgaagggttactttacatggacgttcatggactgcttcgagttcggcgatgggttcaaggaccggttcggcctcatctatgtcgaccgcgccacgctcgcgaggtttcgcaagaagtccagctactggttcgcggatttcctccgtcgatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>SSIVGSQANLAMDRRLLLSALLFIALACSSNRVHGALNRHSFPE GFLFGTGTSAYQYEGAVDKRGQNIWDTFSRIPGKIADGSNADIANDFYHRYKEDLNLI TAMNMDSFRFSIAWSRILPNGTISGGINKEGVEFYNSLINEVIAKGLKPFVTIFHFDT PQALEDKYGGFLSENIVKDYVDYADLCFSLFGDRVKLWNTFNEPTIFCMNGYATGIMA PGRCSPYASASCAAGGDSGREPYVAGHHLLVAHAEAVRLYRARYRAAHGGEVGITQVS HWFEPYDAGSAADRRARRRALDFMLGWFMHPVAHGEYPPAMRRLVGGRLPAFTAEQSE MLRGSFDFIGLNYYTSNYAVAAPPPNKLHPSYLTDNWVNATGYRNSIPIGPPAYTPIF FNYPPGLRELLLYVKRRYNNPTIYITENGTDEANNSTIPISEALKDETRIGFHYKHLQ FVHKAIQEGVKVKGYFTWTFMDCFEFGDGFKDRFGLIYVDRATLARFRKKSSYWFADF LRR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6354..6519#4013..4121#3571..3673#3418..3448#1516..2112#1076..1162#871..949#669..744#529..587#293..353#1..168#agctcgatcgtcggcagccaggctaatcttgccatggatcgtcggctccttctctctgctctactgttcatcgctctggcttgcagctccaaccgcgtccatggcgcactcaacaggcacagcttccccgaggggttcctcttcggcaccggcacctccgcgtatcaggttaattcaccaccgctccatctttgattcctacaccgcagcatcgaatcttttcaggttcttgctcagctcactcgccattgttcttcttgaacgattttctctgacatagtatgatgtgcagtacgagggtgctgtcgacaagcgaggtcagaacatctgggacaccttcagccgcattccaggtcatctttggtgctttgcctcgatatgtttcagagattatttgcagctaaattgtttgcagctaagcgcgttatcttgaacttagcagcagcatttgcggtcgagatgctaattaatcaaccaggaattattggatttgattgtaaaaagagcatgcttttttttctcttgcaggtaaaatcgcagatggtagcaatgcagatatagcgaatgacttctatcatcggtacaaggtgattccttttctgcttatgaggaatttgtaattttgtgtccgtttagttgagtccatggtaaattctgaaactgtgcaggaggatttgaacctcatcaccgcgatgaacatggattccttccggttctccattgcatggagcaggattttaccaagtcagtgagcatacaaacccaaagaattcgatttatcattagccattaccatcttgattatagctcaaccttatcattaagctggttttgaaattttttaactggtcagctgcttaattatttcagatggaaccattagtggaggaataaacaaagaaggggtcgaattctacaacagcctcatcaacgaggtcatagctaaaggcatgcaagtccattcttatctctttctttacatgtataaaaatataacatatttccttgatatctcatttcttaaagaaatttaaaaggaactcattttaccctgacaaatgttcatgcctgcaggactgaagccttttgtcacaattttccactttgacactccacaggctttggaggataaatatggcggcttcttgagcgaaaacatcgtgtaatttactccataaatcactatcactattcgctgctaattatttcatctattctaatatataaatatttctatccatttttcaaaacgtgtacagacgaaggaatgtctagatacatttttaaaaacacaaaaggaattaaaacgaagatagtaattaattaaccttgagctcgatggagaactcatgaacattcatattaaggttttgagttcaaatatctataggagcgaatttcagattaaattatttaaggggttaagttttcgatttaaaaggctatatatattccgttaaatgtagagaccaggtaaagaaaacctttcctaaaaatttttttaaaaatgaacaggaaggactacgtggattatgcggacctttgcttcagcctgttcggcgaccgcgtgaagctatggaacacgttcaacgagccgacgatcttctgcatgaacggctacgccaccggcatcatggcgccggggcggtgctcgccgtacgcgtcggcgtcgtgcgccgccggcggcgactccggcagggagccgtacgtggcggggcaccacctcctcgtcgcccacgccgaggccgtccgcctgtacagggccaggtaccgggcggcgcacggcggcgaggtcggcatcacgcaggtgtcgcactggttcgagccgtacgacgccggctccgccgccgaccggcgcgcgcggcggcgcgccctcgacttcatgctcgggtggttcatgcaccccgtggcgcacggcgagtacccgccggcgatgaggaggctcgtcggcggccggctgccggcgttcaccgccgagcagtcggagatgctcaggggttcgttcgacttcatcggcctcaactactacacctccaactacgccgtggccgcgccaccgcccaacaagctccacccttcctacctgactgacaattgggtcaacgcgacaggcatgcatacaaccccatctgttttttaagggcatttaacttttttttcactatttatgatgtgataattaagaatttaccactcatagcctataacatgtgtatttttatatgtctatgatatatgagttcataggcaaattcttaattgctacttataaaagtggcaaatagttaaatatcttgtcttttaagaccaccatatatacttcaagagaaaattttacgaatagtaaatctaaattttatactccctctccgtttcatattcatatatatatatatatatatatatatatgctaatgaatctatacacatatatgtctagatttattaacatctatatgaatatgaacaatggtaaaaagtcttataatatgaaacggatgaagtaatatacattaaaagatgtggtatattgtgataccgtcttaaggatgataaaatcatctatagttcaatgtccatgctttaatatggcggtagaaaaacaaccagaattgtttaaattgaatctaaaatgatgttattgtgctaatttgtatataatcagaaaaccaacttattcgtgtttatattagtaagattataagtaaagatccaaacacaattttgtatgaataataagttaatgatcatgagaataaaggaaacaacaaagatagtaattgtttttcttgttgggcactttttggttgcttgaggattggtcagaagttcatccactcatatcattatttaggccgagtttagttctaaaatttttctttaaactttcaacttttccatcacatcaaaactttcctacacacataaacttctaactttttcgtcaaatcgttctaatttcaaccaaacttccattttttgcgtgaactaaacacacccttaagagtcctactatattcccgtgcatatagaatagtggtgatggttggtggtagacccataaccgtcactaatagaatcttttaaaagttggatcaaccaaggcaaatctagataaaaatgtgtaatattctgtactacatttgttttttaatgaaacataggaagtacaatagtacacattaacttggggtgtgtttagttcacgctaaaattaaaagtttggttaaaattggaacgatgtgatggaaaagttagaagtttacgtgtgtaggaaagttttaatgtgatggaaaaattagaagtttgaagaaaaattttagaactaaactcggccttggttgaaatcgttgcagttaattaagatttgtgcgtgaaaagtttaacaaaaactcgttgttcgattcaattcgcaggttaccgcaatagcatcccgattggtccaccggtaggttgctcaaatgaatgaatgaatgaatgatttacgacgacaaatagtagagtggcttgtacagttgtactgtatcgagtctgtttaactgaactttcgccgtatctctgaatgatcaggcttacacgccgatcttctttaactatccgccggggctacgcgagctgctgctgtacgtcaagaggagatacaacaatcccaccatctacatcaccgagaacggtaacttatgtctgtttttttattcaggaaaagcagggagaatggtaataaatctcaacagtaacaatcaacagttctccagcagaatgagtactccattcgtctaaagataaattaatttttcacatatcccaaaggtatcaatactaaataaaaagactaggacacctctattttattaaattcaaatgtaattatttcttaatgtatttatccactgttttttataaacttcaatgttatgattacttaaaaacaaacctatttttaacaaacattaagattaaaaataatcttattgtaggacggtagaagtatgaatttgttgcgtacgtgcaggcactgacgaggcgaataacagcacgatccccatatccgaggcgctcaaggacgagacgcggatcggcttccactacaagcacctccagttcgtgcacaaggccatccagtacgagcgcattactcaacccatttttttttcaatatttttagataataatccggcatttatttcagctaaagttataaccacttattaaataaaactagaatagtggcccacgcgacgcgtgggcattcgtattgttaaaacatgatattatagattatttggaaattatatctcataagggtaaactataggctgggcatatctaaatatcattcatcgacttatatgataataaatcaaggtcatatgagttcgacttgtggataagtaagtaaatattatgtatactatctgaatacatactgtacactattgctataaacacaaactgtaatggtaagaaatttaaagttattgtgattgaatcgccttatgaggatgcgatttagtaacaaccaaattaagggtagattaacggttggattgttgtttcctttgtagaagttcaaaatgttcatatttttccacacatttaaagaattgaaggctttttatgttggaacacaaatcatctacacaattgcttggtttagtagtgcaaaaatatcagcaattatttgaagcttttttttgtttttcacatgttaaattgttttctttgaaataatatttgtttgaaataacagagaaattatataaattttattagtatgcggtttatcgacagtcatgatcactttggcaattacttttagctatctcgggtacgatgctttgtcatatgtgcagaaggcaaataagaacacgtgtgtt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