Os08g0544500

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Structured Information

Gene Name	Os08g0544500
Description	Similar to ARP2/3 regulatory protein subunit NAPP
Version	NM_001068941.1 GI:115477620 GeneID:4346211
Length	12715 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os08g0544500, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 8
Location	Chromosome 8:27365743..27378457
Sequence Coding Region	27366081..27366567,27366999..27367208,27367874..27368871,27369346..27369442,27369525..27369640 ,27369712..27369837,27370370..27370480,27370594..27370675,27371091..27371236 ,27371704..27371897,27372291..27372369,27372450..27372554,27373116..27373248 ,27373542..27373684,27373765..27373809,27374077..27374184,27374319..27374444 ,27374999..27375083,27375605..27375687,27375792..27375872,27375956..27376036 ,27377207..27377281,27377359..27377745
Expression	GEO Profiles:Os08g0544500
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008401:27365743..27378457 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008401:27365743..27378457 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>ttgttctgtactcaaaacatggcccatgtttcgttcaaatccaaggaagctgacagcatgtcccgctggtcgaagtaccttagtactgaagagtcacccccttcagcatcactaagctggagggctatgggtgtcgatggccctcaaggttctgcaagtggccagaaacatcttcagatggagccagttgtccaactgtcaaaggtcgctgaaggattgttagccaaaatgtataggctgaatagcatcttggactatccagatccaaatgcgcacacattttcagaagcattttggaaagctggtgttatgccaaatttcccaaaaatttgcatcacattgtcaaagaaatttcctgaacatcctaacaagctgcagcttgaaaaagtagataagtttgctcttgatgcgctgaatgaaaacgcagaaggttacatgcaaaaccttgagcaatggatcacgttgcttcttgatttgctggaattccgtgaacaagctcttcgacttattttagatctgagcagcacagtcataacattgctgccacatcagaactctttaattcttcatgcttttatggatctcttttgctcttttgtgcgagttaaccttttctctgacaagataccaagaaagatgatcctccaagtttacaatatcttgcatatcatgctaaagggtggccgtgattgtgaattttatcatcgattggttcagtttgtggacttatatgatccaccagtcaaggggttgcatgaagatctaaattttgtgagcccacgtattggagaggtcctggaggctgttggcccaattatctttctttcaactgatacaaaaaagttaagaaatgaagggttcctcagtccatttcatccacgttatcctgacatccttacaaactctgctcatcctatgagggcccaagacctggctaatgtaacatcatatcgtgaatgggttcttcttggatatcttgtttgtccagatgaactacttcgagtgaccagtatagatgttgcaatggttgttctgaaagaaaatttagtactctccctgttcagagatgagtacatcttactccatgagaactatcaactctatgtccttccaaaagttttagaatcgaagagaatggctaaatctggacgtactaagcaaaaggaagctgatctggaatacaatgttgcaaagcaggttgagaaaatgttaatggaagtacatgaacaagcattggtgtcagctgatgctctacatcatgaaaggagaattcttctgaaacaggaaattggaaggatggttttgtttttcacagatcaacctagtcttcttgctcctaatattcagatggtcttttctgctcttgctttggctcaatgtgaggtggtttggtacttccagcatgtggggattgcatcatcgaaatctagtcgagggagaacagttgacattgatgcggcagacccaactattggattcctattagatggaatgggcaaactttgttgcctggttcgtaaatatatagcagcaataaaaggttatgcattatcatacttgtcatcttgtgctggaagaatacggttcttacttggtactccaggcatggttgctcttgacctagatgccacactgaagggcctgttccagcaagtcctccattgtctggaaaacattccgaaacctcagggggaaaatgtccctgctattacttgtgacttaactgatttgcggaagcactggctatccatcttgatgattgtcacatcatcacgatcatctgtaaatattagacatttggagaaggctactgtgtctactgggaaggagggcctggtctcagaaggcaatgctgcttacaattggtctagatgtgtggatgaacttgagggccagctttccaaacatggaagcctgaaaaaactttacttctaccatcagcatcttacaacggtcttcagaaacacaatgtttggtccagaaggccgtccccaacattgttgtgcgtggcttggagcagcttgctgctttccagaatgtgcttcttccattattcctgaagaggtcaacaagattggcagagattctatctcatatgttgagtcccttatcgagtctataatgggtggattggaaggtttgataaatattctagattcagaaggtggatttggttcattagagatgcagctttcgccagagcaagcagctatccgattgaataatgcaacaagagcaaaagctgtttcaggcttgttagcaccagggcatgagagctatcctgataatagttcttcagttaagatgctggaagctgctatgcaaaggctgacaagtctatgctctgtgctaaatgacatggagcctatttgtgttctcaatcatgtttttattctccgagagtacatgagggactgcatcataggtaattttaggagaagatttcacagcatgattagaactgatagctgccttcaacgaccatcagtcatagaatctcttctaagaagacacctgagcatcatccatctggcagagcagcatatcagtatggaccttactgaaggtatacgggaagtgctacttgcagagagttttactgggccatttcccaacctgcaagtatttgagacaccaacagaaacacatggaggaggatctgccatagacataatatctaattggtatattgataacttcgtaaaggatgcatctcgcactggagttgtttttgatgcatctcagaattgctttaggagctcacagcctattggtggtggatatttagcggaagcattcacagataaaagagaactcaaagcacttgttcgtttatttggtggttatggagtagataggctggataagttgttaagggaacatacatcagctctactaaattgcattgactcagcgcttaggtcaaaccgcgatgccttagagggccttgctggaagtgtaaactctggtgataggattgaaagagatgcaaatctaaagcagataattgacatcgaaacattggctgacttctgtatccaggcaggtcaggcaataacttttcgccggttgttggtagaagctgttggagctgttcttgaagagaaagtacctctcatatattctctgctcaagggattagctatgcagttgccagaagaggtacctgataaaaatgagatcattagactaagaagggttgctagcagtgttggtgtcggtgacaaacatgatgccgagtgggttcattctattctggcagaaataggttctgctaatgataattcttggaccttacttccatatctttgcgctgcatttatggcatccaatatgtggagcactactgcttatgatgtcaatacaggtggattcagtaacaatttgcattgcttagcaaggtgtgtaagtgctgtggttggaggaagtgaatacactaggatggaaagggaacatcggagaagttcactttcaaatgggcatatggatgagctgcaagagcctgaattactgagccgtgtctcagctgaagcaaatattaaatctgctatgcaactctatgtcaaattgtctgcagggttagtcctggattcatggaatgacactagcaggccatacattgttccaaagctaatattcctcgatcaactctgtgagatgtccccctacctcccaaggagcaccttagaagttcacataccttacacgattctgcgttcaatctaccatcaattatatggagcttcactgatggccacagaaccaatggagccatccccaaggcagtcccctctgatatctctggctcatgcatcaccatcaatgaagcaaaatcgagcagacacaacgcccaggtctcatactttcgagcctggataccacagttcatctgggtcccagtacgatgaaggttatgaaggggatagaagaactggagagaggcaactccgaagcatgaggcgatctgggccactagattacactggaaccaggaaagtgaagtttgtggagggttcaagttctggaagccatggggctggctcaggctcactacagagatttgctgtgtcaagatctggccccctatcctacaaataa</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>LFCTQNMAHVSFKSKEADSMSRWSKYLSTEESPPSASLSWRAMG VDGPQGSASGQKHLQMEPVVQLSKVAEGLLAKMYRLNSILDYPDPNAHTFSEAFWKAG VMPNFPKICITLSKKFPEHPNKLQLEKVDKFALDALNENAEGYMQNLEQWITLLLDLL EFREQALRLILDLSSTVITLLPHQNSLILHAFMDLFCSFVRVNLFSDKIPRKMILQVY NILHIMLKGGRDCEFYHRLVQFVDLYDPPVKGLHEDLNFVSPRIGEVLEAVGPIIFLS TDTKKLRNEGFLSPFHPRYPDILTNSAHPMRAQDLANVTSYREWVLLGYLVCPDELLR VTSIDVAMVVLKENLVLSLFRDEYILLHENYQLYVLPKVLESKRMAKSGRTKQKEADL EYNVAKQVEKMLMEVHEQALVSADALHHERRILLKQEIGRMVLFFTDQPSLLAPNIQM VFSALALAQCEVVWYFQHVGIASSKSSRGRTVDIDAADPTIGFLLDGMGKLCCLVRKY IAAIKGYALSYLSSCAGRIRFLLGTPGMVALDLDATLKGLFQQVLHCLENIPKPQGEN VPAITCDLTDLRKHWLSILMIVTSSRSSVNIRHLEKATVSTGKEGLVSEGNAAYNWSR CVDELEGQLSKHGSLKKLYFYHQHLTTVFRNTMFGPEGRPQHCCAWLGAACCFPECAS SIIPEEVNKIGRDSISYVESLIESIMGGLEGLINILDSEGGFGSLEMQLSPEQAAIRL NNATRAKAVSGLLAPGHESYPDNSSSVKMLEAAMQRLTSLCSVLNDMEPICVLNHVFI LREYMRDCIIGNFRRRFHSMIRTDSCLQRPSVIESLLRRHLSIIHLAEQHISMDLTEG IREVLLAESFTGPFPNLQVFETPTETHGGGSAIDIISNWYIDNFVKDASRTGVVFDAS QNCFRSSQPIGGGYLAEAFTDKRELKALVRLFGGYGVDRLDKLLREHTSALLNCIDSA LRSNRDALEGLAGSVNSGDRIERDANLKQIIDIETLADFCIQAGQAITFRRLLVEAVG AVLEEKVPLIYSLLKGLAMQLPEEVPDKNEIIRLRRVASSVGVGDKHDAEWVHSILAE IGSANDNSWTLLPYLCAAFMASNMWSTTAYDVNTGGFSNNLHCLARCVSAVVGGSEYT RMEREHRRSSLSNGHMDELQEPELLSRVSAEANIKSAMQLYVKLSAGLVLDSWNDTSR PYIVPKLIFLDQLCEMSPYLPRSTLEVHIPYTILRSIYHQLYGASLMATEPMEPSPRQ SPLISLAHASPSMKQNRADTTPRSHTFEPGYHSSSGSQYDEGYEGDRRTGERQLRSMR RSGPLDYTGTRKVKFVEGSSSGSHGAGSGSLQRFAVSRSGPLSYK</aaseq>
Gene 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External Link(s)	NCBI Gene:Os08g0544500, RefSeq:Os08g0544500