Os09g0109500

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os09g0109500

Description

UNC-50 family protein

Version

NM_001069101.1 GI:115477941 GeneID:4346386

Length

5640 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0109500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:801553..807192

Sequence Coding Region

801903..801958,802035..802106,802191..802313,802389..802447,802729..802794
,804131..804226,804473..804563,805236..805261,806023..806090
,807041..807127

Expression

GEO Profiles:Os09g0109500

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008402:801553..807192 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgctgcccacgacggcgtccaaagggcgcggcgccgcccgctctgcgccgccgctcttcggcccctacctccgccgcatcgtcaagtggcaacaaatggatatcgagtacacattttggcaaatggtccatctctgtacttcaccaaaagtagtctatcagcacaccaaatatcacaagcaaacaaagaatcagtgggctcgggatgatcctgcttttgttgtcattctaattcttttccttgtgtttgcaacatcagcttactgtgcagcgtatggagagagtccttcacatgctgctttaacaatcacttcagttgtgcttgtccatttcttgtttgctgggatagttctggccacactttgctggtttcttacaaattcttacttgagggaggaacctaacagtcatgtggttgagcaacgtgtggagtggctctatgcatttgatgttcattgcaactcattcttcccagcctttgtcatcctatatgtgcttcaatattttctatcgcctctgttggtcgcacatggcttctttcctgctctattatcaaacctcttgtttgtggtggcaatttcttattatcactacctgaattttctaggatatgatgttcttccatttttggacagaacaacatttttcttgtacccgattgggcttgtcatcattctctctccactgatgatactcatagggttcaatccaacaagatactttttgagcttgtacttccgttaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MLPTTASKGRGAARSAPPLFGPYLRRIVKWQQMDIEYTFWQMVH LCTSPKVVYQHTKYHKQTKNQWARDDPAFVVILILFLVFATSAYCAAYGESPSHAALT ITSVVLVHFLFAGIVLATLCWFLTNSYLREEPNSHVVEQRVEWLYAFDVHCNSFFPAF VILYVLQYFLSPLLVAHGFFPALLSNLLFVVAISYYHYLNFLGYDVLPFLDRTTFFLY PIGLVIILSPLMILIGFNPTRYFLSLYFR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5235..5290#5087..5158#4880..5002#4746..4804#4399..4464#2967..3062#2630..2720#1932..1957#1103..1170#66..152#gagtggaagcaagcggaagaaggggaggcagatctccctcggccaaccccaagcagatcccgacgatgctgcccacgacggcgtccaaagggcgcggcgccgcccgctctgcgccgccgctcttcggcccctacctccgccgcatcgtcaaggttcgtcgctctcggatctctttcccctcctctttgatctctctcttcgcaggccgtatcaccacatgctgtcgttttaggagccttcaattccacgttagggttccactcccacccgaaatgtcagctctctctcactcgccctatcacagattttcttagcatacctacctcatgtgattgtgtagggaggggatctcgtgtttcagattccttcactattagtgctgatccagtcgtgtcttgtcccgagtgtgctgaggcttacggttggatggccattcggaggtctcacctatttggtgcctgtgtgcatccccactttggaattgcttggccattatttctgattttttgcaaatatctgcattcttggtgcatatatctttcaacaaatttgactaatttaaaaaatactaggtgattcgggggagtagtgcattaagttatattattatatgcaattctcatttacccatgcaatagtgagctgctgctgctgctgctgctgtaaggggagtataaaattgatcttcccaggattactctataaaagcatgtatactaacacatcatgaatactttattttccatcctctgttgcattttttttaattttgaaacaggtttgtggggtacttctttacagcttactctgtggcgttattgttgaatattcctttgatgctaacttttaacttttaagttcatccacagacgtcaaccttaggggaaacctgatcgaaaactattcaagcactgtcttgtgcttcctactgttactacagtgaataaatttggaaaaatattcttgtctttttctggtgcagtcagtagatattccaacataggtttacaacaaatatatgtgtctttctatgctctatatccatgcatcatctgttcttaaggtatttgcaacaatctaatattgttgttctcatcaacagtggcaacaaatggatatcgagtacacattttggcaaatggtccatctctgtacttcaccaaaagtagtgtatgcatcctgccctcagtcctttcttcattgttcgtattatttattttgttacacaaatgcaatctgcaaattttatcatggtaacaacaaacctcttgtataatgaaattcttaatgccaatgttgcataagtgtgtcactcaacctactaagtttttattatggatgctcttgtgtgggcataactatcatggaatggaacattgatttcgataaattctcgaggaatctagttttgaactttagtacttctattaccattactgtcataaacccagttcaacgactgagctataacatgaccacctaattcacctgtggctgcatagaacactctgggttcggttctgctgaatgagctgagttaatttcagcacggaaaacaaggtgagccatcaacacatgattaattaacaatcaactatgataaacttgaaaaatggatttatttgatttttaaaagaaacttctatatggaaattctttgcatgaaatgcaccattagcagttttggaagcatgttcatggtaaatgagggattttctcagcccaacctcacttatgaactcagccttgattagctcatgcttgctacagttgagagatacatcctcatttttagtttcaccacttgaagttattcactgctaatgaattgtccatttgcttcaattttcggtgcttgatgcacatcttattgtttaagaacctgactggcttttgtctatttgtatgcatgttatgatcctggaagacagctatcagcacaccaaatatcacaagcgtatgtggtttactttaacattatttgttactgcggaatgtacgattcattacctgtattctttcgataaccaacttgttgctaagctactcaattctattattttggacataatatttcttgttataaccttgtgatatatattggactattttgatattcccataaaatagctctgtgaccattctttcagccctgagatgcactttttttttatcccgtcattaacatgcacatgtttctacttgttcacatttcctctgtacataccattcaatcctgataacacatttgcgcaattttatttcttacttaaatagtatactatcccgtcaaagctgatgtatattttttttgaaatatgctacagagataatttgagttgacaatgctactgctatttctttgctgtatgatcttgatcggcagacattatcgctattttcttactgtgtgaacttggcactgtagttctcgaagttaaccctgttgaactatgttgaaaccactattaatttatcatttgacattgggcaaacatgccttgtgctcattctgtgaacgttcatatgattatggaaatttgattcattctttactgtggcagccaattaattgctgtgcatttcatattatggaaaaatcctgatttctctcaatacttattttcagaaacaaagaatcagtgggctcgggatgatcctgcttttgttgtcattctaattcttttccttgtgtttgcaacatcagcttactgtgcagcgtgagtcatttacatccttctattttatttgcgggttcctctccatagaatatttgggaatttattttgctgtagaaagcaaagatatcttcttgacagttcaaatctttatcttgcttgggacattcatgtacttacttttattagatgttccatgttttctctctaattttccgttgtacagttaatccattgacttacttttactggttcctcttattgaaaagtaaaattcttgttctttaggtatggagagagtccttcacatgctgctttaacaatcacttcagttgtgcttgtccatttcttgtttgctgggatagttctggccacactttgctggtatgtattgcatgtggtaatgctcacatctttatggagcttaatggtctctgatgattatgaccattaatttttatagcttttcattaagttataataaggaaactattctaacatgaaaacatctctagtatcgagtccattgatgcgaattttacaataaatctagatagtctcaaatatagctgtcacattttaggtcctgtttgaaagtgatgaaatttggatgaatgaggtggatgagatctacttgattatctcgatatattaatattttgaaaaataaacttatcaaacagctaggaacaagttgtctaagcaacgcagtagaataaagttttttgagaaatcatatttttaaaagtgtggcgcaaataatccagggtggattatagctgatcatcatttctgaacagtgtcttagaaatgttgatgacgtgggttctaggaaagtaggactttaaatattgaatgtaggtagtcttaactgtcaggcaaagccctggcagtattttggtccccaaaaaaaaaaagaatggaggtagtagtactaccttgccagcacttcctatgaagttgagtgggagcaaaatccagaatgacctgatttgcacttgtgtcctttttgctgtctgtactctgtacaagcttttgaggtatttatggtgctacagaaaattggaaataacaaaagtaagcttcgagctatatgtttccaaaattctgcaatacacccaatgtaaattgaagctttctagagtaggccagtgggacattgttataagctactatattattttggaacagcttgcttaactatttggcacctttttcttatatgggagtgctgccaggcctttgcctagcaattaaattttataaattaaaataactatacagaacaagaggagagcaaaaagaaataaaccaaaatttacaagccttgtaaccagtctaaaactacttgttggagaggctccttcatcgtacaaacatgcaggagaacttccttcttaaaactgcaaaccaacggtccactcctggagaccttgaaaaatcagtccattttgttgcttccatatatgccaacatgctacaaacatgatctccaaaaaccccttatgctgaaaccgatagcgagtccatgcaaccatctgacaataccattttacaccttgtaaggcatatagcaactttgttggttttagtccacctttttgcctatggtttgttgcaagcagctgtcttgatctgacaagtaatggcttttgttaaaatacacatgtggatcttcaattgagaatcaagagctaatttctgctatactcaaatgcaggtttcttacaaattcttacttgagggaggaacctaacagtcatgtggttgagcaacgtgtggagtggtaaattttgtgttctttcacctgtacatatctattgacttatattgccattgtttacatggaagctaaattgacagtagccagtggcgaacccagaacaaagtttaccatgggtcttatacatactaattatctaattattattcactgatgtactaattagcatggcataaattagctataattagataatctacccaaggtcttgtgatccagggaaactatacgttggtacgccactgacggtcaatatcaataataatggggagaaatttttgcaggctctatgcatttgatgttcattgcaactcattcttcccagcctttgtcatcctatatggtaatattaagtaaatgtgctgtgtatttgaatactggctgtaatgttcatgtatctgacagtttttctcctcagtgcttcaatattttctatcgcctctgttggtcgcacatggcttctttcctgctctattatcaaacctcttgtttgtggtggcaatttcttattatcactacctgaattttctaggatatgatggtaagttcagttttttactaatttaactttgctgcaatgtgtggctgtgctactcctaacaaaagaattggtctttgtgtgtagttcttccatttttggacagaacaacatttttcttgtacccgattgggcttgtcatcattctctctccactgagtaagttcattttatgcagtactgattactgagttaaccacatggcaattgtcacatattttttcacgtcttgcagtgatactcatagggttcaatccaacaagatactttttgagcttgtacttccgttaaggtcgataactagaacagtaagagaagactggtgacaaaactaatggcagattgggtacacactttttactctagcttcttaaatctttgtgtgaatttgaggagagtgaggctcaggaaaaggtcgatttgttcttgagatatattactgccagcgtgggccacgggcacaggccttttggttggagcccattttggtgtcaacttgttcataatatgtattgtttccattgattaaagagtcaaggaccagtgtacaattttagtgggaaccggaacttaagccgattgtatcgaaggggcaccaacattgtaatccacctgcctaagaatcatgagtttttagtggc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0109500, RefSeq:Os09g0109500