Os09g0244000
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0244000 |
|---|---|
| Description |
Reverse transcriptase, RNA-dependent DNA polymerase family protein |
| Version |
NM_001069188.2 GI:297609093 GeneID:4346485 |
| Length |
6999 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0244000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:3890924..3897922 |
| Sequence Coding Region |
3890924..3891954,3892367..3892750,3892863..3892908,3894754..3894834,3894913..3894993 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:3890924..3897922 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008402:3890924..3897922 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgagggggccaagacgtctacggaagttgaacctagatgcacagagcgcaggacatgtgcaagctgaagaagaaaatttgctgtacaactttgaagctctagatgaagcagatgcacaattcaatgacgataatttgcatctcgaagctcaagatgcagggaatgtacaacccacagaagataggccaaatggggaggtacgacgggttctaggaaattttaatgtaaaaaacttggaccaactgaagcaaggaaaggtaattgtagagacggatgaacatggtattccaaatgatagatcaggttctgttctaggctcgtatcttggtaagcttgcacagaattcaacatttgcaccattggacattccaaaatgggaccatgacttatttgtgggaccaaaggagagcatagtcgctgacgtggagttattcatggtaaagatgaaatttgtgtacccttctgagacgaagcagcttacaagagactggattctaatgaaagctgataaagggtggagatcttacaaaagccgtttaaagggaagatactttaatcctgatgtgaggactctaaacgatatattaaaatatgtcccaaaaggtgtcaatggatatcaatggcgtggtcttgttaaaatatggtgtcaggataaacacaagaaattatgtgagaaaaactctgaaagcgcaaaacagcagaggaatccacatacaactggtagaaaaagccatgctaggctttgtaaagagatggaagcaaaagttaaagggaaggtccatgacattgacgtatgggatgaagcacataagaaaaaggatgagcgcattaaggcagtagtggaatcggcttaccatgaattagctaaaaagaaatctactagttgcagtggtctttcatccaaagattatgatgaagtttttcgacgtgtagttggaaaagagacaaaacttcgagggtactacgatcataagaattggagccaaataagggtttctcaaggactagatgttgttggacaatctgaggaatatgcaatgcttaagttacaaatgaatgcaatggaaaataaaatagaggctatgagtgttgatatgactctgatgcgtgccttcatagaacaaaaattccctggagaggattggagaaatattgtggttgcagaacaaaataaagaagttgatatttctgaacaagttggtaatgatatccaacatgaatccaatgttgaagaatcatgtgaacatgtacattctacaccagataatgtgcaggtgcagaagcatttaatcagttatattcctgctaaaaatggttgccacaaaccatctgtaccacatgaacacatgattgccaagcaatcaagcattggaagctttgctagaaggtctgaagctagtcagagatacatggaatcaactatggcacatgaccatggaactgataaggttgatatgtttgatcaagttgacattgactgtacaaatgaatttgataataactttgataattcatttgccaatacctatgctaagtcaaatcatgtgcaacaagtacattctattagttctgctaatggcaatggtcgtcgtttcaatccatctataccatatgaatgcacaaatgctaagcaactaagtggggaaagcttaggcaaaaggtccataacaagtcaaatgaatgtggaatcaatggtgccacgtgagaatgtgaccaatgaggcttatgtttctgaacaagatggtactgatattatgaatgggtttgttcacaaccgtgaggaaccacatgccaatgagaatgctataccaaataatgtgcagcaattatgttctgttagttcaactagagctaaagagaattgttctactaaagctttgccatctgaccacataactgcaaagcaatcaatcattaaaagctctgtcaaaaggactagaactaactgtgtggattcaattttaccacctgataaagccaaacaggatcgtcgaagcggggctgtgattgggactggtcatcgccgtaaagccaatcctgatacttctgttcctaacatgacaccttctcttgatgaattatctacacccactcctgctccatcaccaccactccctatatcacctttcccacatgtatacactcgtcccacacaacccagagagcatctatctactcctacctcctcggcaagtcctgacacccttgtttttgatgaatctaacactattgatgagtcacaggttggtcctaaatgtaatctacgagatcgaactactattgcagctcctgaccgattgggttttcctcatgtgagtgttgtcattccagagccatccacctaccagcaatcttctactattccagaatggcagcttgctatgtctgaggagctcgttgctcttgatcgtatagcggctgggttttcaccaagtgaacatgatcctgctttgtttattcatctctctccacgtggacgtactttgcttctcctatatgttgatgacatgttgattacgggcgatgatgttgaccacatttctcatgtgaagaggcaccttaatgagcaatttcaaatgactgatctgggtccccttagttacttcttgggaattgaggttttgcattcagcaaagggatattatctctctcaatccaaatacatacaagatcttattgtgcgttctggcattactgataataggacagttgcaacacctatggaccttcacttgcaacttcgtggtactgatggtacacctcttgaggatccttctcattatcatcatatagtaggcagccttgtttaccttaccgttactagacttgatattgctcatgccgtccatattttgagtcagtttgtgagtgctcctacttcagttcattttggacatttgcttcgtgtgctgcgatacttaaggggaatatcatctcagtgtttgttctatgctcgtgatagtccgcttcagctgcatgcttactcagactccacttgggcgagtgacccaacggatcgtcgttctgttacaggttattgcattcttcttggctcttcccctcttgcatggaaatccaagaagcaggcggttgtatctcgctctagtacagaggcaaaacttcaagcccttgccactaccacgtctgaaattgtatggcttcgatggttgttagttgactttggtattgtctgtggtgcccccacacctcttctttgtactggagccatacagattgctaatgatcctgtgaagcatgaacttacaaagcatattggtgttgatgcatccttcacccgatctcattgttatcagaaaacaattgctctccagtatgtgccctcagaactgcaagtcgcggactttttctctaaagcacaaactcgtgagcagcatcgtcttcacttgctcaaactcagtgctttagatcctctacttccgccttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MARGPRRLRKLNLDAQSAGHVQAEEENLLYNFEALDEADAQFND DNLHLEAQDAGNVQPTEDRPNGEVRRVLGNFNVKNLDQLKQGKVIVETDEHGIPNDRS GSVLGSYLGKLAQNSTFAPLDIPKWDHDLFVGPKESIVADVELFMVKMKFVYPSETKQ LTRDWILMKADKGWRSYKSRLKGRYFNPDVRTLNDILKYVPKGVNGYQWRGLVKIWCQ DKHKKLCEKNSESAKQQRNPHTTGRKSHARLCKEMEAKVKGKVHDIDVWDEAHKKKDE RIKAVVESAYHELAKKKSTSCSGLSSKDYDEVFRRVVGKETKLRGYYDHKNWSQIRVS QGLDVVGQSEEYAMLKLQMNAMENKIEAMSVDMTLMRAFIEQKFPGEDWRNIVVAEQN KEVDISEQVGNDIQHESNVEESCEHVHSTPDNVQVQKHLISYIPAKNGCHKPSVPHEH MIAKQSSIGSFARRSEASQRYMESTMAHDHGTDKVDMFDQVDIDCTNEFDNNFDNSFA NTYAKSNHVQQVHSISSANGNGRRFNPSIPYECTNAKQLSGESLGKRSITSQMNVESM VPRENVTNEAYVSEQDGTDIMNGFVHNREEPHANENAIPNNVQQLCSVSSTRAKENCS TKALPSDHITAKQSIIKSSVKRTRTNCVDSILPPDKAKQDRRSGAVIGTGHRRKANPD TSVPNMTPSLDELSTPTPAPSPPLPISPFPHVYTRPTQPREHLSTPTSSASPDTLVFD ESNTIDESQVGPKCNLRDRTTIAAPDRLGFPHVSVVIPEPSTYQQSSTIPEWQLAMSE ELVALDRIAAGFSPSEHDPALFIHLSPRGRTLLLLYVDDMLITGDDVDHISHVKRHLN EQFQMTDLGPLSYFLGIEVLHSAKGYYLSQSKYIQDLIVRSGITDNRTVATPMDLHLQ LRGTDGTPLEDPSHYHHIVGSLVYLTVTRLDIAHAVHILSQFVSAPTSVHFGHLLRVL RYLRGISSQCLFYARDSPLQLHAYSDSTWASDPTDRRSVTGYCILLGSSPLAWKSKKQ AVVSRSSTEAKLQALATTTSEIVWLRWLLVDFGIVCGAPTPLLCTGAIQIANDPVKHE LTKHIGVDASFTRSHCYQKTIALQYVPSELQVADFFSKAQTREQHRLHLLKLSALDPL LPP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5969..6999#5173..5556#5015..5060#3089..3169#2930..3010#2754..2855#2586..2675#2423..2503#2246..2347#2081..2170#1920..2000#1746..1844#1313..1648#1140..1226#958..1050#639..872#335..579#1..187#atggcgagggggccaagacgtctacggaagttgaacctagatgcacagagcgcaggacatgtgcaagctgaagaagaaaatttgctgtacaactttgaagctctagatgaagcagatgcacaattcaatgacgataatttgcatctcgaagctcaagatgcagggaatgtacaacccacagaagatagtgagcaagacctttcagagaatgatgacataatcacggagttgcctcttgcagccaaaagaccaattaatataatctgttcttcctatatatgtctatatatatgatttttcctatcacccatagctgaactgttcctaaatgtagggccaaatggggaggtacgacgggttctaggaaattttaatgtaaaaaacttggaccaactgaagcaaggaaaggtaattgtagagacggatgaacatggtattccaaatgatagatcaggttctgttctaggctcgtatcttggtaagcttgcacagaattcaacatttgcaccattggacattccaaaatgggaccatgacttatttgtgggaccaaaggagagcatagtcgctgacgtggaggtgaatttttaattaatgtaaacaaatattatcatgcttatttcagatctaacttttagttattcatggtaaagatgaaatttgtgtacccttctgagacgaagcagcttacaagagactggattctaatgaaagctgataaagggtggagatcttacaaaagccgtttaaagggaagatactttaatcctgatgtgaggactctaaacgatatattaaaatatgtcccaaaaggtgtcaatggatatcaatggcgtggtcttgttaaaatatggtgtcaggataaacacaaggtgacctctccattttaatgctaaacatacagtccaaattttgtttcctaatcatctgtatttagtacagcttctctattttcagaaattatgtgagaaaaactctgaaagcgcaaaacagcagaggaatccacatacaactggtagaaaaagccatgctaggctttgtaaagagatggtaattattttggacttaaatgttattgttacatatctatagctttctaatgctaaatttgatctatcttctgattctttgttgcctaggaagcaaaagttaaagggaaggtccatgacattgacgtatgggatgaagcacataagaaaaaggatgagcgcattaaggcagtagtggtaaatttctttccttgttagttgttatcacaaatgtagtttggttcatttatgataaactaattcatgcatgtttaattatgtaggaatcggcttaccatgaattagctaaaaagaaatctactagttgcagtggtctttcatccaaagattatgatgaagtttttcgacgtgtagttggaaaagagacaaaacttcgagggtactacgatcataagaattggagccaaataagggtttctcaaggactagatgttgttggacaatctgaggaatatgcaatgcttaagttacaaatgaatgcaatggaaaataaaatagaggctatgagtgttgatatgactctgatgcgtgccttcatagaacaaaaattccctggagaggattggagaaatattgtggttgcagaacaaaataaagaagtaagtgtcactgtacaccatcttcccctgtctaaagatcaattaacgaatacactatgtgatcagtacatatgcatggattatgctttttttgcaggttgatatttctgaacaagttggtaatgatatccaacatgaatccaatgttgaagaatcatgtgaacatgtacattctacaccagataatgtgcaggtggtacaatatttacttgataatttttaaattgatgcttttgtaagtctttataatgttgtttttcataagttgcagcagaagcatttaatcagttatattcctgctaaaaatggttgccacaaaccatctgtaccacatgaacacatgattgccaaggtaacttatgcaaatctcactatgctcaccatatgcattttttacattatatatataattaaattggccttcaattgtagcaatcaagcattggaagctttgctagaaggtctgaagctagtcagagatacatggaatcaactatggcacatgaccatggaactgataaggtatacaaactaagcatgcacaaagattgaaaagattgatacaagtagaaggtctgagttattttttggttacaggttgatatgtttgatcaagttgacattgactgtacaaatgaatttgataataactttgataattcatttgccaatacctatgctaagtcaaatcatgtgcaagtgcggtgtttacttgaaaagttttaattgaggctttcacaatttctaaatattgacatttatcataagttgcagcaagtacattctattagttctgctaatggcaatggtcgtcgtttcaatccatctataccatatgaatgcacaaatgctaaggtgacttaggaaaatctcactacataatgagttctgcttgatttaaacaacaatacctaattttaatgaatttcaattacagcaactaagtggggaaagcttaggcaaaaggtccataacaagtcaaatgaatgtggaatcaatggtgccacgtgagaatgtgaccaatgaggtatatacaactaagcacgcaaatatcaattagtaaatttatttggcaatactgtgatttgtttgattttttattcaggcttatgtttctgaacaagatggtactgatattatgaatgggtttgttcacaaccgtgaggaaccacatgccaatgagaatgctataccaaataatgtgcaggttctggaatgtctactttaaaaatgttgaatcaaagtttgccaatgtcttaattctatcatttattattacagcaattatgttctgttagttcaactagagctaaagagaattgttctactaaagctttgccatctgaccacataactgcaaaggtgtgttacagaaatcttactctattactgaaacatgtgattgttacaacatttcacaaagttgactttcaattgtagcaatcaatcattaaaagctctgtcaaaaggactagaactaactgtgtggattcaattttaccacctgataaagccaaacaggttagattcaaactattatgctcttttagttctagtattaatgctgatcaagcctgctcatccacttttgattctttaaaatttttaacacaggggcctcagagaaagggagtattagagaatacttcatctaaatcagtatgtggtttccattgtttatgataaaataaatattcatatgctcatgaatgacaatgctcctagttttgcgaatgacaatattgtgtttctcaaaatgataggatcaaagggtggtgttcttgttttcattgaatccagtatacaaaggcaaagtagtggccaagggaaatttagtgactacagatagcacatatgtggttggaggaaatatgcttggaaatgaatattatggtgtggctgttcatagtgttacaaatattggtgatgagagactgccaagaccatctgaaaactgtactacattaagagaggcaattggttttgtcattccttggcctcgtccctatgtaatattaatcatttcaactcctattataatttgtcacgttgcattttttttttgcatatatctcgttactaatataatatcttgacctttcaggtaagaaagcgtagggatacaagttctgcccagtagcaaggccctttcatacgagtgctctgctcataaccagaattttgctgttattattggtctgactataggataatgaatggaggactgaagaaaagaaagagtggaagccctgatattcaactttccttttgaagaaatattatagatttccttctagcagtttagaaaaacacgcacaacaagctgtaggatgttatatatgtgtgtgtctattgcactttagttttccagttagtcgtatatgtctatttaaaattacatggatgttttatttagttgtaaactccttgctctcatacaagcatgtacagcctttccccttttaatatattatatgttcttgtatatggtcgggaatatggtactgcctgcccatgtaattttttacatgcacatgtatatagactcaattaatatatgattaatttaatgtgcatccatatatataattatatacaatacgtactcgttacaatatactaaatgtataaaatacatactacgctatatctaaaatactgccaccgagacgcaacagaacgtcttaattaatgtgctaaaatactactactgagacgcaacagaacgtcttaatggatgcgtctatggacgttgtacattgttttttaaaagcgtctctatgcctatagaggtgatattccacgtctctaacaacgtcttaaaataaattaggtacgctttaggaaatgtctctatttttttgagacggtcgaaacgaagacgttcctatgacactttataaaagcgcctcgcttgtttgcggagacgaaacaaaacgtctctatattacaaataaaatgtcttctttgggggggttttgttgtagtgtatcgtgcccgtcgtgcttctcgtggtcgcggtgcagctcctactactagaggctctgtgtccgttcctgccacctcacctattggcgcccctcagtggctcagtcgtcttgggttcttgattccggagcttcttttcatgtgacatctgatcagtccta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|
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