Os09g0280500

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os09g0280500

Description

Similar to Transcription factor HBP-1b(C38) (Fragment)

Version

NM_001069300.1 GI:115478339 GeneID:4346610

Length

11697 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0280500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:6483789..6495485

Sequence Coding Region

6484027..6484136,6484862..6484962,6485885..6485946,6486063..6486251,6486411..6486491
,6486708..6486767,6487536..6487613,6487781..6487838,6488186..6488454
,6492143..6492373,6494896..6495060

Expression

GEO Profiles:Os09g0280500

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MGGSREEDRQHHNHLPSELPLGFRSSSPTTMIASSSMSKESSNY DMADFDQASLFLYLDSHDQQSIQEQRQTLNIFPSQPMHVADPAHEAKSAGVAMAMLPN GNQLQVLPSHPSKKPDQQGGQKINSSVPTNPPGPNLPLPNSAKDNKNSSLIKKEGSSS GKGATTSNDPEREGRRTLDPKTLRRLAQNREAARKSRLRKKAYIQQLESSRIRLSQLE QQVHVARVQGAMLGAGDQHQGLPSGPSAASLFDLEYGRWVEEHSKLIFQLRAALNEQM ADSQLQVFVNGAMAQHDELLSLKGAIARADIFHLLCGVWATPAERCFLWLGGFRPSEA IKVMLKQVEPLSEGQLMSIYELQQAAKGTEDALSHAMDGLQQSLSDTVAAPDVAAAGG FMGHMSLAMNKISAMEDIVRQADGLRQQTLHKLQHMLTIRQAARCFVAISDYFHRLRA LSTLWVARPRPEEGPAM</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>239..348#1074..1174#2097..2158#2275..2463#2623..2703#2920..2979#3748..3825#3993..4050#4398..4666#8355..8585#11108..11272#aggtgacatccaaacgaaaagcttcagcccccttctttatagccttttgttacaagtataaaaacaagggtgcaaacagaagtcagttttgccattaatgtctgattttgtatcttttgctagcaagaggggatgtgcatagtgtgaggagagagaggtacaacaagaagagagaaattaagagagcagtagtagaggtgtgctgcaggaggatggtcagggccttcataagggcttcatggggggctccagagaggaagatcgtcagcaccacaatcacctcccttctgagctccccctcggcttccggagctcctcaccgacgacgatgatcgcctcttcctccatgtaagacaagatgtttgtttgtttgttgctgaattatgctactagccatgaagctaattcagagtgttcctcgtttaatttgcaccttcttcagagccctgctggtgttttatccatcttcagttggtttcttgtttctttagaataggaatttgaaaattccaagctgatttatggttttcttcttacccttttggtttcttgacatgcatctttgctgattttctctgctacttcaaagagattgaatcattcttctgctattggggtttaattttccattgattcttcttctgccgtagaggttttctcatcatgtatcttgcatctcgcgtcaagtttgaatttttaattaattgttttccaaaattcaaccatggacatatggggataattagagaaagacacgcacaagccccatcagggatcaccatataagatagtttattggttagttagggatcatggaaattgtttagccatgggctaagataaggagagaagctagacaacaaatcaccaaatactaggatatatttcttttctttgtatctttcaacaagcaacaagtagctagatcagagatggtttttaatggtcttcacataccgactcttctatctgctccattaaacaaaaagttgtactcctcctacttgctttctaatgtgtatgcaatatacctactgattcttgcttgtttcaccttctaatttcctttctaggagcaaggaatcgagcaactacgacatggccgatttcgatcaagcttcgctttttctctacctagacagtcatgatcaacaatccatccaagaacaacgacgtacgttaccgcgaaaaacctgatacttacccagcttctttttcctcccaaaatacactgatgatgatgtgtatatatgtgttagtaattcccttttcctttttccatttcgtacaccataatgttttgtcccctgccttttcctaggatatacgtgcgtgtgtgtacatatatatgtatggatgtatctctgattctttttcttctgattcatgtgtttttcttgtgttaatttttgttctctttttcttcggatttggtatttctttccggtgtgaggagtgtgacatgtaacagactctctgacgatgaccctctctctctctgcaaagaacttgatcttaaagaagctataaatattccttctttccatttctcccccattcctttccatttccaagcttctcatgtactctactgaatcatagccccagaagcatcccttccaactgttgttataccaccagtactacctgttgtgtcctttctctcaccgtgcatatatgccagacatggagtgagaaacatatctagagagagagattttgtaaacatgtactccctccatttcgaaatatttgacaccattaactttttagcatatgtttgaccgttcgtcttatttaaaaacttttgtgaaatatgtaaaattatatatttaacaatgaatcaaatgataggaaaaaattaataattacttaaattttttgaataagacgaacgatcaaacatgtgctaaaaagtcaacggcgtcaaacattttgaaacggagggagtaattaataagcagttttactgaagcaagagtagcttagcctgaactactttccagaagcttcctaaaagtactgaaccaaatagcctttctgaatgcttacatatgcacattagttgcttgctaattgcatggtttaatttgcagaaactctgaacatcttcccttcccagccgatgcatgtagccgacccagctcatgaagcaaaggtacgtgtgtgtgcatgcatgcatgcagatcgattaattcttggaccacatgtggagtactagtttttagtactagttactgtcttctgaattttgacatgtatatatatgttcagagtgctggggtagccatggccatgcttcccaatggcaaccagctgcaggttcttccttctcatcccagcaagaagcctgatcagcaaggtggtcaaaagattaattccagtgtccctactaatccacctggccctaatcttcccttgcctaactctgccaaggataacaagaatagtagcctcattaaggtattcatctctctctctctctctctctctctctctctcatatcatattttttagacaatggatagaaatatggctatatatatgctgcatatatatatgtatatcctttttttttctctgtgtgtcttctgaaggggccaaaaaaatgtggcttgcagaaggaaggaagcagcagtgggaagggtgcaacaacatccaatgatccagaaagagaaggaaggaggacactagaccctaaggttagtgagtcaatcattcatccatccatcctttgatacatttcatgatctctctctctctgcaggacttcaacagcacacaaaagtgcataagaaagtaattaggaggttgaacagtcactgtctgcaggaaataacctgcatattttatgactttttttgagcctgacaacttaattgtgtgaatatgtgtgtatgtatatgcacatgctgcagacactgaggaggcttgcacagaatagagaggcagcaaggaaaagtaggcttaggaagaaggtgagtgggtcaaccaagaaactcaacagcttattaattcaagctagaaaggaatctctcctacatgtactgtttgtgtgtgtttttgtatatatttgtgtttgcagaaacgtacaatactctaggaaaagtacaaacatatctcttaacaataatgttaatatagatgacatgtatatgttgttcacgcaagtgttcccaatatgtatttttgttatcaactttattttgtttgctacatgcatgcatggagtgctagctcgcgattaaatgtactgaccgactttgtgatgtagttgtttttggctctttctttgggacttatgtgctgaaggatatacttatttttactagctttaatgtgaatttgaccgcccaaccaatgcaagaaacattatcacttttcatatgtacatttccaatttctttatggtctcaggtgtgaattattatgatggtactggctatttgaaacatgcatgagtcttatattaagaataatgcccatgatttttttatgtaccatcctttaataattagttatcatctaaaaaaatccattaattggccagaaaaaaaaccatcaattaacgtgtcagtagaatttaagttagtagcagtttcttttaaaaaaatcgtctccgatatttcatatattcgttttatgggcacgtacaataacaaatccatggtttctgctaaaattggatgtggatttatgctatttatattgatgagtatatatatatacattgctttattcttcaggcttacattcagcagttggagtcaagtaggattaggctaagccagcttgaacaacaagttcacgtggcaagagtacaggtaaaaagctaggcttgaaaatgtctaattattaacgaattaattatatctcccagtatattttttggaaacttacttctttattttcttctgaaaaatatttaatttctggcctctacatatattatgcaagtcctgacaaataactactatatatgatatttcagggtgctatgctgggtgctggagatcagcaccagggccttccttctggcccttcagctggtaatgagacactccaacctatctctctctctttttttttatcagttacttcctccattccaaaagattgcaacttttagatacctgaacaagtatttttataattaaaagttactatattttggaacagatagagtactcaattttattacaattaaggatatgcctctataatttaattaaacagcattaattttagtaacaacacaaatcccgtattcgattgttttccttcgtaaagtttttctcctgctttattaatataattggcagtttttcggctggttcgtttcgaaaaagaacacaaataattaataactatctcattgtgatgagcatatatgcagcatcgttgtttgacctggagtatgggagatgggtggaggagcacagcaagctgatattccagctgagggcagccctgaacgagcagatggcggacagccagctgcaggtgttcgtcaacggcgcgatggcgcagcacgacgagctgctgagcctcaagggcgccattgccagggctgacatcttccatctcctctgtggcgtctgggctacccccgccgaacgctgcttcctttggctcggtggatttagaccctctgaggccatcaaggtatatatatatatatatggttgtcaaacattaaattattatattgctgctgaaccaattaaaacgtattcccttcgttttttaatacagtacatatttgataattcatcgtatctaaaatatttttgtgcaaatgcataatatatataaatcaggcttaacgtacttttactggttaaacaactaacaaaaaaataaa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External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0280500, RefSeq:Os09g0280500