Os12g0126000
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Structured Information
| Gene Name |
Os12g0126000 |
|---|---|
| Description |
Multi antimicrobial extrusion protein MatE family protein |
| Version |
NM_001072579.1 GI:115487119 GeneID:4351384 |
| Length |
4538 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0126000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:1250404..1254941 |
| Sequence Coding Region |
1250619..1250699,1250824..1250910,1250992..1251110,1251200..1251438,1251541..1251597 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:1250404..1254941 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggagaggccgggtgatgaacatgatgactgcaggacggctcctctgctggagcctaagcacgctcatggcgaaggcagcaacaacgacaagcaagaagaagatgaagaggaggttgggtcgttggggccgcgggtgttggtggagagcaagaagctgtgggtggtggcgggtccttccatctgcgcgcgcttctccaccttcggcgtcaccgtcatcagccaagccttcatcggccacatcggcgccaccgagctcgccggatacgctctcgtctccaccgtcctcatgcgcttcagcggcggcatcctcctaggcatggcaagtgcattggaaacattgtgtgggcaatcatatggcgccaagcaataccacatgttgggcatctatctacaacgttcatggatagttctcttgtgttgtgcagtcctcctcctcccgatatacctcttcaccactccactcctaatttttcttggccaggatcctaagatcgctgctatggccggcactatttcattgtggtatatccctgttatgatatccaatgttgggaacttcacgctccaaatgtacctacaagcacagagcaagaacatgattgtcacttatcttgccatgctcaatcttgggcttcaccttttcctatcatggcttttaacggtccagttccaccttggccttgctggggtcatgggctccatggtcattgcctactggattccagtatttggtcagcttgcttttgtcttctttggtggttgccctctaacatggacaggattctcatctgctgcttttactgaactcggtgctattgtcaagctttcactgtcttctggagtgatgctttgtgtggaattatggtacaacacaattttggttctcctcactggttatatgaagaatgcagagattgctcttgatgctctttcaatatgccttaatatcaatggttgggagatgatgatttctatagggtttttatctgcaacaggagtgcgggtggcaaatgaacttggagctggaagcgcaagaagggctaagtttgccattttcaatgtggtcaccacttctttctcgataggatttatgttgtttgtgctcttccttatctttcgtggaaggcttgcatacatatttactgaaagtaaggtagtagcagatgcagttgcggagctttctcccttgctagccttctccattttgttgaatagtattcaaccagtgctctcaggtgtcgctgttggatcaggttggcaaagtgtagttgcctatgttaatgttacatcatattacttgttcggtatccctattggtgtaatactaggctatgtgctaggatttcaagtaaagggcatttggattggtatgcttcttggtacgctagtccagactattgtgcttctatttatcactcttagaactgattgggaaaaacaggtagagattgctcgacagagattaaaccgctggtctatggatgagaatgggagacaacagaatccgggtgaaaatccatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MERPGDEHDDCRTAPLLEPKHAHGEGSNNDKQEEDEEEVGSLGP RVLVESKKLWVVAGPSICARFSTFGVTVISQAFIGHIGATELAGYALVSTVLMRFSGG ILLGMASALETLCGQSYGAKQYHMLGIYLQRSWIVLLCCAVLLLPIYLFTTPLLIFLG QDPKIAAMAGTISLWYIPVMISNVGNFTLQMYLQAQSKNMIVTYLAMLNLGLHLFLSW LLTVQFHLGLAGVMGSMVIAYWIPVFGQLAFVFFGGCPLTWTGFSSAAFTELGAIVKL SLSSGVMLCVELWYNTILVLLTGYMKNAEIALDALSICLNINGWEMMISIGFLSATGV RVANELGAGSARRAKFAIFNVVTTSFSIGFMLFVLFLIFRGRLAYIFTESKVVADAVA ELSPLLAFSILLNSIQPVLSGVAVGSGWQSVVAYVNVTSYYLFGIPIGVILGYVLGFQ VKGIWIGMLLGTLVQTIVLLFITLRTDWEKQVEIARQRLNRWSMDENGRQQNPGENP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4243..4323#4032..4118#3832..3950#3504..3742#3345..3401#2960..3046#2276..2817#14..325#tgtgctaggagaaatggagaggccgggtgatgaacatgatgactgcaggacggctcctctgctggagcctaagcacgctcatggcgaaggcagcaacaacgacaagcaagaagaagatgaagaggaggttgggtcgttggggccgcgggtgttggtggagagcaagaagctgtgggtggtggcgggtccttccatctgcgcgcgcttctccaccttcggcgtcaccgtcatcagccaagccttcatcggccacatcggcgccaccgagctcgccggatacgctctcgtctccaccgtcctcatgcgcttcagcggcggcatcctcgtaactatcctctctacccactacacttaatactatttaattacattttgtgtttaaactaatttaaactttgttttccaaattttccatcaaataactctcaaactttgctcgatttgatttttactgtatttttttcaagttgagatttatattttaaagtgtacataagtgcgagtctatgagaaatggatagtgtgggcatatagtcatgttagaaaaaaaaatctaacggtcaaagtaatggaaagtgtattgatggggaaaaaaatatcagacatgtcagagagatgaggcaacatttaatgtcacggaagggatccaaaatattcagaggcacataaaaaaattttcttttttaaaaaagacacaattcgtactgtaagaactaaattatgtgagacctatgtattttttgtttagaaaggggccatccgactaattcaaagcatcccttaatgtttgaagcggactcttagttcagccaccccctcttaatcattgcattgtctttatgcattagttatatacttgtgtgctcttcatgacttcaagtacaaataagctcgtaagatatctgtgttagctagctctggaacaatagcagactgccaagtttttatatatctagatattttttaaggaagcacagcagggagggaggccctacagtaatatattttattgatctttatctcctcatttagtccaaatattaaaaggaggagctcagtcttaaacagatatctcccggaagaaaaggtgggaggtttctgctcaagatgaagttatttcttatcttccaaatacactagacagaagttaagaatttatcgatgaagctgtaacccacatattggtttttagccttagccatcataatttaagttcccatcacggtattccaactaaatccaattgaagctcaacatgaagatgaaaatggacgtgtgaaacaaatgttgcattgtttcaatgaccccttgattacataacacacatactaggtcatactttggtggagcaattttttatgatctcgcatatatcgtgtgttcaatctattcataagaagtagcaatccaaaaactttaacttttgaagtgcacttactcttccataaccaaataaaatgtggaggctagacggatgtaattaaagatcagatagaagaatttctgaaaggcatagttcatgtttccccatatatacttccactgatcagcagtgtgatccaattccaagtttaggagtttgtttgactatcgagaaacctcatcatatgttttccgagatgatggcagattaaaattatcatccagatcagtagatacaaacactttgacagaggcctccttattagaagcaaaggaatatagccttagatatacattgcatggaggtggctagtgagaccacatatcttcctagaaggtgcaggcagttcccttatgtaagatacatctaggaattcctctaaagtggatgcttgttttacaaacatcattccaccagaaggactcttttgggatagttaaattaggcactaggtagacataatacttattctaaatcagttttacctaaggcaagtccttattgttataaaatttgttcaagtgtttcatgagcggtgcctaattttggattgtcaagttaatggcctcctcttctcctttaacttagtctgcaaaccttatgccaagcagccaggaattgtttttggagttgatcatatctgactatttccataagcagtgctttctccctatcaatgctctcaatcacagactttggtatcaaaagataccttactacaagtaatgatgacctctttatattttagacttttactaacaattaatttctagatgtaatcttatcttctatatatgcataaaaacacattataaattgctcaccttaaatgcacattgttgtaaactgcagctaggcatggcaagtgcattggaaacattgtgtgggcaatcatatggcgccaagcaataccacatgttgggcatctatctacaacgttcatggatagttctcttgtgttgtgcagtcctcctcctcccgatatacctcttcaccactccactcctaatttttcttggccaggatcctaagatcgctgctatggccggcactatttcattgtggtatatccctgttatgatatccaatgttgggaacttcacgctccaaatgtacctacaagcacagagcaagaacatgattgtcacttatcttgccatgctcaatcttgggcttcaccttttcctatcatggcttttaacggtccagttccaccttggccttgctggggtcatgggctccatggtcattgcctactggattccagtatttggtcagcttgcttttgtcttctttggtggttgccctctaacatggacaggattctcatctgctgcttttactgaactcggtgctattgtcaagctttcactgtcttctggagtgatgctttggtaagtaacaattgtgtttatgcatacatatgaaatttcagatatgcaatatgttagatgctaaatgtcgaccaacatattgtttagagctaattaattgctcatgtggtttattcttttttctttctcatttgcctttcagtgtggaattatggtacaacacaattttggttctcctcactggttatatgaagaatgcagagattgctcttgatgctctttcaatatggtaatatattcctctttcaattgttgcataatggtttagacaataaaaggtggggtatttgcaaatttgccactggttttttcaatattgcaaggatgccactcaaatgacagttctaatggcatttttgcaattttctagtggcagttttgcaataacgattcaaagtagtggtaaatttgcaattgccccataaaaggtagatcatgtttgtgggtacatcattgtattgttctttgttgttcctttagcagttgaaaaacttgcttattgagcattattgtttttccatatgtagccttaatatcaatggttgggagatgatgatttctatagggtttttatctgcaacagggtaacttagtgatcttacttgttacatgctaagtggttcatttgatcaatcaatcatgtcagataaatttcatttgacatacctatacatgtacatttctagagtgcgggtggcaaatgaacttggagctggaagcgcaagaagggctaagtttgccattttcaatgtggtcaccacttctttctcgataggatttatgttgtttgtgctcttccttatctttcgtggaaggcttgcatacatatttactgaaagtaaggtagtagcagatgcagttgcggagctttctcccttgctagccttctccattttgttgaatagtattcaaccagtgctctcaggtatggtattccatttaaaagaatagtatatatatcaatataatttgaaattgcacattggaattataatattttataatcatctgtaggtgtcgctgttggatcaggttggcaaagtgtagttgcctatgttaatgttacatcatattacttgttcggtatccctattggtgtaatactaggctatgtgctaggatttcaagtaaaggtgaggagccaattgataaaatttcattagtcaatttgggacttaaattgtgtttctcaattccatttgttgtttctatagggcatttggattggtatgcttcttggtacgctagtccagactattgtgcttctatttatcactcttagaactgattgggaaaaacaggtatgttaattgctcacaattttccttatctttttttttattaaatctcttaacccacatagcatgtgggtctctctagattttttttctcatttaatgatgtgtttcatgttcttttttctaggtagagattgctcgacagagattaaaccgctggtctatggatgagaatgggagacaacagaatccgggtgaaaatccatgatctaaaacttctgcacacttgtaatgaattatggtgatctatgaatcagcttgttctaatgggattgccctcagagtttaagatccttcaaggtgacatcatccttcaatgaacctataaatggcttggaatgatgtttttccccatgtgtcacaccatggaaaaaccgtgatgttattgaaggaaccttatatatatatggtcgtaaattatcc</dnaseqindica> |
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