Os11g0472000
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os11g0472000 |
|---|---|
| Description |
The start codon is not identified. |
| Version |
NM_001074410.1 GI:115485468 GeneID:4350492 |
| Length |
9425 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0472000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:18075917..18085341 |
| Sequence Coding Region |
18077256..18077522,18078430..18078756,18079508..18079804,18079920..18080039,18080892..18080954 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:18075917..18085341 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008404:18075917..18085341 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>tgtggatacgttgtcggtgaggcaatgtggcagatgaatctaggagaagctatggaagctgggccatacccagagcgtattggagaaccagattgtagttattacatgaggactggcttgtgcaggtttgggatgacctgtaaatttaatcacccagcagatcgtaagatggctgttgctgctgcaaggatgaagggggaatatcctcaaagaattggtcaacctgaatgtcaatattatttgaagactggaacatgcaaatttggagcaacatgcaagtttcaccacccccgagaaaaagctgcaattgcaacccgagtacagctgaatgctttaggctacccattgcggccgaatgagaaggaatgcgcttattatttaagaaccggacagtgcaaatttgggagcacatgtaagtttcatcatccacagccatctaatacgatggttgctgtacgtggctctgtttattcacctggacagtcagttacttctcctagtcagcatacttacccaggggctgtaacaaactggcccttgtcaagatctgcttcgtttattgcaagtccaaggtggccaggccattctagctatgcacaagtgattgttcctccagggctcgttcaagttccagggtggaatccttatgcagcacaaattggttcttcatcctcagacgatcaacagaggacagctggaggtgcacaatactatactggctcacgtcacagtgaaacacctaacatgggtgaccagggaatgttttcatcataccaagctggttctgttcctcttgggctatatacagtacagagggagagcatatttccagagcgacctgaccaaccagaatgccagttctatatgaagactggggactgtaagtttggtgctgtatgcaagttccatcatcccaaggagagaattatccctactccaaactgtgcgttgagctcattaggtcttccactgcgtccgggagagcccatatgcacattctattctcgctatggcatctgcaagtttggtccgaattgcaaatttgatcatccaatgggaactgtgatgtatggtctcgcaacatcaccaactggtgatgtgtctgcccgacgtatgctggcacctgtaccagcacattcagaagtatcgcctgacaatgtctcagggaggtctcggaggatcacccattcagattcccagcaaataccctctggtgaaagaggcaccgagagagaggcgtcctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>CGYVVGEAMWQMNLGEAMEAGPYPERIGEPDCSYYMRTGLCRFG MTCKFNHPADRKMAVAAARMKGEYPQRIGQPECQYYLKTGTCKFGATCKFHHPREKAA IATRVQLNALGYPLRPNEKECAYYLRTGQCKFGSTCKFHHPQPSNTMVAVRGSVYSPG QSVTSPSQHTYPGAVTNWPLSRSASFIASPRWPGHSSYAQVIVPPGLVQVPGWNPYAA QIGSSSSDDQQRTAGGAQYYTGSRHSETPNMGDQGMFSSYQAGSVPLGLYTVQRESIF PERPDQPECQFYMKTGDCKFGAVCKFHHPKERIIPTPNCALSSLGLPLRPGEPICTFY SRYGICKFGPNCKFDHPMGTVMYGLATSPTGDVSARRMLAPVPAHSEVSPDNVSGRSR RITHSDSQQIPSGERGTEREAS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7820..8086#6586..6912#5538..5834#5303..5422#4388..4450#3725..3876#772..790#tcgttcctctcattccccttccttcctccctcttccgcctccgcctcctcctcctccgcccttacccccgcgcgcgtgcacgcgacggcgcggcgatctgatgctgccgccgctgctgctgcaggcgccgcggtgatggcggcggcgccgtccgccggcggcgttggggagggctcttcctcctccgccgccgccgccgctgctgctgctgccgcgacgatcgggccccacgtggtcgacgaaggtgacgaccccctcatcctcatcctcgtcgtcgtcgtcgtcgtcgtcgttcgctttccttttccgtcagggtgggtgtggggggaagcggcggaggcgggtgccagctgggggtaggtttcgattggttctcctcgtggggaagcgggggtgtcggtggcgcgggtgctagggtttgggcggcaggcggggggtggtggggaggggagggcacgcgtgcggccgaccaatgctggtgaacactgtgctgtcggtgggcgggggtgtggtggggggttgagggtttcggttaatttttgatggcggacggtgttccaacgcagtgctggctctgcggcggagccgctcgattcggtgattaattcatatgtttgggctcatgtaccatattggagaagtcaatccagcttgctggattggaacggtgcatcgggtcggaaaggcgaggtttctgagctgatttggtatcccactccatgcaggagcgctctgttttggtcattctcacaatgctgatatgttttataatgtggatacgttgtcggtggtgagttctatgtgaatttttgtttgtgcgtctattggatgtcggtgattgtcgatggtgtttccatgagaatagtaagaatctcaaatggaaagaatacattgtttttggaagatagggaaggtttttaatgttattgttggttttggaaagaatcatgagggcagggcaggcagtggttcggttaaatttcatttggactcaagctatcattctgtaaatgtttactcaattatgttgtgtggttgaagtaagatatggacatcagtatgttttcaacctggctgttatggtttgtgaatgttctgggcaagtatccgagctatttatcaggtagaaaggagttaccaccaagggttcttgaaaggcacatagacatggggtgtgtttacatatatttttggcctttttgggtttattttttttgtatcactcttgttgaagtgtatcaggatgaacatttctaaatttggccgcatttcttttatatagattgatggtatggttgtaatcacgactcaaaattttgaactccagtacattaaaggtctttggaggatatggcaggtttttagtgaggatactttgtttagaaagacctactacccttctctgttaaaaaatggactggtgaggtgatgacctgatgcacaatgcaggatgaggtattgatacttcagttttggaagattggtcagagtattggtaggatagcttgcctgctagtatttgtgacttgaagttacgctgcccctaaagactctgaccttattcttcttgcagacaaaatttaattagttacacttttcattcttctgtgataatttggagttctgcaatattttgggttgttttctcataagcaaaattagcaagtttaatttcatttgtttgtgttcacgtgtacaaaatgataaattcacttttgtcgtctttttggtaacgccacaatggaagcagtatggctgttcttaaagatttggtacatgaaagaatttattaaaagtttatcagtgtgacaacccatccttatctcatgagttatgacagtactttcaattgttttgaaccgttactataaatttaactatttctttatgcatctttagcacttgacgtgctgtgaggtatgttctacaaaattaattcagttcttcctttttttctgataacgctgaagcggaagtggtatagggatctttttgcagaaaagggaacactttaatcctttttggttgccgtttctgttgttttatgattatatttattggtacatggttcttcctgaactatttataccaagtatgcaattacctgagattaaatttctgatccgatgcctcgggtggctgtgaaggcgacaccattgatgggcaggatcagctttggtgctgccagggagggcttgtcagccgctgctaccgcagttgctgttgcagcctctgtgattgggccccatagttctgatgaaggtgtgctgcaccctcctaggtctttgtctttgttctatggtgtagcctgtctagctggtgattagtgtacttgtatggctatttcatttggggtctttcttttctaaggaatggaatccttgaaactgcagagtttgtaggatttggatctcggatcttgcttttgtttccaagtacgcttcttatggatttatgtttcttgaagtatggttgtatggtgaaatttttgtttgaaggcagtgtttgagtctgatttggtcctcgtagtggagtttttgatttgggtgcagaaaagtgaaactctagaaatacatgtcatctcatcatttggtttgcactcttctagatggatatgttaatcttactttgttttatcatgggtatttgaagaactaaaggtgaatgttttggatgggaggaacagttttgggattagctggtcttggaagtgaaattgcggagaggtagcaagtgatctgaattttcattttaaatgcggggaatacttgtgtgattgtggtgttccatcatttttggtttgcgtaatttatttgttggttgaaccttgagttaatctgatttatggtgctgtttgagttgggtgtagttcagttttgcaaagtttcctgtttgtgttggaatttaagttatttgattctggcgaagaggtttaggtctgattttatactggggtccacagctacaatgaaattaggattcagcttaatttaaggcttttttgggaactcttgttactgttgccaataccagtcttttctgcgaaaagtgttaaaatgttaagtgtcttctaggatgtaattgtatttattgcagatgctttcttgtcagtatctgaacagctgaagacgaagctttcagagtattagatagtttatgtagtgatagtgaatcacttattataatgatatagagggcatgatgaactgactacgactcggtttttactcgagatagaatgaatgaattttattgatttctgtagaaagaatatgggtggaaatctatttcctaatcttggtgcaacttttctctatcttttgagttctgaggctgtgtattgtgatgataattatttatgtgatttgagggtacagaggatcattagtatgattaagttcagtagttctctatttgttttatgtaaattaatttttttcccgttatactggctaaatatagcttattttgtcacttcataatatccagtccagctctctctatgtccgtcttcatgtggtgtttattcactgcaacagtcttaaggtatccaatgacatggattagtagtcatattgttgaatgatgttgccaggaattcttggtgtccattttccacttttcttgatgctaccttctctcctttgatgtcaataatctaccagcttatagattttgctgcaattttttgtgagtgatcggtattgttataattaaattgcagaggcaatgtggcagatgaatctaggagaagctatggaagctgggccatacccagagcgtattggagaaccagattgtagttattacatgaggactggcttgtgcaggtttgggatgacctgtaaatttaatcacccagcagatcgtaagatggtacactaaactattcttgtaccctttttttttccacattagagtatatttttcattagcattaatgtcttctacaatttttacaaatatagtgtggtaaagactaatgctacaagttgaatctatgtaaattgtttgaatttttgacagaggaagtactttgttgattctgtagcgattcccttctaattacaagaatttatctagattggttcttttggagttcatgtgcgagttattttcctgaacaattaacacaacagtgaaaaccagataacagcttggctcctcctttgtaggcatatggctgttttgaaaacctcttcaaatgacttgtaaatatttttctattttctatcttttggaattcatagattttttattagatttgcatagtttaggagcatgataatattttcaaagctgtaagttggaaagcttatggaactcaccatttttgtgctactttctataaattcttacctttgatgtaaatggttttgatcatcaggctgttgctgctgcaaggatgaagggggaatatcctcaaagaattggtcaacctgaatgtcaagtgagattttccattctaacagtttcctcaattttgatacttttgatcatgtaacagtaacggattggtggtgtttcatatcttttaatgctctgatatttgaaagtttatactcgtgacgttaacttttaacatacttgatagtttcacattgcgcccttatttttgagctattttaaacaatatttttttgctggtaatatttgaaacaatattgcctaaaattgttttatcgctgttcttcagttatcctgtgccctgtcaagccgcaggtgtcttagaggttcttccttagctgttcttcagtaagaagttgagggcattaaagataaatagtttcataagtgtatgatctaagtggttactttgatgaaggcagccacatgggttgaaatcatcctttaattgcagcgctaattctcttgaacttggtgaataccaacaccagagttgcctcatgcacattatcacagacaactccttactattttactttctgatgcttttacctgatgttttttggcgcttgaagttgtagtatcttaaacaagatcaaagagcatgatcttgagtgtaatgttggcatctttttctattgcaagccatagcttggatttttccaaataaactggagtagaatgacttgcatccaacccaactcttagcaagtgtgatttagtttagttcgttgaatttcttgttcattgcatgatgatatggactgttttggtattttggacgacatatattcataatgtagctgcttaaagctgtctattagtatatcttatctttgacgacttagcagcattgttttctgtattatttattgtgcttcaccttttttttcagtattatttgaagactggaacatgcaaatttggagcaacatgcaagtttcaccacccccgagaaaaagctgcaattgcaacccgagtacagctgaatgctttaggctacccattgcggccggtttgttctaaatttccattatcttttactattacttgttggacttaaggatagttcattattctgcaacttctctgcaatatttgttttagttacctaaattttattaccacagaatgagaaggaatgcgcttattatttaagaaccggacagtgcaaatttgggagcacatgtaagtttcatcatccacagccatctaatacgatggttgctgtacgtggctctgtttattcacctggacagtcagttacttctcctagtcagcatacttacccaggggctgtaacaaactggcccttgtcaagatctgcttcgtttattgcaagtccaaggtggccaggccattctagctatgcacaagtgattgttcctccagggctcgttcaagttccagggtggaatccttatgcagtatgtttatttctcccactttgacatttacgatcgtctattaaatgtatactcatccagtggagtagatggtgcaattcattggtttattgagaatgctgtcaaagtgactatggtcttatggtctctatttaatctgttttttgtattccctttttctaccacatattgtggtaggaaagaagaggcagcttcacccgttgcagtgttcagcatccacattttgtcatcagttacacactgctaattaccttgaagtttgtcaccaattgttacctgattggcacttttccgcagcaaaaagaattgaatatttaataaacacatctgtataattatttctgcctttctgttgggtaatagatctccaacatatccttacaagatcacttgaagtgtgatccttatttctttagaataacaataatgaaaatattggctataatatcactctgcgcaacaaagtgttacctgtttttatataaatctattgtatgctggcttgttcatgtcatccattagaggctaattaaatctattgtcttaacaagcattatttttcttaaagtaaaaaaaaacattattttcttattgtatatttgtgttgatccacatgcctagagtgatgagcttaatatttttacatggaaaatcatttaccttgagattaattgttgattttgtcgtgccatcatttctgtagctttcatgtcaaatatgtgattgctcaactatttttatgttttcttaggcacaaattggttcttcatcctcagacgatcaacagaggacagctggaggtgcacaatactatactggctcacgtcacagtgaaacacctaacatgggtgaccagggaatgttttcatcataccaagctggttctgttcctcttgggctatatacagtacagagggagagcatatttccagagcgacctgaccaaccagaatgccagttctatatgaagactggggactgtaagtttggtgctgtatgcaagttccatcatcccaaggagagaattatccctactccaaactgtgcgttgagctcattaggtcttccactgcgtccggtaagggagtcttttatagcattgtacaccctaagttcctaagttcatgtattcttagcaacatggtcatttaattttttgctgtatgctgccttagctttgtggcctcattttgtctataaaacctcatgcggcaaatccctttttccatagggagtggtggttcctttgacagagggtattagaaaaaataaactaatccgtgtagtgtagtttaaataaatctgtcctaaagaactctttgttgtcatgtgatgtaattgttttttgacaagagacatcaggagagactcctactatgttaatatattaaatatataaacatgtacaaaataattacagggagtgtggtgtaaattagttagatcttagttgtctttgcagaaagtgaaaccatttagtgtattatttgcaccagtcctccttggtattcgctgtttttttttgaaggaacttgatggctaagcagaatcccatggggcgaattagatttccacttgtgcatcttgactgagaattcccatgctaattttgattgttgatctacatttgaatacaataatgtgtaaatggtactatattcaagattggcatatttctaaatttactttgcatacactagtttttgtactttcttttattgatactgttatcatcacgcctacgatgcctacttactgctgattagtgattagttactctgagtgatgacttggcattctgcatgtgattctattatgtgtagttgatttctcgacaatagctatgcatggagcgtaccaatgcacattttagtaattgctggttgtttatcatgcaatgttcaaaaccgataaaacataaatacatacaatatagaagatggacaagtgttgcctaatcctctgtttctttttcctgcttgcagggagagcccatatgcacattctattctcgctatggcatctgcaagtttggtccgaattgcaaatttgatcatccaatgggaactgtgatgtatggtctcgcaacatcaccaactggtgatgtgtctgcccgacgtatgctggcacctgtaccagcacattcagaagtatcgcctgacaatgtctcagggaggtctcggaggatcacccattcagattcccagcaaataccctctggtgaaagaggcaccgagagagaggcgtcctaagccatcctcggtgcaaatgtttcatgctgcttcctgttcttgactctctgagtaaattacccgcaacaaaacttgaggagccgaagctgtacaggtctcgcccttttgcctcacatttgagctttacataccggagcttgcttcaagacttccaacatgtatcgcattcaggcaggaaaaagttcttgcttgttagggatgctcttttgccccgtgtaaacgggacaaccgaccttatttaaacatctatatatggaacaaactcacctctggacattcgatttcgagtgatgtgccttgatccctttgttgtagttatacaggtgccttgcaatggacaaagcttttgccaaacgggggatatgtgcaaatcgctctcctctctgtttctttcttttttttgccttccctctaatttagcagtttcataaggggcaacccccgcttctggaattgtgcatgttgaggatgcggaaataataggcaattgtataatcatctacatatttataccctgtcacttgttcccataagagagcagaaaattcaccttgatggtgccggctttagtttgtcatttcatcttgcaaaattttgttctgctactgaaccttttatcaattgtgcatcatttttttgccattatatgtgcacgggaaggatggttactaaagaacaagtaacaagaggtagggttagactggttgagacaggtccggttcctaattctgttacagcaatctatcatttgcacagctatcaaggttgccaaacacctctatccggtgttacgcctcctaaatcctgatgaacggagcagctgcgtcaacacctatgtcctgataaacggagcagctgcatcaggattctggagtgtcaggtaggtgaaggtataatgtggagcaaaaggagttccagatgactcctaatcctataatcatccgatacgagtaggttcgccacatgcggatgaaatgtagtggatggtttctaaactacaaatgtagtggatggtttcttataaataggattatcagatcatcagcccttcaaaactatgggcctggttggcacagctctagctcccgctccacccctcctggagctggagctcagccaaacagttttagctccaccaaaaatgggagtggagttgggtagagctctctcacagaatgtactggagttgtagagctgggtttaggcagctccacaactccacttcagactcaactcctaaagttatatttaggagttagagttgtactaaacaggccttacaaatagaacactacttatatgtccacattataagtttgcctaagagggtatcattttc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
