Os11g0549700
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Structured Information
| Gene Name |
Os11g0549700 |
|---|---|
| Description |
The start codon is not identified. |
| Version |
NM_001074604.1 GI:115485856 GeneID:4350702 |
| Length |
5944 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0549700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:22268797..22274740 |
| Sequence Coding Region |
22268799..22268864,22268963..22269103,22269874..22269986,22270649..22270728,22271236..22271399 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:22268797..22274740 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ggctaccacgcgctccagtgggccacgctcaacaactacccccacgtcgcgctctacatcatcgagcatggaggcgacgtcaacgccggggacaatgcgcagcagacggccctgcactgggcggcggtgcgtggagccatagctgcggcggacgtgttgctggagaacggtgcgagggtcgaggcggccgatgtgaatggctaccgggcagttcatgttgcagctcagtatggacaaacagcattcttgcaccacattatctcaaagtacggtgcagactttgagtgtttggacaatgatgggaggagtccattgcactgggctgcctacaaaggaaatgctgatacaattaggttactgctgtttatggatgctaatcaagtaaggcaagacaaaaatggttgtactccattacactgggcagcaataagaggaaattatgaggtgtgcactgttcttgtacatgctggtaccaaggaggaactcacattgaaggatagcggtgggtttactcctgtggaacttgcaaacgacaaaggtcatcggcatctttcctatatcctttccaatgctacaaaagtaacatttgaagacaagtactgctcagggagatcgcggaagattggatatgcttctatcctgttttgctttcttattgtccttatcaccctttttctgaactcaattatttttgcaccgaatttttctagaataactgccgctgttggtatttggtcatggggtgctatttctcttgcctttgcttcattggtgatgttctacagagtaagcagaaaaaatccaggctacatccaagccaataccaagcgacttgatccaaaggaaccacttatggagattgaccttaattcttctgcttggacaggcaattggtctcagttatgccccacatgcaagataattcgcccaatgcgctccaaacattgtccaacttgtaagcactgtgttgagcagtttgaccatcactgtccttggatatcaaattgtgttggaaggagaaataagtgggacttttttgtgttcctttgtatgggaacaactacagcatttctgggcgctgcgattgggttccacagactttggacagagcccattatactctcatcttctgagtcatggattaacttcatgctgtcaaaccatcctggtgctgtactgttcatgttcatggatgtctttttattgactggagcgcttattctgacaggagcacaagcaacacagatagcacgcaatctcacaactaatgaagcagcaaaccagtcacgctatgcatatcttcgggggcctgacggacgcttcaggaatccttacagtcgaggatgccggaggaactgcgctgattttcttgtaaatggatacagtaatgacgaggaggctgcatggccaacgcttcaacaaacagtgcaacgaagctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>GYHALQWATLNNYPHVALYIIEHGGDVNAGDNAQQTALHWAAVR GAIAAADVLLENGARVEAADVNGYRAVHVAAQYGQTAFLHHIISKYGADFECLDNDGR SPLHWAAYKGNADTIRLLLFMDANQVRQDKNGCTPLHWAAIRGNYEVCTVLVHAGTKE ELTLKDSGGFTPVELANDKGHRHLSYILSNATKVTFEDKYCSGRSRKIGYASILFCFL IVLITLFLNSIIFAPNFSRITAAVGIWSWGAISLAFASLVMFYRVSRKNPGYIQANTK RLDPKEPLMEIDLNSSAWTGNWSQLCPTCKIIRPMRSKHCPTCKHCVEQFDHHCPWIS NCVGRRNKWDFFVFLCMGTTTAFLGAAIGFHRLWTEPIILSSSESWINFMLSNHPGAV LFMFMDVFLLTGALILTGAQATQIARNLTTNEAANQSRYAYLRGPDGRFRNPYSRGCR RNCADFLVNGYSNDEEAAWPTLQQTVQRS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3..68#167..307#1078..1190#1853..1932#2440..2603#2814..2943#3038..3137#3335..3383#3658..3732#3909..4007#4628..4706#4780..4928#5373..5567#acggctaccacgcgctccagtgggccacgctcaacaactacccccacgtcgcgctctacatcatcgaggtccagctgctctactgtttgggctcctcgctgccctcagattggggtgtttgctctgttcccttttttttttggctgatggggtttggtatgaacagcatggaggcgacgtcaacgccggggacaatgcgcagcagacggccctgcactgggcggcggtgcgtggagccatagctgcggcggacgtgttgctggagaacggtgcgagggtcgaggcggccgatgtgaatggctaccgggtaatgcagtcgttttgttgctctgaaaactctaggtggtcttaggagatcagttgggagattagaatgtaggatgtttgttgattttagactttagattgttctgaaacagatagcaatgagccagtggcggagccagaaccgtcgtaaagcctgggcgagtgggcgactagtaacgttttctggtgacctactgatttttatacacgtcgatggctaatggcaatggagacggcaacggtggagcccgggtggccgcctaacctgtccgggagctgtccccgccgctgcaataagttaacctcttgttaataagtgctacattatgcaaatagaaatgagatcagcgatttactaaatcaatcatggttttttagtttggtaatacatggattgctggttgatcaagattgaagttattgctcaaggaactactgtagaatttgctgtacgtcttttttttttctctaatgaaaaatcacctgcattgagtttcaaaatatatcaatctttttgccatctgctgtgcaaatctaattcattggaaaagctgtttgtaaaaaaaattctatcagctaacaggagtacagggaggaaacttcttgaatcatgcttacttttctggataacctgtcttgttattagcttttcaacttttatggagtcacactgctggagataatataaccccgtctatctatatttttagcgttttgtagtgtgagtgaaatcttatggttcacatttctttgtttcgatcattatgtcaggcagttcatgttgcagctcagtatggacaaacagcattcttgcaccacattatctcaaagtacggtgcagactttgagtgtttggacaatgatgggaggagtccattgcactggtacttgattatgatgatactctttaccttttagatgcatgttttctcctagtttcacaagcctttcccatgaagaacatacaagaaaatggttgatttgaaacgtatcctggttgaaattttgtctcaaactgttcatgcaagtgaatcattgatatggcaaatatcttcgagaagtagaactgcagaagaatcaatgatacatctgtatcatttggtgctgatttgttggctatcttgcatgatcatcagttaaatttaacagccatcatgagttactcatcttgctctgctcctgtccctcatactgaagaattagcaagccccaaaatgtgaataatctgttaccaatttacttgttatgtaatatacttcacaacaaatcatttgtcggttgtcttctgagttttcactcttcttaatgatttaatctatttttgttggacaaaaaatgcatcggctattataatattccagaattatagtacaaaaatgtttacataaagtttgaatgcccatgtcagtcctgaagagttaattaatttatcgtaatatattgttagcttgatttctgttttcaagacatccataatatgaatacttttatgtattctttcagctatcttatctggttgtgtaactgtatattctaacatattcagggctgcctacaaaggaaatgctgatacaattaggttactgctgtttatggatgctaatcaagtaaggcaagacaaaaatggtaccattcacatgacaatcttcttcttttatgtgatattagttacatgtgttagctctgtgctaagagcaaaatatattgactagtgttcctgatcactatctacgttattcatgcatatgtatattttccatcctgtgtaatttataggagtagttagagaattattagttttatttttggtgaaagctatggacagctggaaatgtggaacataaaatttttctttcttgtcactgaaaagtgaaaactatgggtcctaaattctgtttagcatgtgttctagttgaaaaattagtctcttgttacatatttgttataaaacaattgcatggttttgtttgtttcactggtcatattccttcttgtttagagcatgggaaatgttgatttttttctaggaatagccaaattatatatgtcagtagttgctacatgctagtaatttatttgaggaagctcttaaaagtcacatttgtattaactatatgttgtgatgtcatgtaggttgtactccattacactgggcagcaataagaggaaattatgaggtgtgcactgttcttgtacatgctggtaccaaggaggaactcacattgaaggatagcggtgggtttactcctgtggaacttgcaaacgacaaaggtcatcggcatctttcctatatccttgtaggttcctccagcattaattataagatctagccttcttttcttgaaaatattcgctgcatgtttgagcacgaactaatacgggctaccattgagtctgcatacactacagcggctatttaggtgtgggctgctgtaaatggtgtggatttccacaatatttattcagttgctggttattaagttctaatatggtcctttctcttgtagtccaatgctacaaaagtaacatttgaagacaagtactgctcagggagatcgcggaagattggatatgcttctatcctgttttgctttcttattgtccttatcaccctttttctgaactcaattatttttggtaagcattgcttgtgattttcattttttgtattcaaacttgaacttgtatagcatttattcaaataactgatttgattgtaaaaattttccagcaccgaatttttctagaataactgccgctgttggtatttggtcatggggtgctatttctcttgcctttgcttcattggtgatgttctacagagtaagcaggtaggttatgtgagtgcataatgatgaggagatgagaaacttatttaatactatgcttattggtgtggcactctccatttttagtttttagttacatttcttaattttgaagacgttaatttattttcttataagcatattttctgtgcctacaccctgattgaggttaaatttgtgttcttatggtctttggatagaaaaaatccaggctacatccaagccaataccaagcgacttgatccaaaggtaaaacgccttaagtattgttcaaacaattttccatccacatgtacttcaacaaaatgcccctcattatcatttgtatagcatctcgtccctggaaattatgttcgaacaaagagttaaaatttgttacttcaggaacataaatgttatctggattgaatttgttgctgttcatgcgatcatctgtaatgataactttgtactccagcagtaatatcatataattaggattttggtgttatcataatgatgattattaatattgtctttacaggaaccacttatggagattgaccttaattcttctgcttggacaggcaattggtctcagttatgccccacatgcaaggtattgtaagaacctattttatttttattctttttaattccaaattccttttttcctttcatatttttgtgtatttcttcatactgaaatgaccatatctgcatatgatatttatttttttctattcttatgtatgtcagaaataccaattacatcttttttttgtgacttaccagataattcgcccaatgcgctccaaacattgtccaacttgtaagcactgtgttgagcagtttgaccatcactgtccttggatatcaaattgtgttggaagggtaagacgggagcaattttggaattccacctgaagttttcaatatagcttgtcttccattggaagaaagttctcttccgtgctgttgcagctgtattaccaactagcgattgcttaatagaagtcacataaccatagcctatcatatcctgctaacaaacaggaaacatattccactgtagcacaatgggtataatgtctctctgccctgttccagtgatttgttacagattaagtttcgaatgggattatgtagccataccttttattcttgccatactactaccaaaagttctattcatggactggagcattgtagtaatttcctctgaatattccatccacctaataaataggagggaaaattttttttttctccctggaagaacatgctgcttattgataatcctagactctggaaatgattaagaaatcagaacaatttattatacctatatatgtacgttctatttaccatttagtgctttgaaacattgggaatatatctaaattgcctcgttttggtcttaaaaaatgatggatataaatatctaatgttcaattatatcctgaaaacagatttgctgggtttccctataaccacatacgctttgcttgcagagaaataagtgggacttttttgtgttcctttgtatgggaacaactacagcatttctgggcgctgcgattgggttccacagtaaggagatccagtaaataaaactcataaattattcattaaagggtaaactcacgaggacatttaatgacaggactttggacagagcccattatactctcatcttctgagtcatggattaacttcatgctgtcaaaccatcct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|
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