Os11g0568600
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Structured Information
| Gene Name |
Os11g0568600 |
|---|---|
| Description |
THUMP domain containing protein |
| Version |
NM_001074647.1 GI:115485942 GeneID:4350746 |
| Length |
9500 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0568600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:23030847..23040346 |
| Sequence Coding Region |
23030921..23031124,23031630..23032061,23032623..23032762,23032852..23032972,23033681..23033821 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:23030847..23040346 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcctccggcgagggcaagccgaaccccggcggcggcggcggcgtggtggccaaggggaggaagcggaagtacctcccccacgggaagccggtgaggaagggggcgtacccgctgcgccccggggtgcagggcttcttcctcacctgcgacggcggccgcgagcgccaggccacccgcgaggccctctccctgctcgactccttctatgaagatctggtggatgggaaaggatcagatgggaagcccaaaagcatccctgataaaccattgaacaaaaaaattacgtttgcggattccgattcttcggatgatgaggaagaagatcattcaggggaggtgactgatgacacaaacaatgcagacaaaggtgaaaccacaccttctgagcagcagaaagaggtgtctgacacccctgtagttcccagcaaggacaatgaggaacaaacagataatgctgatgaatcaaaactaaagaagcagcgcgtacaagatcctccgatatctgaacagacagaaccaaaagagcctactgataagccaacagagtccactgataaaccaaaagggtccaatgataaacccattgatgatttgattgatgaggatttgaaggagcttggggataggaaaaagaggctcttcgcaacccttgattcaggctgcaacggttgcatcttcattcaaatgcacaaaagagatggagaccctggtccagttgagatcgtacagaatatgatgtcatcagctgcttcaactcgtaaacatatgtccagatttattctgaggtttttgcccactgaggtgacatgttatgcatcagaagaggaaataacaaaagcaattagtccacttgttgaaaagtactttccaaaggaatcttcttcggtatataagtttgctgtgttatatgaagcaaggtcgaacacaggtattgataggatgaaaattatcaacgcggtagcaaaatctgtacctcaacctcacaaggttgatctcagcagtccagacaggactattattgtccagatagctaagactatatgcatgattggggtggtcgagaggtacaaagagctcgcaaagttcaacttaaggcagctgacctcaccaccggagaagtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASGEGKPNPGGGGGVVAKGRKRKYLPHGKPVRKGAYPLRPGVQ GFFLTCDGGRERQATREALSLLDSFYEDLVDGKGSDGKPKSIPDKPLNKKITFADSDS SDDEEEDHSGEVTDDTNNADKGETTPSEQQKEVSDTPVVPSKDNEEQTDNADESKLKK QRVQDPPISEQTEPKEPTDKPTESTDKPKGSNDKPIDDLIDEDLKELGDRKKRLFATL DSGCNGCIFIQMHKRDGDPGPVEIVQNMMSSAASTRKHMSRFILRFLPTEVTCYASEE EITKAISPLVEKYFPKESSSVYKFAVLYEARSNTGIDRMKIINAVAKSVPQPHKVDLS SPDRTIIVQIAKTICMIGVVERYKELAKFNLRQLTSPPEK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>75..278#784..1215#1777..1916#2006..2126#2835..2975#9171..9257#ctcgtcggcctcccctcccctcccctctccccccaaaaccccacctcgccggaaaccctagagaaacccacgagatggcctccggcgagggcaagccgaaccccggcggcggcggcggcgtggtggccaaggggaggaagcggaagtacctcccccacgggaagccggtgaggaagggggcgtacccgctgcgccccggggtgcagggcttcttcctcacctgcgacggcggccgcgagcgccaggccacccgcgaggccctctccctgctcgactccgtaagctgctgatacgctggttcacttcccttcctccgccatctgcggctatggtgctctacactgctggtccgcgcgggttcgccggctcagtgtttgctcgtggtggtagctagaactcatcacttcggcgtttcgctagtcctattgtttcaaaaatctcgtgctggagcttgtggtgacttggatgttttgaaaattcaattagcagggacaggatttggagatgttaaatgttagcgttgtgttgtgttcattgggttcctctgttgtgatgatgtagttcatatgcttgtttaatttaccgcttaatgctgcaccctttgaacacattaagtaatgactgaaatgagaaattgatagtcgccgcgctggatgttggcttgtttgctagtcatatgtttgggattttctggctgtagagcttgcatgggcttatgctcttcttttttttttttcgagaaaatatacctcatgtgtgatactcaaattgttggatctgcagttctatgaagatctggtggatgggaaaggatcagatgggaagcccaaaagcatccctgataaaccattgaacaaaaaaattacgtttgcggattccgattcttcggatgatgaggaagaagatcattcaggggaggtgactgatgacacaaacaatgcagacaaaggtgaaaccacaccttctgagcagcagaaagaggtgtctgacacccctgtagttcccagcaaggacaatgaggaacaaacagataatgctgatgaatcaaaactaaagaagcagcgcgtacaagatcctccgatatctgaacagacagaaccaaaagagcctactgataagccaacagagtccactgataaaccaaaagggtccaatgataaacccattgatgatttgattgatgaggatttgaaggagcttggggataggaaaaaggtttgtttgaagttacttgctttctgcacaccctttttccccttatcactgaaatgtttgtttttgttttaaatattggcaaagcttagaatgttgtgattaactactctcttgatcaataattgaaattcttgctcagatactaaatttggaagttcacttgtagtagataaagggttttcaacaactaacatcttcaaaagtcaaacatgtatttagctattcattcattgatacttggttttattttggtcatgtgatgacattattgtgaacctatctggagctgtttaagtacattaaaggaatttttagtaacaaatttttttattaggagtccaatttgatgagtgacatgtattacatttcactatggtcaacaattagtgtgaatttggaggtgatgctgtattgagattattacctagcatgccaattgttcctcccaaacaatcccttaatacatgaaaacgatataaaatgatcaattccaagatatcctttttcccacaatggtttatgtactaacttatatgatgaaaacgattgtatgtcaaacagaggctcttcgcaacccttgattcaggctgcaacggttgcatcttcattcaaatgcacaaaagagatggagaccctggtccagttgagatcgtacagaatatgatgtcatcagctgcttcaactcgtaaacatatgtccaggttcagatttggttatgttgcaatctttgcatagatatactaggcagttattttcttgttttcagactttcctttttaatgcatgctagatttattctgaggtttttgcccactgaggtgacatgttatgcatcagaagaggaaataacaaaagcaattagtccacttgttgaaaagtactttccaaaggaatcttcttcggtatataaggtaactttctggcctaatttctatgttgatgttttcaatgtaatcttttagggacttagattcttagggaaactaagatctattataaaactgtaagagaagataggcatgttgccaggtcattttgtctatggtagctttattcatatttcgtgttgtccaattagaagacgtttctaaacttcattggagaggaattgttgttacttcaatgtgaattcaaccatcttaagtaaaaccagtcatgttgttacttcaatgtgaattcaactatcttaggtaaaaccagtcatcatgtataattgtgtgttaagtgttaacaccaggtgtcctttccatttaataaatggaacaatttagcacatggtaataaggctatgtacttatatatttgtatgatcatgtcagctgtaataagtcaatcgaatagcagtattactttttgttgattggataataatttgtaaatgatgagtcattagtttatcaccatttcccagttatccttcatagaagggatccaacaatattttatgatatttattccccttctccacccaatataaagtatatctgacattcaccacaccttgtggccatgttgcaatagctgatagtagtaataagaaaatataaatcaaattacctctattttgttttgctatacaaaattacatttctttacttggaggtttttaatctttgcagtttgctgtgttatatgaagcaaggtcgaacacaggtattgataggatgaaaattatcaacgcggtagcaaaatctgtacctcaacctcacaaggttgatctcagcagtccagacaggactattattgtccagatagctaaggtaaatgattttatcctgaatgcacttatgacgttattgtccgtaatgcatatgaactgttctgttagaaaaccatgcttatatcctatgattttcaccgaaaatccattgaatcagttgcttattcaaatgaaaactacatggatggctaaaactctgtaacatatcaggttaatgctgtaagaaccaattttgttaagcttttgaatcagttgctctgtcacacttcatgtagttgtagtgaaagcttttttgggtccaagggtgcaaatgggcaggcccgggaacccacttatagtacaaataccgctgggttacccgcttatttgtactataagtgggttcgtgggcctgtccacttgcacccttatttgggccccacagattttgaacaaaaatacctatcttgattgcatttaactagtaatatgcccgtgctaacgctacgtgacatctcacaacaacatcacaatgatactttgacaggaaaaaaattctgtacaaaaatcatgcttgatttcattgttatattttcttttgtataacagaacaccatattaatatgcattcaagcaattaacataaaagcccgagtacggtctgatataggttaacatgtaatactttacgaacaggaaattaaacatacacagtttgaaattcgaaacagtagtgatgtatatgtcttgactttttagattatacacagaatttgtgtagtattttatacaattattggttagatattgctttgaagaaaaacacgcatattttaatgataaataaattgaatagaccatgcaattcttattcaatagaacatatgcatcatgggttaatcccatctctgtagagcaggtcatcaaggcatacaaatacaaaaatatgaattaatattcattgacaaacgtaactaaaatctgattactgtgtctgcttggtgcctatgctttcttgcgctgcgatatcatcatgtccctcttctctaccttgaggataacaaaatccatttgttcctccttgaaaaataataaacaaggtcatgataaaaaagaacatgatcacaactgccagtaaacagatgaacaaaaataaaaaagatcatgcaaaacttacatctccaactgtatagctgtatcacctatgaagcacttaatgtctttattaacagcacgaataagatggattccagtgtaacattggatatgctgtacaattcttctatgaatcaatgatagttgcaacctggctgtgtgtgttagtatcagatctatgcaattagtctacaagaattacattattaggtggcaggacaagaagcactgttatatgtcgattgtcaaggacattcacattcatttgaagagtttccattaacctaaaacaggaaatgaaaccattgtatcgtatacccagccataccttttacctcttccaagccccacagcgttgatggagctgttcgattaaccagccagcacaagtacatcttattgatatgtttttcttcgactccaaattttatcttccttgttttccgttagcacacaattcaaactactaaacggtgagttttttgtaaaaaaatatagaagatatttgaaaaatcaaataaatccattttcaagtttataatggttaatacttaattaattatgtgctaatgagctttcttgctttacgcgcgtgaaaaatctttcttcaaactcaacaaaagaacgcaaccttatctcaagggatccaactgaacctatatggtctgattcactgtgcacccaaattaagaaatataaaccgagtacgtggtcaatatatatccacgaaaacactgaacatcttgaactaaacagatacttgaatagaaaatgcaacggccagctttgacttgaatctctcctctgaatgggatacttgaatagaggcaatgaccagcggttcattatttcctg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