Os11g0643700

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os11g0643700

Description

Nuclear pore protein 84/107 family protein

Version

NM_001074892.2 GI:297612266 GeneID:4351012

Length

8907 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os11g0643700, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:27370869..27379775

Sequence Coding Region

27378657..27378824,27378925..27379041,27379128..27379214

Expression

GEO Profiles:Os11g0643700

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MAGELNRFQPGVSIEISRLDAWYSDGHGSVESTAAYIIRGLCRR CCLPETILRSMQASIALSEAGDSLDHCDKLIELVASSESGIMHLFSQQQLQEFLLFER ECYLSKMELEEEQLEQLPADG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7789..7956#8057..8173#8260..8346#gggggtttggagctctcgcggcggccattggagagggaggggggaggcgcaaaccctagctgccaccgtccctgaggcctcgccatggaggtggacccgccgccgcctccgccgccgccgatggcgaactacttcgacccggagtcgtccggccgccgggaggagtaccgccgctacaggtgagacgctctcttccccctcctcttcgcgctccaccctttcgcgcgctcgccggcggggtgggtgagtggcgccgatgcgggcgttgctgcgagtgagcgtgatgctgtggtggtttcttagtttgaggggaaatggagtgaaattggttgaggagagatcgatttcctgtatgtgaggacactagatgtgctggtgttgcgtttgatgacgaggtgttcaggctgttggttcgtcgcagtcggtcgcagaacagtagttaagtctctcttgtcaggctcagattgctaagtactgtccgcctcagcttggtgacagtttagattgtccattttgtttcaacaaatctatggtcaattttggtgctgggaaatgggaattgaccaaatcaatagtcaagtaatcaaccaaaccagatatccgtctagtgttttttccccatgaggcaaaggtctattgtggagcacatgaatctgcctcgttttgcttttgagtgatccatgcccaagcaggttgtattcgcaaagatctgcacgaaaccagttatgttctaagccaggatatagtcagtactctagcttatatttcttcactgagttctctttgtgtacggttgagtacttgctgtagctaaaattgcagaaaagagtaaatgtaacttagttgcataaaatggtgagaacctgttactcttacgggggtggctactatactagctgattatttttctttcctctataatttaaacagaaagagattatcttcttcaaatgcctctccactgttgggtactgcggtctccaaattttcagaagcaaggctgttctgtgatggaaacagcatacagaggcggcccaatgctggtctactccttgaagatatcaagcaggaggctgctgatatttctgattttgatagcctggatgaatctaagctgtttggatcaggaaaaaaaagggcatcattggatgcctcagatgcaggtttcagttcaggtaggcaggcagtgcggtcggcattgaaatcagtcaaactggaggaggatatgccacatgaaggagaaacaacttctacaatttttgcatccctccttgattctgcaatccaaggttggtacaagcaatttagtttggatagcaagcgtcttatgaactgttctgtatctattttggcataggcagcctttacttgtgtgtttttctttgatgtctctttggtgcctgatagactgtagtttccaagctttatttgcacccttttgtctctgtaattttcacctcatgccattgcgtttgtttattagctttaatttgatcaaccatgaaactacgaaggctcttctgtaagctaacttgcatggaactcatgtagcacagttaacgatggatgcttgcaaatcatgcccactacttactcttaaaaatatgtcttttcactttacaagagaaactcttcctgcacaatactatagccaaataaatggttaacattaatagtagcaccagaagctggcaattttatgtgaccagaaatttaaattgagatacatttttggtactgtatctttgctccttttaacttcccttccagtcaatggttgattttactttgaaagggttaatgacttctgaattctgacgagtgattcttcttgcaggattgatgcccttctcggatgtgattttacaatttgagaggacatgtcgaaatgcttcagagtcgataaggttttctattgctttgcactataccatgttcaattctatagcctcctatgagctgctagattcggtctgtttgtcaccagtcagcgattcttagattatctctctgctattgaaaacgttcctgctatcctatcattaactcatagttttgttgcatcatgctatactgataaatcttatgcatgattactccaaacaatttgtgtataatttctgacagttgcaaagatgaatacttttatcatagctctgatgcctattctttggtatctgggcaatgccatccaatattcaggtccgctgggacaggaaagcttcggatggtggaggatagacttatgcagcaaaaagcgcaattgttactggatgaggctgcttcttggtcacttctttggtacctctatgggaaaggtaatagtttcaatcacttaagcgagacccttttttttcctttcagtaatggaaaccatagatcagcattattctttaagtaatcattttactgtaccctcaatgaaatttcatctgctacatgccaggaaatgaggagcttcctggagagctatttgtggtaagagacatatatagctgctgatgtattaagttcatttatctgcatactttgtcctctgaagtcaaaactgtaaaatcacctaaagtctgcaatatttttgttgataggcaccgactacttcccatcaagaagcttgccgctttgttgtaacagaccttacggcacagttatgtctacggattgtactttggcttgagggtcttgcttctgaagctcttgatttggagaaaaaggtaaaagtgcctgtttttttttttctttcgaagacttcacttcagtgttcttcattttctgctgagaagttggtaggaattgtttattgccgcataattgacatggaatagaatatcctgcctttatgccatgtaggtgagaggatctcatgttggttcatacctaccaagttctggtgtttggcatcgtacacaaaggtacataaagagaaagaacaatgatactactatagtgaagcatgtggattttgatgctccaactcgtgaaggagcccaacttcttcctgatgacaaggtaggctactgatgtatcgcaagttcaactgtacttggtaggtttgactttaccagaaccattcattacatattaatttccttgtttgaacagtagtgcagcatagcatgtgagacctccctaagttcattatagcatagcaggtcgtggataactctagcatgtctaatgcttcaaattttatttcttaactagactcgagcaaaaccacatgattagcagcagcaggcagtgctgtgtgtttagaaaataaagctgcttccttcaatagtcattttctaaatatctcatgttttagcatctctaatgaagtaataatggttaacatctttctttgtgtgggagcagaagcaagatgaattgcttttagaggatatctggactctcttgagagcaggaaggttagaagaggcatctgaactgtgtcggtctgctggtcaggtaggccagttagttgtatcccatgtgtttcttataatgtatctttctaccttcttttggttgtgtattgatccttgagtatgttttcagtcatggagagctgcaactctttgcccctttggtggcatagatttgtttccttccttggaggccatgctgaagaatggaaagtctagaacactgcaagcgattgaattggaaagtggtgttggacggcagttatgtctttggaaatgggcttcatattgtgcttcagaggttaaacatgctcttgtttttgaactatgctctgttgtgctctcaattaatggtctgaatttttttattttcttcaaattcattacacttttgtgtagccagcacataatgctttgcaaacctaaatctgaaattgataatatttatgtagaaaattgctgaacaagatggtggccgatatgagatggcagtatatgctttacaatgcagtaacttaaagcgtatcttgccgatctgtactgactgggaggtatactgtttattcagctcatgcaaacgttttgagtttgatttcttgaagttgttctttccttgactgaatgcgtgacctccatatgatatgttattttctctctgatttcctagtcagcttgttgggcaatgacaaaatcctggttaggtgttcaagtggatctagtattgtctcagtaccaaaccagtagaccagaagagaaacagtttgatgacgagatgaatggaacccaacctatgttgaactcagctggcccagaaagttggccacacagtgttcttgatcagcaaccccgtgatatatctgcgcttctgcagaaactccactcgaggtattaacattgcattgcatggcacttctatcaatccatcttttgcctatttatatgttctgtcattcttgtgatgcagcgaccttgtccatgaaactgtttctcgagcatgccgggagcagcatagacaaatcgaggtaaaatagacttgcaagaacggtgaaccacctgtcatgttattttttatgcattctcagcttagtttatctaatgtggtatgccagaattaaattagataaattttttatgcattcttcattagaatgctctaaactgggagcaactcatccaaaattacttgctaaagccagttttagactagggcagtcaattttttaaacttgtagtcgtttatggttcttaaattccaagcatttgaatattatatttgttgtttatttctcccacttgtccaaatttttatgtatcattttccatgactcaattcttcacaaaaaatcattttcgcatggtattaaatggagcatatagacaatttcaagaaactacactccttgcatagtcatccattataatagtgaacataggaagttgtttaaccactctctaatggccacttcccgtattattatttgatagatgaatctcatgagtggaaatatagctcatcttcttgatcttttatggtcatgggtgtcac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External Link(s)

NCBI Gene:Os11g0643700, RefSeq:Os11g0643700