Os12g0162400
| Gene Name |
Os12g0162400 |
|---|---|
| Description |
Similar to Calcineurin B-like protein 3 (SOS3-like calcium binding protein 6) |
| Version |
NM_001072755.1 GI:115487471 GeneID:4351575 |
| Length |
4424 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0162400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:3144130..3148553 |
| Sequence Coding Region |
3144388..3144445,3144864..3144976,3145073..3145153,3145518..3145570,3146043..3146151 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:3144130..3148553 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggtggattcctcggaagggctccgacggctcgccgcgttgctgttcaagtgctgcagccttgacagctccaatcgtcccaacggcctgcaggatcctgaacggttggcgagggaaacagtttttaacgtaaatgaaatagaggcgctgtatgagctgttcaagaagattagcagtgctgtggttgatgatggcttgatcaataaggaagaattccaactggcactgtttaagaccaacagaaaagacagcatgtttgctgatcgggtatttgatttgtttgacacgaagcacaatgggattcttggattcgaagaatttgcacgggctctttctgtgtttcatcccaatgctccaattgatgacaaaattgattttgctttcaaactttatgatctcaaacaacaaggtttcattgagaagcaagaggtgaagcaaatggtggtcgccacacttgctgaatcaggaatgaacctttcagatgagattatagaaggcattattgacaagacatttgaggaagcagatacaaagcatgatgggaaaattgacaaggaggagtggcgcaaccttgtgttgaggcatccatctttattaaagaatatgacactcccatatctcagggatataactacaacatttccaagttttgtattcaactcccaggttgaggacgcatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVDSSEGLRRLAALLFKCCSLDSSNRPNGLQDPERLARETVFNV NEIEALYELFKKISSAVVDDGLINKEEFQLALFKTNRKDSMFADRVFDLFDTKHNGIL GFEEFARALSVFHPNAPIDDKIDFAFKLYDLKQQGFIEKQEVKQMVVATLAESGMNLS DEIIEGIIDKTFEEADTKHDGKIDKEEWRNLVLRHPSLLKNMTLPYLRDITTTFPSFV FNSQVEDA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4109..4166#3578..3690#3401..3481#2984..3036#2403..2511#982..1041#782..864#517..640#ctctcctcccccactccaccgccaccgccgccgtcgccgctgccgccgccgccgcgcgaggaggacgggcggatctcccaatgaggtgactcctctcccccgccgatctccccgaatccccccgttccccgtagccctctctttctcccccgccggcctcgtcgtcgccgtcgtcgtcgctgggaattctgttcgtggatggggcggccaccaccgcgtagccgtgggagagaggattcgtttcgtgtttgggttggggggtgcagcgggtgggatccgggagtttcggttcctggggcagcggcgtgatcgatgatgggatatgtggatttcggttcacgtcttcgtgattccggcggggaattgccgaattgggggcgatggtggttgctgacttggtgtgggcggtggattcctacggtatattgggtgatctccttgttgttgttgttgttgggcgttgcaggtgtgaggcttgttgattggggagctgctggttgtagtttgcaattgcaaatggtggattcctcggaagggctccgacggctcgccgcgttgctgttcaagtgctgcagccttgacagctccaatcgtcccaacggcctgcaggatcctgaacggttggcgagggaaacagtttgtaagattcctctttccaactccccttctttttgatgattcgatgtgtacggaatcagtttcagtatatattcttaatagatggtattcttgttctgtttccgtttattcgtcaatgagtttattctgcttggttatgcagttaacgtaaatgaaatagaggcgctgtatgagctgttcaagaagattagcagtgctgtggttgatgatggcttgatcaataaggttagtagtatttctgctagtttcctttgctgtgaattggatggccatggatcaaaattagaattccgtggcatctgaactagttaactcagctgatggcattggctgtcttgacaggaagaattccaactggcactgtttaagaccaacagaaaagacagcatgtttgctgatcgggtatggctagctaattgagttctgtttaatgaagtttttatgatgttgttcatggtatttggtctgttctagcctttctgcactactgaatcactttatcgtttttcctagttttacacatcatgattaatgaagcacgtatgatgtagtacacattgtatgaatgtggagtagtcaatgttacatggaataatttaaagcaccgagaagttgatatttgaaaactctgctcatgtgattgcatatgtctatttgtgcatgtgagtgtgaatatatgtgtgtgaatcatgcacccgcaagcatggagagcgggtgttaattcttaccaagtcccctctgttattataaagggataattgcaaatatgccactgatttcaacccctaactcggaaaagccattataaatacccaaactgcaaattagccaccaaagttagttcccgttactttcgtttgccatcgccacctgaattggtacaatcaaaaggccaaaaataattcataaaactaacttaaaagataaggagcatgacaagaccatcttgcccctaaccggaaaagatcctcgctggctcgccgccctctcacttgcaggcatgtgggcgaatggcgggagggctgccggccacgcacaggtagagggcttgagggcggcgtggggatggacaatcgatgggagggcgcgctgacgggcggcgtgtcggcggacgacaggaggacatgtggccaggcggacagcggacggcgaccggcgtgcatgtcggcggtggttggagtccttgcgacgacgggcaacgggggtagggaaaatctcaccttttttgggtaatcttgccggaggtgcgaggaagtcgacggcagccgccgcgatagcagcagcagcacgttgcaacggaagcagcaacgctcgcggctgcagcacgagcacgcggcagcagcagctcactacaggcctgcagcgagagcagcagctgcaacaactccctacgatagcagcagcaagccagcaaggtggtagggctgcagcaagagcagcaacaatggcgggcgcccggagacggcagcagcagggaggggcatccttgtcctattttttgtgagaacccatcttttaacggtgttattcccagccgtgaatctaatggcaagtatcatgggttccaatcgttttttatggcaagcatgcaattacgttttttataatggcaaattcacaataccgattcaaatcagtggcaaatatgcaattggccctattataaattattagttactttttaaacatgcagatgcacattcctttatgccatcatctgaagtcaactcaaaagtgcgctgttttcaatttaatcaatttaggtatttgatttgtttgacacgaagcacaatgggattcttggattcgaagaatttgcacgggctctttctgtgtttcatcccaatgctccaattgatgacaaaattgattgtaagacatcatgcttcattttattttgtatatgtacttactgcaacatgggcaattgaataccaattttcattgttttctgcaatactatgcgacaattgcataagacattatcacaaaataattggtctgccattgggatcctagtaattgcaactagacactatcagtttttcgaagtgttccttggatgggagagaaatctgtggctgtgtcatttattatcaatccaagcctagcctccttattttaaagaccatgcaaactacttatgtatggtggcttatttattatcagttaaatttagttgagtatgaactttattatctgttaaccgtttttccttgatttctaacgtaacttatgtatttaattgattttcagtggagctcgtttatattacaaatatattccattatactataataattaactaatcatccttttgatattatgcttcaataacttgcagttgctttcaaactttatgatctcaaacaacaaggtttcattgagaagcaagaggtatcttccttctgcttgttcataagccactctttcttgttttgctatttactatactccatgagaagcaagtgttgcatttttttagacacatgctttcagtaccccatatattagcataatttcccacctaataatttagcacaacaattcaacttgtcaagtcatgttccaggataagccgtttactgtactggcttgagtatttaagaattgtgagagtttttatgtctattacggcaaactaaactgcatccctctggaaggttaattgtttatttgtttgagaaggcatacttgatttagcatcaactcatgtagcagctgttggtcaagaaaagttattctagtccttgattatcaggtgaagcaaatggtggtcgccacacttgctgaatcaggaatgaacctttcagatgagattatagaaggcattattgacaaggtatgcatgagaacctgcattgcagtacagtgcgtatatctgttgtatttatactcagttgcttatggagaaaaaaaacatttgctttgttactagacatttgaggaagcagatacaaagcatgatgggaaaattgacaaggaggagtggcgcaaccttgtgttgaggcatccatctttattaaagaatatgacactcccatatctcaggtcactgttgctaacctgtttgtgcattctgtttctttttggtatcttaggtcactgttgctaacctgtttgtgcattctgtttctttttgttcctaataaataacttgtcaacttttcttcctcaacatctacttgggatcaatggaatgtatgttgaggttactatgctagctagactctgagatatttactgaatatctgtacacatggtttctgcgtatttagtgacttttaacttgaaactatgcaacaaaacatattgaatgcacttagttttaaccttacaattagacatttacatagtattgcttctctatgtggaggccgtttgattccatttgatgtaaatacggatttttcggcttctgtaatacttgacatggcaacctttttctaatcataactttctccaacagggatataactacaacatttccaagttttgtattcaactcccaggttgaggacgcatgaggtcaagcttcagaccatattctagggtccagttcgttttatttcattttgttgatatctttctcgtgcttggaacaaacttttatgattgctccgcttcaagatgtgaatccgtagcaaggatgaagtttttaccattttttatgtatatacttgaagatggccttcaactcttcatgtgtagacttgtaggatgaaccgtttctcgtgatgtagaaatgttcttcaatcctaagataaacggttgcctctaccgtc</dnaseqindica> |
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