Os12g0171200
| Gene Name |
Os12g0171200 |
|---|---|
| Description |
Similar to TRNA nucleotidyltransferase (EC 2.7.7.25) |
| Version |
NM_001072807.1 GI:115487575 GeneID:4351629 |
| Length |
7042 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0171200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:3618437..3625478 |
| Sequence Coding Region |
3618608..3618787,3619669..3619799,3620182..3620299,3620607..3620659,3620763..3620812 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:3618437..3625478 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:3618437..3625478 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggcggtgtctccgccgacgccgcagcagcagcagcagcggtgcgtggtggaggtgagggagggcgtggagctgacggagaaggaggagcggatcttccgtcgcctgctcgatgtcgtccgccacttcggcctcggcacccagctccgcgtcgccggcggctgggtcagggacaagctattggggaaagactccactgacattgatattgcacttgataatatgacgggccagaatttctgcgagaaagtaaatgagtattcagaattattgggtgaggaacagaaaggaattggcgttattcagtgcaatcctgatcaatcaaagcacttggaaactgcaaggatgcttatattcgacatttggattgactttgtcaacttgaggtctgaaaaatatgctgaaaacagtcggattcctaccgtggagattggtacagccaaagaagatgcattccgtagggacctaacaataaatagtttattcttcaatatcaacactaacacagtggaagatttaaccggaagaggtattgaagatctgaaaaagggtcttattgttactcctttacctgccaaagctaccttcttggatgacccccttagagttcttcgagcaatccgatttgctgctagattcaactttacattaactgaagatttgaaagatgctgcttctgatgaaaaggtgaagtctgaacttggtagcaagattagcaaagagcgcatcggtcatgaggtagatcttatgatgtcagacaaacatcctgttaatgcaatgtgttatattcgtgatttggggttattttatgttgtctttgcttttcctgagaagcccgaccctccagttcctgacaaatgtgaccggctttgtgtttcacatattgaagttgcatggaatcttgctcattctattggctgctctgtgttcagtggtggttctgattccaagtcacaggatgagcaccgaaggctttgcttttatagtgcactattcactcctgttcggaatacaatatatttggataaaaagtcgaagaagattcctgtcactaactatattattcgtgactctctgaagttaaaagctagtgatgctgacacggttgtcaacgtacatgctgcaagtgaaaagtttgctgaattaattaatctccttgagtcgaatgaaaatctgacaactgtgaaagagaaattggatgatgaataccttgagatcccaacagactcagttaaacgtgttttggcagggcttatacttcgggagataaaggacttttggcgtgtggcactgtttatctgcactcttacctacccggaggttagcagtggtggtgattctctcggccagccagacgaattacatcaaaggaaagaaaaatacacaagagctgaacgtttaataactgaactggagcttgatggcgtatggaagatgaaaccgttgcttgatgggaaggccattatggggattatgcaggtcaagggaggtccacttatcggaaaatggcaacaacgactgttgaagtggcagcttgcttatccaaggggaaccacggaggagtgcatcgagtggatgaagcagtcgcagtcgaaacggcaaaaagtatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAVSPPTPQQQQQRCVVEVREGVELTEKEERIFRRLLDVVRHF GLGTQLRVAGGWVRDKLLGKDSTDIDIALDNMTGQNFCEKVNEYSELLGEEQKGIGVI QCNPDQSKHLETARMLIFDIWIDFVNLRSEKYAENSRIPTVEIGTAKEDAFRRDLTIN SLFFNINTNTVEDLTGRGIEDLKKGLIVTPLPAKATFLDDPLRVLRAIRFAARFNFTL TEDLKDAASDEKVKSELGSKISKERIGHEVDLMMSDKHPVNAMCYIRDLGLFYVVFAF PEKPDPPVPDKCDRLCVSHIEVAWNLAHSIGCSVFSGGSDSKSQDEHRRLCFYSALFT PVRNTIYLDKKSKKIPVTNYIIRDSLKLKASDADTVVNVHAASEKFAELINLLESNEN LTTVKEKLDDEYLEIPTDSVKRVLAGLILREIKDFWRVALFICTLTYPEVSSGGDSLG QPDELHQRKEKYTRAERLITELELDGVWKMKPLLDGKAIMGIMQVKGGPLIGKWQQRL LKWQLAYPRGTTEECIEWMKQSQSKRQKV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>172..351#1233..1363#1746..1863#2171..2223#2327..2376#2481..2579#3080..3189#3342..3469#3640..3730#4179..4262#5703..5765#5895..6039#6179..6343#6488..6582#6665..6766#ggcctcctcctcctccctctcctccgccgccgcagctgctcccctctcctcctccgccgccgccgcctccttcgcggttggcctccgccgctcgtctcagcgatcccatctagagccttcggttcctccggcttacccgcccgagcctgcgcttcctccggcttctcgggcatggcggcggtgtctccgccgacgccgcagcagcagcagcagcggtgcgtggtggaggtgagggagggcgtggagctgacggagaaggaggagcggatcttccgtcgcctgctcgatgtcgtccgccacttcggcctcggcacccagctccgcgtcgccggcggctgggtcagggacaaggtgagttccccccccttccctttttttttttgagaaaaggtggacacatctccttttccgcattgtcagtagagtacatggagaacagtacgagaagtagtgattgtatcaaaccattttggagaaaaaaaatcttgggaaacttggtttagggcttttggggtttgtggcccttcgaattttaactttgaagagctcgatactagtttgtttaggtactggaatgtgtgctttgtcatgtaagttttaggggttttttcctgggcattttgaagacattgttttgctatgtcattgacattttttttataaaaaaaaatcagtggatttttggctgttatagtttcaaattagtgtttcctgtggagagttccttgtatggctatgtttagggttcctgacaggagaaattaggtgactgcctgtgaattgtggggattgtcaggctgatgggctcagggaatggctcaatcaacttgttttgttggtcttggcttcttctagtctgtaagcgggagacatgtgcttccactgcatttagttggaaattttagatgcaaatagtgcacctgcacatggcatagtgtaatttacaggcatcttcctttaagagcagagaagtgaatatttccttgttgatatgcataatttgggtcttattggatgtgtgctatgtgaatgttgtattacacattcaaggtttgcatgatggatattggatactgcattgtatgacaaacagtcaaaggagatgcaggtagatccctgctttgaaaaacaaggatttgcactactgttgtcatttgcagctcatctctaataagaatatattgttgagtagttttgctgactcaacctttctcttttcatataatcgtcagctattggggaaagactccactgacattgatattgcacttgataatatgacgggccagaatttctgcgagaaagtaaatgagtattcagaattattgggtgaggaacagaaaggaattggcgttattcagtggtatgcaatctttataattttattcccagcgagtatatcctattactgttatctcagtttgtttttatcacttatttggtcaagctcagcagcagcaattaattcactgagatcacagagcacatcagcacacagtttatcaaataaattccacgacctttttgccattataagtttcatgttggtttgagttagtcctacaaaatattctcagttgaatttgtgaaacaaataaccttctcatagagtatcatgacctttagtgcaagaaaattatgaatactttctgtaccttaagtttatcatgctttgtcatattggcatttgtataatgccagatgcatgctgtcatgggatcgtgatgtttcgtaatttctttcagcaatcctgatcaatcaaagcacttggaaactgcaaggatgcttatattcgacatttggattgactttgtcaacttgaggtctgaaaaatatgctgaaaacagtcggattcctaccgtggtatgcacacatatcaagcattgtttttttttccagaattgtgtatatgctgttatgttcatatttccattatatatttgcatgtactgactatctgagtttttagttaaatttgcattgacatgtgtctttttggtgtggctttatatgggtatagtactagggaatggtacatttgttgactcagatgtcctaaataaccattagcatttttgggagcaatctataattctttcttgcttattctgttattcatgtttttaactctgatctccctcttagctatgacatttttttcaatacgcaggagattggtacagccaaagaagatgcattccgtagggacctaacaataaataggtatttgttttcagatcagttctgctctgcatttaaagtaatgcttttattgctacaatgttgagttgtctagtaaactctttctatattcaaacttggacagtttattcttcaatatcaacactaacacagtggaagatttaaccggaagaggtgagcttggttgttggatcctaacatagaagcttttagatatacataacctttttcaaatgttcatgctgtttgtaatcatgttgatttcatattccatgaaggtattgaagatctgaaaaagggtcttattgttactcctttacctgccaaagctaccttcttggatgacccccttagagttcttcgagcaatccgatttggtaaaacatccttttaattgatatacaatatttccattgctaattttatgctaagctataccattgttgttggctttttaggacttgatggtgttatcatcattatcatcacaaatatactttcagattacagatttattcatgacaagtttattttcctaaaagtaaataacatctcatatttaattgcattcgtactgggcaaattggccgctgaaaactccagaattgcttttctgtttcaagttagatactctttgctgaatgttcatcaatagccagtttagattcactttatatgcttatgttatcatgtgcacgaatcatgatatttgaattttctttgcatataagagcttgataattataggcatgatatcagtagacatgtaattgtctactgataattgaactggataccttgtttatagatttatcattgaatagcgtgcatggaacattgcatttcttttgcatatactaatgcatatctctcacagctgctagattcaactttacattaactgaagatttgaaagatgctgcttctgatgaaaaggtgaagtctgaacttggtagcaagattagcaaagagcgcatcggtcatgaggtttggttttggtcctacttatagccaacctacaattcctcttttctttcttcatgaacgtaaaactaaccagacatcatcattcaatatgtattgagtaacataatagaacgcccattatcaccaatttaatctgcttgtatttcgtgcaggtagatcttatgatgtcagacaaacatcctgttaatgcaatgtgttatattcgtgatttggggttattttatgttgtctttgcttttcctgagaagcccgaccctccagttcctgacaaatgtgaccggtgtgttcttgctataacatatatctactatatgttttgaattcattctactaaagggccacacaattacatttcagacatctgtacctgtagagcttcttctagttatttccattagcatgtgtgcttcacttgacagttttatctcctaatcttatatttgtatgcaggctttgtgtttcacatattgaagttgcatggaatcttgctcattctattggctgctctgtgttcagtggtggttctgattccaagtcacaggtgtgagaaacttcagaatgtgtccttttctttgttaagcacacaccattaagtcaaacaacctctctctctctctctctctctctctctcacacacacacacacacacacacacaaaaattgctttatggtcaaaatggtacttcaataacttcactgcaaataattaacaaaccatagtcacccttaatctttggtggaataaatgacgtagagaacttacagaaatttgtacacctgattgaaccattaagttttggagtaaaaaataatagttattattattcagaggacctatgacactaaacttttcactatagtcccatcttatttctgtgattggttcctatgttacactttccatgttatggctaaaccgaattaaacaatttgctatacattggtgtatctttgctttcctaacattaagatctgtgattgtgtttaggatgagcaccgaaggctttgcttttatagtgcactattcactcctgttcggaatacaatatatttggataaaaagtcgaagaaggtaatgtctaaattcttactcatgcatcctccacacttttctcctatgtaaatgcttttaactttttaagcaggtaaattatgtcagcttaatctactttggttaaacaaatcatctcccttttctacaaggatgttatagctagacttgcttcctactaggttagcaggagagatggggcgaacccagcatttctccaggcctcgggcaacccatggtgtatattggcccccacagtgaatacatggtgaaattacataggcttccatgggctttagacttaggccacccaggccatggcccaggtggcctgggacctgggttgtctgcccctgtaggagagtgcaggctagatgcatcatggccatatttttttgtacagactgaacagtaagttcatcaagttcgttcatttttgtactagcaaaattttttttcaacttttagtttacttgtgggtgcacttgtattttgcagtgtgaagtactagaatttcttgagagcagtttttgtgcatcatggttaagattttttttaggtattagctaaatgcctgtgctttgctacaatcgaaaacattttataatattttataaaataaataaaagtatattgttcatgaaatttcgtaccttcctttttttatagggaagactggccttactttaatttatatgtggttatccatttagatttagctgttatataatatcaagaagttcaaagggtaatatgtaaaagttcaatgggagtaggtggaatggcagattcactgccaccaccattggagtctttttaaaggagtatagaagtatagatgctgaatattatgaggtagtgcttagatttgcctggaagtccatcctaagttttgataagatgtcaggttgtttgtgtggctgtcaaagagtgaagagagtatattgtgaccatttagatacatatgtagccatagttttgtttctacggactgagctgaatatgtagagtagttcttagattaatttctgtacaattgtacaatgccagcattggttacctatgactgttaatttatgttctccagtaaaaccagttggcaaattgtagatttaactggtttgtagcatctagataatcagatcttatttcaaatgccacatatccctgagttttctgttaattagctttactgtgcttgaaattcttttgaggttggttgctgacgaaccgtggctattaaacaatatctttgtgtgaggaaatagctggtgcttgttttaactgccacagctatattcaacttaatgtaaaaaatgggctagaagatcagaacagagcctacaacaattattagcagtgaaccattttactaaccaaacaactatttaatcaccactttcttttgtattgtattgttttgtagcaagtatcctgacaagattgttgcatcatctacagattcctgtcactaactatattattcgtgactctctgaagttaaaagctagtgatgctgacacggtacaatttcctgagcaggcctcatcgtcctttttagcttattactgctatttttttcctcgaatattattcccgttactttgtacggtgagaaaataaatcaacttataatctgttctgcacttgaaggttgtcaacgtacatgctgcaagtgaaaagtttgctgaattaattaatctccttgagtcgaatgaaaatctgacaactgtgaaagagaaattggatgatgaataccttgagatcccaacagactcagttaaacgtgttttggcaggtcagcagagagtttgattttaaaatttgaaaataatttatattggttagtatttactgtctatttttgtgtgccagttgcttaatttgggaatttaatttgcctagtaatctaaaaattgtgacttcgagagttacagggcttatacttcgggagataaaggacttttggcgtgtggcactgtttatctgcactcttacctacccggaggttagcagtggtggtgattctctcggccagccagacgaattacatcaaaggaaagaaaaatacacaagagctgaacgtttaataactgaactgggtaaagaatcaactgatgactgccgacttccttatgactttctacatgatgttgtattactgtctgaacacctcaatgtgaaaaccaacttattcatatccttgttaagattttctgatttatatcttactacctcttctccagagcttgatggcgtatggaagatgaaaccgttgcttgatgggaaggccattatggggattatgcaggtcaagggaggtccacttatcggaaaatgggtatacctgacactaatcgactatgtctgaattgttctagttcctgaacacattttaacacatttttccttcgttctggtagcaacaacgactgttgaagtggcagcttgcttatccaaggggaaccacggaggagtgcatcgagtggatgaagcagtcgcagtcgaaacggcaaaaagtatagcgcaacacctgagaatcttctgccacatcaacattttgctggagcattggcagtcttcagaattctgatagggcacaaacttaacttcccaagttcctaggagtgcagcgttatcttgcgtgacatgtaacagcgcgttgttaggagtatagctttatcttggccgtcttctcttccgggtatccatggttgaaatttgcaaaattttgtggtcgaatatactgtactgttataccctatgatgaaagaggaaaatacttagtgtattagaggagc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
