Os12g0278800
| Gene Name |
Os12g0278800 |
|---|---|
| Description |
Similar to Zinc finger CCCH type domain containing protein ZFN-like 1. Splice isoform 3 |
| Version |
NM_001073101.1 GI:115488163 GeneID:4351978 |
| Length |
7920 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0278800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:10435170..10443089 |
| Sequence Coding Region |
10435451..10435606,10435992..10436261,10436862..10437167,10437974..10438099,10439867..10439926 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MADADARAPPKSDPGATPIGSISPSSAAPAAGEDEVEVEVEVEE QLAGLAIADQGEELLLPKPTGWEDGPVVVAGDEVSGGEKLPGEVAAAVGVEGAAADSR PRFPRRPGEPDCTYYVKFGSCRFGMKCKFNHPARKKKSRVKGSNGGSGSGGSNSSSNK ASSPDDEQQAPKEEYGSYVPDISPEVDSLGFADKGSASNLENFKKYSYEIIDVKKGRV EPKELKVAKEKRKEFISEGSSQEECKYYSTPGGCKFGKACKYLHRDGKEGKTDAEKVD LNFLGLPLRPGEKECPYYMRTGSCKYATNCKFHHPDPSNVASKDPQLEHENGDAPQQD VQGSSSQPNASIWPDQRTVNEHHVPFIAPSPSYSAGMLPPQGMYPPPEWNGYHQVPLN PYYPPGVPFQHFPAAPINHPMYKAPEIPGHQQVPSEEYPERPGQPECQHFVKSGFCKF RMKCKYHHPRSPVPPAGALSPLGLPIKPDQPVCTYYGRYGVCKFGPACAYNHPFNFSP VPAAGPPLLPAQYPTPGNYTL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7484..7639#6829..7098#5923..6228#4991..5116#3164..3223#2561..2605#2272..2331#1459..1521#782..862#132..554#ctttctctctctagggtttttccccactttcgttgcttcgcttcgcttcttcccccacctgctctcgtctccatcaccatcccttctctctcctctctctctctccagtctccacctccgaggagaggccaatggcggacgccgacgcgagggccccgcccaaatcggaccccggcgccacgccgatcggttcgatctccccttcctccgccgcccccgccgccggggaggacgaggtggaggtcgaggtggaggtggaggagcagctcgccggactcgccatcgccgatcagggggaggagctgctgcttcccaagcccaccggctgggaggatggccctgttgttgttgctggagatgaggtctccggtggtgagaagctgccgggtgaggtggcggcggcggtgggggtggagggtgctgcggcggattcgaggccgcggttcccgaggcgacccggggagccggactgcacctactacgtcaagttcgggagctgccgctttgggatgaagtgcaagttcaatcatccggcgaggaagaagaagagtagggtgggtggattggtgttggagctagttgtttaattattttgcgcgattttagggggtttttttaatttttttatgagggcgttttgatctggttttggtgatggcgagttggggtttggtggtttgcggatgggtgagacggagacgacttttgtgagtgggtttttctcatgtgtccgtgacttcgcgttgtttttgtttgtttgtctctgcatgcgtgtgtacaggtgaaaggtagtaacggtggtagtggcagcggcgggagcaacagcagcagtaacaaagcctcctcgcctgatgatgagcaggtgattagcgctttttatgcctcgtgttttacttcagctattcagcgcatgcatgtctgtcttgatttggcacgttgcttgggcttgttgtcttttctattgtattattatgttgcagcatgcaaatacactgttttttttttgtcttgaaagcgggtaaatgaaactaatatgatgaataattggagtgcacggagcttatgttgccatgttgttcatataagttgtgtgatctgaatgcaattagttttgatgctatggaggtctaataaattgctaaattttcacataaatttcagtcaccatatgtcgtgttttcgcggtggatattcatggttctaccatatccatgctgctataaactagatgtgtggcctattaaatgtttaaaagacaaacaagtgttaaacacttagcttacacggagttgatggaagtggccaataagggtggacaaaaattaaagagtggaaaacaagggaacggcaaatttggatggtggataagatattaagttaacacttgatagcaaataacgattttttttcttcagtaaaatttaattcgcctttctgttattgaatttaactttccagcaggctccaaaagaggaatacggaagctatgttccagatatttcacctgaagttgattctttggtgcgtcatctttactttattctataattgaatgtgaaggagtaacgccgaattcattgatgactaaagctagtgtctgtactgtgtccaagtgattgaaaagcagttgaaaatggtttcaaaagctgtgttgtagtacaccaccttgcacgttgacacttcggcaatatttttaatattgtacaaatctgtgtccaccatcatgaattgactagtttggatgtaactgcataggcattgcaccaaaatggttgtcctgaaaagcacggcatgccatactggcatacctaggtgtcgctaatttcggtgatgaatcaaccaccttgaactgtgaagttcagatagctattagaaaaacttggccccaaggggaaagacctcccctgaggtctttcaattaagaagaggcacccaaaactggggctgagaaaggccacaaaagcttgtcccccctacacgatgagtcgctccctatggattgggccttaacccatgctttgaggtccctaccccacacacgagggcacgccttccatttggcgattctacccatgtttttgggggaaccaacaagtgaccttttcttttgtgcgagaccaggatttgaaccctggtcagtagctttccactggaaggcattaccaccatgctacaagcacgtttgcagaattaactattagatgcacaatttatttatttttttccttttctataataattatctaatgttaatatcttattttctcgtagggatttgctgacaaggggagtgcgtctaacttagaaaactttaagaaatattcttatgaggttagcaaccagaatttcctttcagcatatcaagtaatttatttgagatgtatctattaatggttgagactcaagatacttgcctcttagtgaggtgtgattgttatggaggtgatttacattttacgccattcaacctgtgaaagcaattccaattttatacatgcattcatagctagaaattgaaagtatcacaatgtttgatgtgttctgtttttctttgttgcagattatcgatgtgaagaagggaagagtggagccaaaggaacttaaggttagctgttgctgctgtgtgattggcattatacaatatgaatgaactcttttgagttgcttgagaaatgtagtttgaattttcaaaattgtcatatcttttgttggttgattgtggaggatattgagaaattaatttgtttgatgaagttagatgaaatatattaaaatgttcgcaatttttatattattgaagcccctttggcagcaccttgatggtcagctggtcatccttttgtaaaatgtccattgtttgtgttaaatttttttatctgccttataatgttgtattatgggattttcttttttccccataccttcatatctatatatactgggtttcttgtagcaaattgcgtccttcatgcctcctgtaactgagtctgaactaacaaatttatatatttgctgtacttacatgataacaaacctcattgtcatgcaaaattctggttttatctaggatgttataaccttttggttgatctgtattttgtataaagtcttcattttattatctcctgattatactatcttctttttctgcgaggtactgaaggttgccaaagagaaaaggaaggaatttatttcagaaggtagttcccaggaggaatgcaaggtttgttagtgatctttcaccctatcgataagtctttgatcaattttgctcttaaagcataggggccatgtaatattaacagctgaaaattccttgtactggatattatgatgtacagactttcagttccttgaaaatccgtcctaaatgttctgtagattttataaatcgaaggtttaggggtaaggtgattaggcttgtctgaataacctggttgagcatgtggtttatcttattgaccactccatccgattccataattcttcttgttttggacaacgacatggtctccaaaacatatctttgattatgaattttctactataatatgtacaataaataaatatttaactttttaagactaatctatacatgttctaatgccttcaaactaaaatatttttaaagctattgatagtcaaagttctgatagtctgacctcaatcttgtcccaaacaagaagaattatggaaccagagggggtacattttagtaaagtaatgaagctgcattactctttttggttttatacttggagaaaataatttgggatcagtaaatctgttaatcttcacagcttatttgggggcattaaacaaccccatataccatgcattgtacatgtgcttgtggtctggagcagtcaaccaatggaatggatggctgaatcctgtgtctggtcactggtgtctctgatagcctaacaacctatgtgttatcaaggtgagctattcagcagagtagaatagcagcacagagcggagatcagagcaacatgagagccaaattttaaagcaaagcaaagcaaaccagctaagcagaggacggcatgtaggagatcagcatagcaaatcatgaggcagatgaagaggcagaggaagagcacaacagagtcatagcatgcaatggaggaatagtggagaagaggcggaggaagagcttacaagagtgtgagccagaggaagtagcagaagtggaagaacaactgagctggtcgcaagggtgaatgggtgattgtagaaaggcgcttgcagtggctagtgttcctctgctctgcatgtttctcaactccctaaaatttcacaattgttttctctcttctattccctgaaaccaaccattccaattccatgaaccaataaattgaaggggttcttacccttggaccaatcatggtggttctggtgcccagttcatttaggtgctaacttaactggtgggacttaggtgaagggacattttgtcttcttgttgccacctggatgccatggcgtcacttagatgatgccttgataacataggttgctacaccagaacataagttttagggcttgtttcgggagtttttgacagctgtagcttcttccagaatcaaaagctcccccaaacagtccaacttttcatttagattctgcgaagctgtagttgtagaatccagaaaatgaactataagccagattctcaccagctgcttctcagaatctaaagctcccccaaacaggcctttggtaacatgccatgaacgtacaacaaattatttatatcaactctagtgttcttttacatattctttagtaaatttcttcattgtattgctatatttctgtaagttaattttgttttgtcaccatagttgatcctagcatgctaccatagt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