Os12g0279000
| Gene Name |
Os12g0279000 |
|---|---|
| Description |
Similar to ATP-dependent RNA helicase DOB1 (mRNA transport regulator MTR4) |
| Version |
NM_001189974.1 GI:297729078 GeneID:9268439 |
| Length |
7210 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0279000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:10458044..10465253 |
| Sequence Coding Region |
10458134..10458439,10459096..10459296,10459377..10459595,10459672..10459698 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:10458044..10465253 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:10458044..10465253 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgaccctcaagcgtaaggccgattccgcggccgccgagctcgcgtcccctcctcccaaggccccgcggggctcggaagcactcgctgaatcgccttccctcgccggcgggggcagcgagcccgtcgcctgcgtgcacgacgtctcctacccggaaggctatgacccgtccgcccccgccacccacctgctcaacggcgtcggcggcgccgagggtgctgggcctgccaagaccttcccgttccagctcgaccccttccaggccgaggccatccgatgcctcgacaacggagaatccgtcatggtctcagctcacacatcagctggaaagacagtggttgcattgtatgcaatagcaatgtctttgcgtaatcagcaacgtgtcatctatacatctccaatcaaggctttgagtaaccaaaagtacagggaattcaaagaagagttctctgatgtcggcctcatgactggggatgttactattgagccaaatgcatcttgtttggtcatgaccacggaaatttggcgtagcatgcagtataaaggatcagaagtcatgagggaagtcgcttggattatatttgatgaagtacactacatgcgtgatagagagagaggagtggtgtgggaggaaagtatagtgatggctcctaagaactcacgttttgtgttcctctcagctaccgtgcctaatgccaaggagtttgctgactgggtggctaagagagtgctttatttctcaggtacataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATLKRKADSAAAELASPPPKAPRGSEALAESPSLAGGGSEPVA CVHDVSYPEGYDPSAPATHLLNGVGGAEGAGPAKTFPFQLDPFQAEAIRCLDNGESVM VSAHTSAGKTVVALYAIAMSLRNQQRVIYTSPIKALSNQKYREFKEEFSDVGLMTGDV TIEPNASCLVMTTEIWRSMQYKGSEVMREVAWIIFDEVHYMRDRERGVVWEESIVMAP KNSRFVFLSATVPNAKEFADWVAKRVLYFSGT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>91..396#1053..1253#1334..1552#1629..1655#gctaacctctcccttcgcgcgcaactccttaaaccctagccgccgccgccgccgccgtcgtcgccgtcgccgtcgccgccgccgcgcgccatggcgaccctcaagcgtaaggccgattccgcggccgccgagctcgcgtcccctcctcccaaggccccgcggggctcggaagcactcgctgaatcgccttccctcgccggcgggggcagcgagcccgtcgcctgcgtgcacgacgtctcctacccggaaggctatgacccgtccgcccccgccacccacctgctcaacggcgtcggcggcgccgagggtgctgggcctgccaagaccttcccgttccagctcgaccccttccaggccgaggccatccgatgcctcgacaacggagaatccgtcatggtacattaacctgcaagctaatttaatcccctccaccttcgatttattctggcattctaccttcgatttccattggctcctctcgtgttttccttttggtttgtttcgcctaaagtagacaagatgatgatgctcaatttttggcagctacaccgcttagccctatatttcatccctcacattctatcatgtatgatgatgagttgttctgtttagcctcaaatgaatcaattttgatttttacgttaagcctttggggagttcattcgtcgcacaatgtgcatatgcaaccaaaaggccactccataagtttgtcgagtttggctcagcttgttaagtttaggtcctctttggtagtttggtttgaggaatcaaaccatctaggatcagtgatccatcatgggataatcccacaaaatttgaggaatgactgcattcttcatccaatagcttagcatgtggaggtggtgctggacaaacctgttccattcctcaatccaaactaactcatcatgtatcaaatgatgagttcatcatcccgctcgtgaaaccaaacaggccatttattcatctgtctggcatgccacttaagttattttatggtttttcaatcagcattgacccctttatacttttgttttcatgggagtttccaggtctcagctcacacatcagctggaaagacagtggttgcattgtatgcaatagcaatgtctttgcgtaatcagcaacgtgtcatctatacatctccaatcaaggctttgagtaaccaaaagtacagggaattcaaagaagagttctctgatgtcggcctcatgactggggatgttactattgagccaaatgcatcttgtttggtatggtatccttatgattctttgaaatcatcccatctatgttaaatgttttgttacttaatcttgatctgaaaatgcaggtcatgaccacggaaatttggcgtagcatgcagtataaaggatcagaagtcatgagggaagtcgcttggattatatttgatgaagtacactacatgcgtgatagagagagaggagtggtgtgggaggaaagtatagtgatggctcctaagaactcacgttttgtgttcctctcagctaccgtgcctaatgccaaggagtttgctgactgggtggctaaggtttgttgccacgcttccctagaacacatttgatcaagcatttatcagcatttgatctatcttctttgaccataagagagtgctttatttctcaggtacataagcaaccttgtcatatagtatacactgactaccggcctacacctctccaacactatgtatttccttctggaggtgatggtttatatctggtagttgatgagaagagcaagttcagagaggatagttttcagaaaggtttgaatgcgcttgtccctgctagtgagaatgacaaaaagagggaaaatgggaagtggcagaaaggtctcttgacaggaaaacctagtgaggacagcgacatattcaagatggtgaagatgataattcagcgtcaatatgacccagtgatacttttcagctttagcaaaagggagtgtgaatttcttgctatgcaggtatgttcttctgtaaattactgtgatttagataacagaagattttattgatttggcaaacgggccgatttagtttttttttttactgcccttcttgtatgctatagatggctaagatggacttgaatgatgatgatgagaaggcaaacattgaaacaattttttggagtgctatggatttgctttcagatgatgataagaagcttccccaggtaagttgttttatatggctaagttgattcagataggttttcaaaaagacaggacgtttgaactcaagctactagcacacaggatatgtattgcctgtagctattatgcacttcatttgtatatgtacagtcttgtggaaactatttttcaaacaatcaaatgatacatcagtcatctttcatttatacccatacaataggttttctgggcctcttctttttcttaacaaagtttcctgtttcttcaaagtttgaactttaaagcacatatgtgttggtggaagactgctatcgacatagtaattaataaggttgtaccagtaccacgtcacaagatactctgataccgtgctataccagcatcaacagactaattacctactagtacagggaccattaattggtccataccttcaaccggtgcttgtattttatctttcatttagttcctttgataactgagcgattgggataattgagccatggggttttcacaggtttcaaacatgcttcccttgttgaaacgtggcattggtgtacatcattctggtcttttgcccattttgaaggaagtgattgagatactcttccaagagggccttatcaaggttagcatattatattattttatgtttcctatgacttcttcagttgctgttatttcctagccttatggctaaaagtgtatcaacagttcaattagcatactgactgactgctcatctatggaacaatgatagttagaagcaaatgttttgattcatattttacacttttactcaagatgattctggatgaccttaaagggtgcttgattgctcacctaagaacatatattctgatagctgtgactatttgcagtttcatagattaggcacttctatttgcctttgcaaacagtgaagtgcatctgttatatttaggatgtttgagttttctgcactcaattgcactgtagggtttgaatagaaagagagatctaaattttgtgaagtacttattttttttatattatgatgaaattataatttcaactgcttgttttatttgaaatgaaaatggtatctattttctgcttttgtgatccatgccattcattgtacttaccttggtgataaaatgctaacataatattaattttattatatggagcttagcacacttgtatgccttatctatttaagatatacctttttgttgtaacttttagcttctgagattgaaaccttgtgttgtagtgcttgtttgccacagaaacattcagtattggtttgaacatgcctgcaaagactgttgtgtttaccaatgtgcgaaaatttgacggtgatcgattcagatggttgtcaagtggagaatacatccagatgagtggccgtgctggtcgccgaggtattgatcagcgtggtatctgtatattgatggtagatgagaaaatggaaccttcaactgccaaaatgattctgaaaggaagtgctgatagtttgaacaggtaagtgtcctggattcactgcttatacttagcattttagcctggatgaatggtgttaatgagaaaacctgggcattggactgaaactatctgatctattactaaattaacaatggttatgctttaccaatccttttaattaagtagcctgtttctgtgcatgctattcaggtccttatatcaagaaaccttgagctatcatactattgcttaagttagtttaggcatatctttttgttgaactgttatgtttcttatagttttgagcgttcaattttttttcctgttttgcatggttctcaacttctcatgtgattatcctcctcttgatcagtgcctttcatttgagctacaatatgttgttaaatcaaatacgctgtgaagatggtgatcctgaaaagcttcttcggcactcattttaccaatttcaagctgatcgagttctccctgatcttgaggtttgttgacattgtcaatttatatttatgcttagtttttgggcttgaggattccatgagcaaattactaaacgatctacatgtttagtattcagtaaagtgagcagttctaattaataattacataccaaaattgattttccctcaggaaaaaaaatgccagtaaaccaactagtgcgcccagtaccaggtgccctagtatcacaattaatagcaattacactagcataaaaaccctgttattgaagcactatatttgcacttacgtattactctatttgaattttgtgcagaagcaagtcaaggagctggaactagagagaaattccatgattattgaggaggaggagaacctaaagagttattatgatctcttgcagcagtacaaaaatctaaagaaggatgtccgcgatattgttcattctcctaaatatgttctacctttcttgcaaccaggaaggcttgctcgcgttcagtacagtactgatgagcaatccaccttctctattgatgaaaacatcacttggggagttacaataaactttgaaaaggtgaaaacccatagtgaaggtacagaaaacttaaatggaaaatctgatcgagccatactgttatgtaatctttttctcttttgttgaagttgtttcccccgagttgtttggcaatgcaattccattatataacctacaagtcttgtaattagacattttaaggtggttttggaactgagtttaggctccagcacaagatatgcttgctgactaatcgctgcttcaaagttcaaatttgtatgaccacatttattttttctatgatcttgcacttaatctaaatgagctttgattaattgtggtagattgatatttgatagtctgtcctggatttttttgtcgtcataaaaattaggaccctttttttcggcaaattgcatttcatgagtctcattatgtataactccagcactgcctggttgtctggttgagaacacatgacaggggcatcttatagctattgtgtctctctttactcctgagttctgatttatttttttattaaaaaattcagataggaggcctgaggattccgattacacagttgatgttctcacaagatgttctgtaagcaaggacaaaagtggaaagaagacaatgaagattattcctctgaaagaccgtggagaaccagttgtgatttccttgccactttctcaggttatttccttttcctatttgaccggtgaactttttatgttctaaacatttataacaatgcaaagtggtctgttttctgtctaattcacagattgatggactaagcagcattcggatgcacataccaaaggatcttttgcctgtagaagctcgagaaaacacattgaggaaagttgatgaagttatttccaggtttgctaaagatgggatccctttattggatccagaagaggatatgaaagtaagaaaaaaaatcatgcatatcactcaggttatctctatatatgtagttctaacagcttgtttgtttttcttttcaggtacaatcaagctctttccggaaagcttccagaagaatagaagctcttgaaagtttatttgagaagcacgatgtccacaattctccacatattaaacaaaagctaaaagtgttgcatgctaagcaagaattatcaaccaaaataaaggccattaaaagaacaatgcggtcttccactgctttagccttcaaggatgagctcaaggcccgaaaacgggttcttcgtagactggggtaatgctttgatgcatcctttgacacgtatattctgataatatgctgatttggaattcagaatgagtgtctacatgtctaatgattgccatgcataagatagatcatgtttgttgtataaattttgcttgctgaaaaacaactttacaagggcaccagataaaaactgacaaacacatagcataattacataaccagtggattattctatcaaattagaaacaacatacaccatctatcccaattggcatgccctatgttagttgcatgtcaaattgtatccattcttttgtaaataaatataaattcttatcagaggatcaactttgtgacagatatattacaagtgaggatgttgtggaagtgaagggcaaagtagcatgcgagataagttctgctgatgagctaacattgacagagcttatgtttagcggcactctgaaggatgctacagtagaacagatggtagcgctgctttcttgctttgtttggcaggaaaagcttcaggatgccccaaagccaagggaggagctcgacttgctgttcttccagttgcaggagacagctagaagggttgctaaccttcagcttgactgcaaggtaattgatataactaagccatcatatggattgtttgttgatataattgttataaagctaggtggacttgctccagaattgtatcttaatgctgaaacaaaatgttctcgtcttgccgatgacagatccaaattgacgtggagagttttgtgaactctttccggcctgatataatggaagcggtgtattcatgggccaaaggatccaaattctatcaaatcatggagatgacccaagtatttgagggcagcttgatcagggccatcagaaggcttgaggaggtcctgcaacagctaattctggcatcgaaatccatcggtgaaacccaattggaagcaaaacttgaggaggctgtcagtaagatcaagagggatatagtgtttgcagcatctttatacctgtaaaatagcttgatggtctcctgagcatgtgaaggctatcaaagtcactctttctgttgagctgcctgattactgttgaaggggagcaggtccttggcagagaaattttgttgttactaccccagtaggcgctaactaaattaattggaattttctaaaggaatccagatatgtacccattttttcatgtgtacaaattacagatgtattggaaccttgtttatcatttgaaaatctaggtttgaggtaaacggtgtaatttgacgctatgtttctccttcaatctatcatgggttggta</dnaseqindica> |
| External Link(s) |