Os12g0292900

From RiceWiki
Revision as of 10:28, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os12g0292900| Description = ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein| Version = NM_001189978.1 GI:297729086 GeneID:9272053| Len...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os12g0292900

Description

ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein

Version

NM_001189978.1 GI:297729086 GeneID:9272053

Length

7339 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os12g0292900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 12

Location

Chromosome 12:11348931..11356269

Sequence Coding Region

11349369..11349480,11350623..11350628,11350720..11350790,11351231..11351330,11351900..11351901

Expression

GEO Profiles:Os12g0292900

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008405:11348931..11356269 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008405:11348931..11356269 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>gaagctgcgaggagagggaggcttcacggagcccagcaccgacttccggcgactgtgcggggagcagctcgagatgttccgggtggtcatctcccgcgacgccgtcctctctgtgtattgattctagttggtaatttcaccatatctgctggactaagagcagcggaagcttttcttgtaaaacaccagatggaaatcataactgaatttggagctgtagtccttccaatggtgaaacacccatttgttgttggtttccttgttgcggagctcccagaactagttggataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>EAARRGRLHGAQHRLPATVRGAARDVPGGHLPRRRPLCVLILVG NFTISAGLRAAEAFLVKHQMEIITEFGAVVLPMVKHPFVVGFLVAELPELVG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>439..550#1693..1698#1790..1860#2301..2400#2970..2971#ggtagcggaaacttgtgtccggtgctctccgcaatccggtcgacgccggtcgtttctggcgctcgcggctcgccaatggccaaaccaacgtcgtcgtcccaatagtccccttggcgttgttgccaccgcctcctcccgcaccgcgatgccactcctcgacaccccctacctcgccctccgcgttcgcctcccccgcttcccgaccccccacaatcccagacccgccgttgccatcgaagcccagcactcctttccccacggcctgctcgcccgtgccgcgtgccagccgctccgtcacgtcgcggctccagcggagggggagggggaagaggtagaggacctcggcacgccgtcggctgcggccgtggcggaggccatccggcgtgcttcgagcgcgtcgccggtgcgtttcaggagggtgcaccgggaggagaatgagaagctgcgaggagagggaggcttcacggagcccagcaccgacttccggcgactgtgcggggagcagctcgagatgttccgggtggtcatctcccgcgacgccgtcctctctgtaagctatatttttccctatgtattgatagcactatataggtttgcttgctactcctacagtcttgttctgctcaaaataagtcacctatgagcaatatagttattagatgagaataggtactaccatcttatgttattttaaggaacaaaaagtacatcgaaacattggagaacatataataaggtaaggatgacaacaaaatgatatcaggagtccaggatggtaatatccaggtccaattgtgcttatgtgcacaacatttgttcatgaacagttgatgattaaatttaactgaataataattatagtaaaattcagaaaaccacaagttttatagtttaagttgcagaaaaccacatgtatattctgacttgtggcatataaccacaggttttatggtccttatgtttcataaaacccacctttagacagatctcgattaatttcaatatatctgaaacgatattttgcaaattagtgaagagttaaactatcaaccttagtcaagaacgcaataattataaaaaattatatgcactctatattttaaaattttaagtaattaaatccatagtcaacatgcatcgaggttttgtgaaactttagaaccatgatggctggggttatgtgccaccagtcaaaataccaaggattttatgtaagtttcaccgtaaaatatgtggtttcgtgaaatttactctaataattaataaggagtgtagaagtttgttttcttctagactacgtagaaaaggttttgaagtgcatccccttcttctttcaaaaggaaatgtaactgctatattttcatttgtggaaattttctattagcccctgcaaatgacactaggattcctcagcccacaaaaatggagtagcaaagtgtttgtgagtgccaacagttttcatgttttttgtagcaaattctgaatttcatcctttggaggtgtaaagtatgagagcaaataactagttccgcgattaatctgaaacaatcatgtcaccatttgtttcgtttttagcttatctgccatttagatgaataaattcttttcttgttaggaatttattaggtgcttatttcaacctatgtggtcataaattaataaagaaaatgtttttatctatttattttgaaggtgtatgtaagacctgctggcagttatattatggatcagcttgaattacgtcgagttgctttatatcctgaaactaatgtttctaaaggagatacagtgattctagttggtaatttcaccatatctgctggactaagagcagcggaagcttttcttgtaaaacaccaggtaaattattcattgccttttaatccacatggtacttttcatagttgtaatactgccaatgaagcaccttatttcgtttaagaattgtattgattggacaaaaggttaacgaacacctgacctcattcttgtcaccacatgtgcggatgtgcctatgaaccaatgcagagttcacttgtgcatacagcgggaacaacattatttaccatttatgtgggttaaaacttagtgtataaacttgttttagtaaattatttattttttaatcaactgaacatgcaactggcaaatagtagggcaatgttagcgttaaagagattgtcaggccacacctgctcatccagttttagttacagcagctattgagctttcaagtttaatcatgtcagttcttcctatttgttttaatttcattgattactatatctcatatgctgcagatggaaatcataactgaatttggagctgtagtccttccaatggtgaaacacccatttgttgttggtttccttgttgcggagctcccagaactagttggatgtacaaagaactccgagacttctgatattcagataccatcacactcattcttagacaagtcatcagatataactccatatactaaaggggaaacttgggattttcaaacttctggagaccaagctaatagttatgctcagttagttactgaatggaaaaatagtgcacttatgatttctcgaactttagcaatggcttatgtcatggaccaggtagtttgttcatgaccattagataatttttattcaaaataaaatcattcattaactgtttttgactggaatcattaactgttgccagccaatgcctataacctttcttgtagacacatattattttggaatttgggaaaacatgcaattaggaatgcagttttgaggcatcccctttgatatacagcaggcatatgtgaaatatttcctgatgttttattcataaaacatgggcatgtgtaacagatatgctcttgataaactgaagaaaatattccataactgaattcctcgcctgctctagtttacattgctagttatatattttggttattcacataagtgcattcctcgcagaaagcatatttgcttcagcaagcttcctggcaaaacaatattagaatgagtggcttagtagaacaggcaagtttttaacttcaaagtaccaactgaaaaacatcatagtattcatcttacaagaatccctttggcagattcgaggacccctcgctaatataagagctcttgcaaagatgttatcagttcatacaaagagaaatgaggtatgtggatcaattctcattaagctgttcattgtttttcactttgtttaaatgaatcttgaagttgtcttggacgctttcctggttgggtatcctaatttgattttttgcagatctcttatgatattgttgaagacgttatgatccaaggtgatcatttgaaagatgctttgcaacagattcaagatgcagtttatctgactaaggtaacattgtaatgacatttcataaatcactgacaaaactgtgtgctctacttaaatacacctctttcttattagcttggaaaataaaaaaaataagaaagtactgctactaagcgttaggctggaaatggataccaagggtaatggggtacatatagggatgcaatgggaaaagtgcctacaaatgggaacaaaattaagtgaaaagtgaaccatcagttcagtggtgtaggccaatgagcagacctatgtacatcccaaatgataaaacttaattaagacaatgttttagcatacaaggataattccattatctcttatgatttttcctcacgtatccctaagtgaatttttgtcatgttatctgaacaggtgaacatagttaggtacaatgaggaaaccttaaagaaaattcaggggtcaccttcttcaagaactctaccacactatcaatcagatcctaagaatagttcacagaaagttgattcgttgtcatcacatgattctgacaatggagacatggtgatacccatgccacctctctggctggcccctcttcaaccccaagacgctaggtaacagtttgcttcaatttgccattccaagatgttgaactctcagttacatagtagactaatttcatgcgttgaatgctttgtttaccaagaaattgttgtagctgtgatttacttgtagttcagttttagttatttcaaaataagtgtagtctatcacagaccaataactattgattaccagtacccaatgcatagtgtcactcctgttttcagtaaaacttatttttgtcatagttttcatgtgcttctaaagtactccctctgtcccaaaatataacaacttttagcctttagaatttgccccaaattataacaacttctccaccaacattcccttctcaaccaatcacaacccaccatgcaattttcccacctacctccacttctcaaccaatcacaatcttccaccatttaattctaagtaattcttaataaccgtgtccaactctaaaactccttgtattcagggatggaggtagtagttgtttgcacagattattttatgctggaccatttcttgtgtaataactattttattgtttactgaaataaaaatgcacataacatttcaatggtttcaaataaatctagctgttgggttcatgaaacatcatatcctagttattctacactattcctaaccatgcttatatttcaatatttgagaaaaccataatactctaaatttcatggtctgtttttctgtactagcaaaagttctattgtggtaccatgaatatcaagtaaatattactgtacatttcaagtttatgttatcttaattgccagagtttcagactgacaaagttttgcatttgagatccattacaaaggtagaaggatattatgcaaaacatatgtgaaatctaaatccattgtactatgcaaatatgcaactaaaaagggaacaggaaagcatgtagcattgaaattaagtggagaataaaaccatcattttcttaaaaaaagatctactgatccaaagaaaaaacatatttacattgaccaaatttctgaaaattttcattacatatatcttgatcaatgcctatgtattaaacactactattcgcaatgcttgttttccgtgcacacggtttgtgaactgctaaaatcatattgagaagttgctttaaaaatcatattaatccattttcaagtttttttagctaatacagtactgaattaatcatgcgataatccgtcgctccattttgtgtgctggaggaagtggtcccagcacttgcaaagaacgcggcctaaactgttcttttacctcaagcaccaactccatgtttttgtccagaaaagtttatttcttttcccttacccagttgaatcgatttaattttggtctctcaactacaaaaccaaacaaaactcatctcctaactcttaaaactagaaaccagataaaaaatgtccctcctaccaactagaagtggttttcacatatgttggtggacagaagaagaaaaacaaagtcagaaaaaagtggaccatcatcagtaaagatttaaattttaaattcaattgatgctagaaaagatttatgtttttctgacattctttgttcttttgtgaactaatttttgtttcatctgtcttcttgtttcacagtgttgatcaagacaaaacaatcgtccatcttgtcccttcccataaatctttctttttgcatttgatttattggggtgtttgtatgaatagtgtatatattgaaaaaaatcacttttatcgatttggatagtgttggggtatttgctcttttgaggacctcatgtcgcccatgtcccgtgtacttgtatgtcagtactttatttgtttacatctcaagttaccatatttttaattgcttgagtaaaaaataacttagatgttagtccccaacaattcaattgtgcattatttgtcactttatttgttgtcaggcagaccatgtgatctctctgttgtactggaagatttggttggagcagctcaaccgcttgcttttaggcagcaacgcactctagatgtaacaggaatttcacacccgcttcaagttgctgttgaggaatctgctttaagacaagcgctgagtaatctcatagagggtgctcttctacgcactcagcttggtggccgagttcagatatatgctggtgaagcacctgcaggaggcattctcgttgtcattgatgatgatggtcctgacatgcaatacatggtaagtacatttgttctttcatttgtaaggctctttagtgtttcataatgtttttttagataatggaaactttattggcctctgcataactaagatgcacacagccaaaacacacacccactctagttttgaaacaaaagaaaacataaaacatagggagaattatgggacatcaatccaatgtaattatgacttttcatcagtgtgccaaagaattcctttgggacaacaatacaagagcatctcattcaaactattgtgcaatgtactaataatgaaatatagtgtcggttttcaattttctagtgaaacctaaagttaactgatggtcaccagattgagatattttattttagatgcgatattttggaggcctaaatttgtttgaactttggttcacttgcttgtattgcttcaagcactgtaagaatattttcatgtccagcaaagtttttatttatcattgacaattggttcaaatttctgatttctatcattttacagacacagatgcattgccttgctccattcgggtcagaccttgcggatggtatgcatgaagataatatgacatggaatttcattgcaggattaacagttgcccgtgagatacttgagaactatggctgtgttttgcgtgtgatatcgcctcggagacctgatgcaattatagggactggaggtagtcgtattgagatatggttgccaacttcacagacagaactatctgagatcactgaaggagcttagctgaattttagtaatcaacgcatgtttagaagataaaggtaattatgcattcaagctattatggtcatttactgaagctttatttgttgtcataatcttactttgtcagatccatcatgctatttagcaggtcatgtttaattggcatgatggagatcataccaccttttctgttttggaaatgttcgaacgacggctgcaaagtgagcttatacttctgattagatcagtcatcagtgaagcaccatatgaacatctttacacgcattccagtaaagcatgttacctgtggaaaaagcaccatatgaacacctttggacgtttttgtagcataaggaactgtagcacggtatacagtttgtatggtagagctagataccgcacttatgaaaagaagtacttttttgttgtttcgcagagc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os12g0292900, RefSeq:Os12g0292900