Os12g0448900
| Gene Name |
Os12g0448900 |
|---|---|
| Description |
Similar to Pathogen-inducible alpha-dioxygenase |
| Version |
NM_001073250.1 GI:115488461 GeneID:4352160 |
| Length |
10266 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0448900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:15478306..15488571 |
| Sequence Coding Region |
15478572..15478755,15479062..15479305,15479793..15479995,15481033..15481260,15481432..15481577 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:15478306..15488571 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:15478306..15488571 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggttcaggactcttcaagcctcgtgttcatccggacctccgtgatgttttctctaagatgtctttctttgacaagattggctttctattcattcatgcatttgacaagagaaacctgtggcacaaggtgcctgttccgatcggtttgctctacctgaacacccgccggaccctgctcgaaaaatacaacctgctagctgttgggaggagttctcacggtgctctgtttgatcccaaggagttcctgtaccgcaccgaggatggcaagtacaacgacccccataatgctgaggctggtagccaaaacaccttttttgggagaaacatggagccggttgatcaacaggatgagttgatgagcccagatccatttgttgtggcgacaaagctgttagccaggagagaatacaaggacacagggaaacagttcaatatactagcagctgcatggatacagttcatggttcatgactggatggatcatatggaggataccggacagattggaatcacagctccaaaagaagtggccaatgagtgcccactcaaatcgttcaagttccaccccacaaaagaactgcctacgaattctgatggaataaagattggtcactacaatatccgcacagcttggtgggatgggagtgcagtatatggtaataatgaggaaagggcagaaaagctcaggacttatgttgatggaaaactagtgatcggagatgacggtcttcttttgcataaggagaacggtgtggcattatccggcgacattcgcaacagttgggctggtgtttcgatcttacaagctctttttgttaaggaacacaatgcagtttgtgatgcaataaaggaagaacatcccaacctatcagacgaagaattatatcggtatgccaaattggtcacttctgctgttattgcaaaggttcacactattgattggactgtcgagcttctcaagacaaaaaccatgagagctgcaatgcgcgcaaattggtatggattattgggtaagaaaataaaagacacatttggtcacataggaggaccgatattaggtgggcttgtgggactgaagaagccgaacaaccatggcgtaccttattctttgactgaagagtttaccagtgtttacagaatgcactccctaataccaagcactctcaagctcagggatccgacagggcaacccgatgcaaataattccccaccatgcctggaagacatcgatattggagagatgattggtctcaagggggaagaacagctatcaaaaatagggtttgaaaaacaagcattatcaatgggatatcaagcttgtggtgcacttgaactatggaactatccaagtttcttcaggaacctcattccacaaaatttggatggtaccaatcgatctgacagaatcgaccttgctgccctagaagtataccgagacagggagagaagtgtaccaaggtacaatgagttcaggaggagactatttctgattccaataaaaagctgggaggatctgacaagtgacaaggatgcaattgaaaccataagagcaatatacggagatgatgtagagaaattggatcttcttgttggtcttatggcagagaaaaaaatcaagggatttgccataagcgaaacagcattcaacattttcattttaatggcatcaaggaggctcgaagcagatcgattttttacaagcaatttcaatgaggaaacatacaccaagaaggggatgcaatgggtcaaaacaacagaaggcctacgagatgtgatcaaccggcactaccctgaaatcactgccaagtggatgaagtcctctagtgctttctctgtgtgggatgcagactactag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGSGLFKPRVHPDLRDVFSKMSFFDKIGFLFIHAFDKRNLWHKV PVPIGLLYLNTRRTLLEKYNLLAVGRSSHGALFDPKEFLYRTEDGKYNDPHNAEAGSQ NTFFGRNMEPVDQQDELMSPDPFVVATKLLARREYKDTGKQFNILAAAWIQFMVHDWM DHMEDTGQIGITAPKEVANECPLKSFKFHPTKELPTNSDGIKIGHYNIRTAWWDGSAV YGNNEERAEKLRTYVDGKLVIGDDGLLLHKENGVALSGDIRNSWAGVSILQALFVKEH NAVCDAIKEEHPNLSDEELYRYAKLVTSAVIAKVHTIDWTVELLKTKTMRAAMRANWY GLLGKKIKDTFGHIGGPILGGLVGLKKPNNHGVPYSLTEEFTSVYRMHSLIPSTLKLR DPTGQPDANNSPPCLEDIDIGEMIGLKGEEQLSKIGFEKQALSMGYQACGALELWNYP SFFRNLIPQNLDGTNRSDRIDLAALEVYRDRERSVPRYNEFRRRLFLIPIKSWEDLTS DKDAIETIRAIYGDDVEKLDLLVGLMAEKKIKGFAISETAFNIFILMASRRLEADRFF TSNFNEETYTKKGMQWVKTTEGLRDVINRHYPEITAKWMKSSSAFSVWDADY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9817..10000#9267..9510#8577..8779#7312..7539#6995..7140#6581..6794#6271..6404#5679..5828#4659..4922#3763..3852#agagcgtgcgggcttcttctcctagcatgagttgagcctcttaataattttctccgaaaaggcgtgctttaatttcctctgagattgagctcagcagtacatctccaggtttttcttctgccagcaggtaattaagcattgtttcttgaattcttgttgagtgctttcatttaatttgcttgttccgatctggtacctgcatgggttgccgcagatgacacagagagcgtgaagaaatttctcataacatgtgcagactcaaacacacacacacacacacacacacacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatacatatacatatatatacatatgtatacatatatatacatatacatatatatacagggcttagacgttctccttttgatttcactcgtgtgttaccttgtggttggtgtgttattaaccaggattaaaggttagagaacctttattatatgttcgtaatactgaccgacactaataagagggttcgatgcacgtaaaatttagacccgagacctggtcctcaataaactgctgcagcgggataattcttcttgtgatttttgcaacttctgatcgaccaactgttatgtggttcttccttggcctcccaatggccagtgtgggttgcctcttggtatggcaaccacgtatgacgccggactgtactcctgatggagtcaggcctccttcttccaaagcctttacacataggcagtgtttagttcccttcaaacttctaacatcaaactgtgcaattcgttattttttatctacatttaatgttttatacatatgtacaaatgtttgtacatatgtataaaacattaaatgtagataaaaaataacgaattgcacagtttgcatgtaaattgcgagacgaatcttttgagcctaattataccataatttgacaatgtgatgctacagtaaatatttgctaatgacggattaattagacttaataaattcgtctcgcactttacatgcggaatctgtaatttgttttgttattagtctacgtttaatattttaaatatgtgtccttatataaaaaattttttggcacacgacggccatagactgacataggttgacataggtgacctatttttaaggaaagggcaattaaatttgttaatcaatggaaaaacaacgttttgttccatcgatcacctgaatcgatcatgcagtgtttgttatgaatcgatcatgcagtgtttgttattcttcttcctcggttcctcttagtctccattgtctgccataacgagaatattcgcatctcaatccaggagcggtagatcaaacttcaaactcatcttggaaataaaatcctgaatctattgttataagctgtagaatcctagtagaaacacacgaaatactctggatgtataaaataaagttgatctccgtataaacctcctcctcgtaaacatgggttgcaattgaacatgaatttgcattcacataattaaacagaaccaaatcaatgcaccggaattgatttcctggtacgaagggcatgtgcacgcaaatgcacaagcaaaatgatgcatgcagggatgcagctatatatccacagttgagaggtctcgccaatcgcaggcggatgcatgcacaagagacgtgtaatcataatcctgtccagctgcaacgaccacaacccacgattttgctgtcagtgtcgccgtcgatgtctgaaatttcttccttgtccacctggcgcgtactatgcagctgcgtgcgtcgtactccatcactgtcctacgaatagtactctctccatcactataaagttcaacagtaacttttactctctccatattatttaaaaaatttataaaaaatatataaaaattaagtcaagtataaaagtattattcatattttatcatctaattacaataaaaataccaatcataaaaatatttcaaataaaacgagtggttaaagttgagcactgaaaccataactgtattaattattatgggaggaagggtacaccatcttattcgaattgagggtacccacaacccacaattgtacttatgtatcaaagcctcctccatattatttgagctgcagctggatttattcgtatttattcaggccttcctttggccacgagttttctcgtcaccttgtccttccgaccgtatttattcgtgctgaatgcgatgtgaggtttttggttgggctgtttaattaggtcttgtttagttcgcgaaaagaaaatttttgggtgtcacatcggacgtttggtcggatgtcggaaggggttataggtcacgtatgaaaaatctaatttgataactcgcctgaaaaccgcgaggcggatattttgagcttaattaatctgtcactagcacatgttggttactgtagcacttatggctaattatagactaattaggctcaaaagattcgtttcacgatttctatgcatactgtgcaattagtttttttaaatctatatttaatactccatgcatatatccaaagatccgatgtgactttctgggaaaaaaaatttgggaactaagctaggccttagttacatcgaatgttttatggagttttcgcatactaataaaaaaactaattgcagattccgtctgtaaaccgcgagacgaatttattaagcctaattaatctgtgcccagcattaacgcctcacagatagactccacctttgacttgctgactagatgagactaacgacgacatagctaccgccgtcgctaatcagatcgactcttcgatccgagaaatcgcaccgatggcagggattgcagaaagaaaaacgaccacgtcgtgtagatcgaatctccaatgctctgataccactcgttaagaaaatagatacataacgcagacacggaattttacgtcgggaaaaaaccacgaacgccaactggcaatgatcactatttaggagtcagatacaaacgcagggatacattgcactatcgcacctcttcctgtgcggcttacaaaggatacatataagagaatctaggagtcctaataggcaaagactcgaagtcctagtaggaaactaatcctataatacaaaatactagtagaaaactaatccggtcatattgattgcttaaattccgatcacatatttaacaatttggctcaacaaattggttttacatgcataataagaaattttcgctgcataataaacaaatttacatgccgtatcaacgattggaactacaacacatataaaacaagtttgaccggtccgtgggtgtgtttagtttacaccaaactttccccaactcccaacttttcatcacatcacatcacatccaaaactttcctacatacataaactctcaactttttttccaaactaccaacttttcacaaacttctcctcaatttcagaaactaaacacagccacggtatcactgtatcagcccccataaaattatcggtcctgagcagctacacctacacatcatatcttttttatttatttaaacgcctatatagtacgcaacttaccaacaaatcaatcatgcacatgtctttgagtatgagaacatactgagaaccggttgatctgcatgtcttttctattaattataaacatagtactacaccttattgattgttataccttccaaagaataatacattgttagttacttctttgtaagccctgatattcaagatcattcattcatttaatttgtttgcatgtagccatgggttcaggactcttcaagcctcgtgttcatccggacctccgtgatgttttctctaagatgtctttctttgacaagattggctttctagtacgtttttaattaatttttaagagtaatttatatatcaagtatttatttgatgtacatactgcatacaatatacacatacatacctattccttaagaatatcaggtaatgattatatattaatgtctgatcatatataggaattatgtgttatgtatgaaaattaatcagtatgcatgtaattgatgtggtcatctttttattttatagcaagataagggtgttaattagagaggatgcatacatatataggtgagcacttcagttaattacatcttggcattaatgaagtgttatttttataataaaataattgatcacatataatatatataacaattctaatgcaacaaaaaataaattatattttgagctagcgatgcaggattttaattgtttgatctgttttaattaatatctcaggtgtgtgtgtgtgttgtctatatatatatatctcaaaaaatacgccaaattaagtttgatgcaccatttaattagggcaatccgttataattaagtatattttcaaatgagtatgtgtgtcaatatgtaatattttttcccctgcatatcctggtaattaacaaattatgttcgtataaatatggccattatagaagcacgcatatatacataagcttgatcatgcttgtgcaccaccttattaactactcaagttatttgaagctttccaattgatattcctcattagtacgttgaagtatttaattttacatatgcacatatacctaattaaattcccaatgtattaactaattaactcttgttaatttcgttcatgtagttcattcatgcatttgacaagagaaacctgtggcacaaggtgcctgttccgatcggtttgctctacctgaacacccgccggaccctgctcgaaaaatacaacctgctagctgttgggaggagttctcacggtgctctgtttgatcccaaggagttcctgtaccgcaccgaggatggcaagtacaacgacccccataatgctgaggctggtagccaaaacaccttttttgggagaaacatggagccggttgatcaacaggatgaggtactacttctattttacaaattttcttacagaattctaaatttctaagttctaacagtacaagttaatagcttaattaagcacttgtttccctaaagtccagcctgtatctaagcatgtaatagggatagtactgctagggtgtcagctagccttacctagctaacatgttttacttacctgttttatacttgcttttactacatgttctgccatcaacttttttatgggatggagggggtatatggtacgatcgaccaggacaaatatgctaagcctgatctaatctcggccggacctgatctatatttaccagctgatttcaattttcatccctattatcttgttcaatagaaaattagataccatatatattgaatttagttaatgaaaaataaaggagtaaagatcaccaaaaaagtggttgatttttatttctaatttaatatctagtttgacagtttgactttaagactttataataacactcttttttatgaaacttttgtttggtagttcgttctgcatgcttcaaataagtaaatgaatgaattaacattgaaactcaaaaaaataagacgcgagttttgtcagtatatattaagataagagctaattaatgtgcttgttaatttaaaaatagaaccattttctttttaattagatcatactgttaacagatggaaatttgaggtacacttttaaatcatcaggttaattatgcttaacataattagctgttatttatcggcgcagttgatgagcccagatccatttgttgtggcgacaaagctgttagccaggagagaatacaaggacacagggaaacagttcaatatactagcagctgcatggatacagttcatggttcatgactggatggatcatatggaggataccggacaggtgcatgcttgatttaattccttaatttgagagccttaagttgttgaagtcttaaaattaaatcttcatcttccattgagattttgaaatatatattgtagttacatgtggcaaatcgggcgggcgggtcaggttcgggttggacgggttgggttagtttgaccttctagaatatctcgggtcgggtcgggtcgggccgatttcaatatcaacattttttttatcgtatgttgatttgagttggattggatgctatttgatatcggatcgggtcagttttggatcatatcgcgagtcaggtcaggtcaatttgattttggaaaacgtcatgtctggtcgggtcagattcgagtcgagtcgagcagatttcttgggtcgggttgggttctaccacctctaattgctagttgatatataattcaattttcttggtttcttctagattggaatcacagctccaaaagaagtggccaatgagtgcccactcaaatcgttcaagttccaccccacaaaagaactgcctacgaattctgatggaataaagattggtcactacaatatccgcacagcttggtggtgagtaatgcttaagattttctcgagttaagatctttatcagaaatttatcttaagcacaaagaatgaacttaaaaaatagagacaatcgatgtatatatataaatcaatgcatatttgcccataaaaaatgtcgtaattttttttttgcaatttctataattatatataccaagggatgggagtgcagtatatggtaataatgaggaaagggcagaaaagctcaggacttatgttgatggaaaactagtgatcggagatgacggtcttcttttgcataaggagaacggtgtggcattatccggcgacattcgcaacagttgggctggtgtttcgatcttacaagctctttttgttaaggaacacaatgcagtttgtgatgcaataaaggtaagcgaatatatcatcactattttctatttgtttagttttaggaagaatataatttgctgttcttgactagcttgccactgattgtctatttgtttagttttaggaagaatataaactgttatttaccaaaacattaatttgttttctttatgctataaatatgaagaaaagattacaaatgttttttttaatctcaggaagaacatcccaacctatcagacgaagaattatatcggtatgccaaattggtcacttctgctgttattgcaaaggttcacactattgattggactgtcgagcttctcaagacaaaaaccatgagagctgcaatgcgcgcaaattggtgaggatgcatttatctcattttctcatatttgccgaaagaaaaaaaatataaccattgatgcgggtattacttttccaagtggaaattttatttacatctgcaaattcaaattaattaaattagtgagaatgtgtacaatttacctgatattctgattcttttgtgaaggtatggattattgggtaagaaaataaaagacacatttggtcacataggaggaccgatattaggtgggcttgtgggactgaagaagccgaacaaccatggcgtaccttattctttgactgaagagtttaccagtgtttacagaatgcactccctaataccaagcactctcaagctcagggatccgacagggcaacccgatgcaaataattccccaccatgcctggaagagtgagtaaacaatttaggcctcgtttggttggggaaaatttttagttttgattgtcacatcggatatacggatatacatttaaagtattaaacgtagtctaataacaaaacaaattacatatttcgctaggaaactgcgagacgaatttattaagcctataattaatccgtcattaacaaatgtttactgtagcaccacattatcaaatcatagcacaattaggcttaaaagattcgtctcgcaatttacacgcaatctgtgtaatttgttttttctacatttaatacttcatgcatgagtccaaaaattcgatgtgacagcgtgaaaatttttgttttgggaactaaacagggccttatgtttggcatccatccctctcatttttttaatgtggaagatgaaatgcaaactaacaacttctatttattaaatcagatagaaaaatagtagattataaaaaaataacgaaaaaaaaaagttaaggccctgtttagatcctccaaaatggcaaaagttttgccattttgtagcactttttgttattttggatctaaacactagtagcaaaagttagcaatttagcatttggcatttgctagtccatagtagcaaattgtgccaaaaagtgctttgggaccacttcctctctctttctctctctcactttagtgctagaatggcaaaactttaacatgcatctaaacactaactagtacttttgcaatgccaaaacttttgccaccaaaacttttgtcatttgccatttgccattccaaatggatctaaacatgccctaggacgttctcctattacatatcgactcttaattacatcattgattactgaacctgactttagacactgaactcgacacaaacggctagatttgttattattttttttagcttcttggctacacaataaaaagtagtagaatgtataatcttggtcacaataagttttctgctcggttagcacatttttagtataactgacataaacactgacaccatttctttcttgtgtcaaaatgtagcatcgatattggagagatgattggtctcaagggggaagaacagctatcaaaaatagggtttgaaaaacaagcattatcaatgggatatcaagcttgtggtgcacttgaactatggaactatccaagtttcttcaggaacctcattccacaaaatttggatggtaccaatcgatctgacagaatcgaccttgctgccctagaaggtataattaaaatttagactcaatttataccactaccagtagaggatcatgattttgcaccatgtcaagttggtacaagctagggtccaccaagaataatccaatgcataaaaatattgaaaataactcacactggcaacaaatgaagtgctagaacaagtattgtgaccttaattaaactactatgttgaaatttatcacaacatacttttcaattttcaagaattctcgaactattattgtactaaccagattgaaaatacaagattctcttaccgagacatatatcatgtttgtatatgttgtaaccttaactagcatttatttaaaaaacaaggacattgctgcgtactagtataaataaaaatgttaagcaaaaactgtactatccaagttaagtaaagaggacattgtactgctgtgtctaatgccttttgacaatgattacactgagattaatatcattttcttttcctctaaattaaagtataccgagacagggagagaagtgtaccaaggtacaatgagttcaggaggagactatttctgattccaataaaaagctgggaggatctgacaagtgacaaggatgcaattgaaaccataagagcaatatacggagatgatgtagagaaattggatcttcttgttggtcttatggcagagaaaaaaatcaagggatttgccataagcgaaacagcattcaacattttcattttaatggcatcaaggtaacatttagttctaactaatattgaatgctagacaaagtaccaatttttgtttaagcccttgctaaacgtattaggcaacaaccgagaatgtggcttaagcttattttgagtgattcaaaatttacccaaaccaaagtttattaaggcaagaaaatataacgatgtgaccattatatatgggtacattactggtagatccagaatgttaccagaaaaaaaaagaagtcaaatgtggaagtactaattatagatgataaccactcagttaagatatgaatattaatttaacatctctaaaaacaggaggctcgaagcagatcgattttttacaagcaatttcaatgaggaaacatacaccaagaaggggatgcaatgggtcaaaacaacagaaggcctacgagatgtgatcaaccggcactaccctgaaatcactgccaagtggatgaagtcctctagtgctttctctgtgtgggatgcagactactagtgcaaaaattaaaggccccctgccatattatttggcaagttctatgaaatattatttgtttacagaattatggtgtttgttcagtgtaaatatagttaaatatgtcagtgtaatatatgtaataggattcatcgcacgacacaagttgtatgctcatttgtttacaatttattgcacattattatttgttcattgtaattaaatatggctgggaaaataagtaggaggagaccatataacatcttcctacaatcttctgtttgatt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |