Os12g0556600
| Gene Name |
Os12g0556600 |
|---|---|
| Description |
CTP synthase family protein |
| Version |
NM_001073537.1 GI:115489035 GeneID:4352499 |
| Length |
6225 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0556600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:22860060..22866284 |
| Sequence Coding Region |
22860497..22860573,22860738..22860831,22860916..22860996,22861093..22861141,22861369..22861454 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:22860060..22866284 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:22860060..22866284 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>aaaaatactgtagcttcggaagaagaagaagaagaaaggggtttcccttccgtacaccagcagcagcatcagcagctgctcctccccgcccaaaaaaatccaatctttccccatggcggagcccggggaggatgcagcagcgtcggcgtcgtcctcaaggcctgcggcctccgcgtcacctgcatcaagatcgatccatatttaaacacagatgctggtacaatgtctccttttgagcatggtgaggtctttgtgcttgacgatggtggagaggttgacttggatttagggaattatgagcgtttcttggatgttactctgacaagggataacaacattacaactggaaagatatatcagtctgtcattgagaaggagaggaagggtgactatcttggaaagacggtccaggttgttcctcatgtaactgatgaaattaaacagtggatacagtcagtatcttctgttcctgtggatgggcagactcgtccagctgatgtttgtgtcattgaattgggaggcactgtaggtgatattgaatcaatgccattcattgaagctctgcgccagttgtcattttctcttggtaaggacaatttctgcctcatacatgtgagccttgttccggtattgggtgtagttggtgagcagaaaactaagccaacacaacacagtgtacgagaactaagggccttgggtctgactcctgatcttctagcatgccgatccgcacagccactaataggatctgtcaaggagaaactttcacaattttgtcatgtaccggttgagaatatacttaacatccatgatgttccaaacttgtggcatgttccacttattcttagaaaccaaaaggttcacgaggctataatcaaacaacttaaccttggaaggtctgctggaccccctgagttacgagattggacacagatggctgagtcatatgatgacctcaaaaactctgttaaaatcgctttggttgggaaatatactaatctgaccgattcctacttatcagtggtgaaggctcttctacatgcgagtgttgcatgttcattgaaaccttctatccagtggattgcagcttcagatcttgaagatgcaactgcaacaagtgcaccagatgcccatgctaaagcttgggaaactcttaagggttcctcttgcattttgataccaggaggattcggggatcgtggaatatctgggatgatattggctgcaaaatatgctcgtgagaataaagttccataccttggcatttgcttgggaatgcagatatcagtgattgagatgtccagaaatgttcttggcctaaaggatgcagacagtgaagagttcaactcagaaacaccatttcgtgtggttatgtacatgcctgaggtttcaaaaacgcacatgggaaatacaatgaggttgggttgccgaagaacgttctttcgcaggacagattgtcttacatcaaaactatatgggagccctgagcatgtagatgagcgtcatcgtcacagatatgaggtgaacccttctttcgttgctatgcttgaaaacgctggccttcattttgttggttgcgatgaaagtggaaagaggatggaggttgtagagctacaagaccacccattttacataggtgttcaattccatccagaatttaagtcaaggcctcggagaccttcacctccatttactggtctaatattggcagcagctgaatacatgggaacacctgcaaataactcaaatggacatgttggaacatctgagtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>KNTVASEEEEEERGFPSVHQQQHQQLLLPAQKNPIFPHGGARGG CSSVGVVLKACGLRVTCIKIDPYLNTDAGTMSPFEHGEVFVLDDGGEVDLDLGNYERF LDVTLTRDNNITTGKIYQSVIEKERKGDYLGKTVQVVPHVTDEIKQWIQSVSSVPVDG QTRPADVCVIELGGTVGDIESMPFIEALRQLSFSLGKDNFCLIHVSLVPVLGVVGEQK TKPTQHSVRELRALGLTPDLLACRSAQPLIGSVKEKLSQFCHVPVENILNIHDVPNLW HVPLILRNQKVHEAIIKQLNLGRSAGPPELRDWTQMAESYDDLKNSVKIALVGKYTNL TDSYLSVVKALLHASVACSLKPSIQWIAASDLEDATATSAPDAHAKAWETLKGSSCIL IPGGFGDRGISGMILAAKYARENKVPYLGICLGMQISVIEMSRNVLGLKDADSEEFNS ETPFRVVMYMPEVSKTHMGNTMRLGCRRTFFRRTDCLTSKLYGSPEHVDERHRHRYEV NPSFVAMLENAGLHFVGCDESGKRMEVVELQDHPFYIGVQFHPEFKSRPRRPSPPFTG LILAAAEYMGTPANNSNGHVGTSE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5712..5788#5454..5547#5289..5369#5144..5192#4831..4916#4669..4746#4444..4593#4318..4356#3957..4046#3610..3672#3449..3518#3085..3131#2910..2972#2779..2829#2455..2538#2244..2308#1862..1918#1671..1788#1526..1576#1365..1451#1205..1284#221..278#1..135#aaaaatactgtagcttcggaagaagaagaagaagaaaggggtttcccttccgtacaccagcagcagcatcagcagctgctcctccccgcccaaaaaaatccaatctttccccatggcggagcccggggaggatgcggcagcggcagcggcggcggcgtcgaccaagtacgtgctcatcaccggcggcgtcgtcagcgggctcgggaagggggtcacggccagcagcgtcggcgtcgtcctcaaggcctgcggcctccgcgtcacctgcatcaagatcggtccgtgtgtttcttcccccattctttcaactctttgctcatctgaatgcgatggctaaaaccctaggaaatcgagtgtggtttgggggagtgcggagatggcgattgtatgtgattgctggttgaattcgaatttatggcatttgttgtgcttattcttgatgaaggggtaaaatattgccgccttgtgatgaatttggtaggggttagggcttttttcatatctttcttgatttgggggtgtgtcaaaagcgtcggcttgttggtttatgtttggagggaggtgaaaggtggccgctttcttgtttatggtaatggagtattgaaaaggttgcctattattgattcagccttcatggggggccatgattgtgggtgcattcttgtcttggttatgttttggtggtgaaaatgctatcatttttctgtagaaaaataatctatcaatgaagccgtgaggagtacttattgtctaattgatgtagaaaaacaatccatcaatgaagccgtgaggagtacttattgtctaattgatgtgaattcttgaaggttctgttgctttataggcttttagatgtataaaggtggtgtcacctacctttttgatttttaaggttgtgatggatcatcaagtatcacaatgtggccttggaaagctctatgccattttggatattgaaattgttttcctgcaccgtggtcaatcttttctaggtgacttttcttgattgacatgtgggaacatgggtccttttcagcattttctttgttagggtaagtgtcaaaccagaaagtttttttttgtgtgacttttgcaacatatgtggtaccccatgtgcagagtttaacttgcttggaggtttctcagtttattgatgtatcattagtcttacactcttactattgtccatcacctggtgttgcagatccatatttaaacacagatgctggtacaatgtctccttttgagcatggtgaggtctttgtgcttgacgatggtggagaggtatggcttctttgatgcttccatgtgatgttactctttatgacctgtgcacatgagcttgtaatgtttgaaatttgtaggttgacttggatttagggaattatgagcgtttcttggatgttactctgacaagggataacaacattacaactggaaagatatatcaggtgatcatcccttcctagaaaatgcttgctggttgtcacatgagtttgtaatcaatggcttttgttgttttcagtctgtcattgagaaggagaggaagggtgactatcttggaaagacggtccaggtaattcccttgtggcatttttttttggcaatggtcacatgcttatggaatacccatatgacaaactaaaatcttatggctgtaacatgttcaggttgttcctcatgtaactgatgaaattaaacagtggatacagtcagtatcttctgttcctgtggatgggcagactcgtccagctgatgtttgtgtcattgaattgggaggcactgtaggtagggtttcgaggcatcttatggtatagttattactattataatggatgaactaaattttttcttgtttcaggtgatattgaatcaatgccattcattgaagctctgcgccagttgtcattttctcttggtacagttggattttcttcttgtgatttcaaatttaataggtcatggttgctgagaaatatgttgagttcaatgggctacgctgactctctatcatttcacaccatttttctctgtttatttctttggaaatgattgggctgtagattaggtatccactttattcggtccgcaccgccttcctcttttgtgctaaagtggcaagctgatagtcacatgctattgttgatatgttgagaagacatgcagcgttgttttaaaaacaattctgatttgttagtgctcattgttggatattgtacccatcattcttatatattttgcaggtaaggacaatttctgcctcatacatgtgagccttgttccggtattgggtgtagttggtgagcaggtaaataattctcttcaatcatgatttctgctgatgacatcttgacctctgacatgagacaaaattgcattgcaatattcaagtcttatgtcaggacatataattgctaagattgaaccctgaatctgtcatttccatttttgtagaaaactaagccaacacaacacagtgtacgagaactaagggccttgggtctgactcctgatcttctagcatgccgatccgcacaggtaatgcaaacaacatagaataacagaacactcttaagatatgatatctccattgattctagcatttgatgttgatgttccctattttattatcatatggaatacttctctggcagtcactctaatatgtcttttcctgtcttactctggacatgactgtccatatctttttggtgcttagtctatattttttcttgtctgtaatggattgacataattttttgcgatctgaacattcagccactaataggatctgtcaaggagaaactttcacaattttgtcatgtaccggtatgtttttgcttctaagtttgaaaagagccattttattctcatgttttcctacttacattctatcttatctcttacaggttgagaatatacttaacatccatgatgttccaaacttgtggcatgttccacttattcttagagtgagttatctttggctcaaagcttaagtgttgactctgtagagaaagataatgagtatgatttatataatcattgcactaatactttattttgacatgtgttattttccagaaccaaaaggttcacgaggctataatcaaacaacttaaccttggaaggtgagccagacaattactgaatatcagtttcttgtcaatgtttggaaataatgtgcccaagtgtgtgcctataggaagttttatatttgggatttactacctttgaaaatcatgaatagttcattattatgttacacttgctatttctggtctatatttgaccccttttcagttaacgtgaatggacttgcttgatcgttgtgagatttatgagttcgggcagtaataacaaatctgttgtactttcctggcattacttattttatataaggtgttttggttagtatgttgaatcaattccataccttattctgtaggtctgctggaccccctgagttacgagattggacacagatggctgagtcatatgatgacctcaaaaactctgttagtattgttaagttgctctaatatcttgactttgcattgattattttcaagtgcataattaattttgatggacttcaatgccatgcaggttaaaatcgctttggttgggaaatatactaatctgaccgattcctacttatcagtggtgaaggtgagttaaatcaactttttaatatagaattgttatttattcaattatgcatccaattggtgaaaatgggtcctttttatttatgttttgcctgttgtgccattatttccctccattagtgcctactgcaaatgcaatcaattcctaagagttgtgtttatgcaaggagatttttgaactacccactactcttgcagtgctactgatttaattcttattgaaatattatagtattatacatgcaaatgttgtttcaaattcatgtgtatacaaatatgtttcaggctcttctacatgcgagtgttgcatgttcattgaaaccttctatccagtggattgcagcttcagatcttgaagatgcaactgcaacaagtgtaagcccgaaactctttgttcataatatgatagggagtagttctactggattacgctacatctcttaacacagttgtaatgtttaaaccaatgctctgttttatgtttgttgccaataattatctcagggctaaagatcatttttattcatactagtctactaacttaatatattctctattgaaagcaatgtaacactcctattatagttgtccttcctgctttgtgttatcttatgattctgcctttccatgacattattcttcacaggcaccagatgcccatgctaaagcttgggaaactcttaaggtgagtatgctgattgtctatggttcctactgtgactatacaaactctatctttaaagtataacatttataaatgataaaatttcagggttcctcttgcattttgataccaggaggattcggggatcgtggaatatctgggatgatattggctgcaaaatatgctcgtgagaataaagttccataccttggcatttgcttgggaatgcagatatcagtgattgagatgtccagaaatgtatgtatgcttcctttttgttacttgttaattaatttatctttagagactctcatattgtgcatcctgtcataggttcttggcctaaaggatgcagacagtgaagagttcaactcagaaacaccatttcgtgtggttatgtacatgcctgaggtaattcttaatttcttatccagttacatgcaagaaagagacatgactttgatctaacctaaggccttgcaattaactatacaggtttcaaaaacgcacatgggaaatacaatgaggttgggttgccgaagaacgttctttcgcaggacagattgtcttacatcaaaactgtaaggatttctgacaacttgtcagatcacagaagtcaattgattatctacacgatgaaaaatttaatgtcttaaagagcttgttgttaggaaccttgttaaaacagtttgtcgaaatgcagcctttgtagactagttaaaagtataaattattgactaactcttgcatgttcgttttcacatctccttatttcatcttctaatttggacataaatgtaaatcatagatatgggagccctgagcatgtagatgagcgtcatcgtcacagatatgaggtttgccaagaattttgttttattaaactctgtcattctatatatccattgcatcattatgcttgtaagtgattatccttttgtctatttaaacaggtgaacccttctttcgttgctatgcttgaaaacgctggccttcattttgttggttgcgatgaaagtggaaagaggatggaggtaccaattaacagcctgttccagatttctgtcttgatttattttcttttgttgaagcctgagcccgcttccacctatgaacaggttgtagagctacaagaccacccattttacataggtgttcaattccatccagaatttaagtcaaggcctcggagaccttcacctccatttactggtatggtattcctctactaaaatcacaaaatctgaaaattttgttgtattaagctttgtgttacttttttttttcttccaagctccactcatatgatgcagtactttggtctatctttgttctagcttttcggtgtagtataacaactttaattttctatacaggtctaatattggcagcagctgaatacatgggaacacctgcaaataactcaaatggacatgttggaacatctgagtaatgccatccttaatctatcaggtacatgattctgaaacttgactacccttttctcaatgtttctattccataaacacacatttgagattggatttcttgtttgtatctgtcagatggaggtcattgatccctttttggtgttttgttgaggcatctgcttgttgctgctgagatgaggattctagtcattttggtcacatacataatcatgtaccggagataacacttaaagctggaagagaatttttgttatcccagagacctgtaattgcatagctgatcatggattcatgatacagtgtgcaacggattttagcgtggtaattttgttgggtgctcagagttttaacttctgatagtaattgtatcctgttaaacccgtgctccgttcaagttaaaatgaaaacttgcattatcttacctgtttattcttctgtg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
