BGIOSGA001308
| Gene Name |
BGIOSGA001308 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001308, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_02645 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001308-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001308-PA |
| Length |
4096 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:25689898..25693993 |
| Sequence Coding Region |
25693886..25693993,25693559..25693802,25693239..25693346,25692920..25693156,25692620..25692801 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:25689898..25693993 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCTACTCCCCATTCCCCAGCGTTAGGGTTCCAGGCCGCGACTTCTCCGGGCCAGTGGAACGAAGTTGCCGCATCGGCGTCCCCTGCATCCCGCCGCATCGAGAAGAAGCCCATCATCGTCTCCATATCGCACAGGGACAGGGTTGCTGAGAGCAGCAGCGCCACCAGCCCAACCGTGGTGATGGCTTCGTCGCCGGAGAAGAAGGATCCTCCTAGTTGTGGCTCTCGGGATTCCCAGCCCATCCCTTGCACGGACGATCCCCCCTTGTCTGAATCCCCAACGACGGACCTAGGCTGCCACGATCCGCGCGACGAGGACGCCGACCACCCGGCACCACCCATGGGCAAAGATTCAGATGACGTCTTTGCCTCAGCCAACTCACACAATATGTTGATAGGTGACATCGACGAGGATAGTGATGATGATGGTTACGCAGACGAGGAGACAACTTGCCCAGGGCAGAACTTCACGAAGGAGCAGGCAAAGGAAATAATTCGCAAGTGGCTAGAAACATACGACAAGAGGAATAGTGAATTCATGGTGGCGTGCGAGGAGTTCCAAAAGCAGGGAGGGGATGAGACGAGTGCTTCTTGTCCAGTATTTCCTTTGAAACCGCTCCCGGAGACAACAGATTTCTGTACCACCAAGAGTTTGTGCTATCACCGTGAATACAAGACCAATGATACTTCTGAGACTGCATCTACTATTGGGTGGCTTGAACCCAAGGAGATGCTCCAGATCTTCTCTTTGAGGTTGTCCAGCTCCATGTCCTATCCTATTAGTGTTTACGGAATCTTTGCAGTACGTGATTACTTGGACCCTTTGAGGAATTATGTCTTCAACCGTACCAGAGATGATCCTGTCATAGTTGAACAGGATTCCTTCACATTACCTCTTTGCAGCCCTTGTCGAGGAATGTATGTAGTAGAATATGCATTGTTTGAGGTTGATCTTTGGGTGAAAATGGAAGGTGGAGTATCTAATGACAAGCAATTACTATCCGCGTATGTCGAGATTTTTGCCCGTGGCGTGTTTAATAAGGAGATAAGGGGGCGGATATTAAGTGACCATTGCTATCTGGACATACACTATATGTATCTTTCACAGAGTATTGAAGCTGTCATACAAGTATCCACAGAGATTGACAGTAACGATCCTCGTCATGTGAGATTCACTGCATTTTGTAGTGGCTTTGACCGTGAGATTTTGCTGTTCAATGGGAAATTCTGCAAGGACAAGTCTTTCCAGCACATTGTGGCAATGAAGTCCAAGGGAAAACTGGTTGTTCACTTGGAGTTTGAGGGATCCCTGTTTTGCTGGACTTTTAACAATGCTGCATCCACTATTGGGTGGCGTGAACCCAAGGAGATGCTCCAGATCTTCTCAAAGAAGTTGTCCAGCTCCATGTCCTATCCTATTAGTGTTTACGGAATCTTTGCAGTACGTGATTACTTGGACCCTTTGCGGAATTATGTCTTCAACCGTACCAGAGATGATCCTGTCATAGTTGAACAGTGCTACATTTTGGTATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPTPHSPALGFQAATSPGQWNEVAASASPASRRIEKKPIIVSISHRDRVAESSSATSPTVVMASSPEKKDPPSCGSRDSQPIPCTDDPPLSESPTTDLGCHDPRDEDADHPAPPMGKDSDDVFASANSHNMLIGDIDEDSDDDGYADEETTCPGQNFTKEQAKEIIRKWLETYDKRNSEFMVACEEFQKQGGDETSASCPVFPLKPLPETTDFCTTKSLCYHREYKTNDTSETASTIGWLEPKEMLQIFSLRLSSSMSYPISVYGIFAVRDYLDPLRNYVFNRTRDDPVIVEQDSFTLPLCSPCRGMYVVEYALFEVDLWVKMEGGVSNDKQLLSAYVEIFARGVFNKEIRGRILSDHCYLDIHYMYLSQSIEAVIQVSTEIDSNDPRHVRFTAFCSGFDREILLFNGKFCKDKSFQHIVAMKSKGKLVVHLEFEGSLFCWTFNNAASTIGWREPKEMLQIFSKKLSSSMSYPISVYGIFAVRDYLDPLRNYVFNRTRDDPVIVEQCYILV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..108#192..435#648..755#838..1074#1193..1374#2079..2535#3662..3843#4079..4096#ATGCCTACTCCCCATTCCCCAGCGTTAGGGTTCCAGGCCGCGACTTCTCCGGGCCAGTGGAACGAAGTTGCCGCATCGGCGTCCCCTGCATCCCGCCGCATCGAGAAGGTAAATCCATGGATTTGGATGACGGATCTGTGGTTGCGCCTCCCATTTTTCTTTCAAGATGAGTTGCGAGCTGTGTGCCAAAGAAGCCCATCATCGTCTCCATATCGCACAGGGACAGGGTTGCTGAGAGCAGCAGCGCCACCAGCCCAACCGTGGTGATGGCTTCGTCGCCGGAGAAGAAGGATCCTCCTAGTTGTGGCTCTCGGGATTCCCAGCCCATCCCTTGCACGGACGATCCCCCCTTGTCTGAATCCCCAACGACGGACCTAGGCTGCCACGATCCGCGCGACGAGGACGCCGACCACCCGGCACCACCCATGGGCAAAGGTGCATCCTCAATCCTCCTCTTGCTTTCATGTATGCATTTCCTTATACGATATCGATCGTCATTCGTCACCCAAGGCACTAATTCAGACTGCAAATTCAGACTTTTGTCCCATCACACTTTTTTGTTTTTCAATTCTAAAACACCACATTGGTTGTGTGCCTCTCGGTAGAGGCCAGAGATGTAAACCATTTCTATTATCTGAAAAATTCAGATTCAGATGACGTCTTTGCCTCAGCCAACTCACACAATATGTTGATAGGTGACATCGACGAGGATAGTGATGATGATGGTTACGCAGACGAGGAGACAACTTGCCCAGGTAACACTACTAATAATCCAGTAGAGAGCTTCGATTCCAGATTAAAAGACGAACAGATACTATCGCTATTTTAATTTCTCAGGGCAGAACTTCACGAAGGAGCAGGCAAAGGAAATAATTCGCAAGTGGCTAGAAACATACGACAAGAGGAATAGTGAATTCATGGTGGCGTGCGAGGAGTTCCAAAAGCAGGGAGGGGATGAGACGAGTGCTTCTTGTCCAGTATTTCCTTTGAAACCGCTCCCGGAGACAACAGATTTCTGTACCACCAAGAGTTTGTGCTATCACCGTGAATACAAGACCAATGATACTTCTGAGAGTAAGTGCTTGTCGATTCCTATTATAAAGGATTCAATAGTTATTAATATTGTGTGCTACCAAATTACCAAAATGTATTTGTAAAGTAACGACTTTTCTTTTCTTTTAAATGTTTGTAGCTGCATCTACTATTGGGTGGCTTGAACCCAAGGAGATGCTCCAGATCTTCTCTTTGAGGTTGTCCAGCTCCATGTCCTATCCTATTAGTGTTTACGGAATCTTTGCAGTACGTGATTACTTGGACCCTTTGAGGAATTATGTCTTCAACCGTACCAGAGATGATCCTGTCATAGTTGAACAGGTAAATACAGTCTATTTTTGGAAGTTAAGTTATATATCTTGGCTGAAAAAGATACCCTAATATGCCTATATATATTATATATATGAATGCTAATAAGATTTTTTTTTTCTTGGATAGGCTGAATGTAGTGTGTTAGCAGATACATATTGTTGACAATTGGTTTTATGGTTCTTAAAGGCATCTTTTGTATGGTTTATCGTTAGCACTGTTTCAAAATATATTTTTGTTTCTTTCAGTGCTCCATTTTGATATAAGTGCATCACTGTTCGCTGCAACTGTAGTACATTCTCCTGTCATCCCTTATATTTTGGTTACAATGGGTCTATTGTTAAGTCTTTTGGTGTAAAGATTTTCTAGTGTGTTAATTAAGAGGTATATATATACCTCTAACACTAAGAGGTCTATATCAGTAGTGCTCAATATCTCATTGTTACGATATCTCATTATATATGATGTGCATTTTTGTATTTCATTTTCTGATTGTACTAACACGCTGATGGTGTCCGCAAAAATATTTAACTGTGTATATACCATCGAGTTTGTGCAAAATTTGCATGCCATTCTATTTATTTATTAGTATGCATGTCCAGTTGAGTTTATTCTATTAGAATACTTTTAAAATATGTATTTGTATGTTCTAATTAACACACTTAAAATTGCTTAAGCTCTAGCTTTGGATTCTAACAAGTCCTTTTAAATTGTAGGATTCCTTCACATTACCTCTTTGCAGCCCTTGTCGAGGAATGTATGTAGTAGAATATGCATTGTTTGAGGTTGATCTTTGGGTGAAAATGGAAGGTGGAGTATCTAATGACAAGCAATTACTATCCGCGTATGTCGAGATTTTTGCCCGTGGCGTGTTTAATAAGGAGATAAGGGGGCGGATATTAAGTGACCATTGCTATCTGGACATACACTATATGTATCTTTCACAGAGTATTGAAGCTGTCATACAAGTATCCACAGAGATTGACAGTAACGATCCTCGTCATGTGAGATTCACTGCATTTTGTAGTGGCTTTGACCGTGAGATTTTGCTGTTCAATGGGAAATTCTGCAAGGACAAGTCTTTCCAGCACATTGTGGCAATGAAGTCCAAGGGAAAACTGGTTGTTCACTTGGAGTTTGAGGGATCCCTGTTTTGCTGGACTTTTAACAATGGTGAGCTTGGAGCTGTTAATTCTCCCGATGATTCAGTCCTGAAGCAATTTCATGTCAGGGTGTTGTTTTCTCCAAAATAATGTGTACCAGCCTATAATAGCTTCTTTGGGTGAAGGAGAGGAAGTAAATCAGTATAAAAAGCTTGATACAATGTAGTGCTTGTGTTAAGATGCTTATCTGGGTAATAAACTAGACCAGTACTTGCATTCAGATTTGCAAATTGCATCCAGGGCCGAGATTGTTGGAGGCACTGTTCACAAGGAGGCTTAATCTTTGAAACCTGGATGGGATGTCCATCCATCATTGTGCTCTAGCCTCTAATCCAAACATTGATGGATTGTACACAATTTGTGCTTTATGGGCTTAATTTTACCTCCATTCTCTCGCCCACTAGGGAATATTTCTGGTGAATAGTGTTAGGTCCTCTTTGTTAAAGCTTAGACTTATTGACTTAAGTTTTAAAGTTATCTTTTTTTATATATATTATATAAGCCGGTGAATTTAAAGTTTTAAGTTTAATGCTGGAGTCATGTCTCCGTCTCAAATAAGCCAAAACGTTTCTCCAACCTAGCTCCTGGATTAACACTGTATAGCTCATGACTTTAGAAAAGCCAAACAAAAAAGATCATAAGCTAAGCTTATAAGCCTAAACAAAAGAGGGTCTACTATGGTCCTTGAACTTTTGCTTCGGGATGAATTTACCCCTGACGTGAGCTAGTTTCCAAAGAACTCCATATAAAATTTGTTATATACTCCGTACTAGCTTTCTATTGGTTCCTGGATCGACCTAAAGCGTCATATGGACTTTGGCATGCTATCCTTATATGCAAGATCAATATTAATATGTTAATTTTACCCTTATATGTAGCACAGAGAAACAGAAAGAAAAATCAAAGGCAAAGGCAAACCAGAAAAAAATTACGGATCAGACTGATCATGTACGTATGCTTTGGTTGGATGCATAAATAAAATAGTCACTCTTACAGATTGATAATACTTATCATTTTGACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGTGCTACCAAAGTATCAATATGTATTTGTAATGACTTATCTTTTCTTTTAATTGTTTGTAGCTGCATCCACTATTGGGTGGCGTGAACCCAAGGAGATGCTCCAGATCTTCTCAAAGAAGTTGTCCAGCTCCATGTCCTATCCTATTAGTGTTTACGGAATCTTTGCAGTACGTGATTACTTGGACCCTTTGCGGAATTATGTCTTCAACCGTACCAGAGATGATCCTGTCATAGTTGAACAGGTAAATACAGTCTGTTTTTAGAAGTTAAGTTATATATCTTGGCTGAAAAAGATACCCTAATATGCCTATATATATTATATATATGAATGCTAATAAGATTTTTGTTTTTCTTGGATAGGCTGAATGTAGTGTGTTACCAGATACATATTTTGACAATTTGTTTTATTTTCTTAAAGACATCTTTTGTATGGTCTATCGTTAGCATTGTTTCAAAATATATTTTTGTTTCTTTCAGTGCTACATTTTGGTATAA</dnaseqindica> |
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