BGIOSGA001516
| Gene Name |
BGIOSGA001516 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001516, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_02210 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001516-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001516-PA |
| Length |
4642 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:20735760..20740401 |
| Sequence Coding Region |
20739805..20740401,20737163..20737378,20735760..20736833 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:20735760..20740401 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGCGCCACGGTGTCGGTTCTCCGCGGCTCCAGCGACGAGTGACGGCGTCGCCAGATCTGGTCTCCCCGCTTGGCCGGGGTGATCGGCGACGGGCTCGGTCGTCGCCGGCGCCGCTCCGCGGACCTGGCAGGGAGGTGGCTAGCAGCAGCGATGGTGGCGGATGTGGCGGCGACGAAGTTGGCGACGACAACGGCGGACTGCGGCGCGTGCCGCGACGCCGGCCCTCGTCAAGAACCTCGCCACCACGAGGGAGGCGCGGCGCCCTCGTCAATGTTCCAGCTGTGAACGCCGTGCCCGTGACGCCTTCCTCCATGATGCCGACGACCTGCGCTTCGCGCTGCACCTCCGATCCGTGCCACCCCGGCCGGATCTGGACGGCTGGCGTCTGGCGGCGCTGGCTAGCGATGATGGCGGCTGACGGTGGCGGCTGGACGGTGGTGGCTGGACGGGGATGTCCGTGGCGGTGGCGGTGGCGGTGGCGATGGTGGCTGACAGTGGCGGCTGGCGACGGTGGTGGCTGTGGTAGTGGCGGTGGCGGCTGTCGACGATGGTACCTATGGCGGCGATGGTTGAAGGCCATCATCCGGCTGACGGCCACACTTGAAGATGCTGAGGAGCAAGGGCTCCAGGACAACTATGTTAAATTGTGGCTTAAGGAGCTCAAGGACTTGGCTCTTGATGCCGAGGATGTCCTTGATGATTACCGGTATGAGCTGCTGCAGAGCCAAGTCCAAGAGCTTCAAGGTGATTATCCACGCAAGCGGAAGCACATGGATAATGATGAAGAGGACAATGATAGTATTGATGAGAGAATTAATGAGATGATAAACCGTTTCGAGGAGATATCCAGAGATCGAGATGCTCTCAAGCTCAGATTTGAAGATGGCCATAAAATTGTTGACAGGGGAAACTGGATGAAGTCACGGCCTACTAGCCACCTTATTGATGAGTCCCTTGTTTTTGGTAGGATTGATGAGAAGGAGGATATTATCAAGTCAGTATTATCTCATCAAGACATGGAACCATCTGGAATTGTTGTTTTGCCAATTGTTGGAATGGGTGGTATTGGCAAAACTACCATAGCGCAGATGGTATATAATGACAGTCGTGTCAGAAAACATTTTGAGCATAGTGGTTGGATTCATGTATCCCCAACATTTGATGTCCATAAGTTGACGATTGCCATTACTGAGTCATTAACCATGAAAAACTATGGCTTCACACAGCTAAGCTTAGTTCATGGGGTTCTCTTGGAAGAGGTACAAGGAAAGAAATTGTTTTTCGTGCTTGATGATTTGTGGAATGAATGTGAAAGTAGCTGGCAGGATTTTCTATCTCCGCTCAGGCATGCACAAACAGTGACAATTTTGGTCACCACCAGGAGTAAAGAGGTTGCACGTCTTGTTCAAACAGTGCAGCTATATCATCTTGGCTGCATTCCTGACAAGGATTGCTGGTTGTTGTTTCAGCATTATGCTTTTGGAAACCAACATGAGAGTGAACAGTCCATATTAGTTCAGATTGGCAGGAAAATTTTGCAGAAATGTGGTGGCTTACCGTTAGCAGTGAAGTCACTAGGTTGCCTTTTACGATCAACAATGGATGAACATGCCTGGATGGAAATATTGGAAAGTGAGCTTTGGGAATTGGATGAAGAGGATAACATCTTTCCAGCTCTTAGATTGAGTTATTACTGGTTGCCAACAAGATTGAAACCTTGTTTTCTTCTCTGTTCATTGTACCCTAGAAATTTAGGATTTACAAAGGATGACATTATTCAGCTGTGGGTCGCTCAAGGTTATATCTACTCTACAAACGGGAAAACTTGCCGGGAGATAGGAAATGAGTATTTTAATGAACTGCACGCAAGATCACTTGATTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGRHGVGSPRLQRRVTASPDLVSPLGRGDRRRARSSPAPLRGPGREVASSSDGGGCGGDEVGDDNGGLRRVPRRRPSSRTSPPRGRRGALVNVPAVNAVPVTPSSMMPTTCASRCTSDPCHPGRIWTAGVWRRWLAMMAADGGGWTVVAGRGCPWRWRWRWRWWLTVAAGDGGGCGSGGGGCRRWYLWRRWLKAIIRLTATLEDAEEQGLQDNYVKLWLKELKDLALDAEDVLDDYRYELLQSQVQELQGDYPRKRKHMDNDEEDNDSIDERINEMINRFEEISRDRDALKLRFEDGHKIVDRGNWMKSRPTSHLIDESLVFGRIDEKEDIIKSVLSHQDMEPSGIVVLPIVGMGGIGKTTIAQMVYNDSRVRKHFEHSGWIHVSPTFDVHKLTIAITESLTMKNYGFTQLSLVHGVLLEEVQGKKLFFVLDDLWNECESSWQDFLSPLRHAQTVTILVTTRSKEVARLVQTVQLYHLGCIPDKDCWLLFQHYAFGNQHESEQSILVQIGRKILQKCGGLPLAVKSLGCLLRSTMDEHAWMEILESELWELDEEDNIFPALRLSYYWLPTRLKPCFLLCSLYPRNLGFTKDDIIQLWVAQGYIYSTNGKTCREIGNEYFNELHARSLD</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..597#3024..3239#3569..4642#ATGGGGCGCCACGGTGTCGGTTCTCCGCGGCTCCAGCGACGAGTGACGGCGTCGCCAGATCTGGTCTCCCCGCTTGGCCGGGGTGATCGGCGACGGGCTCGGTCGTCGCCGGCGCCGCTCCGCGGACCTGGCAGGGAGGTGGCTAGCAGCAGCGATGGTGGCGGATGTGGCGGCGACGAAGTTGGCGACGACAACGGCGGACTGCGGCGCGTGCCGCGACGCCGGCCCTCGTCAAGAACCTCGCCACCACGAGGGAGGCGCGGCGCCCTCGTCAATGTTCCAGCTGTGAACGCCGTGCCCGTGACGCCTTCCTCCATGATGCCGACGACCTGCGCTTCGCGCTGCACCTCCGATCCGTGCCACCCCGGCCGGATCTGGACGGCTGGCGTCTGGCGGCGCTGGCTAGCGATGATGGCGGCTGACGGTGGCGGCTGGACGGTGGTGGCTGGACGGGGATGTCCGTGGCGGTGGCGGTGGCGGTGGCGATGGTGGCTGACAGTGGCGGCTGGCGACGGTGGTGGCTGTGGTAGTGGCGGTGGCGGCTGTCGACGATGGTACCTATGGCGGCGATGGTTGAAGGCCATCATCCGGCTGACGGTGCGTCGGCGGCGGCGACGGTATGTGGAGGCAGGGAAGGGGTCTGGCGGCGGGGAAGGAGTCCGGGTGCGGGCGCGCCGTCGACGGCGGGAACAACTGTGGGCGGTGGCCTTGGCCGAATCGCTGAAAGGACAATGTTGTTGACCGACGACGATCCTTCTTGTGCGGATTGGTGGTGTGGGTTTGGACAGGGAATCGCGGGCGAAAGCCTTGCCGAGCCATTTGGCTGGCTGACAACGGCGACACCGTTTGGCGTCGTTCCCCTTCTTGGAGGCGTTGTTTTAACATACCCCTTTCCTTTCCCTACCATATTCTCCGGGTGAAAACCTTGCTTCGGTTCCGAACGAGCGGTGGTGGCGATCCACGTCGCATCCTCCTTGGGGGCACCGCTTTGGAGAAACCTCTTCGTGCAAAGATATTGTCATTGGTCTATGCATTGGCTTTGAACTTCAGTCCTAGGCCTTGACGAGGCCTTCTAGCTCCACATTTTGTTTTGCTTTTCTCAGTTTGGGTCCTCTCTTATCTTGTTTGGTGTGTTCAACTTGTCTTGAACTACACTCTCTTCTGGAGTAGATCTTTGTAATAATTGGCTGTAGTTCTTTTTGAGCAAAGGCCGGGATATTATATTCCATTATCTAAAAAAAAGAATGTTCTACTACTAATAAAGAAACTTAAAACGCAACTTAAAACAGTTTAAGCAATACATTAGAAGAATTTTATTTTGAAAAAAATATTTTTTGATGCAACGAATAATTTGTTTCAGCTCTTCGGTAAATAATCTGAAAAGAGACTAAAGGCTAAGCTAGTTTAGTTTAGTTCCACTTAGTAGAAGCCAAACCTTTAGTAAGCTCCATAAAGGTTTGATGGGTTGATGCCAAATTGAGTGTTCCAAGTGCCAATTAATGGTTAGGTTCAAGCACTCCAAAATAATAAACCTCTATTCTTGAATAAGCACTCCAAAATACAGTTAATATGCCATAGGATGTATTAGCAAAAAGAAAAATAATTTATAGGTAAAACTTTATCTATGTGTTCTTAGCGACTTAAATGATAATGCTAAAAAAATAAACTTTAAAATCAATTTTTAAAATTCATATTTTGACCGCGACTGATGCTGTATAGAGAAAACGATGAGGCCTTAGTCTGGTTGGAGGGAGATTTTCAGCACATGCGAAACGAGAAAAGCTCATTAGCACATAATTAATTAAGTGTTATCTATTATAAACTTAAAAAATAGATTTATTTGAATTTTTTAGACAAATTCTATATAGAATTTTTTTTTGAAAAACACATCATTTGAAAAGCATGTTAACAGAAAACTTGCTCGAGCAAGTTGAGGGTTTGGAGTGGAAGAGTACATAGAATAAGGCAGCGATGTAGTAAAAAAATGGTGACTAATTTGTCCTTGGCAATTGTTATAAAATGTAATTAAGAAAATAAGTAAAGTGGATAGGGAAGGGATGGAACCAAAATCAAAGTATATAAAGCAGTTAAAAAAATTTACTAATGAAAGTGGTGGCTACAAGTATTTGAACACAAATGATTTGATCTAAATTGATAAGTTACGGAGGAGTGAGGAGTGAGGACCGGAAGGAGTATCATAATTTACTGTTTCAACACCAAAACTTTGATGATAGTATACACGTTTTGGCATGAACGCCCCAAAACCAGAAAAAAAGACTTCTCCCTACTTGTCCCTCATGCTGCTGCTGGGGTGTGCGAATCCCTTTCCCACGCCGCTGCTGCGCGGCTAGGCTATCAACGGACCACGCGTACGACGTCGTGGAGGCGGCCGACCATATCTGTGGTCTCGCTGCGCGCGGCTGCCGTGACGGAAAGCCCCAGGTTCTTGTCTTCTTGATTCTAGATACCCGCCATCTTCCTCAGCAAATCAACCACTTTCTGGTTTCAAGATGATCTTATTTTTTCAGGCTTATGCTCGATGCAGGGTACCCTTGACCTTAATCCGTACTAGCGGTTGCCCTAGTCCCCAAGCAGGAACTATTGGAATTCTTTTGGGCGATTTGGGTCACTGTTGCACACCCAAATCATTAAGGGCTTAAGTCGATAAGACAAATTTGGCGTTGGGTACTTGTTCACCCAAGGATGAAATTCACAAAGAACTGATATGAGCAGCAATTGTGCTTATACTTGTTCTGCATCATCTCGACACCCCTGTGTCAATGGGGATTGGAGAATACTGAAGACCTAAGCCAAGGACCCTGAAGAAAAATCATATCTTTTTTACTGAGGAAGAGGTGAAACTCCAAGTTATGGCTAGTGGATTAGTGTCATCTCTTCTTTCATCAACCAGCAGCCTGTTAGCAATTCTTCGAAGCCCGTTGTCAGATTTATATCCCCGGAGCGGTCATCCCACTGCATCTGCCGATCTGCAACGACTGAAGCGACTGCTGTCACGCATCCAGGCCACACTTGAAGATGCTGAGGAGCAAGGGCTCCAGGACAACTATGTTAAATTGTGGCTTAAGGAGCTCAAGGACTTGGCTCTTGATGCCGAGGATGTCCTTGATGATTACCGGTATGAGCTGCTGCAGAGCCAAGTCCAAGAGCTTCAAGGTGATTATCCACGCAAGCGGAAGCACATGGATAATGATGAAGAGGACAATGATAGTATTGATGAGGTATGGATGTACACGATTGGTGCATAACCTTCTCGCTCCAGCCTGTTTTAAGTGAATTACTCAAACAAATTCTACAGATCATAAATCTCCTTGGGATAGCAGTGGGTATTGTTCATGTCTTGAGTCCATTAAAATTATTTTCTTCTTAGTTTATGGGGTTGCCTTGCCTGAAGATAGTTCCTTCGATCACCCTTGTTAACTACGAGTTTATATGTATATGTATTAATGTATATCGGGCTAAAACTTAGTAATGAAATTATCTTTTCATAAATAACGCATTGTTTTACTTCTTCTTGCTCTTATTCACCTTTATGGAAATTAATTCGCAGAGAATTAATGAGATGATAAACCGTTTCGAGGAGATATCCAGAGATCGAGATGCTCTCAAGCTCAGATTTGAAGATGGCCATAAAATTGTTGACAGGGGAAACTGGATGAAGTCACGGCCTACTAGCCACCTTATTGATGAGTCCCTTGTTTTTGGTAGGATTGATGAGAAGGAGGATATTATCAAGTCAGTATTATCTCATCAAGACATGGAACCATCTGGAATTGTTGTTTTGCCAATTGTTGGAATGGGTGGTATTGGCAAAACTACCATAGCGCAGATGGTATATAATGACAGTCGTGTCAGAAAACATTTTGAGCATAGTGGTTGGATTCATGTATCCCCAACATTTGATGTCCATAAGTTGACGATTGCCATTACTGAGTCATTAACCATGAAAAACTATGGCTTCACACAGCTAAGCTTAGTTCATGGGGTTCTCTTGGAAGAGGTACAAGGAAAGAAATTGTTTTTCGTGCTTGATGATTTGTGGAATGAATGTGAAAGTAGCTGGCAGGATTTTCTATCTCCGCTCAGGCATGCACAAACAGTGACAATTTTGGTCACCACCAGGAGTAAAGAGGTTGCACGTCTTGTTCAAACAGTGCAGCTATATCATCTTGGCTGCATTCCTGACAAGGATTGCTGGTTGTTGTTTCAGCATTATGCTTTTGGAAACCAACATGAGAGTGAACAGTCCATATTAGTTCAGATTGGCAGGAAAATTTTGCAGAAATGTGGTGGCTTACCGTTAGCAGTGAAGTCACTAGGTTGCCTTTTACGATCAACAATGGATGAACATGCCTGGATGGAAATATTGGAAAGTGAGCTTTGGGAATTGGATGAAGAGGATAACATCTTTCCAGCTCTTAGATTGAGTTATTACTGGTTGCCAACAAGATTGAAACCTTGTTTTCTTCTCTGTTCATTGTACCCTAGAAATTTAGGATTTACAAAGGATGACATTATTCAGCTGTGGGTCGCTCAAGGTTATATCTACTCTACAAACGGGAAAACTTGCCGGGAGATAGGAAATGAGTATTTTAATGAACTGCACGCAAGATCACTTGATTGA</dnaseqindica> |
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