BGIOSGA003341
| Gene Name |
BGIOSGA003341 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003341, complete gene. |
| LocusTag |
P0475H04.18 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003341-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003341-PA |
| Length |
4674 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:12346279..12350952 |
| Sequence Coding Region |
12346279..12346552,12348108..12348404,12348485..12348698,12348822..12348931,12349005..12349204 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:12346279..12350952 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:12346279..12350952 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGCGGCGTCGCGTCGCTGGGGCTCAGGTCGTCCGGGAGCTATGGATCCTTGCAGCAGTCCAACGGCCAGTCGCCGGCGCCGGCGCCGTCTCCGCCGCTCGCCGCGAGGAAGGCCGGGAAGATGTCCTTCGGAGGGGCGGGCGCTGGAGGCCGAGGCCTCCTCTTCGCCCGGATCTGCAAGCTCACCAGCCGCCGCCGGCGGATGCTCCTCCTCCTCCTCGTCGCTGCTGCCGTGCTCTTCTGCTTCCTCTTCTCATCACTCGTCAGTAAAGATGAAGATGCACCACCTGGTATTGAAACCATGCTTGGAATTTCTGATCAAGTCCGGAGCTTTGTGAATCCTGTTTGGACATCTTCGGGTAGACCAATAACCCAGGGAGATTCTTTGAATGGGAATGGTTTGAATACAGCATCACAGACAGAAAAACAGTCTGACTCTGACAGTAGTCATAAAAAACTTCAGGGTCTCTCATGGAGCTTCCCGCCATCTATTGTACTGGAGCACCACCCTTGTGAAAATTTCTCATTTTTTCCTCCACCTATTGACAGGAAACGCACTGGACCACGGCCATGTCCTGTTTGTTATGTGCCTGTTGAGCAGGCCCTGGCATTGATGCCAGGTGCACCATCAGCATCACCAGTCCTTCGAAGCTTAAATTATTTGTCTGGTGATAATTTGATTTCAAAAGAGTCAAACCACGGTTCTTTGTTTGGAGGTTATCCATCATTGGAAGAGCGAGACAAGTCTTATGACATAAAAGACTCAATGACGGTTCATTGTGGATTTGCGAGAGGGAAGATACCCGGTGTCAATACTGGGTTCGATATAGATAGAGCTGATCTTTCTGAGATGTGGCAGTGCCAGGGGATAGTTGTTGCTTCTGCTATTTTTGGAAATTATGATATAATGCAACAACCAAAAAACATCAGTGTTTTTTCAAAGGATACAGTTTGCTTCTTCATGTTTCTGGATGAAGAAACAGAAGCAGCAATAAAGAACACTACAACAATTGATAATTCTAAAAGAATTGGGCTATGGCGGGTGGTTGTTGTCCGCAATCTTCCATATTCAGATGCAAGGCGCAATGGAAAGTGTTTACCTGATTTGAAAGCTATAGTTATGCTACTTGTAAAGGCAAATGATGCTATGCTTAATGTTCCAAAATTACTACTTCATCGTCTATTTCCTAATGTGCGGTATTCAATTTGGATTGATGGGAAACTTAAACTAGTGAGGGATCCTTATCAGCTATTAGAGAGATTCTTGTGGAGAAAGAATGTTAGCTTCGCTATTTCCAGGCATTACAGACGCTTTGATGTCTTTGAGGAAGCAGAGGCCAACAAGGTTGGTGGAAAGTATGACAATGCTTCAATCGATTACCAAATAGAATTCTACAAGAGAGAGGGTTTAACCCATTATTCTTCAGCTAAGCTTCCTATCACGAGTGACGTCCCTGAGGGCTGTGTAATTATACGGGAGCACATCCCTATCACCAACCTCTTCACGTGCCTTTGGTTTAATGAAGTTGATCGCTTCACCTCCAGAGATCAGCTGAGCTTTAGCACAGTGAGAGATAAAATAAGGAAACGAGTTAACTGGACTGCAGATATGTTCCTGGATTGCGAAAGGCGTGACTTCGTTGTCCAGGCATATCACAGAGAACTATGGGAACAAATACTACGAAGTCCGCCTCCACCCCAGCCTCGTTTGGTGCGCCAGCAACCCAGAAAGATGCTTCCGGATAATACAGCAAAGGAACCTGGAAAAGCCTCCGGGTCCAAGAGGGTATCAGCGAAGCGGACACGGGATAAGAAATCAGGCTCGAAACGAGCTCATAGAAGTAAGGTCACTGGTGGGAAGGAATTCATCCAACTGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSGVASLGLRSSGSYGSLQQSNGQSPAPAPSPPLAARKAGKMSFGGAGAGGRGLLFARICKLTSRRRRMLLLLLVAAAVLFCFLFSSLVSKDEDAPPGIETMLGISDQVRSFVNPVWTSSGRPITQGDSLNGNGLNTASQTEKQSDSDSSHKKLQGLSWSFPPSIVLEHHPCENFSFFPPPIDRKRTGPRPCPVCYVPVEQALALMPGAPSASPVLRSLNYLSGDNLISKESNHGSLFGGYPSLEERDKSYDIKDSMTVHCGFARGKIPGVNTGFDIDRADLSEMWQCQGIVVASAIFGNYDIMQQPKNISVFSKDTVCFFMFLDEETEAAIKNTTTIDNSKRIGLWRVVVVRNLPYSDARRNGKCLPDLKAIVMLLVKANDAMLNVPKLLLHRLFPNVRYSIWIDGKLKLVRDPYQLLERFLWRKNVSFAISRHYRRFDVFEEAEANKVGGKYDNASIDYQIEFYKREGLTHYSSAKLPITSDVPEGCVIIREHIPITNLFTCLWFNEVDRFTSRDQLSFSTVRDKIRKRVNWTADMFLDCERRDFVVQAYHRELWEQILRSPPPPQPRLVRQQPRKMLPDNTAKEPGKASGSKRVSAKRTRDKKSGSKRAHRSKVTGGKEFIQL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..274#1830..2126#2207..2420#2544..2653#2727..2926#3420..3482#3541..3644#3849..4036#4110..4309#4444..4674#ATGAGCGGCGTCGCGTCGCTGGGGCTCAGGTCGTCCGGGAGCTATGGATCCTTGCAGCAGTCCAACGGCCAGTCGCCGGCGCCGGCGCCGTCTCCGCCGCTCGCCGCGAGGAAGGCCGGGAAGATGTCCTTCGGAGGGGCGGGCGCTGGAGGCCGAGGCCTCCTCTTCGCCCGGATCTGCAAGCTCACCAGCCGCCGCCGGCGGATGCTCCTCCTCCTCCTCGTCGCTGCTGCCGTGCTCTTCTGCTTCCTCTTCTCATCACTCGTCAGTAAAGGTACAGCCTATCTTACTCCATGTTTTCTTATTAGCCTGTGTGACTATCAGACCAAATATTTTGTTATGCACTCAAATGATGTAATGCAACTTGCATCATCATACATGTACAAGCATCTGGCTTTTATGAATTTTAGTTATTTTACATGGTTATTATAGGATATTAGGAAGTGTTATTATGTGTAGTTGACAAGTACAAATGCTCTAGTGAAGTGAAATCGCGATCAACATCTTTAGTAATGGCAAAATAAAAAGGCAGGATGTACTATCTACTACTCCTACATTGGTGTTGGCTCTCATTGCCTTTTTTAAGTCAACATGATTTTTTATTGTGTAAGCATTTGATCCCCTTGACCTTGTTTACTTGCATTCTTCAATTTGCATCATAGCTGACTGTTGTGATGCATAAAAAATGGATTGCTATATTATAAACATTAAATAATAGTATTGAGTAGTGACCCAAGTTTTGAGTCCTTGGTTTTATATTTGGCTACAACAGGCACTTATCTAATTATGGAACTGTGGAACTGTGTTTCATATTTTATTGGGATGTATGGTGGTAGGTGTATTTACTGTGACTTAGATATTTATGAAAGTGCATACCTCGCAATGAGAGACATTAGTTTTGATAAATCTGTCAACATTTGATGCCTTTCTAGTACTGGCATTGTAGAATTGTGGTGTTGCTAGAATATTTTATTTGCTTGATCATTTGGTCAAATGCATGCTTATGTTAGCAACTAGTCTGCTACTTCTCTTACTATGCATCTTGTTTGATTTTTCCTGATTAATGTATTTGTGATTCTTAGCCCTTTAATTTTATCCTGCAGTCAATCTGCACATTTTTTTTCATGATTAAAATAATAATAAACTTTGTTTCAGTTTGCATCTAGCCATTTCAGTCAATATCTTAATTAGGGCATGTTGACGGACTACAATACTAGATCCCTCACATGTTGTTCATACATCATGGGTTGGGAATCTTTGACAAAGCTATAATAGTTAGTGTTCTGTCCATTCCCAAATTACTGTTTGATAACTTGACATGTGTGCCCTTTCAAATATGTTGAGTAGTGCCTCATTTTATATGTCAACAGCATTTAGCCTCTAGTTTTGATTCGCCTATTCCATCTATGTTACAAATATGTGAAATAAAAAATGGCCGCCTTTTCTGCAATAAGGTATAATTGCTAATTTCTCTCTAATACTAATTAAAACAAGGCAACTGTCTTCTATTCTAATGGCGTTACTCATGGCTTACAACAATTAACGTACATCCGTCGCATGAATCTATCCATGTTGATATTGGTGGTTCTACCGAATATCTAATGTGTAATCATGATATGTTTTTTTCTCATGCTGCATGGGTCAAACAGTGTAAGCTATTTTCTTTTTGTTGTACTAACAAGATTGAACTTATGTGCTATTCAAAAGCCTACTAAAGTAAGATGCCATCTTTAACATTAAGTATAGTTTTTCTGGCTAATTTTTGTGCTTTCACTTTCATATATTTCTTATAATACTGAACTATGAAATCTCATCGTGGCCTATGCTAGATGAAGATGCACCACCTGGTATTGAAACCATGCTTGGAATTTCTGATCAAGTCCGGAGCTTTGTGAATCCTGTTTGGACATCTTCGGGTAGACCAATAACCCAGGGAGATTCTTTGAATGGGAATGGTTTGAATACAGCATCACAGACAGAAAAACAGTCTGACTCTGACAGTAGTCATAAAAAACTTCAGGGTCTCTCATGGAGCTTCCCGCCATCTATTGTACTGGAGCACCACCCTTGTGAAAATTTCTCATTTTTTCCTCCACCTATTGACAGGAAACGCACTGGACCACGGCGTAAGTTTATCATTTTGACTAATTAAATTCAGAGTTACAGAAGTGCTTCAATCTAACTGTAATATTTTGTACATTTGTAGCATGTCCTGTTTGTTATGTGCCTGTTGAGCAGGCCCTGGCATTGATGCCAGGTGCACCATCAGCATCACCAGTCCTTCGAAGCTTAAATTATTTGTCTGGTGATAATTTGATTTCAAAAGAGTCAAACCACGGTTCTTTGTTTGGAGGTTATCCATCATTGGAAGAGCGAGACAAGTCTTATGACATAAAAGACTCAATGACGGTTCATTGTGGGTATGTTTACATAGCTCATCTGCTTTAGCTTCTGCACATCTATATGATAACTATCTACAGAAGTACAAATATTAATGCATTTTAATAGTTTACAATGTAACTGAACTTTACTGCATTTTTCAGATTTGCGAGAGGGAAGATACCCGGTGTCAATACTGGGTTCGATATAGATAGAGCTGATCTTTCTGAGATGTGGCAGTGCCAGGGGATAGTTGTTGCTTCTGCTATTTTTGGTAACTATATTATCTTTTCTTGTCAATTGTAATTGCATATTTCATTTCAACTTGCTTATTTGTGCTCTCTCAGGAAATTATGATATAATGCAACAACCAAAAAACATCAGTGTTTTTTCAAAGGATACAGTTTGCTTCTTCATGTTTCTGGATGAAGAAACAGAAGCAGCAATAAAGAACACTACAACAATTGATAATTCTAAAAGAATTGGGCTATGGCGGGTGGTTGTTGTCCGCAATCTTCCATATTCAGATGCAAGGCGCAATGGAAAGGTACGCAGATTTTAGAAGTTTTATTTTCTAGTTATATCTGTGAGGCACCACATTCTATCATGAAGAGGCACAACTGGGCAGGTTAACTTTCTTGTGGACCATGTAAATAGTAAGTTGTAGAGTAACTAAGATAATTCAATATGTAGTTGGTTTATAAAAACATTGATCTCTGTTTATAAAGATGGAGGCTGCTCCTCTGTTCAGAATAATAATAATCTTATACATCATACATGACTTCATGATACATTATACAGTAATAAAATGCACCTTTACGCTGGCAGTGTAATTACTAAAGTTGCACTCGCTGTTAAGCTGTGCAGATGCTAATTGATCTTGAGGTCTGTGCAAGTCTTTTGAATCTTTATTGCATTCTGCAGATTATAATTGATAGACCGTAGGCTGTAGCTGATACTCTGAATATGAAGTTTTTATTCTCTTTTCTACAAACTGAAATAACGCCATAGACCCCCCTTGGCCTTATTACCATTTTCAGTGTTTACCTGATTTGAAAGCTATAGTTATGCTACTTGTAAAGGCAAATGATGCTATGCTTAATGTGAGTGGATTTGTTAATTTTTAATCATATATGACCTTGCGATCATCTCATCAAACAGGTTCCAAAATTACTACTTCATCGTCTATTTCCTAATGTGCGGTATTCAATTTGGATTGATGGGAAACTTAAACTAGTGAGGGATCCTTATCAGCTATTAGAGAGGTAAATATCATATTTTCTCATCAATGTATTGATTGCATCCTGCAAATAGTTCAGGGAATAGGTATCGTTGAAGTAAATTCAATAGTTGTGGCTGCTATGGATTCTCCATCTAATGTATAAAGACCTAAGTTGCATAAATTGTCAAAGTTTAATCTGAGCAATGGCATTTATTGTCTGTTCTCTAATAGCACTGTTATGTCACAGATTCTTGTGGAGAAAGAATGTTAGCTTCGCTATTTCCAGGCATTACAGACGCTTTGATGTCTTTGAGGAAGCAGAGGCCAACAAGGTTGGTGGAAAGTATGACAATGCTTCAATCGATTACCAAATAGAATTCTACAAGAGAGAGGGTTTAACCCATTATTCTTCAGCTAAGCTTCCTATCACGAGTGGTAAGTGCTTCTCCCTAGCTAATGAGTAGTAATCTTCCTTGCTTGCCTTATAACAGTATATTGTGTTCTCCAGACGTCCCTGAGGGCTGTGTAATTATACGGGAGCACATCCCTATCACCAACCTCTTCACGTGCCTTTGGTTTAATGAAGTTGATCGCTTCACCTCCAGAGATCAGCTGAGCTTTAGCACAGTGAGAGATAAAATAAGGAAACGAGTTAACTGGACTGCAGATATGTTCCTGGATTGCGAAAGGCGTGACTTCGTTGTCCAGGTACTTTTAATGGTTCTTTAGTCTGGAAATCCTTAAACATATAAGCGAGAAAAGGAAAACCAACACATGATCTTTTCTGGCATTTATTGTTGTTTTTTAGTCTTAACTTGCTTTACGCGCTTCTTACTTAACAGGCATATCACAGAGAACTATGGGAACAAATACTACGAAGTCCGCCTCCACCCCAGCCTCGTTTGGTGCGCCAGCAACCCAGAAAGATGCTTCCGGATAATACAGCAAAGGAACCTGGAAAAGCCTCCGGGTCCAAGAGGGTATCAGCGAAGCGGACACGGGATAAGAAATCAGGCTCGAAACGAGCTCATAGAAGTAAGGTCACTGGTGGGAAGGAATTCATCCAACTGTAA</dnaseqindica> |
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