BGIOSGA003736
| Gene Name |
BGIOSGA003736 |
|---|---|
| Description |
DExD box helicase protein HLA-B associated |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003736, complete gene. |
| LocusTag |
BAT1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003736-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003736-PA |
| Length |
4721 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:22940263..22944983 |
| Sequence Coding Region |
22940263..22940390,22940499..22940599,22941961..22942133,22942215..22942446,22942593..22942711 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:22940263..22944983 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGCGAAGCCGAGGTCAAGGACAACGAGGTGTACGAGGAGGATCTCGTCGACTACGAGGAGGAGGTCGAGAACGGCGCCGACGGCGGCGCCGCCGCCGCCAACGCCTCCGCCGACGTCGTCAAGAAGGGGTACGTGGGGATCCACAGCTCGGGGTTCAGAGACTTCCTGCTCAAGCCGGAGCTGCTTCGCGCCATCCAGGACTGCGGGTTTGAGCACCCTTCCGAAGTGCAACACGAATGCATTCCACAAGCCATTCTTGGAATGGATGTCATCTGCCAAGCAAAATCTGGGATGGGGAAGACTGCTGTTTTTGTTCTCTCAAGTCTTCAGCAAATTGATCCTGTTGCTGGTCAAGTTGGTGCACTTGTGCTATGTCACACAAGGGAGCTAGCTTACCAGATTTGCCATGAATTTGAGAGGTTTAGCAAGTACCTTCCTGAGGTAAAAGTTGCTGTCTTCTATGGTGGCGTTCACATAAAAAAACACAAGGATCTGTTGAAGAATGACTGCCCTCATATTGTGGTTGGAACACCTGGAAGGATACTTGCTCTAGCTAGAGAAAAGGATCTTTCCTTGAAGAATGTGAGGCATTTCATTCTTGATGAATGTGACAAGATGCTCGATTCGCTTGATATGCGTAGAGATGTGCAGGAGATCTTCAAAATGACACCCCATGATAAGCAAGTGATGATGTTTTCAGCGACCCTTAGCAAGGAGATCCGCCCAGTTTGCAAGAAATTCATGCAAGATCCTATGGAAATTTATGTTGATGATGAGGCTAAACTGACCCTTCACGGGCTTGTTCAGCACTATATAAAACTAAGTGAGGCGGAGAAGAACCGGAAATTGAATGATCTCTTAGATGCACTTGACTTCAATCAAGTTGTGATATTTGTTAAAAGTGTTAGTAGAGCTGCAGAACTGAACAAGCTGCTTTGTGAATGCAACTTTCCTGCGATCTCTATACATTCTGGAATGACACAGGAGGAGAGGCTGACCCGGTACAAGAACTTCAAGGAAGGACACAAGAGGATTCTTGTGGCTACTGATTTAGTTGGCAGGGGAATTGATATTGAACGTGTCAACATTGTCATAAACTATGACATGCCCGATTCTGCTGACTCGTATTTGCACAGGGTTGGAAGGGCTGGACGTTTTGGAACCAAAGGACTTGCAATAACATTTGTTTCCTCTGCCTCAGACTCTGATGTTCTTAATCAAGTGCAAGAAAGATTCGAGGTTGACATAAAGGAGCTTCCTGAGCAGATTGATACTTCGACATATATGCCTTCGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGEAEVKDNEVYEEDLVDYEEEVENGADGGAAAANASADVVKKGYVGIHSSGFRDFLLKPELLRAIQDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVICQAKSGMGKTAVFVLSSLQQIDPVAGQVGALVLCHTRELAYQICHEFERFSKYLPEVKVAVFYGGVHIKKHKDLLKNDCPHIVVGTPGRILALAREKDLSLKNVRHFILDECDKMLDSLDMRRDVQEIFKMTPHDKQVMMFSATLSKEIRPVCKKFMQDPMEIYVDDEAKLTLHGLVQHYIKLSEAEKNRKLNDLLDALDFNQVVIFVKSVSRAAELNKLLCECNFPAISIHSGMTQEERLTRYKNFKEGHKRILVATDLVGRGIDIERVNIVINYDMPDSADSYLHRVGRAGRFGTKGLAITFVSSASDSDVLNQVQERFEVDIKELPEQIDTSTYMPS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..128#237..337#1699..1871#1953..2184#2331..2449#3069..3125#3203..3387#4164..4308#4379..4462#4547..4610#4711..4721#ATGGGCGAAGCCGAGGTCAAGGACAACGAGGTGTACGAGGAGGATCTCGTCGACTACGAGGAGGAGGTCGAGAACGGCGCCGACGGCGGCGCCGCCGCCGCCAACGCCTCCGCCGACGTCGTCAAGAAGTGCGTGCCCCCCACCCCCCCCCCGCGCTAGGGTTTGCTTGCTTCCTAGGGTTTCGTGGTTGAGTCGGTGGGAGGGGCCCTGATCTGACCTTCTTCTATGTTCGATAGGGGGTACGTGGGGATCCACAGCTCGGGGTTCAGAGACTTCCTGCTCAAGCCGGAGCTGCTTCGCGCCATCCAGGACTGCGGGTTTGAGCACCCTTCCGAAGGCAAGCTCATATGCTCTTCTTTTTTCCCCCTTGTTGCTGCTGCTAGTGTTCCTAATTTAGATTTATTGAAATCTAAATAAATGATGTGTGAAGTGGCAATTATTTGATTCTGACTTCGATATAGTCTGAGTAGTCACTTAACCAACACTAACCAGGTGTATATTAATTTGGTTCAAGGACTTTATAGATCTATAAATGGGCTAAAACTACTAGGATTGCGTTATCTAAGTGGTAACTGAAAATTCGAAAGTCACGTTTGTCAGGACCGTGTTATTTATTTCCTATAATAGCTTCTTACTCTTATTTATTTCCTGCAATACCTTAATCGACCTTCACGCTTGCTACTGCCTCTTACGTTATCTGAATCTTCAAACTTTGAGCCCATATGATGAACAAAAAGGCTTGATTGGAATTCTTTAAGTAGCATAGTTAACTGAGTTCGAATTGTTTTGACTAGACACGATACATAGTTGGAAAGCTTGACTAGACTGATGGTTTTACTGGAAAAAGGGCAAGTGTGCTTAAGATTGGTCTGGTTGTGCACTAAGACATACATTTAGACTGCTTTAATTGGAAAAAAAACAGAGTGCTCACATTGGTATCACTCTGGTTGTGCACTAGGTGCTTTTGCTGGGAAAAAGGGAACCAGTGCTAAGCTGCTTGTGCGTTAGTACTATCCATGCATTTAGATTATGTTGAGCCGGTGTTAAACCAGCACTGGTTGAATCGGCTGAGCCATCCCACCACCTCGTCACTTGTCTTTGTATTGAAACATACATGCAACATAAACTTTATTGAACTGTGGACCACTGGACTGGTGAACCAAGAATTTGGTCGGGTCACTCACTGGTTCAACCTTTCATACTATGATACTGTATTTAGACGGAGTGAATGCAAGATATGATTACTGAAAAGGCAAGCAATTTGTTGTTTTTACAGGTGCTATTTTCTCTGTTAGCTCACATGGGCATATGCCATATATTTAAACTTTGAATGCATGCCCTAGGCATTGATGCATTTACCCACTCAACTTTTGCAGCCAGCTCTTCCGTTTCTAGGATAGTTCATCCAGAAGTAAACTAAGTGTTAACCCAAATAGAAAACAATAAACGAATTGATTGTGCATGAACATTTGCTCGTCCTAGTGCTTGTTTCTAATACCAAATCAGATTAAATACATTCTAGCGTACATTTTTATATTCTTTCGAAATGTATTAATGAAAAATATCATTTTGCAGGTACAATTTTATCTGACAATTTTAGTTGGAGGAAAATGTGGTAAAAACTTTCAATTAACGGCGACAGGAGGTTAAATAGTTTCTCACTGGGGTACTCTCCAATTTTGTTTGGCTCCACACCAGTGCAACACGAATGCATTCCACAAGCCATTCTTGGAATGGATGTCATCTGCCAAGCAAAATCTGGGATGGGGAAGACTGCTGTTTTTGTTCTCTCAAGTCTTCAGCAAATTGATCCTGTTGCTGGTCAAGTTGGTGCACTTGTGCTATGTCACACAAGGGAGCTAGCTTACCAGGTATATATTTATGTCTTAGTTTAATTATGTCCAGTATGTCTGCATATACTAACTGTCTCTTTACTTAATATAATGTTGTAGATTTGCCATGAATTTGAGAGGTTTAGCAAGTACCTTCCTGAGGTAAAAGTTGCTGTCTTCTATGGTGGCGTTCACATAAAAAAACACAAGGATCTGTTGAAGAATGACTGCCCTCATATTGTGGTTGGAACACCTGGAAGGATACTTGCTCTAGCTAGAGAAAAGGATCTTTCCTTGAAGAATGTGAGGCATTTCATTCTTGATGAATGTGACAAGATGCTCGATTCGCTTGGTAGGCTGCTGTTCCTTGATCAAGTGATCATCATTCTACACGCAGAATATGTTCACTTTGCGATAACTTTTCTACCCCTATTTGTATCATATCAATATATCATACATGGCTCTGTTATATTCTTATTAATCTATTTGTTTCTTCAGATATGCGTAGAGATGTGCAGGAGATCTTCAAAATGACACCCCATGATAAGCAAGTGATGATGTTTTCAGCGACCCTTAGCAAGGAGATCCGCCCAGTTTGCAAGAAATTCATGCAAGATGTAATGTCATGTGGCCTATCTCATTTCAATAGCGCTTCTTCTTACTCTGGCATACACATACCTTGATAGGAGCGGTGGCAGTTCTGGTGTCAGTAGGTCAAAGGGATTTCTGATTACCGTACACTTCTGCATTGGTCGTAGTTCATCAATTACTACCTGAGTGTTCCTATTGGCTGCAAGTGAAGTCTTCTGTCAATGTGAACCATCTGGGGAGAATGCGGGTGTTGGGGTTGGGAGGGCACCATTATTGTAGATTGTACAAGGCCAGTGCTGCTTTTCTCCAATTGTCTGCATGCTTGTACTGGACTCCGCTTTATCAGAGTAAACTGCTTCTGTTTCTCCTACCCTTCTCATGGTCAGTGTGGACAAAGCAGCTTCCTCTTGATGCTAATTCTTATAGCAAGCACTGCTCCAGAACTTGTCTATGATTTGGTCAAATATCAGTGTCCATTGTCATAGCTGAAGTTCAAATACCAGTGCCCATTGTCATAGCTGAAGTTCCCTTAGGAGGCTCAAAATTCTGATGCAAGAAGAATTGATATGCTGTTCTTATTGGAGTGCCTAGAACATTGGCACACAGAAATTCTAATACCTTTATCTACCATTTGTTATCTTACAGCCTATGGAAATTTATGTTGATGATGAGGCTAAACTGACCCTTCACGGGCTTGTTCAGGTACTATTTAATTATCAATCTGTCATCTGTACCACTTTTCTGATTATTTTGTACCAACTCCCTTTCCCTGATTCCAGCACTATATAAAACTAAGTGAGGCGGAGAAGAACCGGAAATTGAATGATCTCTTAGATGCACTTGACTTCAATCAAGTTGTGATATTTGTTAAAAGTGTTAGTAGAGCTGCAGAACTGAACAAGCTGCTTTGTGAATGCAACTTTCCTGCGATCTCTATACATTCTGGAATGACACAGGAGGAGAGGTTTGTTATCTTGAATTCCTTTGCAGCCTGGTCTTTTAGGTTCTTTGTTTTTCATGCTTGTTTTATCAGTTCCTTATGAAAATAACAATAATCTATGCTGATGTTGATGGTGGTTGTCTTATTTTAGTTATCATTTTCTTTTTTACTGTAATGCTTTAGATGATGTCAGATATTTCATCAACCTAGTTCAAATGTATATTCTATAATATGTACATTTTTGTGGTGCCTATAAATGTTTTGGGCAATGGTCAACCATAATGCATATTATCCATGTGAGTGTTATGATGTAAGCATGGATGGAGTTGACTTATTATTCTTACGTTCGTATTTACTTTATATTATTTCAATAGTTATGCCTAATAAATTTAGCATATCTTTGAGAGGCACATATACGAAATCTTGTTGACAGTAACAGCATGCCATGAAGCAGGATTCGCCTTTGTTTGGTTTATGTACTCATTGTTATTCTCTAGACCTTTTATACTACTATATGAATATATGAATATTGTTGTTGGTGGTGATGGTCTGTCTGCCATCTTGTGACCTACCCTCAGCCACCACTCACCACTTTATTGCTGGCTATGAAATAGACATGATGGGTTTTAGAGCAGCCATTCATATACAGTAATGATCTTATGCAAGCAACATTCCTAATGAAAATTTGATTAAATGATTGTTAGTAGTTCTGAAATTTACTGCCTGACCAGTTGTGGCGGTTTGATCCCTACCAAGAATCCTTAATGCTTGATCCTCATTTAATGATGGAGCTTTTGTAGGCTGACCCGGTACAAGAACTTCAAGGAAGGACACAAGAGGATTCTTGTGGCTACTGATTTAGTTGGCAGGGGAATTGATATTGAACGTGTCAACATTGTCATAAACTATGACATGCCCGATTCTGCTGACTCGTATTTGCACAGGGTAATTTTAACATCACTTCACTGCTTCTCGTTAAGTTCTTTTTTTCTCTTTCTGACATTCTAACCTCCAGGTTGGAAGGGCTGGACGTTTTGGAACCAAAGGACTTGCAATAACATTTGTTTCCTCTGCCTCAGACTCTGATGTTCTTAATCAAGTTAGTATAATTGATCATTTTAATTTTGTTGCTTAACTAGTGTAACAAAGCCTCACTGTAATTTCACATGCATGATGTTTTAAGGTGCAAGAAAGATTCGAGGTTGACATAAAGGAGCTTCCTGAGCAGATTGATACTTCGACATATAGTAAGTGTTGCTTCCTTGTTATTCCAGATTTAGTTGTACTAATACCGTATCATATGATTTCAAAGAACTGATTTGTTGTATTTTGATTTGTGTTTCCCAGTGCCTTCGTAA</dnaseqindica> |
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