BGIOSGA006714

From RiceWiki
Revision as of 02:44, 28 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA006714| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006714, complete gene.| tag = P0413A1...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA006714

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006714, complete gene.

LocusTag

P0413A11.1

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA006714-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA006714-PA

Length

7552

Source

Oryza sativa Indica Group 

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:10736157..10743708

Sequence Coding Region

10743546..10743708,10743324..10743415,10742292..10742361,10742083..10742198,10740480..10740576
,10739411..10739490,10739081..10739275,10738848..10738931,10738709..10738769
,10737985..10738045,10737473..10737566,10737329..10737401,10736929..10737011
,10736270..10736460,10736157..10736166

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:10736157..10743708 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:10736157..10743708 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGTTCAAGACCAGTTGATGAGGTTCTTGATGCTGCCGCGGCTGGGGTCCACTACTCCACGCTCCGTTTGGATGAGCTTAACATCAATGGCTCCATGACAGGGGAGGAACAACCAACGACCTCAGGGGTGGAGAATGGGCACCAGGAGCCATTTGTCATTGGTGTTGCCGGGGGTGCATCTTCAGGCAAAAGTACTGTATGCAAAATGATAATCGATCAGCTACGTGATCAGCGTGTAGTTGTTGTTACTCAGGAGTCTTTTTATTATGGGTTGTCTGATGAGGAATTGGTCCATGTTCATGATTATAACTTTGATCATCCAGATGCATTTGATACGGAGTTACTACTCTCTTGTATGGAGAACTTGAAACATGGCAAGGCTGTGGACATTCCTAATTACAACTTCAAAACATATAAGAGTGTTGCAAGTGCAAGAAAGGTCAATCCTTCAGATGTAATTATTTTGGAAGGAATTCTGGTTTTCCATGATTCACGTGTCCGGGATTTGATGAACATGAAGATCTTTGTTGACACAGATGCTGATGTGCGATTAACAAGGAGGATTCGACGTGACACCATTGAGAAGGGTAGAGATATCAAAACTGTGCTAGATCAGTACTCAAAGTTTGTTAAGCCTGCTTTTGAAGACTTCATCCTCCCAACCAAGAAGTATGCTGATATTATCATCCCACGAGGTGGCGATAATGATGTTGCAATTGACTTAATAGTTCAGCATATTCGTACTAAGCTTGGTCAACATGATCTCTGTAAAGTACACCCCAATTTGTATGTCATTCAGACTACTTATCAGATACGAGGTATGCACACAATAATACGGGATGCTGCCACAACAACACATGATTTCATATTCTATGCTGATCGGTTGATTCGATTGGTTGTTGAGCATGGTCTTGGTCATCTTCCATTCAAGGAAAAGCAGGTCATAACTCCAACTGGATCGGTTTACACTGGGGTAGAGTTCTCCAAAAGATTGTGTGGTATCTCAGTGATTAGAAGTGGTGAGAGTATGGAGAATGCATTGCGGGCATGCTGCAAAGGTATAAAAATTGGGAAGATTCTTATTCACAGGGAAGGAGACAATGGCAAACAGCTAATCTATCACAATTTACCGAAAGATATTGCAAACAGGCATGTGCTGTTGTTGGATCCCATACTGGGAACAGGAAATTCAGCTGTTCAAGCTATATCTCTACTCTTGAAAAAGGGTGTACAGGAAACAAATATTATTTTTCTGAATCTTATATCAGCTCCCCAAGGAGTGCATGTGGTCAGCAAGAGATTTCCAAGAGTGAAGATCGTGACATCAGAAATCGAGTTTGGTCTGAATGATGATTTCCGCGTCATCCCTGGGATGGGTGAGTTTGGGGATAGGTACTTTGGGACAGATGATTATCAGTCATCAACACCATTCTTTTGTGATGAGAAAAATCGTGTCAGGCTTTTGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGSRPVDEVLDAAAAGVHYSTLRLDELNINGSMTGEEQPTTSGVENGHQEPFVIGVAGGASSGKSTVCKMIIDQLRDQRVVVVTQESFYYGLSDEELVHVHDYNFDHPDAFDTELLLSCMENLKHGKAVDIPNYNFKTYKSVASARKVNPSDVIILEGILVFHDSRVRDLMNMKIFVDTDADVRLTRRIRRDTIEKGRDIKTVLDQYSKFVKPAFEDFILPTKKYADIIIPRGGDNDVAIDLIVQHIRTKLGQHDLCKVHPNLYVIQTTYQIRGMHTIIRDAATTTHDFIFYADRLIRLVVEHGLGHLPFKEKQVITPTGSVYTGVEFSKRLCGISVIRSGESMENALRACCKGIKIGKILIHREGDNGKQLIYHNLPKDIANRHVLLLDPILGTGNSAVQAISLLLKKGVQETNIIFLNLISAPQGVHVVSKRFPRVKIVTSEIEFGLNDDFRVIPGMGEFGDRYFGTDDYQSSTPFFCDEKNRVRLL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..163#294..385#1348..1417#1511..1626#3133..3229#4219..4298#4434..4628#4778..4861#4940..5000#5664..5724#6143..6236#6308..6380#6698..6780#7249..7439#7543..7552#ATGGGTTCAAGACCAGTTGATGAGGTTCTTGATGCTGCCGCGGCTGGGGTCCACTACTCCACGCTCCGTTTGGATGAGCTTAACATCAATGGCTCCATGACAGGGGAGGAACAACCAACGACCTCAGGGGTGGAGAATGGGCACCAGGAGCCATTTGTCATTGGTTAGTAGTACTTGCTCAGTGCTGTTTTTGTCTGTTTATTTTGCAAGTAATCAGTAAATATCGACTGTTGTACATAATGTAGCCCTTTTGCCTCCCGATGTTTCATTCCCTGATTTGGTTTGGATTACAGGTGTTGCCGGGGGTGCATCTTCAGGCAAAAGTACTGTATGCAAAATGATAATCGATCAGCTACGTGATCAGCGTGTAGTTGTTGTTACTCAGGTTTGTCCCTTTTGCCTTGTGGTATTTGTGTCATCCGAATTTCTTTTGAATACCATATGCCACTAATAGTATATTTCTTAGTTCAATATATGTGGTATTAAGGTGAAATACATCCATGGAACTGTCATTTTTTTAGTTACTTTGTTCCATATTTCACGCATCACAAATAAAATAACCTTGTATTTTCGTCGTTAATAGAACCTAGATATTGGTATGTTTGGATCCATTACATGGATCTAGGATACTATAGTTATATAGTACACATCATTTTATCCTCTAAATGGGATTATGTTTTCCCTGATTTCATGGTTTAGCATCATGCACACGAGATGATATTTCAAGTGTACAACCTTTACCTTTGCTAATACAGTTAAGGCACAGTGCCTAGTATCTGTTTTCTGAAATTGTTGCTCTGCCTTAGATATATTGTGTAACATCATACTTGATATATACTGTTTCTTTTTTGGTATTTTTAGTTTTTCAATCGCGAAACTCTTAATGTTATAAAAGTGATTTTTCTTGTCACTCTTTCAATGAACCATGATCATAATACTTATATTGCTAACTGCTTCACATAATTCATTTCTGCTGTAAGTGGTAGGCTTGCAGGCATGACTGTCTGATTGTGATCGAATAGTACCCCCTGCTTTCCATAGCAAGTTTCTAGTTGCTCCTACTTTATTTTTCTGTATTGGCACTGTTAACCTTATTATCTTGTTACTTTTGTGATCGTGCATCTGAAAATTTGCTCTATTTAAAGCCAGCATTATGTGTTTATTGTATACTATTTCCATTAATTACTTATACTGTGTCAAATATGACAAGATAACTTTTCTACGAACATGCTTGTTACAGATTGTACAAATTAGTATATCGTGCTGTATTGCTAGACACCAGAATGTGCCCCCTTTATGCTAAATATCATATTGCCGCCATATTTTGTTTACAATCTTTCTTTGCAGGAGTCTTTTTATTATGGGTTGTCTGATGAGGAATTGGTCCATGTTCATGATTATAACTTTGATCATCCAGGTATGATGCATATTCCTAAGAAGTTTGCCTAAGTATGCTGGTGACTAGAGCTGTGCACTGATTTTGGTGCTACTGCTGCTGTCCTTATTTCAGATGCATTTGATACGGAGTTACTACTCTCTTGTATGGAGAACTTGAAACATGGCAAGGCTGTGGACATTCCTAATTACAACTTCAAAACATATAAGAGTGTTGCAAGTGCAAGAAAGGTACTACTATTTTACAGTGCTATCATAATTTACTCACCTGGTAAACTGAAGGTTTCCTCGTCCTGAGTTTCTAATAAAGCCTTAAGATTCTAATCTATGCCTGCTGTATGAACTGAGTGATCTATAAGTTAGTAGGAACTCTCCTTAAAATAGCAGCTATATTTGTAGAAAGGGTTATTTAGATACATGCTACATAATTACTAATTTTTGGGATATGCCAGTACAAAGTTGTTGCTTTATTATATGACACTAGCGAGTAGGTAAAATTAGAGATATCTCATCTACTTCACCATCTCCCGTAGCTGCTGTGATTGTTGGAGTAGCACAGTCTCATCCTGGTGAGGCTTCACAGCTTGAATTCCCTCTTGGAATCTAAGCCACCACTACAGTGGTAGTATGACTGAACTCTCGACAACTATAAAAAAAGTATTCTATAAAAAAATGAGCATAAGAACAAGGATTGTCATAGCAGTAATCCTGAGCTAACCTTCATTGTTCATGAGTATCATACTATCATTTTGTCTTCGTTCAGATCTTGTGAGTTGTCCAAGAGAAATGTAGCTGAAAATTGTGTGCTGGTCTGCTGGATAGCTAGGGAGTCAGAACACAGAAGTTTCATTTCCCTTTTGTAGGTGCTTAAGCTTTGGTTAGGAACTCATATATGCCTATTAATACAATCTGCCACCAGAAGTTTTCCATTAAAAAGTGATGGTTTTGAAATGCCGAAAGATCCAATAATTTGATATTTACTCCGTCCCAAAATATAAGGGAAATGTGAAGACATGGGAGTGATTATAAGGGATTTTGCCCATCCAATAATTACATCGGCAAAATCCCTTATATTTTGGGATGGAGATAGTATATTCCAGTAAAATTCGTAGCTTATCTGCATGGTTTTTGTCGGGCTCTGTGAAGCATGTAACTATGTCACATAACATTACTGCATATATCTAACAACAAATACTCAAAAGAACTTATCCAAGGCGACAAGCCAATTGTACAGGCCATGGCTGGGTACACCATTATTGGTGAAAGTTCTAGTCACTGAAGTAGTACATCCCTTCAGCAAAGCAACCTTTCCTGTCGATGAGGCAGAAGTTGGGGATGGTAGATATGGCTGATGAGGGAGAAGTTGGGGACGGTAGATATGGAACGGACGAAGGGAGAGGACAAGGACATTGTGTCCAGTTTGTTTCATAATGGCATATGTCAGAATTTTCCTACTTAGCAGTGGCATATCGAAGTCCACCTTGTAGTGGTATATCTGAAATGTAGTAACTCTATGGTTGCACATATTTAAATAAACCTCGTTAAAATATATTGTAGTTAGTTTTAATTGGCGCAGTTTCTAGTAAACACTAAGCACCTTATTGTTTCACAATTTCAAATAGTATTATTTTATCCATGAAAATTGGATCACTGATTACAGTTTATTCTTCTCTTTGTTTATCCATATCTGTTTTACTTTATGTTTCAGAGAAACCCTAATATTTTGACTTCTGTCAGGTCAATCCTTCAGATGTAATTATTTTGGAAGGAATTCTGGTTTTCCATGATTCACGTGTCCGGGATTTGATGAACATGAAGATCTTTGTTGACACAGGTATCAATATTTGCATGCCAAACTGTCTTATTATCTCTAGCTCTTGCCCATGACCAGTAATCATCAGTTGTACGTGTGGTCAGTATGATTATTTCCATATTTTATCCACATTTGTGTTTATACATGTGCATAATGTAATTTTGTTGTCTCCTATTTGATTTGAATTGGAAGTACTCCATCCGTCCTATTTTAAGTGCAACCATGAGTTTCCGTGCCTAACTTTGATCATTCGTCTTATTTAATTTTTTTTTGTAATTAGTATTATTATTATTATTATTAGATGATAAAACATGAATAGTACTTTATGCGTGACTAATGTTTTTGATTTTTTTTAAAAAAATTCAAATAAGACGGACGATCAAAATTGAGCACAGAAAATCATGGCTGCATTTAAAATGGGACGGAGGGACCACTCTTACTGTCGTACACTTATTTCCTGGACAGTGAGTTACACTTGGTACTAGTAAAATCCAAGAAATTAGCAAGCATATCACACACAATCTAGACACTATAACACTAAATAGCAACAGGAATACCCAAGAGTGACCTTATGCACCATATAGGCATCTAATACCTGATTGTGGGGGCTACCCAGCACCTAGGGCTGACTTTTAGAACACTGATTTCATTGTTCATTTACTAGTTCTTTTGTATCAACTCACAATTTTTTAGTTATTTCCATATTTTGAAATACTGTTCATTTGTTTTTTAAATACGAAAAGAGTTATTTTTGAAGTCACAAATGTCGCCAAATGTATATTGCATAAACTGCTGTGAAGGAAACAACCAAGGCTAGCACTTCGCATGCCCCCTAGTTAAAGAACTTGAGAGACATCCTTCTAATCACTCTTGTGAATTTATCACTATCTTGAACTTACGTATGTTGATAGACAGGGCCTGTAAATTCACAAGAAAAATAGTTTGTAGCTATCCATTGAACCCTGTGAATGTGTTGTCCTTTATTGTATTTCATCCTATTGAATTTTCAGATGCTGATGTGCGATTAACAAGGAGGATTCGACGTGACACCATTGAGAAGGGTAGAGATATCAAAACTGTGCTAGATCAGGTTACATGGTCACATACCTTTTTACTCACTAGAGCTGTTTTTATTTAACATGTTTACAAATCTTAGTTGTTAGGTCAGATCTCCTTGATGATTCTTTTTTGAAATTAACCACTTAATTCTACTTATGTTTTACAGTACTCAAAGTTTGTTAAGCCTGCTTTTGAAGACTTCATCCTCCCAACCAAGAAGTATGCTGATATTATCATCCCACGAGGTGGCGATAATGATGTTGCAATTGACTTAATAGTTCAGCATATTCGTACTAAGCTTGGTCAACATGATCTCTGTAAAGTACACCCCAATTTGTATGTCATTCAGACTACTTATCAGGTACTTCATGTGACCATAAATGTGCTGCAGTTTTTTCTTATAAAACCGATTGTTTTTTGATAATCTCATAATATTGAATGTTAATGCAATTATTTCTGGATTTTTGTAGCGTATATAAATATTAGCATTTCAATTCTTCTTTCTTTCAGATACGAGGTATGCACACAATAATACGGGATGCTGCCACAACAACACATGATTTCATATTCTATGCTGATCGGTTGATTCGATTGGTCAGTATGAAAATGCAATTGACATGTTTTCTTTTGTATGAGTTCCCATGGTAGCTTGAATTTTGCTGTGGAATATAGGTTGTTGAGCATGGTCTTGGTCATCTTCCATTCAAGGAAAAGCAGGTCATAACTCCAACTGGTAGGTAGTATTGCACTGTGACCATTCGTTGTCTTCCTTGTACTGTTCTGGTGTTACAAATTATCTCTTCAAATGCAGAGAATCTTGCTCGCTGCTAGTTGTATTAAGATGCTGAATCTGGACCAGTACATGATTAAACATAATGTCCTGTATTAGTATTTTTCCATTGAATTCAAGCTATATATTTCATAGTAATTTATTCTCCTGTTTCTAATGATTATGATTAAACATAATGTGGCATGTCATTCTGCGTTAAGTTTGTATGGGTTGCAGTATCATGGTTCATATTTTTTCCTTTTGTTTTTGTTACTCATCATTTGATAATTGCGCATGGCAACAAGCATCTATTTGTTGGGTTCATGTTTTCTAAAATCTTGGAACCATTCATTGTTTGATCTTCTCGCATAAAACTTCTCACATTGAGATTTTGTAACCATTCATTGTTTGCTCTTCCAAATTTTCCCAAACAAGGGTAATTGTCCTCATTTTCATTTTCATATTAGCTGAATACAGACAAAACCAAGGTAAATCTTGAGGACTTCTATCCGAAGGGGTTATAGATTATTTACCTCCATAGTTCTGTTCTCTTGAGAATCATGGAGTTATATGCATTTGTTTTCTCCTGCAATTAATTTATATCTTTGCCCTTATTTATGCGTGCAGGATCGGTTTACACTGGGGTAGAGTTCTCCAAAAGATTGTGTGGTATCTCAGTGATTAGAAGGTAGTAACTTCTTGATATTTTGATCTTGCACTCACTTGAGACTCTAATTGAGATCACACTTGGAACTCAGTTGGAAAGTTTTTTATTTTGTACCATGCTACTATCATGTTTGTCAGCGATATCTTTATGTTTCTCCTTTTCTTTGCTTGATAACTCGTGCAAAATGATAAAATGGAGCGACACGGCTATTTACAAATGCTGTACCAGAAAATATTGGAAACTTTAATTCAGTGTCCTTAGCCTGGCCTTTGGGCTACATTCCTATAAACCCTATCCTAGTCACTACTAAGCATGCTTTCTTGAGCAACTCATAATCTTGGATTCATTCCTTGTCAAGTATCTTGTTAGTAAAGCACATCATAAATTTTTGAATAGAAAGGCATAACTATGTTAATTATTTTCTGCAACTTCTCTCCAGTGGTGAGAGTATGGAGAATGCATTGCGGGCATGCTGCAAAGGTATAAAAATTGGGAAGATTCTTATTCACAGGGAAGGAGACAATGGCAAACAGGTTTGGTTTAATCTACTTTTGGCATTATTTGTTGGAGTTAGTCAAATTACTAAGCTCTTGATTCCTTGCAGCTAATCTATCACAATTTACCGAAAGATATTGCAAACAGGCATGTGCTGTTGTTGGATCCCATACTGGGAACAGGTATGTTGATGATTCTCACATATCCTTCCTGTTGTTACATGAATTTTGTTCTTGTGCTCACTGGAGCACTTCTGCCTCCACCTATCTCATGTAAAAGAGAGCAAACAAATGTGGGGATTCTGTACTTTTGCAACAAAATTAGTTTGGCAAATTGTCCCTTTTCAAACTATTTCACGTGTCATCTGTGATGTTCTCAATGTATCTCATGCATATAATGTACATTGTTTTGTCTATTGACTTGCTGAAATTTCGCGCACCTGCTCTACTGTTGGATATTCGTTTCATCTCATATAGTCTTATCTTCTTCATCATACCAGGAAATTCAGCTGTTCAAGCTATATCTCTACTCTTGAAAAAGGGTGTACAGGAAACAAATATTATTTTTCTGAATCTTATATCAGTAAGTCTACTGAAGTGCTGACTTTGGATTCATTATTTATTTATTTGCATGGATTGCATATGTGCTCTATTGAAGCTCATAATCTGATTGTTTTGGTACAATAATAGATATAATATTTTTTGTCTCCTTTTCCTCTTACAAGGTTGTCCTTTAGTGGAAGCTAAATCTTATTTACGCATTCTGCCTACTTCAATACTTCACTTGTACTGGTTTGGTGAACACAATTGCTAGCTAATAAGCATATCTACTGCATTTTTCAACTTTCTGTATCTGTTGTTCGGCAAATTGCTGAACAGTTAATGGAGGGCACAGTGGATAACTCTCTACAAGTTACTTCTCGAAGTGCAGTCTGGAACTTATGACCATTGCTGTACATGCTTGCTATGTTGGAACTTATCACGTTCGCTGTTATTGTGTGGCGGTTGATAACCATTGAGCTTACCACAAAAACTGTTGGAATTGTTCCAGGCTCCCCAAGGAGTGCATGTGGTCAGCAAGAGATTTCCAAGAGTGAAGATCGTGACATCAGAAATCGAGTTTGGTCTGAATGATGATTTCCGCGTCATCCCTGGGATGGGTGAGTTTGGGGATAGGTACTTTGGGACAGATGATTATCAGTCATCAACACCATTCTTTTGTGATGAGAAAAATCGTGTCAGGTGAGACATTGCTTGTTTTTTATTTTTTGTTCCCTACGAGAGTGTTCTATTGTCTGATGCGGATTCAAGCTTATCGGCATAACAATTGACACAACTCATGCAGGCTTTTGTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA006714

Retrieved from "https://ngdc.cncb.ac.cn/ricewiki/index.php?title=BGIOSGA006714&oldid=60266"