BGIOSGA007735

From RiceWiki
Revision as of 03:03, 28 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA007735| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA007735, complete gene.| tag = P0026H0...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA007735

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA007735, complete gene.

LocusTag

P0026H03.10

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA007735-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA007735-PA

Length

5840

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:6360994..6366833

Sequence Coding Region

6360994..6361067,6362361..6362446,6362533..6362656,6362895..6363021,6363095..6363189
,6363480..6363603,6364408..6364488,6365062..6365160,6365301..6365468
,6365573..6365660,6365747..6365817,6365887..6365955,6366255..6366386
,6366627..6366833

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:6360994..6366833 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:6360994..6366833 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGATTGAGCAGTTCGTCAATTTCGTCATCCGGCCGCCCCGGTACCCACATTCCGTCGCCCTTGTTTGCTTGTGGTCAGAGTATAATCCAGATCAGTATTTATGGGAGACGGAGTTTATCCTTGCTGGGCGCAAGTACAAACGACTAGACTTGGAGGCAACCTTATTCTGCCTTTACCAGCTTACGAATGCAAGAGGCCTTACAATAAAATGCAGCCACTATGTTCCTGCTTTCATTCCAGAGAATACTTCTCTTCCATGTGTGATTTACTGCCATGGAAATAGTGGATGCCGGGCAGATGCAAATGAAGCTGCTGTTATACTGCTTCCTGCAAATATCACTGTTTTTACACTTGATTTTTCCGGGTCAGGTCTATCAGGTGGAGATTATGTAAGCCTTGGTTGCCATGAGAAAGAGGACCTAAAATGTGTGGTGTCATACCTACGGACCACTAAGCAAGTTTCCTGTATAGGCCTTTGGGGGCGATCGATGGGTGCTGTTACAAGCCTACTCTATGGAGCAGAAGATTCCTCGATTGCTGGAATGGTATTGGATAGTGCTTTCACTAACTTATATGGCTTGATGATGGAGCTTGTGGATGTCTACAAAATCCGGGTTCCTAAATTCACGGTTAAGATGGCTGTTCAGTATATGAGAAAGATCATTCAGAAGAGAGCTAAGTTTGACATAATGGATCTTAATGTTTTACAGTTCGCTCCCAAGACGTTTATTCCTGCATTGTTTGGTCATGCTTCAAATGACATGTTCATTCAGCCTCACCACTGTGATCGTATTCACCAGGCGTATGGGGGGGATAAAAGTATAATAAAATTTGAGGGTGATCACAACTCCCCAAGACCTCAATCATATTATGATTCAGTTTCAATGTTCTTCTATAATACTTTGCATCCTCCTCAATTGCCTGTGAAATGCTCCAATAATCTAGGTGCTTTCAAAGTTGGCACGGTGACCAATGAGAGTTTCATTTTTGAGATCATTAGTGGTCTACGAGGAGCTGGAACCAATTCATGCAGTTCATCAATAGATGCATCGAAATTTCCAAATGCTACAACACCAGTAGTTGAATTGCTGTCAGAGAGTGTGAATCAGCTGTCCATTAAGAATGACAGTGACTTGGATTTTCTTTTAGACGAGAATCGCACCCTCTCAGAAATTGATGGTGATAGTGCTGGGTCACGCTTGCAGGACAAACCAAGTGGGCACAATGAGGAATCCTGCTCATGTACAAGCTCTAACAGAGAAAGTTGGGGTAGATGTTCCTCTTTAGGGGGAGCTAGTGACGACTCATTCCCTGGCGATATTAGTGATAAGCAAGAGAATATGACTGTAAAGGCTCTGGCAACACCGCTAAGACAGAAAGACAGCAAATCAACAACCCCAAAAACAAAGGAGAAGAAGAAGTCACTATGGAAGAAGCTTAACCGTGAGAGGGCAGGGGTGGGTGATAGTCTATCGCAACGTTTGAAGATGTGCCTCAGTCATTCTTCTCGTCACAAGAGAGTCAAATCATCTGGGATAGTGTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MIEQFVNFVIRPPRYPHSVALVCLWSEYNPDQYLWETEFILAGRKYKRLDLEATLFCLYQLTNARGLTIKCSHYVPAFIPENTSLPCVIYCHGNSGCRADANEAAVILLPANITVFTLDFSGSGLSGGDYVSLGCHEKEDLKCVVSYLRTTKQVSCIGLWGRSMGAVTSLLYGAEDSSIAGMVLDSAFTNLYGLMMELVDVYKIRVPKFTVKMAVQYMRKIIQKRAKFDIMDLNVLQFAPKTFIPALFGHASNDMFIQPHHCDRIHQAYGGDKSIIKFEGDHNSPRPQSYYDSVSMFFYNTLHPPQLPVKCSNNLGAFKVGTVTNESFIFEIISGLRGAGTNSCSSSIDASKFPNATTPVVELLSESVNQLSIKNDSDLDFLLDENRTLSEIDGDSAGSRLQDKPSGHNEESCSCTSSNRESWGRCSSLGGASDDSFPGDISDKQENMTVKALATPLRQKDSKSTTPKTKEKKKSLWKKLNRERAGVGDSLSQRLKMCLSHSSRHKRVKSSGIV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..74#1368..1453#1540..1663#1902..2028#2102..2196#2487..2610#3415..3495#4069..4167#4308..4475#4580..4667#4754..4824#4894..4962#5262..5393#5634..5840#ATGATTGAGCAGTTCGTCAATTTCGTCATCCGGCCGCCCCGGTACCCACATTCCGTCGCCCTTGTTTGCTTGTGGTGTGAATTTGGCATGGTTGGTACATTGGCATGTGGCCGTACGTACTGTTGTGAATTGGGAGATTTGCATGATTAATGCGAGCCTCACGTACATGCAGCTTGGGTTCCTCGATTGCTAGTAGATTAGGTAGAATCTAGGTTGTTTTGAGTTTATGTTTTATTCGAGCAAAGGGGAACCACGGGCATTATTTATTGAAACCAGTCATTAGTTCGTACAGAACCATGGAAGCAAGATGAGCATTCAAGCTACTAGGATATGCTGGAAGCGCCAAGTTCTAGCTCGAAATTCGATACATTATGCCTCCGTAATCCATGCTAGAGAAAAGAAGCAAAGAAACCAATAATGTGCTTGAAAGTAGCCCAAAGTTACTTTGACATGTTTCAGTAAAATTTCTGTAGAAAAGATACAAAGGAAACAAAAAGGTGCTTGAAACTAGCCCAAAGTTACATTGTCTGGTTTCAGTACAACTTTTGTCAATGCAATATGCTGGCTCTGAAGCCTCCACCCTGAGCAGTTTGTGAGGGAGGCTGAACCGGTCATGCTAATCTTACCAATGATTCATTTCAAAAGTTTGCATGTCAAGTGTGAGAACGAGGATTTATACCTAAGGATAGTCATCTTGGATATGATGGTACATTGGCCCTTGATTTTCTTTAGAGCACAGTAACCTGCTTACTGTTAACAGAAACCTGATAGGAGTACATGGGCTCTTGATGTTGTAGATCGGTACCATGTGCCATAAAAGCTAGAGTTAGGTACAATGGAATGGTCATTGCAGTTGGCATTGTGTGGGTAGTTGTGCATGTATGGGCATGCTCTATAATGCCTACAACATATACCATTAAGAAGTAGCTTTAGTGTGGCACGATAATCTAGCCCATGCTCACATGACAAATGTGGGCAACCTGCTGAGTGGAGGGATAACGAGAAAACTGTTAGCAGTTGACCTTCTTAGGTGTCGGATTTTTTCATTCTGGTTGCGAATATTATGGATATGTCTTTTTCAAACTTATCTTTGTTTAAGGGGAGGTGTTTTTTGCATCGAGTTTTGAATTGGAACATCTGCACATGGAAATGTTTTCTCTTCACTGCATTTCAAAGCTGAAAAATCTCATAATAGGTGTCTAATCAAAGAATCAGAGCCATGCTGATGCAATGTATAAATAATTGAATGGACCATTGACTTAGTTTGCATGAACCTGTCAACTGACAATGGTACAGTTTATTGAAAAGAAAATTGTAGGAAATCACTGTACACGGTCCCATGGAATTTACCAGTTACTTGTCTGCAGGTCAGAGTATAATCCAGATCAGTATTTATGGGAGACGGAGTTTATCCTTGCTGGGCGCAAGTACAAACGACTAGACTTGGAGGCAAGTAAGGGAACCAATTGTCGAGGTTTTTTTCTTTAATTCATTTACTGGGAGAAGTTTGACTGCAATTATGGACATCTTTGTTGATAGCCTTATTCTGCCTTTACCAGCTTACGAATGCAAGAGGCCTTACAATAAAATGCAGCCACTATGTTCCTGCTTTCATTCCAGAGAATACTTCTCTTCCATGTGTGATTTACTGCCATGGAAATAGGTATTTACCTTGTGTGCTCAGTGCTAGCATATTAGTCTGAGTCGTGTTTTCTTTAACATTCAGATTAGTGTATTTTGATATATTAATATGTGCTCCTAAGCCTTTGGAAACCAAATTAATATTAAGTTAGTAGCACACGTTATGAGCTAGCATTTCCTCTTAACTGATGAGATTCATCTCAAGCAATCACCGATATCTTTTGGAATCTTTAACAGGCTTTTGCTTTGACTCAATGCAGTGGATGCCGGGCAGATGCAAATGAAGCTGCTGTTATACTGCTTCCTGCAAATATCACTGTTTTTACACTTGATTTTTCCGGGTCAGGTCTATCAGGTGGAGATTATGTAAGCCTTGGTTGCCATGAGGTATATAATCAGTATCACTTTTGTTCTTCTACATTTATATCATGGATAATTACATTATTCTGAAATTTTCTAGAAAGAGGACCTAAAATGTGTGGTGTCATACCTACGGACCACTAAGCAAGTTTCCTGTATAGGCCTTTGGGGGCGATCGATGGGTGCTGTTACAAGGTACCTTTTAGTTTGGATATACTGCATGCTCCTTTTACTTGGTGGTGGAGATTTATTTATTTCACTTCACGTGACTTGATTGATATGTTACACCAAACAGAGATCAACATTGAACAAAATTATCTGTACTTAAGTGGCCTCTGATTCTCCCGTTTTGCTCTTTGATAATGTGCTTTAGAAGGTTTTTAGGCTTTGAGTTCATGTCATGTATAAGATGTCTTAAATATGTGATCTTTGCGTAACGGATCCATCCCAATTCATTCGTTGTTTTGTGAACTAATGTAATACAGCCTACTCTATGGAGCAGAAGATTCCTCGATTGCTGGAATGGTATTGGATAGTGCTTTCACTAACTTATATGGCTTGATGATGGAGCTTGTGGATGTCTACAAAATCCGGGTTCCTAAATTCACGGTATGCACATATTCTGTATAAAGTTGCTTTTGTTCCATAACAAAATGACATGGAATGCTGCAATATTGCATTGGCATAATTTGTAGGGTATCATGGCTTATAATAGCTATGATTCTTTCTTGTTTCTTTTTGGGAAATCAGATTGTTCTATTGTGGCTTAATAGCTCAATATTTGCCCATCGAAACCATGGTTTTACTATTCAGCACTCAGTCACTTAGCTCTTAGTTGCAATTGTTATTTTTTGAGCAATTATTCAACCAGGCTAAGTTAGTAATTACTTCATCAGGTTAGGAGTGTAAAAGGGCTTTGAGTTATGTGATTGAACACCATTCAGTTGCTTCAACTTAAAATGCATTTATATCCCATTTTTAAGCAGAAAAACTACCTAACTTACTGCCAATGTTATTTGATTTCTACTTTCATTGGTTTGCCTGCACCCCCATAATTACCAATTTACATAGTTTCCTTTGATGTGATGCAAGAAATAAACATGCAAATAAAGCTCCATTCTCTTGATGGAATTGCAAACGACTACACACAACTTAAATTCATCTTCTGGTTGCAAATAACTATGATAACTTATCTGGTAGCTCTATCTTATTCTGTTATTGGATATGAATTTTAATTTTAGCACACCCTTATTAAAATTACTTCTTCCTTCGTATTCAGCTTTCACTTCTAATGTTGTGAAGCGTAGCATCGTTGTATGTTCTTACTAACATAAGCTCCTTTCTAACCTTAGTGAGCATTGCTGTATTTGCATTGTTTTAATCATTTTTTTTTTCTGAAATTTGTCGTTTCAGGTTAAGATGGCTGTTCAGTATATGAGAAAGATCATTCAGAAGAGAGCTAAGTTTGACATAATGGATCTTAATGTTTTACAGGTTTACTTTCTGTATCAATATCTCGCAATCATAGTATTGTAGAAGTTAACACAATGTAATCCTTTTTGTTACTGAATAAACATGTAGACGCATAAGCTCATGGAGTACCATAAAGACTATTTCAGACTACATTTTGCAATTATTCACTGCCATTGGTTATATTTCATATTAAATAACACTATGGACATGATAAATGATATTATCAAATACTCCCTCCATCCCAAAGTATAGTAGCAACCTAGTATACGATTAGGCTTATCCAGATTTGTAGTACTAGGTGGTGCCTAATCATGTACTAGTATTTGGGGATGGAGGGAGTAATTAGTTTTCTGCAGAGCCTGGCTGATTATGCTGGGTGTTATATGTAATTGCCTCCATCCCAAAAAGACCTTATTGTGCATAGCAAGAAATGAAGTCTTTCTGGGAAGGAGGTAGTAATACTTAGAAATCCTCTATTAGTGAACTGTTGATTATTGAACTTTGCCATCTGAAGTGCTCTTAGTTGCAGTAATTTTAAATGCTTGCTCGCTCCTACAATTGTGGCTGACTTTGTGTTCTCTTGTTCTTAAACAGTTCGCTCCCAAGACGTTTATTCCTGCATTGTTTGGTCATGCTTCAAATGACATGTTCATTCAGCCTCACCACTGTGATCGTATTCACCAGGCGTATGGGGTAATGCATAATGTAGTTTGTTTTATTAATGCCACTCAAAATCGAATAAATAATACATAAATCGCTAATTGACTGTTCCTGGCTTCCTGCTGAAGAATACATTATTATTTGTTTAAAATTAAATCATGTTTATTGTACAGGGGGATAAAAGTATAATAAAATTTGAGGGTGATCACAACTCCCCAAGACCTCAATCATATTATGATTCAGTTTCAATGTTCTTCTATAATACTTTGCATCCTCCTCAATTGCCTGTGAAATGCTCCAATAATCTAGGTGCTTTCAAAGTTGGCACGGTGACCAATGAGGTAAAGCTTCATAAAATACGTTACAAAACTTAATTTGGAACCACTATTGTTCTTATGAAGTACTTTGAGTGAAAACAAATATTTGCTTTTGGGTGGTCCTCCAGAGTTTCATTTTTGAGATCATTAGTGGTCTACGAGGAGCTGGAACCAATTCATGCAGTTCATCAATAGATGCATCGAAATTTCCAAATGGTGTGTTACGTTCCGCTCTTTTGCTTCCTTGTAGTTGAATTGTATAACAAGGCGCTATTCACTAACTGTATCTCTTTTTATTTCAGCTACAACACCAGTAGTTGAATTGCTGTCAGAGAGTGTGAATCAGCTGTCCATTAAGAATGACAGTGACTTGGTAGGATTGCTAATGATACGTTCGTGCCTGATATGCAATACCCTTTCCTGACTGTTCGATTAAATGCAGGATTTTCTTTTAGACGAGAATCGCACCCTCTCAGAAATTGATGGTGATAGTGCTGGGTCACGCTTGCAGGTGAAGTATATAAATTGGTTAAGCAGAAATTAATCACTGTATTTTGTAGTGAAGCTCAACATTATCTCCATATGAGTAATTGAGGTCACTGTAAGAAATTGTGGCAATTGTAGCACAACTATGGTTTGCTTAGTACTTAGTAGGGTCATTGAAACCAATGGTCAGTTCCATTCATCATGATTGATTACCCGGTGGACAACAATTGTATATAATTGTCAACAGACAGGAAAAACGCTTCGATATTCCTGTACCTGTAAGTTGTGTGATGAGTGATGACAATATGTCTGCTTTTCTTATAGGACAAACCAAGTGGGCACAATGAGGAATCCTGCTCATGTACAAGCTCTAACAGAGAAAGTTGGGGTAGATGTTCCTCTTTAGGGGGAGCTAGTGACGACTCATTCCCTGGCGATATTAGTGATAAGCAAGAGGTAAGTTGCCTCTCTTACTTCCCTTTCAGTTTAGTTGTGTGTACTAAAAATACTATGAAAGCAGGCACATTGGATGTGAGGTAATTATGATAAATATTTTGCATGATATTTAGATTAATACTGTTATATAGCTTAAGTTGATTAGCTTAGTGTTACTAATCGTTTATTTGGGTTTCTCTCAAATAAGTTCAATATTTTTTCTCATTATAAAATCTCAGATACAGTAAATGTGTCTTGTAGAATATGACTGTAAAGGCTCTGGCAACACCGCTAAGACAGAAAGACAGCAAATCAACAACCCCAAAAACAAAGGAGAAGAAGAAGTCACTATGGAAGAAGCTTAACCGTGAGAGGGCAGGGGTGGGTGATAGTCTATCGCAACGTTTGAAGATGTGCCTCAGTCATTCTTCTCGTCACAAGAGAGTCAAATCATCTGGGATAGTGTAA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA007735