BGIOSGA014584
| Gene Name |
BGIOSGA014584 |
|---|---|
| Description |
(RAP Annotation release2) Glycosyl transferase(Rice |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA014584, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0010H02.17 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA014584-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA014584-PA |
| Length |
4337 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:26517922..26522258 |
| Sequence Coding Region |
26521978..26522258,26520019..26520274,26519141..26519342,26518919..26519066,26517922..26518459 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:26517922..26522258 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:26517922..26522258 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGCGGGGCTGCGGCCGCTGGTGGTGGGTCGCCGTGGCTTTGGTGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAAGGGGCGCGTGAGGAGGCAGCGGTGGCGGTGGCGGTGGCTCCGCGGCGGCACGCGTACGCGGCGATGATGTACATGGGCACTCCCCGGGATTACGAGTTCTACGTGGCCACGCGCGTCATGATGCGATCCCTCGGGAGGCTCGGGTCGGACGCCGACCGCGTCGTGATCGCCTCCCTCGATGTCCCGCCGCGCTGGGTCCAGGCGCTGAAAGATGATGGTGTGAAGGTGGTCTCTGTGGAGAATTTGAAGAATCCTTATGAAAAACAAGAGAACTTCAACATGCGATTCAAGTTGACTCTTAACAAGCTGTATGCATGGAGCCTAGTTTCCTATGACCGAGTTGTTATGCTAGACTCTGACAACATTTTCCTCCAGAACACTGATGAATTATTTCAGTGTGGCCAGTTCTGTGCTGTCTTCATTAACCCTTGTATCTTCCATACAGGGCTCTTTGTGCTTCAGCCCTCAATGGACGTTTTTAAGAACATGCTACATGAGCTAGCTGTTGGGCGTGATAACCCAGATGGTGCAGATCAGGGCTTCCTTGCTAGCTATTTCCCAGACTTGCTTGACCGACCAATGTTCCATCCACCAGTTAATGGTACCAAACTTGAAGGAACATATCGTCTTCCGTTAGGCTATCAAATGGACGCATCTTACTATTATTTGAAACTCCGCTGGAGCATTCCATGTGGGCCGAACAGCGTGATTACATTTCCTAGCGCTCCATGGTTTAAGCCATGGTATTGGTGGTCTTGGCCAGTTTTACCTCTGGGACTTTCTTGGCATGAACAACGCCGTGAAAACTTGGGGTATTCATCGGAGCTACCGGTTGTATTAATCCAGGCCCTATTTTACATTGGAGTCATTGCAGTCACCCGACTTGCGCGGCCTAGTTTGTCAAAGATGTGCTACAACAGAAGAATGGAGAAAAGTACTATAGTTTTGCTCACAACACTCAGAGTAGTGGCAGCATGGTCCATACTTGCAGCTTACACCATTCCCTTCTTCCTGATCCCACGGACGGTGCATCCGCTACTAGGTTGGCCACTATATTTGCTTGGTGCTTTCTCCTTTTCTTCAATCGTGATCAATGTATTCCTCCTCCACCCCCTTGCGGTCCTCACAACATGGTTGGGGATCATCGGTGCTCTCTTCGTGATGGCATTCCCATGGTATTTAAACGGTGTTGTAAGGGCCTTGGCAGTGTTCGCCTATGCATTTTGCTGCGCTCCCTTGATCTGGGGATCTTTGGTTAAGACAATGAGCTCCTTGCAGATCCTGATTGAAAGGGATGCATTCAGACTTGGTGAACCTAACCAGACAGCCGAGTTCACGAAGCTTTATTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGRGCGRWWWVAVALVVAAAAAAAEGAREEAAVAVAVAPRRHAYAAMMYMGTPRDYEFYVATRVMMRSLGRLGSDADRVVIASLDVPPRWVQALKDDGVKVVSVENLKNPYEKQENFNMRFKLTLNKLYAWSLVSYDRVVMLDSDNIFLQNTDELFQCGQFCAVFINPCIFHTGLFVLQPSMDVFKNMLHELAVGRDNPDGADQGFLASYFPDLLDRPMFHPPVNGTKLEGTYRLPLGYQMDASYYYLKLRWSIPCGPNSVITFPSAPWFKPWYWWSWPVLPLGLSWHEQRRENLGYSSELPVVLIQALFYIGVIAVTRLARPSLSKMCYNRRMEKSTIVLLTTLRVVAAWSILAAYTIPFFLIPRTVHPLLGWPLYLLGAFSFSSIVINVFLLHPLAVLTTWLGIIGALFVMAFPWYLNGVVRALAVFAYAFCCAPLIWGSLVKTMSSLQILIERDAFRLGEPNQTAEFTKLY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..281#1985..2240#2917..3118#3193..3340#3800..4337#ATGGGGCGGGGCTGCGGCCGCTGGTGGTGGGTCGCCGTGGCTTTGGTGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAAGGGGCGCGTGAGGAGGCAGCGGTGGCGGTGGCGGTGGCTCCGCGGCGGCACGCGTACGCGGCGATGATGTACATGGGCACTCCCCGGGATTACGAGTTCTACGTGGCCACGCGCGTCATGATGCGATCCCTCGGGAGGCTCGGGTCGGACGCCGACCGCGTCGTGATCGCCTCCCTCGATGTCCCGCCGCGCTGGGTCCAGGCGCTGTAAGCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGTCTATGTCGCTCTCGCGCCACTAGCCTCACGGTTGTCTTTAGCTTGGATCGCTGGGTAATGATCAAAATCTGTCTCCCTCGTAGATGTTCGATTTGTACTTTGGAGTATATTTGAATCGAGGTCTGATTCAGCTCTCTCTCTTCTTTTTTTTTTCACGCGCTGGAGGGTTGACTTCGTGCCTGTTTTGTTGTTTGATGCGAATTTGTGGGTTTCTTAGTGCAGCTCTTCCCGTAGCTCAATGCAATTTTTTGGTCACCTTGCCTTTGCTGATTCTTATGAAGTTGTTTGGTTATTTGAGCACCGCGCTTGCCGTTTTATGCCAATTGATGACTATGTGATCGGTGCCACTATAAATGGCTAGAATCTCTTCTTCCCTGTCCGTATCAAATTCTTCGATTGTCGTTTGTTGCCTTCTCTTAAGCTTGTTGTTACTCTCTTTTTTTGGCCTTGTTTTGCTGTATTTTTCTCTGAATTTTCTGGCTTGCGGATTGGCAGTGTCCTTGCCATGTCCTGGTTACTATTACTGTTTCTCCCCGTACTATTCGACGAAGATGCTGCTTGTTCGGAATGATATCCTGTAACTGTTACGTACCTTGTTACGGTCATTGAGTTTGCATATGCATTCATGTTGACTTTGTAGCCTAGAGTCATTGAAGTTTGTTGAGAGAGATTGTGCGTCCTGGTTGTGAGATATTCGATAAATTGTGATATTTGTGCTGCTAATTTCGACCTCAAGTTGCTGCGCAAATTGCAGTTAACTGATTAACTCATTGCCTAAGCTTTATTATAGAACAGTTTTTTCTGTTGGACTACTGATTTGGCCTTTGTTACAGATTTGTTCAAAAGTGGTGAGAATTGACCTGTTAATTTCCACTGCCGATTATTCTACATGGAAGTTTGCTGATTGTGACTGCATTGTTCTATTACAATACTCCAGTTGGACTAGCATGTGAACCCCTCATATTGTCCAACTGACCACATGTGGATGTCGACCTGAGTTGATTTTGTCCCTGTTATGGCTTGTTGGCCGTTGCCTAAGAACTTACAGTTTCAGAGAATGCTAGCTTTGTTCTGAAGAATTTGTCAGCTTTCTTTGTATCCTAGTGGTCCATCCTTTCCCCTCTGTTCTGAGAATATCATACCTGTGCTGGCCAGATTGAGCATTTTTAATTGTGGAGTTTAGTAATAGATATTCAATTTAATATGGTATATGATTAGTTGAAGTAGGTAGCCATGTTGGGCCAGGAAGCTTAGCCATTATTGAGTCATGTAACTAGCAAGAGTATATAATATTATGTTATTGGCACTAATGAAGTTACAACTAATCATGGAGGAACAAATATGGACATAACAAAACTAGAGGAACATTAGTGATGTTGTAACTTATAAGTACCATGCAAGAATAACAGTGGCATTATTAGTGGAACCAATGAGGTGATTAATGGGGTAATAATACATGCATCTTTCAGAAAAAAAATGATATTTGAATTCAGTTTATCATTTGATAACTTAAGTTACTGGTAGAATTGGCATGCAATTATTGTTACTAGATATATTTTCCGTCAGCTGAAATACATGCTCTTTTTGTCTTGTGTGGTCTTGATTCTTCTAGTATTTATGCATCTTCAACTGTTTCTTTAGGAAAGATGATGGTGTGAAGGTGGTCTCTGTGGAGAATTTGAAGAATCCTTATGAAAAACAAGAGAACTTCAACATGCGATTCAAGTTGACTCTTAACAAGCTGTATGCATGGAGCCTAGTTTCCTATGACCGAGTTGTTATGCTAGACTCTGACAACATTTTCCTCCAGAACACTGATGAATTATTTCAGTGTGGCCAGTTCTGTGCTGTCTTCATTAACCCTTGTATCTTCCATACAGGGCTCTTTGTGCTTCAGGTAGGATTACTTGCTATATGGGTTTCTCCTTTCTTCTGCAAAATTTCTTTTAACTTTCTCCATGTAAGGAAAGATATTAGCTCTTAATCTCTTCATTACTAGGAATGACTATGAATCGACCTCCTTTAGTCCATTGCATCTACAAAGGCATTCTGTTTTGTTTAGCACTTCATATTAGGGGTGATCTAACTGCCATTTGATAAGTAATCCTTCATTATTGTTTAATTAAAAGACCTATGCAGTTTTGTTGCCAACTGGTTTACTGCAAATCTTTTACCTGAAATTAATAAGCTTGGTTTTAGAAGCTGCAAGCTTATATTGAATCTGTTTTCTTCCTGGATATTAGTCTTTAGCTTTCTGTTGGCCTTTCTCAAAGCACAGATGTATTTTTCAGGGGCGCGAAACACAGAATCTACAATACTTCTTAAATCTAAACCTATCTAATGCACGGGCCAATTGCTGTTTTTTTTGGCACAATATTCTGCAGTAGGCAAATTCAAAATGGTTATGACAACTCCTACTTTGTGCACTCATTTTTTTTGTCATACTAACCAGTTGTTACTTATTAATCAACCTGATTTTCTCTAGTCCAGAACCATCTAAAGTTCATCAAATGAACCTGAATATTGAAATTTATGTCGTCATGAATATTTTTTTCTTTCTATTTTGTTTTCAGCCCTCAATGGACGTTTTTAAGAACATGCTACATGAGCTAGCTGTTGGGCGTGATAACCCAGATGGTGCAGATCAGGGCTTCCTTGCTAGCTATTTCCCAGACTTGCTTGACCGACCAATGTTCCATCCACCAGTTAATGGTACCAAACTTGAAGGAACATATCGTCTTCCGTTAGGCTATCAAATGGACGCATCTTACTATTGTGAGTATCAATAGACATATACGAATTCGTATGCTCATGCATTTTCCCCCTAGACTAATGGGATATTTGTTCAGATTTGAAACTCCGCTGGAGCATTCCATGTGGGCCGAACAGCGTGATTACATTTCCTAGCGCTCCATGGTTTAAGCCATGGTATTGGTGGTCTTGGCCAGTTTTACCTCTGGGACTTTCTTGGCATGAACAACGCCGTGAAAACTTGGGGTGAGTAATTTTCTCAGATATTTTGTCTTGCATTTTATTTGCATGATTGAATTCTGATGTTAATAGAATCTTCCACTAATGCATTGCTTCATGTACAAAATTTGTTAGCATGGATCATGGATGGTAATATCATCCATAACAGTGTATCATGTGCACTCGTGTGATTGGTTAAATGCCCTTTGTGAATTGCTTTCTATCTTCTTTAGAATAAAGATGTGTAACAGGTCATTATCGAGCCTTTTACATTTTAGAATAAAGTTGCACAAGGCAAGGAATTATTGTGCTTCTTTTTTTTTGTCAGGATAAAGTTCCATAAAGTAGTGGATTGCAAAGTCTTCAACCTTCTGTCATGTTTTTTAGGATAATGAAGCATATAACAGTATTCATTTTGTTGCATCTTAATTTCTGAAGCACAGAGTGTTGCCTTTCCTGACTATATGTAAACTTGATGCAAAGCAGGTATTCATCGGAGCTACCGGTTGTATTAATCCAGGCCCTATTTTACATTGGAGTCATTGCAGTCACCCGACTTGCGCGGCCTAGTTTGTCAAAGATGTGCTACAACAGAAGAATGGAGAAAAGTACTATAGTTTTGCTCACAACACTCAGAGTAGTGGCAGCATGGTCCATACTTGCAGCTTACACCATTCCCTTCTTCCTGATCCCACGGACGGTGCATCCGCTACTAGGTTGGCCACTATATTTGCTTGGTGCTTTCTCCTTTTCTTCAATCGTGATCAATGTATTCCTCCTCCACCCCCTTGCGGTCCTCACAACATGGTTGGGGATCATCGGTGCTCTCTTCGTGATGGCATTCCCATGGTATTTAAACGGTGTTGTAAGGGCCTTGGCAGTGTTCGCCTATGCATTTTGCTGCGCTCCCTTGATCTGGGGATCTTTGGTTAAGACAATGAGCTCCTTGCAGATCCTGATTGAAAGGGATGCATTCAGACTTGGTGAACCTAACCAGACAGCCGAGTTCACGAAGCTTTATTGA</dnaseqindica> |
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