BGIOSGA017006

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA017006

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017006, complete gene.

LocusTag

OS04G0588200

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA017006-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA017006-PA

Length

10170

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:28508358..28518527

Sequence Coding Region

28508358..28508630,28508728..28508862,28509028..28509207,28509298..28509366,28509483..28509683
,28509782..28509835,28509920..28509981,28510083..28510215,28510384..28510494
,28510603..28510699,28511233..28511309,28511724..28511789,28512016..28512168
,28512977..28513032,28513111..28513171,28513243..28513353,28513598..28513732
,28513805..28514035,28514589..28514663,28514749..28514870,28514969..28515041
,28515126..28515230,28515316..28515483,28515667..28515736,28515812..28515963
,28516162..28516239,28516332..28516424,28516549..28516686,28516825..28516864
,28516938..28517011,28517365..28517499,28517933..28518052,28518366..28518527

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:28508358..28518527 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:28508358..28518527 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCTCCACGGAAGCGGACGGGGGCGGCGGCGGGGGCAGCTTCGAAGAAGCCGCCGGCCTCGCAGCCGTCGCAGCCGGCCAAGTTCGGTATTCTCCACTTCTTCGAGCGCCAGTCCCAGGCCTCCTCCCAGAACGCCAAGCGCCAGAAGGCCGACGGCCCCTCGCAGCCTCCCGCGCCGCCGCCGCCGCTCATCGAGGAGGAGCCATCGGAGGTGTCGCCGGAGGTCACCAAGACTCTGGCGCCGAAGCGGGTCAGGTTTTCTCCTGGGATGCTGATTAAGCAGAGCCAGGACGATGGGGGTGGGGAGGTTGTGACTTGGAAGATCTCGCCGGTGAATGATCGCCTGCGCATGGTCACTTCAAGGCAGATGACTGGTATGGCGCTTCATCCGTGCTCAAACAATGAGAAGCATTCCTCGGTCGAGTCTACAAAGAAATGGCATTCATCACTGCTGGGCATGTCAAGATGTACTGCTTCAGCACGCAATTTGGATATGTGTGGAACTGGTCCAGGTGGCTGTGACGGTGTGGAGGACACCCAAAGCCCATTTCGGACTCCTCCATCACTGTCCTATAGGTGCAGTGAGCAGCAGCTTAATGGGGGTGTGGTTTCTGATGGAGGACCTGAGCAGTTGGGGGCAGGGGAGCACAAAAAGGCACTACTTGATCTTTTAGATCAAGTGGAAGATGCAATCATGGAAGAAGAATTACCTGCTGATGGTGAGAATAAAGGAGAGCAGCTCATAAATGGTGATCCGAAAAACATTAGTTGTTCTCCTATTGCTGACAGCGATCAAAATGTACCCTCCCAGAAGTCCCTTGATGCCCCGCCCTTCGATAGCTTTTTGGTGTTGGAGGTGTCAGAAAAGCACAAAGGCGATAACTTACCATGTGATCGCTATCCTGTTAAGGTTTTACGTTTGCTGAATGAGCACGGTGGGAAAGAGCATGCAGTCCATTTGTGTGATGAGTGGTTCCATAGCCTTATTAGCCCAGGCGACACAGTAAGTGTCATTGGAGAATTCACTGACCAAGGAATATGTATTATTGATCATGACAAAAATCTTGTTATAGTGCATCCAGAATTACTCATATCTGGAACACGGGTTGCTTCTAGTTTTCATTGTCCAAGAAGGTCTGTTCTCGATGACAGACTAAAAAGCAATGAATATTCAACAAGTGCTTTGATTGGTACTCTGCTGCATCAAGTATTCCAGGCAGGGCTACTTGAAGATGTTCCTTCAACGCAATTCTTAGAGCAGCAAGCCAAAGAAGTTCTTTTGAAAAATATTGAGAGTTTATATGCATGTGGAGCCAGTGAAAGCAACACGCTTAAAACGCTGATTGAAGCAGTCCCCAAAATATTGAATTGGTACAAGTGCTTTATGAAGGTATCAAAATGTAACAATGTAAATTTTGGTCAAATTGAAGGACAAAAGACTGTTGGAGTTGTGGAGGTAATGGATATTGAGGAGATGGCCTGGGCTCCAAGATATGGTTTGAAAGGGATTATTGATGCTTCTATTAGATCAAGGGTTTCATGCAATGGTAGTTCATACGACAGAGTAATGCCTCTGGAGTTCAAAACTGGTAAAGGAACTAGTGGTCAGACAGCTGTGGAACACACTGCCCAAGTGATATTGTACACGCTATTGATGACGGAGAGATACTTGAACAAGGATATTGACTTGGGTCTTCTGTATTATCTTCACACAGACCAAACATTGGGCATCAAAGTCAAGAGGTCTGATTTAATTGGATTAATAATGCGTCGGAACGAGCTTGCCACTGAGATCCTGAAGGCATCGATTTCACAGAGTTTTCCCCCGATGATACAGGCGCATGGAGGCAATGCTGCAACTAGTGGGCTTGGTGATTTATTTGATAATCTCGTGAATCACTTGACAGTTGCACATCATACCTTTCTTAAACACTGGGACAGATTGATCGATCTTGAAGCTAGAGTTTCTCAGGTCAAGAAGAAGGAAATTTTCCAGCCACATCATTCAAATACTGGGAGCAGGCATTCTTCCCCATCTTATTTTGTCCTTGATGTTACAAATGGACATTCAATAGATTCATCTGGAAAAAGCAAAAGATACATATATACTTTTCTGCGCCAGAAGTTGCAGCCTGAGACAGCTGATCAGCCAGGAGAACATGTTGAAAGTGTAGATTTTAGCCTCAAATGCGGTGATTCTGTGGTGCTTAGCACAAAATCTGGGCGAATAGCTGTTGCAAATGGATACATAAGGGACCTCAGCCGTGCCCATATAACGGTTTCATTGCCACGACGTCTGAGACTTCCAGGAAGTAATTCCTTGTTAGAGCAAGGAGATCTCCAATGTGAAGTTTGGCGTATAGATAAGGATGAGTCTGTTTCTTCATTTGCTACCATGAGACTCAACCTTGTCCAACTATTTGCTGAGAATCCACAAAACTCTCACCTAAGGAAGTTGATTGTTGACCTCGAGGCTCCCAGATTTGATAGTGGAGGACTCCTAAGTCAAGATCCGGCACTATCATATATACAATCATTGCCAAATTTGAACAATGACCAACAGAGATCGCTGCATAAAATTCTAGCAGCAAAAGATTATGCGCTTATCCTAGGAATGCCTGGAACAGGCAAAACATATACGATGGTGCATGCCGTGAAGTCATTATTGATGAGAGGGGAATCTATTTTGCTAACCTCATATACCAATTCAGCTATAGATAATTTGCTTATGAAGTTGAAGGCTGAGGGTGTAGATTTTCTTCGAATTGGAAGGCATGAAGCTGTACATCCTGATGTCAAAGGCCACTGCTTGTCAACAACAGATATACAATCAGTAGATGCCGTCAAAGCTAGAATGGAGCAAGTGCAAGTTGTTGGAGTCACTTGTTTGGGAATTTATCACCCTTTACTAGCACATAAGAAGTTCGACACATGTATCATGGATGAGGCAGGCCAGATCACATTACCGGTATCTCTGGGACCTTTGATGCTTGCAACAAAGTTTGTTCTAGTAGGAGATCATTATCAGCTTCCTCCACTTGTTCAGAGTTCTGAAGCTCGAGAGAATGGTATGGGTGTCAGTTTATTTTGGAGGTTGTCAGAAGCACACCCTCAAGCAATTTCAGCATTGCGATGCCAGTACCGAATGTCATCTGGCATTATGGAGCTCTCAAATTCATTGATTTACGGCAATAGGTTATCCTGTGGTTCGTTGGAAATTGCAAATGCCAAACTCAAGCTTTCTGGCAGAGGTCCTGTTCGCTTGAAGCTGAAAGAGATCTTGAACCCTGATAGGGCTGTCGTCTTTGCGAACACAGATGAAGTACCAGCTTTTGAGGCCAAGGAACATAGAACTGTGAACAATCCTACAGAAGCATTAATTGTTTCATGGATCACCAATGAATTGCTAAAGAGAGGTGTAGCTCAAGATGGGGTTGGTATAATAACTCCATATAATGCCCAAGCAAATCTCATTCAGCAACATGTAGACGCTTCAGTTGAGGTTCATACAATTGACAAGTACCAGGGGAGGGATAAAGAATGCATTATAGTATCTTTTGTACGGTCCAATGGGAATTCAAGGGCTAGTGGTTCTTCTTTGCTTGGTGATTGGCACAGGATCAACGTTGTCTTGACACGTGCAAAGAAGAAGCTCATCATGGTGGGATCCGCTGCAACTCTTTCAACGATCCCATTGTTGAGACTTATGATTGAGAAGGTAGCTGAGCGTGGCGGTCAGTTAGATCTGACAAATAAGGATGTACAGTCAATTCGAGAGCTAACAAGCTCTCGATTGAATGTACAATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAPRKRTGAAAGAASKKPPASQPSQPAKFGILHFFERQSQASSQNAKRQKADGPSQPPAPPPPLIEEEPSEVSPEVTKTLAPKRVRFSPGMLIKQSQDDGGGEVVTWKISPVNDRLRMVTSRQMTGMALHPCSNNEKHSSVESTKKWHSSLLGMSRCTASARNLDMCGTGPGGCDGVEDTQSPFRTPPSLSYRCSEQQLNGGVVSDGGPEQLGAGEHKKALLDLLDQVEDAIMEEELPADGENKGEQLINGDPKNISCSPIADSDQNVPSQKSLDAPPFDSFLVLEVSEKHKGDNLPCDRYPVKVLRLLNEHGGKEHAVHLCDEWFHSLISPGDTVSVIGEFTDQGICIIDHDKNLVIVHPELLISGTRVASSFHCPRRSVLDDRLKSNEYSTSALIGTLLHQVFQAGLLEDVPSTQFLEQQAKEVLLKNIESLYACGASESNTLKTLIEAVPKILNWYKCFMKVSKCNNVNFGQIEGQKTVGVVEVMDIEEMAWAPRYGLKGIIDASIRSRVSCNGSSYDRVMPLEFKTGKGTSGQTAVEHTAQVILYTLLMTERYLNKDIDLGLLYYLHTDQTLGIKVKRSDLIGLIMRRNELATEILKASISQSFPPMIQAHGGNAATSGLGDLFDNLVNHLTVAHHTFLKHWDRLIDLEARVSQVKKKEIFQPHHSNTGSRHSSPSYFVLDVTNGHSIDSSGKSKRYIYTFLRQKLQPETADQPGEHVESVDFSLKCGDSVVLSTKSGRIAVANGYIRDLSRAHITVSLPRRLRLPGSNSLLEQGDLQCEVWRIDKDESVSSFATMRLNLVQLFAENPQNSHLRKLIVDLEAPRFDSGGLLSQDPALSYIQSLPNLNNDQQRSLHKILAAKDYALILGMPGTGKTYTMVHAVKSLLMRGESILLTSYTNSAIDNLLMKLKAEGVDFLRIGRHEAVHPDVKGHCLSTTDIQSVDAVKARMEQVQVVGVTCLGIYHPLLAHKKFDTCIMDEAGQITLPVSLGPLMLATKFVLVGDHYQLPPLVQSSEARENGMGVSLFWRLSEAHPQAISALRCQYRMSSGIMELSNSLIYGNRLSCGSLEIANAKLKLSGRGPVRLKLKEILNPDRAVVFANTDEVPAFEAKEHRTVNNPTEALIVSWITNELLKRGVAQDGVGIITPYNAQANLIQQHVDASVEVHTIDKYQGRDKECIIVSFVRSNGNSRASGSSLLGDWHRINVVLTRAKKKLIMVGSAATLSTIPLLRLMIEKVAERGGQLDLTNKDVQSIRELTSSRLNVQ</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..273#371..505#671..850#941..1009#1126..1326#1425..1478#1563..1624#1726..1858#2027..2137#2246..2342#2876..2952#3367..3432#3659..3811#4620..4675#4754..4814#4886..4996#5241..5375#5448..5678#6232..6306#6392..6513#6612..6684#6769..6873#6959..7126#7310..7379#7455..7606#7805..7882#7975..8067#8192..8329#8468..8507#8581..8654#9008..9142#9576..9695#10009..10170#ATGGCTCCACGGAAGCGGACGGGGGCGGCGGCGGGGGCAGCTTCGAAGAAGCCGCCGGCCTCGCAGCCGTCGCAGCCGGCCAAGTTCGGTATTCTCCACTTCTTCGAGCGCCAGTCCCAGGCCTCCTCCCAGAACGCCAAGCGCCAGAAGGCCGACGGCCCCTCGCAGCCTCCCGCGCCGCCGCCGCCGCTCATCGAGGAGGAGCCATCGGAGGTGTCGCCGGAGGTCACCAAGACTCTGGCGCCGAAGCGGGTCAGGTTTTCTCCTGGGATGGTAAGTATTGGTCTTGCGCTTGGTCCGATTTGGAATGCATTAGTTGGCGTTTGGATCGACTCTTAGGTTTGGTGGTTTCTTGTTTGGTGCGGTCCAGCTGATTAAGCAGAGCCAGGACGATGGGGGTGGGGAGGTTGTGACTTGGAAGATCTCGCCGGTGAATGATCGCCTGCGCATGGTCACTTCAAGGCAGATGACTGGTATGGCGCTTCATCCGTGCTCAAACAATGAGGTATATACTGGAGTTTCTTTATGTTCTTGCGAGGTATATACCGGCGTGCAATGCACGTATGTATGTGCATTGGAGCCGGTGGAGACACAACACTTTCTTGTGTGATGAAATTAATCGTTTTTTGTGGCTTTCTGGTTTGCTATTCGATATGTAATTGTATTCTAGAAGCATTCCTCGGTCGAGTCTACAAAGAAATGGCATTCATCACTGCTGGGCATGTCAAGATGTACTGCTTCAGCACGCAATTTGGATATGTGTGGAACTGGTCCAGGTGGCTGTGACGGTGTGGAGGACACCCAAAGCCCATTTCGGACTCCTCCATCACTGTCCTATAGGTGCAGTGAGGTACATACAGTTATACGATGAATTGTTGTGTGAATGCTAGCTAATGTAGTTCCAAATCGTGTTGATGGAGTAATGGTTTTGTGCATGAAGCAGCAGCTTAATGGGGGTGTGGTTTCTGATGGAGGACCTGAGCAGTTGGGGGCAGGGGAGCACAAAAAGGTGAACTAAGATAACACTAAATGTCCTGGGTGCCATTGGTTTCATGATATTATTACATGTAAGAACTAAGTTGCCAAAGAATTGATCGACAAAACTATGCCATTTCTTTTTACCAGGCACTACTTGATCTTTTAGATCAAGTGGAAGATGCAATCATGGAAGAAGAATTACCTGCTGATGGTGAGAATAAAGGAGAGCAGCTCATAAATGGTGATCCGAAAAACATTAGTTGTTCTCCTATTGCTGACAGCGATCAAAATGTACCCTCCCAGAAGTCCCTTGATGCCCCGCCCTTCGATAGCTTTTTGGTGTTGGAGGTTTGCTTTCTTTACCTCCATGGGTTGGTTTCTATCGAAGTTGGAGCTGCTCTAGACTTCTAGTACAATAGAGATTTATGTGTTTAATTACTTTTCAGGTGTCAGAAAAGCACAAAGGCGATAACTTACCATGTGATCGCTATCCTGTTAAGGTATATATCCTCTTTACCTATCTGGATGAGCTAGTTTGCAATTAAATTTTTGTTATTTTGCAAAGTTGCTAACTGTTTTGACAGGTTTTACGTTTGCTGAATGAGCACGGTGGGAAAGAGCATGCAGTCCATTTGTGTGATGAGTGGTGAGTTCCTATATGCAACTATTGAAATGATTCCATTTTTATTTTCTATATACATATGAACCTTCATCAATCTATTGCCTATATATTTCAAACCACTACAGGTTCCATAGCCTTATTAGCCCAGGCGACACAGTAAGTGTCATTGGAGAATTCACTGACCAAGGAATATGTATTATTGATCATGACAAAAATCTTGTTATAGTGCATCCAGAATTACTCATATCTGGAACACGGGTTAGTATTAGCCTCCCCCCATCTCTTTATTATAACCTTTGTAGTCAATATCCCAGATCAATATGAACAAGCTGCTATGATATCCTCAAATATTATTTTATAAGAACTGTTTGTAAAAATACATTCATCTTATCTTGTCATCATATTTTGATATATAGCTTATTTTAGGTTGCTTCTAGTTTTCATTGTCCAAGAAGGTCTGTTCTCGATGACAGACTAAAAAGCAATGAATATTCAACAAGTGCTTTGATTGGTACTCTGCTGCATCAAGTATTCCAGGTTCGTTGGTGCAAGAAAAATTGGCAGCTCTGGTTAATACATCATGCACTTTATCTTCATGTAACAGTTGTGTGTGCCTCACTTTGTTTCTTTCCTCTTGTGCCTCAGGCAGGGCTACTTGAAGATGTTCCTTCAACGCAATTCTTAGAGCAGCAAGCCAAAGAAGTTCTTTTGAAAAATATTGAGAGTTTATATGCATGTGGAGGTAAGATTCGTGACAACATTTTTAATCCATAAAAAACACACTACACAAAAGTATGACACTATGACATGGACTGTTCATGACTTATTATGTTATACTGAGTGCCCTGACCAATAATGTTTTTCTTACTCTATTCTTAGAGCACCGATTCAGTAAGGCTATAGTTATCAGTAAATTATCATGTGCTACTAAATTTTTTGTGAAACTTTATATTTAATTTTTGAATGTTGTTTTGACTAATTTGATCCAATTTTCTGTGCTATATCCTTCCTATTATTTTTATATGTTTACACAAGGAACATGGAATGTCATTCCAAAAGTTCTGCAAATCTGTTGTGTTTGTTCTGAAATATCAACATACATTGTGGTTGTTCTCATACATCCTCATTTACTCAAGTCATATTGGTATATGTCATGTTTGATTACAGTACTGTATTGTAGCTCAGCTTCTTTATTGATATTTATAACATTACACAAACTATCTTATATCCCCAGCCATGTGCATATCTTACTGGTTTTGACATTTTTCTATGCAGCCAGTGAAAGCAACACGCTTAAAACGCTGATTGAAGCAGTCCCCAAAATATTGAATTGGTACAAGTGCTTTATGAAGGTGGAGTAGATGACTTGCACAGCAGTTTTTTATATTCACTGTTGGGGCTCCTTAAATGACCACAAGAATTTTCGAAGTCCATAGAGTTGCACCATGGTCATGAATACTCCACTTATTTTTGTTGAATTGGAACCTGTTGTTATACCCATATGGCACTCTTCTATTTCTTTTCAGAGGTTCTAGGCAATGATTAATCACTCGATTGAGCCATTTTGTTTTTAATTGCTAATATATGCCATTTCTATTACGGAGTATAATTTTTTAAGAGAAAGTTTTGATCTAGTCTTTCCTTTATCAATCCTGGACTAACTTGCCTGCAAAGTTCACCGGTGGATATATTGCATGTCTTGTCCTTTACTTGTTTAAAGAAGATACTGTTACATGTTCTGCGCTAATCATCGTCGGCACATCCAGGTATCAAAATGTAACAATGTAAATTTTGGTCAAATTGAAGGACAAAAGACTGTTGGAGTTGTGGAGGTAGGCAACATCTTGAGCTTGCAAAACTTTGGAATATGACCTTTTCATATTACGTAACTTATATGTAATATCAAGCGAGTTCGTTTCATGATGGTAAACTCCTGTAGTCCTTGTGATTCTCAGCCATCAAAATTAGGCCAACACAGAACTTTCACTCTCCCCATGTCCTTGTGTTGACTTGCACACCTCATTCTTAATGGCTTTATTGAAATGAATTTCACCTTAGGTAATGGATATTGAGGAGATGGCCTGGGCTCCAAGATATGGTTTGAAAGGGATTATTGATGCTTCTATTAGATCAAGGGTTTCATGCAATGGTAGTTCATACGACAGAGTAATGCCTCTGGAGTTCAAAACTGGTAAAGGAACTAGTGGTCAGGTAAGCATATGCTCCTGGATAGTGGATCCACTTGAAGATATATTATATCTTTTTCTGGCATGAGATATTTTTGTCACCGGGGTTCTGGAAACTATTTATGTAATAAATTAGTGAAGTATTGCAACAACCAGGCTTCTTGAAAGATTGTGCTGATTCCATAATCCATATTAATTCTTACAAGTAGTCATGCTCTCAATTTTTTAATCAAAACCTGACGAGTTCATTGAGTTTTATATTGCACAGGCCAGAACTGTTGTTTTCTGTCTGTTTTCCATAATGTAATTACTGGTTGCTTACTTGAATTAGATTCCCTGCTCTATTTTATCCAAAACTTTAAGCTTTAGTTACAATTGACTAGAAACCTGTCAACCACCTAGTCATGTCCATTCTGTGGCAACAACCAATCAATAATAATGTCCTACAACAACTAATCGTATCTTAAAAAAACCCAATCATAGTTCACTACAAAATAATAATTAATCAATAATCCGGAGCCTCAGTTCCATTCTACTTTCACAAGGTCAACACCCTTCAGTAGTTTTGATAATTAATACATGTCACATGTAGCGGCATCCAAATATATATTTTGATACCTTTTTTGAAATGTGATTGTGACTATTAGTGTTATCTTTACTTTATGTCCATTTCTGAAAAGAATATTGTGTTATTTTTGTGGTGTTTCACATACTGTGTAGCACTCTAGTGTCTCCTATTTACCTAACCATGTCTGAAAAAACAACAATTTAGTCCTTCAGAATAGATCCAGTTACTTCTCTATTGCCCTTCACAATGGTTTATATATTTCCAGACAGCTGTGGA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA017006