BGIOSGA017105
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA017105 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017105, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1112_E08.119 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA017105-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA017105-PA |
| Length |
10467 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:30004775..30015241 |
| Sequence Coding Region |
30004775..30004889,30005033..30005226,30006232..30006353,30006433..30006491,30006806..30006834 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:30004775..30015241 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:30004775..30015241 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGGCGCCGCGGGAGGGTTCGTCACGCGGGCCTTCGAGGCCATGCTCAAGGAGTGCACAGCCAACCGCGGCAAGTTCGCCGCGCTGCAGCAATCCATCCAGTCCTACCTCGATGCCATCAAGGGGGCGGCGGCGGCGGGACAGGAGGAGGGCGGCGACGCGGCGGCGGCGCCCATCACGCAGGTGCTGGCGTCGGCGGGGCGCGTGCTGGAGGGGACTCAGGCCGAGCTGGTGCTGCAGCCGCTCCGCCTCGCCTTCGAGACCAAGCACGTCAAGCTCGTCGAGCCCGCGCTCGACTGCCTCCATAAACTTATTGCTTATGACCATCTAGAAGGCGACCCTGGTTTAGAGGGTGGTAAAAATTCCCCTCTATTTACTGACATCCTGAACATGGTCTGCGGTTGTGTTGATAACACCTCCTCTGACAGCACTGTTCTCCAAGTCTTGAAAGTGCTTCTCAATGCTGTTGCTTCAAATAGATTTAGAGAAATTGCAGTTGTCTTTTACAAAAATCCTGTTTCTGTACCACCTGCCAGCTCTGCAATGAAAGAAGAACCATCATCTAGCACAGAGGAATCAGAGAATGGTGAAGTATCCACTGGTAACCAAGCTGATGAAAAAATTACTCTTGGAGATGCGCTATCCTTGAATCGAGCTACAGAAGCATCTCCAGCATCTGTTGAAGAGCTTCAGAGTCTTGCAGGAGGAGCTGATATTAAGGGGTTGGAGGCTGTTCTTGACAAGGCTGTTGAACTTGAGGATGGAAAGAAAGTATCAGGTGGAATAGACCTGGACACTGTGAACATAATACAGCGTGATGCACTATTGCTCTTCCGGACTCTCTGCAAGATGAGCATGAAGGAAGAGAGTGATGAGGTTGCTACAAAGACAAGGCTGCTATCACTCGAACTGTTACAGGGATTGCTAGAAGGAGTCGGTGATTCATTTACCAAAAATTTCCACTTCATCGATTCAGTTAAAGCCTATCTTTCCTATGCTATTCTGCGAGCGGCTGTGTCTTCATCTGCGGTTGTTTTTCAGTACGCTTGTGGGATATTTGCAGTTCTATTGCTTCGTTTTCGAGAGAGTCTGAAGGGTGAGATCGGTGTCTTCTTTCCTCTGATAGTTTTAAGGTCTCTCGATAGCTCTGACAGTCCACTCAGCCAAAGGGCCAGTGTCCTTAGGATGCTGGAGAAAGTCTGCAAGGATTCACAAATGCTTGCAGACATGTTTGTAAATTATGATTGTGACCTTGAGGGGCCAAACCTTTTTGAACGCATGGTCAGTGCACTCTCAAGGATTGCACAAGGATCTCAAAATGCGGATACAAACACTGCCGCATCTTCTCAAACAGTTTCTGTGAAAGGCTCATCTCTTCAGTGTTTGGTGAGTATTTTGAAGTCATTGGTTGATTGGGAGCAAGCTCGAAGAGATTCCTTGAAACAGGGGAGTGTTGCCGAAGCTTGTGAAAATGATTCTTCTGCAAGGAGCATAACAAGTGATGAAATAAAGAGCCAAGAGGATGGTCGCAATCAGTTTGAGATAGCTAAAGCTCATAAGTCAACAATGGAGGCTGCAATCTCAGAGTTCAATCGCAAACCAGCAAGGGGGATTGAGTATTTGTTATTAAATAAGTTGATCGAAAATAATGCAACATCTGTAGCTCACTTTCTCAAGAGCAATTCTAGCTTGGATAAGGCTATGATTGGTGAATATTTGGGACAACATGAGGAGTTCCCTCTTGCTGTGATGCATGCTTATGTTGATTCAATGAAATTTTCGGGATTGAAGTTTGATGCTGCAATTCGTGAGTTCTTGAAAGGGTTTCGCCTTCCTGGGGAGGCACAAAAGATTGATCGCATAATGGAAAAGTTTGCTGAGCGGTACTGTGCTGATAACCCTGGACTTTTCAAAAATGCAGATACTGCTTATGTTCTTGCTTATGCTGTTATAATGTTGAATACTGACGCCCACAACCCAATGGTGTGGCCTAAAATGTCAAAATCAGATTTCGTACGAATGAACACTGCGAGTGATGCAGAGGAATGTGCCCCAAAGGAGCTCTTGGAGGAAATTTATGATTCCATTGTCCAGGAAGAGATAAAGATGAAAGACGATTTCCCTGATTCAGCAAAAACTAATAAACCCAGACGAGAAACAGAAGAAAGGGGTGTTGTCAATATCCTCAATTTAGCTCTTCCAAGACTGAAGTCAGCAAGTGATACCAAAGCAGAAAGTGAGAAAATCATTAAGCAGACTCAAGCACTTTTCAAAAATCAGGGACAGAAGAGAGGTGTTTTTCATGTTGCTCAGCAGGTCGAGCTTGTTAGGCCAATGCTTGAAGCTGTAGGATGGCCTTTGCTTGCAACATTTTCTGTTACCATGGAGGAAGGTGACAGCAAGCCTAGGGTTGTGCTATGCATGGAAGGGTTTAGGGCTGGCATCCATCTTACTCGTGTTCTTGGGATGGACACCATGCGCTATGCTTTCTTGACATCCTTAGTGCGGTTTACATTTTTGCATGCTCCTAAGGAAATGCGTAGTAAAAATGTTGAGGCTTTACGGACCCTCCTTGGCTTAGCTGACACAGATATGGATGCTTTGCAAGATACTTGGAATGCTGTTTTAGAATGTGTCTCCAGGCTTGAATATATCACTTCAAATCCTTCAATTGCTGCAACTGTTATGCAGGGATCAAATCAAATATCGAGAGAATCTGTTGTCCAGTCACTGAAAGAGTTGTCTGGGAAGCCTGCTGAACAAGTCTTTGTAAACAGTGTAAAACTACCAAGTGATTCCATTGTTGAATTCTTCACTGCTCTTTGTGGTGTTTCTGCAGAAGAACTGAAACAGACACCTGCTCGTGTCTTTAGCTTACAAAAGCTTGTCGAGATAAGCTACTATAATATGGCTCGGATACGTTTGGTGTGGGCGAGAATATGGTCTGTCTTGTCACAGCATTTTATTGCCGCTGGGAGCCACCACGAGGAGAAAGTTGCCATGTATGCAATTGACTCATTGAGGCAGCTTGGTATGAAGTACTTGGAACGTGCAGAATTGAACAAATTCACATTTCAGAATGACATATTGAAGCCTTTTGTTATTTTAATGAGAAATAGTCACAGTGAAAAAATCCGTGGTCTAATTGTTGATTGCATTGTTCAGTTGATCAAATCAAAAGTTGGCAGCATAAAGTCAGGTTGGCGTTGTGTGTTCATGATATTCACCGCGGCAGCTGATGATGAGAATGAACATATTGTTGAAAGTGCTTTTGAAAATGTAGAACAAGTTATCTTGGAGCATTTTGATCAAGTTGTTGGTGATTGCTTCATGGACTGCGTCAACTGTCTTATTGGTTTCGCAAATAATAAATGCACACCTCGAATTAGTTTAAAGGCTATCGCTCTCCTACGCATATGTGAAGACCGTTTGGCAGAGGGTTGCATTCCTGGTGGTGCTGTTAAACCTGTTGATGATGTTCCAGAGGCCCATTTTGATGTTACTGAGCATTATTGGTTTCCTATGCTAGCTGGCCTATCAGATTTAACTTTAGACCCCAGACCAGAAGTTAGACACTGTGCACTTGAAGTGTTGTTTGATCTTCTGAATGAGAGAGGTCATAAATTCTCCTCACCTTTTTGGGAGAGCATTTTTCATCGTGTACTATTTCCCATATTTGATCATGTAAGGCATGCTGGAAGGGATGGCCTTTCTTCTGGGGATGACTGGCTTCGTGATACCAGCATTCATTCTCTGCAGTTAATCTGCAACCTTTTCAATACTTTCTACAAGGAGGTGTCATTTATGCTTCCACCTCTTTTGGGCTTGCTGCTTGAGTGTGCCAAGAAAACAGACCAGACTGTTGTTTCAATTGCTCTTGGAGCTTTAGTTCATCTCATAGAGGTTGGTGGTCACCAATTCAGTGACAGCGACTGGGAAACACTTCTAAAGAGCATTAGAGATGCATCATACACAACCCAACCTCTCGAACTCCTCAATTCAGTAGGATTTCAGAAACCAAACAATCAGCAATCACTTTCAAGAGAAGCAGAGACCAACGGTCTTGGTAGTAGTTACCATGATAGCAGGGAAGGAGGAGCTTCAATAAGTCATATTGATGAACAGGATGGTCATCAGGAAACAAATGCACAGACTAGCCTAGACAATTCAGAAGGTTTGCCATCTCCATCAGGGAGAGCACAACCTGCAGTTTCCCCACGGGGTCAGACCTTTGGACAAAGAATTATGGGGAATATGATGGACAATCTTTTGGTCAGGAGTCTTACTTCCAAATCAAAAGGTCGTACAGACGATATTGTGCCACCCTCACCTGTGAAGGCACCTGATGCTGACGGGGCTGACAAAACTGACGATGAAGAGAATCCTATGATGGAGACTGTTAGGAGTAAATGTATCACTCAATTACTGCTACTTGGGGCCATTGACAGCATACAGAAGAGGTACTGGAGCAGGCTAAAAACCACACAGCAGACTGCAATAATGGATATTTTGCTATCACTCCTAGAATTTGCTTCTTCCTATAACTCAACTTCAAATCTTCGAACCAGGATGCACCATATACCCCCAGAAAGGCCTCCACTGAATCTTCTTCGCCAGGAACTAGCTGGAACTGCTATCTATTTGGAGATTCTTCAGAAATCAACTGTGGAACATGATGGGAATGACCCAAGTGAGGATACAAATGGGCACGTCATAGAATCTGATGAACATGAAAAGCTCAAGAGCCTCGCAGAAGGGAAGCTTGTTTCGTTTTGTGGGCAGATCTTGAAAGATGCTTCTGATCTCCAGCCAAGCACTGGGGAAGCTGCAAGTGCAGACATACACCGTGTACTGGACCTAAGAGCACCAGTTATTGTCAAGGTTTTGAATGGAATGTGTATCATGGACGCTCAGATATTCAAGAAGCACATCAGAGAGTTCTATCCATTAATTACAAAACTTATCTGCTGTGATCAGATGGATGTTCGTGGTGCCCTTGGTGACCTTTTCAGCAAACAACTTACCCCACTCATGCCCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGAAGGFVTRAFEAMLKECTANRGKFAALQQSIQSYLDAIKGAAAAGQEEGGDAAAAPITQVLASAGRVLEGTQAELVLQPLRLAFETKHVKLVEPALDCLHKLIAYDHLEGDPGLEGGKNSPLFTDILNMVCGCVDNTSSDSTVLQVLKVLLNAVASNRFREIAVVFYKNPVSVPPASSAMKEEPSSSTEESENGEVSTGNQADEKITLGDALSLNRATEASPASVEELQSLAGGADIKGLEAVLDKAVELEDGKKVSGGIDLDTVNIIQRDALLLFRTLCKMSMKEESDEVATKTRLLSLELLQGLLEGVGDSFTKNFHFIDSVKAYLSYAILRAAVSSSAVVFQYACGIFAVLLLRFRESLKGEIGVFFPLIVLRSLDSSDSPLSQRASVLRMLEKVCKDSQMLADMFVNYDCDLEGPNLFERMVSALSRIAQGSQNADTNTAASSQTVSVKGSSLQCLVSILKSLVDWEQARRDSLKQGSVAEACENDSSARSITSDEIKSQEDGRNQFEIAKAHKSTMEAAISEFNRKPARGIEYLLLNKLIENNATSVAHFLKSNSSLDKAMIGEYLGQHEEFPLAVMHAYVDSMKFSGLKFDAAIREFLKGFRLPGEAQKIDRIMEKFAERYCADNPGLFKNADTAYVLAYAVIMLNTDAHNPMVWPKMSKSDFVRMNTASDAEECAPKELLEEIYDSIVQEEIKMKDDFPDSAKTNKPRRETEERGVVNILNLALPRLKSASDTKAESEKIIKQTQALFKNQGQKRGVFHVAQQVELVRPMLEAVGWPLLATFSVTMEEGDSKPRVVLCMEGFRAGIHLTRVLGMDTMRYAFLTSLVRFTFLHAPKEMRSKNVEALRTLLGLADTDMDALQDTWNAVLECVSRLEYITSNPSIAATVMQGSNQISRESVVQSLKELSGKPAEQVFVNSVKLPSDSIVEFFTALCGVSAEELKQTPARVFSLQKLVEISYYNMARIRLVWARIWSVLSQHFIAAGSHHEEKVAMYAIDSLRQLGMKYLERAELNKFTFQNDILKPFVILMRNSHSEKIRGLIVDCIVQLIKSKVGSIKSGWRCVFMIFTAAADDENEHIVESAFENVEQVILEHFDQVVGDCFMDCVNCLIGFANNKCTPRISLKAIALLRICEDRLAEGCIPGGAVKPVDDVPEAHFDVTEHYWFPMLAGLSDLTLDPRPEVRHCALEVLFDLLNERGHKFSSPFWESIFHRVLFPIFDHVRHAGRDGLSSGDDWLRDTSIHSLQLICNLFNTFYKEVSFMLPPLLGLLLECAKKTDQTVVSIALGALVHLIEVGGHQFSDSDWETLLKSIRDASYTTQPLELLNSVGFQKPNNQQSLSREAETNGLGSSYHDSREGGASISHIDEQDGHQETNAQTSLDNSEGLPSPSGRAQPAVSPRGQTFGQRIMGNMMDNLLVRSLTSKSKGRTDDIVPPSPVKAPDADGADKTDDEENPMMETVRSKCITQLLLLGAIDSIQKRYWSRLKTTQQTAIMDILLSLLEFASSYNSTSNLRTRMHHIPPERPPLNLLRQELAGTAIYLEILQKSTVEHDGNDPSEDTNGHVIESDEHEKLKSLAEGKLVSFCGQILKDASDLQPSTGEAASADIHRVLDLRAPVIVKVLNGMCIMDAQIFKKHIREFYPLITKLICCDQMDVRGALGDLFSKQLTPLMP</aaseq> |
| Gene Sequence |
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