BGIOSGA017906
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA017906 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017906, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_20246 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA017906-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA017906-PA |
| Length |
7834 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:24117146..24124979 |
| Sequence Coding Region |
24124923..24124979,24123592..24124410,24122823..24123020,24122586..24122747,24122181..24122279 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:24117146..24124979 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:24117146..24124979 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGAGCCACGGCGCCGGGGTGGTGGCTGCTGGATCCGATGCCGCTCCTGCCGAGGTCAGCATTGTGGGGCAGACAAATCCATCTACTTATCCACCTTTAGCTTTAGGGCATCATTCATGGTCCTCTTCAACTGGGGCAGCTACAGTCCCGTGGAGCTATCCAGTGAACAATCAAAGCCAAGATACAGTTTACTATGATCCACAAAGGGATGTTTCGGTTTCGGGAGACAATCAGAGCGTGGCAAGCAGTGCACCTCATAATGCTCAGCCAACTATGGGCACAGAAAATGCGACTCATTCTCACATGCCTTACTCAAGTTCACTTCAACATGGGTACACTGCTGCAGAATATGCAAACTATTATTATAGCTACCCACAAACTACAAATGGTTCTTCTGTCCAGCAAGGAGGAACAAATCAACATTCAGGTGCAGCTCATCAGCCTCTTACTTCATTTCAGAATTCAGAGTCTTACGTTGGTCCCACAAGTAACACATATTACAATGCTGGTGGTCATCAGACTGCTCCAGGATATGGAACTAGCAATAGCTATTATCAGAACAGCACATGGAATGGTGGAAGCTTTGAAAATAATTATGCTCAGTCATATCAGAACTACCCGTCATCCAATACCAACACAGTACAGCATTCCATTTCAGTGCCTACCAATTCTTTCTCATACCAACAGCAGTACAACCAATGGCCATACTATTACAATCACACCGTGCCAAATCCTGCTGGTGATCCAGTCGGGAACAGTAACTCAATTGTTAACACTACTTCTAGCTACTCCTATCCCAGTATCCAGCCACCTCCTCCAGGAACTACATCATGGAAAAGTAATTCAAGTTCTTCTATTGCGCCTCCTATTCAGGCTTCAGGTGGTCCAGGGCCTCAAGATCAATATATCAACCAGGCGCACGCTCCGGTGTTGGAAAACCAGTATGCTGGCCAGGTAGCAGGTAACCCAAGGTCTCAAAACCATTATGCCAGCCAGACACCAGCCTGCCCACAGAGCACTGTGAATTTGAACCCCGTTCAGCAAAGCAATCATGGCGATCAACAAAATACTGTTTTTATTGCAACCGAAAATTCAAGTGAAAACAAAATGCAGGTTCCTCGAATTGCTCCAGGTTTTTCTATGGTAATACCAAAGAGCGAGAAGAAAATTTTAGGTGCTGATTTGTCAAAGAAGCCTGCTTATGTTAGTGTTTCCATGGTGAAGAATGATGCTAGATCACTCCCTTTTTCATTACATAATTATGCTACGAGGAATCTCAACCGTTGCAAGGATGAGGCCCAGAAGGCTGCTTGCCAGAGTATGATAGAAGAGATAAAAAACAGCGCCATTGCTGATGGAACCCTTCTTACTAAGAATTGGGACACTGAGCCACTGCTTCCTTTGGTACAAAATGTTGCAACCATTCCAGAAACAAGTGCAAACAATTCAAGTCCCTCCTTGTCAACATCTACCAATAGGAGACGCCAAAAAAGTAGGTGGGAGCCTGTTGTGGAGGAAAAGGTTACAGATAAGGTGGAACCGGTAAAAGGGTTGGTGAACGGTACCACCCACAATAATTTGGAAGCCAAAAACAGAATGAGTAATAACTGGGATTCCAGAAAATTTTTCCAGTCTCATCATGCGACTGCAAACAAAGTCAGTCAGCGGCCTGCCAAGAAGCAAAAGATCAGCAGTTACTCAGATCAAATGCAAAATGGAAATGCTTCAAGTGATAGTGATAAGGAGCAGGATCTAACCAAATATTATGCCAGTGCAACCGCACTAGCAAATTCACCTGAGGAGAAGAAGCGCAGGGAGCATAGGTCAAAGCGTTTTGAGAAGAACCAGAATTCATCATCTAAATCGAGGAATTCTGCAGCAAGTAAAGATGTAATGGCTAATATACATGCACGAAGAGCTGTTTCAGCTCTTCTTGCCAGAAGCTGTGAAGATGGCACTACCTTGGCTGTGGAGGATATGGATTGGGATGCATTGACAGTAAAGGGGACATGCCAAGAAATTGAGAAACGATATCTCCGGCTTACATCAGCACCTGATCCTGCCACAGTAAGACCGGAGCATGTCTTGGAGAAGGCCCTTTCCATGGTTGAAACATCTCAAAAGAATTATCTTTATAAATGTGATCAACTGAAGTCTATTCGCCAAGATCTCACAGTTCAGAGAATCCAGAATGAACTTACTGTCAAGGTTTATGAAACTCATGCACGTTTAGCAATGCAGGCAGGTGACCTACCTGAATATAACCAGTGCCAGTCACAACTGAAGAGGCTATATGCAGAGGGAATCAAGGGCTGTTACTTTGAATTCTCTGCGTACAATTTACTCTGTGTCATGTTGCACTCTAATAATAAACGAGACTTGCTGTCATCATTGGCAAGGTTATCGAAACAAGCCAAACAAGATGAAGCTGTCAAGCATGCCCTTGCAGTTCATTCTGCTGTTTCATCTGGAAACTATGTCCTATTTTTCAAACTATACAAGCAGGCACCGAACTTGAATTCTTGCCTCATGGATCTATATGTGGAGCGAATGCGTTTTGAGGCTGTAAAATGCATGTCTAAATCATATCGCCCGACTATACCAGTGGGATATGTTGCACAAATTTTGGGATTCTCAAGAATTGATAGTGAAGCATCAGAAGAGTGTGAAATGTGGTTAAAAGCTCATGGTGCTATTCTTTCAATAGACAACAGCAGAGACTTGCAATTAGACACGAAGGCTTCTACTACTACACTTTACATGCCAGAGCCAGAGAATGCCGTCGCACATGTACACATCGTGCCAGTTATGGAGCTCAATGAAATGGAGCAGCAGATGAAGGGCATTATGCTTCCGGAGCTTTGGAGTTGGAGCAAATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASHGAGVVAAGSDAAPAEVSIVGQTNPSTYPPLALGHHSWSSSTGAATVPWSYPVNNQSQDTVYYDPQRDVSVSGDNQSVASSAPHNAQPTMGTENATHSHMPYSSSLQHGYTAAEYANYYYSYPQTTNGSSVQQGGTNQHSGAAHQPLTSFQNSESYVGPTSNTYYNAGGHQTAPGYGTSNSYYQNSTWNGGSFENNYAQSYQNYPSSNTNTVQHSISVPTNSFSYQQQYNQWPYYYNHTVPNPAGDPVGNSNSIVNTTSSYSYPSIQPPPPGTTSWKSNSSSSIAPPIQASGGPGPQDQYINQAHAPVLENQYAGQVAGNPRSQNHYASQTPACPQSTVNLNPVQQSNHGDQQNTVFIATENSSENKMQVPRIAPGFSMVIPKSEKKILGADLSKKPAYVSVSMVKNDARSLPFSLHNYATRNLNRCKDEAQKAACQSMIEEIKNSAIADGTLLTKNWDTEPLLPLVQNVATIPETSANNSSPSLSTSTNRRRQKSRWEPVVEEKVTDKVEPVKGLVNGTTHNNLEAKNRMSNNWDSRKFFQSHHATANKVSQRPAKKQKISSYSDQMQNGNASSDSDKEQDLTKYYASATALANSPEEKKRREHRSKRFEKNQNSSSKSRNSAASKDVMANIHARRAVSALLARSCEDGTTLAVEDMDWDALTVKGTCQEIEKRYLRLTSAPDPATVRPEHVLEKALSMVETSQKNYLYKCDQLKSIRQDLTVQRIQNELTVKVYETHARLAMQAGDLPEYNQCQSQLKRLYAEGIKGCYFEFSAYNLLCVMLHSNNKRDLLSSLARLSKQAKQDEAVKHALAVHSAVSSGNYVLFFKLYKQAPNLNSCLMDLYVERMRFEAVKCMSKSYRPTIPVGYVAQILGFSRIDSEASEECEMWLKAHGAILSIDNSRDLQLDTKASTTTLYMPEPENAVAHVHIVPVMELNEMEQQMKGIMLPELWSWSK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..57#570..1388#1960..2157#2233..2394#2701..2799#3078..3181#3869..4031#4208..4675#4800..4940#5163..5222#6185..6315#6402..6535#6646..6851#7567..7618#7746..7834#ATGGCGAGCCACGGCGCCGGGGTGGTGGCTGCTGGATCCGATGCCGCTCCTGCCGAGGTAGATGACGCGCCTCGTCTGATGTTCTATTGATTTTTGAATTTGTTTTTTTTTTTTGAATATGTGATCGTTTATTTAGTGTCTATTTAGGATGCAACGAATTTGATATTATGCTAATTACTGTACCAAACTTAAGCTAATTTGAGGATGTGGGTGATTGGTAGAAGTAAAATTTAGCCAAGGGAACTAAACTATTCATGCAAGGTGGCTTCGTTGAATTTTTGCAAAGAAAAATTAGAGGAGAAGTTTGATCGGATTTGAACGTCTTTGCTATGCGTAGAACTACATGTTAATTCTGAGAATCTATGGTTGTATGGAAGCCTAGTTGTACGAATCATTCTAGTTGCAATATAGTACTGACTTAAAGCATTTTGCCAATGAATTACTGAAATGGTTAAAGCTGCAGTGAGGATGAATCTTTTGGTCATGGCTTTTGTAACTAAGTTGCTATGTGCATTATGCCATTATATAAATGATCATGAGTTCATGACCCCTTTATTTGCTAATGGCAGGTCAGCATTGTGGGGCAGACAAATCCATCTACTTATCCACCTTTAGCTTTAGGGCATCATTCATGGTCCTCTTCAACTGGGGCAGCTACAGTCCCGTGGAGCTATCCAGTGAACAATCAAAGCCAAGATACAGTTTACTATGATCCACAAAGGGATGTTTCGGTTTCGGGAGACAATCAGAGCGTGGCAAGCAGTGCACCTCATAATGCTCAGCCAACTATGGGCACAGAAAATGCGACTCATTCTCACATGCCTTACTCAAGTTCACTTCAACATGGGTACACTGCTGCAGAATATGCAAACTATTATTATAGCTACCCACAAACTACAAATGGTTCTTCTGTCCAGCAAGGAGGAACAAATCAACATTCAGGTGCAGCTCATCAGCCTCTTACTTCATTTCAGAATTCAGAGTCTTACGTTGGTCCCACAAGTAACACATATTACAATGCTGGTGGTCATCAGACTGCTCCAGGATATGGAACTAGCAATAGCTATTATCAGAACAGCACATGGAATGGTGGAAGCTTTGAAAATAATTATGCTCAGTCATATCAGAACTACCCGTCATCCAATACCAACACAGTACAGCATTCCATTTCAGTGCCTACCAATTCTTTCTCATACCAACAGCAGTACAACCAATGGCCATACTATTACAATCACACCGTGCCAAATCCTGCTGGTGATCCAGTCGGGAACAGTAACTCAATTGTTAACACTACTTCTAGCTACTCCTATCCCAGTATCCAGCCACCTCCTCCAGGAACTACATCATGGAAAAGTAATTCAAGTTCTTCTATTGCGCCTCCTATTCAGGTATGTTCCTTCCTTTCTATGTATATCGCTACTAATTGTACATAGCCTTCTTGGTCACACCCTGGACATTTATTGATCATGGGTTTTAAGCTATCTGGTTATGTTGCTATTTTGGGACAATCATTTCTTTTTTTCGATCAACAGATGGTGTTTACTTATTTTGTGTTGCATATATGTTATGCCTAGTTAGCTTATCTCAAATTCAACTTCCTCCGCTTGCTGTGCATCTGGGTGCAGCATTCTTTTCGATGAGTTTCGTGGGCTATAAACACGCTCTTTACGATATGGAACATCAGAATGCATGATGATTGTTTCCGTACTTTGTTCATGTAGATTTGGTTGGCACTAGCACTTCTCTTTGTGTTTGCATGGAGAAGTTTATAGCACATTGCATACTAAGAAAATCATCTGTACCGTATGAAGGTTTTTTGTTGCTTGTAGGTCTTGAAGTGTCATGTCTTTTCTGTCTTGTTTGACTTGTGGCAATTTTCTTGTGTTCTTTAGCTCACTACATAGATTGTTTCATCATGAGAATAGAAAATAATTATATCTAAATTTCATCTACCTACAGGCTTCAGGTGGTCCAGGGCCTCAAGATCAATATATCAACCAGGCGCACGCTCCGGTGTTGGAAAACCAGTATGCTGGCCAGGTAGCAGGTAACCCAAGGTCTCAAAACCATTATGCCAGCCAGACACCAGCCTGCCCACAGAGCACTGTGAATTTGAACCCCGTTCAGCAAAGCAATCATGGCGATCAACAAAATACTGTAGGTTCAAACGGTCCAAACTCAAATATTTACTCAGTCGACCATGTATCTGAAAATTTACACCCAAATTTGCAGGTTTTTATTGCAACCGAAAATTCAAGTGAAAACAAAATGCAGGTTCCTCGAATTGCTCCAGGTTTTTCTATGGTAATACCAAAGAGCGAGAAGAAAATTTTAGGTGCTGATTTGTCAAAGAAGCCTGCTTATGTTAGTGTTTCCATGGTGAAGAATGATGCTGTAATTTTCTGCTCTTCTTTTCTTCATTTCTGGCACATGATGTTCTAACTTTCTAAGGCTATTTTTTTTGCTCATATGGAAAATGACTATTTGGGGAGCTATTGGCATATAAAATGATTCATTAAATTATATATTAGTTTGTTAGTTCAAACTCATGATATTTAAATTCGTTCGATGTCTATGAGAATGCTTGGCTTATTCCTTGGAAAACCAGCGCAAAAGTTAGCACGTATTATGCTTATACTTAATCAAGGAAGATATTGGTACTTGCATATTCACCACCTACTTTTCTATTCTCATGTTTAGAGATCACTCCCTTTTTCATTACATAATTATGCTACGAGGAATCTCAACCGTTGCAAGGATGAGGCCCAGAAGGCTGCTTGCCAGAGTATGATAGAAGAGGTAAATCTCTGTTATATTGTTTTGGCGTTTTGTTAGTTGCCAGCATTTTGTTGTAAAAAAGATTGGCATCGTGGCTGTTGCCAATTTGCCATTCACAACAAATGGCTGATCACAGTTTTCTAGTTGAATTCACTCCAGTTATTGGGCCAGCGATTGATGTGGTGCTTCATTCATATGTTTTCCTTTGTTTATTTTGTGGTTCTTTTACGTCAATTTAGAATGATGTAAATTCGTTGACTCTGTATCTCAGTCTTGTTATCTTCCTAATATAATATCAGATAAAAAACAGCGCCATTGCTGATGGAACCCTTCTTACTAAGAATTGGGACACTGAGCCACTGCTTCCTTTGGTACAAAATGTTGCAACCATTCCAGAAACAAGGTTTGTGCTTCTGGATTCTCTGGACAGTGATAATGTAGTGTTTTGAGTACTTAACTACGTTGACTGATATTTTTTATCTGTTGTTTTGGACTTATGTTGCTATAGAATTATACTTTCGGGCAACCAGCACCATGCAATGAATGAAAATTCCAGCTTACACCTTCTTAACAGTGTTATCTTCTGGGTAATTTATATCAGAAGTGTTATGATCTAAGCAAATATCGCAAAAAAAATAATTTATCTATAATAATAGTAAGATGCCTTCAGATTTATATAATTGGATATGTCTCAACTGTCTTGGACATATGTTAATCTTATTGGGCAGTATATGGTGGAATCATGGATGTATCATTTCATGAAGAATATTTAAAATCCTATACCCTTCCTCCGATTTCTAACCATGATAACCCTAGAAAATAATTAAGATGTGATTATTGGGAATTGGTTTTTGGGTGCAGAACTATTCATATACTTAATCAAATGTTTGCATTACATAGATACTGGGTTAAAAGTGATCCATCTAATTTTGCCACAAACTACTATGCCCAAATTCGTGTTGTAGGCAAAATTAGGATTCCTTCCTTTCACTAAAGAAAGTTTTGAGTCATTGGCTCATTGCTGCTTCTGTGCTATGCAGAATCACATATTTCTGAATTAACTTTTTGCTATTTGTTTTCCATATAGCAGTGCAAACAATTCAAGTCCCTCCTTGTCAACATCTACCAATAGGAGACGCCAAAAAAGTAGGTGGGAGCCTGTTGTGGAGGAAAAGGTTACAGATAAGGTGGAACCGGTAAAAGGGTTGGTGAACGGTACCACCCACAATAATTTGGAAGCCAAAAACAGAATGGTAAGAACCGGCATGTGAACTCTTGCAAAATCTCATACTAATCAGTCAATGTACAAGAGGAACAGATTTCCATATTTTAACTACATGTATGGCTTTCCATTTCTGAATTGCCAATATCAAATGCCTGTGTTATTGCTCTACTTAGTATTTGAAATATTTGAATGAATGCCATGCAGAGTAATAACTGGGATTCCAGAAAATTTTTCCAGTCTCATCATGCGACTGCAAACAAAGTCAGTCAGCGGCCTGCCAAGAAGCAAAAGATCAGCAGTTACTCAGATCAAATGCAAAATGGAAATGCTTCAAGTGATAGTGATAAGGAGCAGGATCTAACCAAATATTATGCCAGTGCAACCGCACTAGCAAATTCACCTGAGGAGAAGAAGCGCAGGGAGCATAGGTCAAAGCGTTTTGAGAAGAACCAGAATTCATCATCTAAATCGAGGAATTCTGCAGCAAGTAAAGATGTAATGGCTAATATACATGCACGAAGAGCTGTTTCAGCTCTTCTTGCCAGAAGCTGTGAAGATGGCACTACCTTGGCTGTGGAGGATATGGATTGGGATGCATTGACAGTAAAGGGGACATGCCAAGAAATTGAGAAACGATATCTCCGGCTTACATCAGCACCTGATCCTGCCACAGTAATAAAACCCACCAACTGTTGTCCTGGATTCTTAATTGAAAAGCATCAATAGCAAATCTTTTTTCTTTTGCAATTTGATCATATCTACTGTTTCTTCTCCTTATCTGAATAATGCTTGGCAGGTAAGACCGGAGCATGTCTTGGAGAAGG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