BGIOSGA017932

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA017932

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017932, complete gene.

LocusTag

OS05G0455500

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA017932-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA017932-PA

Length

5980

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:23741761..23747740

Sequence Coding Region

23747681..23747740,23747370..23747456,23746816..23746887,23746507..23746713,23746255..23746416
,23745793..23746070,23745081..23745231,23744778..23744942,23744588..23744665
,23744373..23744462,23744199..23744285,23744028..23744114,23743859..23743955
,23743642..23743745,23743091..23743166,23742552..23742702,23742371..23742439
,23742168..23742234,23742005..23742075,23741761..23741839

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:23741761..23747740 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:23741761..23747740 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGAGCGTCGACCCGTCCCGGAGCTTCGTGAGGGACGTGAAGCGCGTCATCATCAAGATTATCAGGAGTGGGGCTTTGCTTGGGCTTTTCTGTGGTTTACTTGATGTGACGGCCTATGTCGAAGTTGCCAATCTTTCGACTCTGGTGGGCACTGCAGTTGTCTCCAGACAAGATGGAAGATTGGCTTTGGGCAGGGTTGGAGCTCTGTGCGAGCAGGTTAAGGAACTGAACTCTTTAGGATACGAAGTGATTTTGGTCACCTCAGGTGCTGTTGGAGTGGGGCGACAGCGACTTAGGTACCGGAAGCTTGTCAATAGCAGCTTTGCTGATCTGCAAAAGCCACAGATGGAGTTAGATGGAAAGGCTTGTGCCGCTGTTGGTCAGAGTGGACTGATGGCTCTTTACGATATGTTGTTTAACCAACTGGATGTCTCGTCATCTCAACTTCTTGTCACCGACAGTGATTTTGAGAACCCAAAGTTCCGGGAGCAACTCACTGAAACTGTTGAGTCATTATTAGATCTTAAAGTTATACCAATATTTAATGAAAATGATGCCATCAGCACTAGAAAGGCTCCATATGAGGATTCATCTGGTATATTCTGGGATAATGACAGTTTAGCAGGACTGTTGGCACTGGAACTGAAAGCTGATCTCCTTATTCTGCTCAGTGATGTGGATGGGTTGTATAGTGGTCCACCAAGTGAACCATCATCAAAAATCATACACACTTATATTAAAGAAAAGCATCAGCAAGAAATCACTTTTGGAGACAAATCTCGTGTAGGTAGAGGAGGCATGACAGCAAAAGTGAAGGCTGCTGTCTTGGCTTCAAATAGCGGCACACCTGTGGTTATTACAAGTGGGTTTGAAAATCGGAGCATTCTTAAAGTTCTTCATGGGGAAAAAATTGGTACTCTCTTTCACAAGAATGCGAATTTGTGGGAATCATCTAAGGATGTTAGTGCTCGTGAGATGGCTGTTGCCGCAAGAGATTGTTCAAGGCGTCTACAGAATTTGTCATCAGAGGAACGGAAAAAGATATTGCTAGATGTTGCAGATGCTTTGGAGGCAAATGAGGATTTAATAAGGTCTGAGAATGAAGCTGATGTAGCTGCGGCCCAAGTTGCTGGATATGAGAAGCCTTTGGTTGCTAGATTGACTATAAAACCAGGAAAGATAGCAAGCCTTGCAAAATCTATTCGTACCCTTGCAAATATGGAAGACCCTATAAACCAGATACTTAAAAAGACAGAGGTTGCTGATGATTTAGTTCTTGAGAAAACATCTTGCCCATTAGGTGTTCTCTTAATTGTTTTTGAGTCCCGACCTGATGCCTTGGTTCAGATTGCATCTTTGGCAATTCGAAGTGGTAATGGTCTTCTCCTAAAAGGTGGAAAAGAAGCTATCAGATCAAACACGATATTGCATAAGGTTATAACTGATGCTATTCCTCGTAATGTTGGTGAAAAACTTATTGGCCTTGTTACAACTAGAGATGAGATCGCAGATTTGCTAAAGCTTGATGATGTCATTGATCTTGTCATTCCAAGAGGAAGTAATAAGCTTGTCTCTCAAATCAAGGCGTCAACTAAGATTCCTGTTCTTGGGCATGCTGATGGTATATGCCACGTATATATTGACAAATCAGCTGACATGGATATGGCAAAACATATTGTAATGGATGCAAAAATTGATTACCCAGCAGCCTGCAATGCAATGGAGACCTTACTAGTTCATAAGGATCTTATGAAGAGTCCAGGCCTTGACGACATATTAGTAGCACTAAAAACAGAAGGAGTTAATATTTATGGTGGACCTATTGCGCACAAAGCTCTGGGATTTCCAAAAGCTGTTTCATTTCATCATGAGTATAGTTCTATGGCCTGCACTGTTGAGTTTGTTGATGATGTTCAATCAGCAATTGACCATATTCATCGTTATGGAAGTGCTCATACAGATTGTATCGTCACTACAGATGATAAGGTAGCAGAGACTTTTCTACGCAGAGTTGATAGTGCTGCTGTATTTCATAATGCAAGTACGAGATTCTCTGATGGGGCTCGTTTTGGATTGGGTGCTGAGGTTGGCATAAGCACAGGGCGTATCCATGCCCGTGGACCAGTGGGTGTTGAAGGTCTCTTAACTACACGATGGATCTTGCGAGGGCGTGGGCAAGTGGTGAATGGTGACAAGGATGTCGTGTACACCCATAAGAGTCTTCCTTTGCAATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MASVDPSRSFVRDVKRVIIKIIRSGALLGLFCGLLDVTAYVEVANLSTLVGTAVVSRQDGRLALGRVGALCEQVKELNSLGYEVILVTSGAVGVGRQRLRYRKLVNSSFADLQKPQMELDGKACAAVGQSGLMALYDMLFNQLDVSSSQLLVTDSDFENPKFREQLTETVESLLDLKVIPIFNENDAISTRKAPYEDSSGIFWDNDSLAGLLALELKADLLILLSDVDGLYSGPPSEPSSKIIHTYIKEKHQQEITFGDKSRVGRGGMTAKVKAAVLASNSGTPVVITSGFENRSILKVLHGEKIGTLFHKNANLWESSKDVSAREMAVAARDCSRRLQNLSSEERKKILLDVADALEANEDLIRSENEADVAAAQVAGYEKPLVARLTIKPGKIASLAKSIRTLANMEDPINQILKKTEVADDLVLEKTSCPLGVLLIVFESRPDALVQIASLAIRSGNGLLLKGGKEAIRSNTILHKVITDAIPRNVGEKLIGLVTTRDEIADLLKLDDVIDLVIPRGSNKLVSQIKASTKIPVLGHADGICHVYIDKSADMDMAKHIVMDAKIDYPAACNAMETLLVHKDLMKSPGLDDILVALKTEGVNIYGGPIAHKALGFPKAVSFHHEYSSMACTVEFVDDVQSAIDHIHRYGSAHTDCIVTTDDKVAETFLRRVDSAAVFHNASTRFSDGARFGLGAEVGISTGRIHARGPVGVEGLLTTRWILRGRGQVVNGDKDVVYTHKSLPLQ</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..60#285..371#854..925#1028..1234#1325..1486#1671..1948#2510..2660#2799..2963#3076..3153#3279..3368#3456..3542#3627..3713#3786..3882#3996..4099#4575..4650#5039..5189#5302..5370#5507..5573#5666..5736#5902..5980#ATGGCGAGCGTCGACCCGTCCCGGAGCTTCGTGAGGGACGTGAAGCGCGTCATCATCAAGGTGATTTTTGTTTGGCCGCTGGGTCGCAGGAGTCGCCGTCACGGATTGACCTTGATAGATCTAGTTTCCGAGGATTCGTGCGCGTCTGCTTGGGCGCTGTTTGCATTGTTTGCGCTCCTCTTCTCCGTATTCGTGAGATTGTTTCTGGATCAAATTTACCGGGCGAGTGTTTTGTTCAGAGTTGAAGACTCGAGAGACGTTTGATTTGGGATTCTCGTTGTTAGATTATCAGGAGTGGGGCTTTGCTTGGGCTTTTCTGTGGTTTACTTGATGTGACGGCCTATGTCGAAGTTGCCAATCTTTCGACTCTGGTAGGCATCATCATGGGAAAACTGTTGGCTATTTCGCTGCGGGGCAGCGGATTTCTGTCAGATGGGAATTGGTGGGTGGAATGGCACAGAAATAGAAAAGAGACATAGTATCTTATATTGGAGCGTTCGGCAAATTTCTGTCCCTTGCGATCGCTCTCACAAATTCGTGTTTGTTTCATCTGTGACACTTTTTATTTGTTCAAATCCCATGCTTTTTCCAATTTTTTTATAAAAAATATGCGGAACTGGTGAAATAATGTCTGAATTGGAAAGGTGATGAGAATCGAATAATGTAGAATCAAATACCGTTGCTTTTGAGTTTAGGCTTTGGAAAAGCGTTTAGACTTTAGAAAAGCCTAGCAGTTTTGTGGAACCTCAACGCAATACCTTCAACACAAGATGTACCACTGTACCAGTACATAATAATAATAAAATAATAATGTTTTTATCTCTGTGCGGTTAATTCCTTTTTTGCATGACAGGTGGGCACTGCAGTTGTCTCCAGACAAGATGGAAGATTGGCTTTGGGCAGGGTTGGAGCTCTGTGCGAGCAGGTAAAAGAAATCCATTTTTTTGATCTTGTGAGCTGTTCTGCAATGGCTATGTAGTGTTGGATATGTTGGCAGGTGCCTAACCAAAGAAAAGTGGCAATGCAGGTTAAGGAACTGAACTCTTTAGGATACGAAGTGATTTTGGTCACCTCAGGTGCTGTTGGAGTGGGGCGACAGCGACTTAGGTACCGGAAGCTTGTCAATAGCAGCTTTGCTGATCTGCAAAAGCCACAGATGGAGTTAGATGGAAAGGCTTGTGCCGCTGTTGGTCAGAGTGGACTGATGGCTCTTTACGATATGTTGTTTAACCAAGTGTGTTTATTAGTCTGGCATTCAACTTCAACAAAAATGAATAGGTTACTTTTTGTATCTTTTTGTAACCTTGAACTTCTTGCATTGCAGCTGGATGTCTCGTCATCTCAACTTCTTGTCACCGACAGTGATTTTGAGAACCCAAAGTTCCGGGAGCAACTCACTGAAACTGTTGAGTCATTATTAGATCTTAAAGTTATACCAATATTTAATGAAAATGATGCCATCAGCACTAGAAAGGCTCCATATGAGGTATGTAAGTGTGTTTCATACCATACATCTCCTGGAAAAGTATGAAACTTCAGTTTTTGCGTGGTGCTGCTCTTTAGCTGCTACTTATTGTTATACTGCTTGTATGCCTAGCCCTAGGGCCTTGTCAGTGTATATGCAAATAGCCATGACTTTCTAACCACACTCACCTATAATTCTTTTACAGGATTCATCTGGTATATTCTGGGATAATGACAGTTTAGCAGGACTGTTGGCACTGGAACTGAAAGCTGATCTCCTTATTCTGCTCAGTGATGTGGATGGGTTGTATAGTGGTCCACCAAGTGAACCATCATCAAAAATCATACACACTTATATTAAAGAAAAGCATCAGCAAGAAATCACTTTTGGAGACAAATCTCGTGTAGGTAGAGGAGGCATGACAGCAAAAGTGAAGGCTGCTGTCTTGGCTTCAAATAGCGGCACACCTGTGGTTATTACAAGGTAAACAATCTATTCCCTAGAGTATAATGGATATGACTGCTAGCATCAATCAGATGCACTCCATTATATATGTATTGTCAAATTTCCTGTCAAGTGCAACTAGCAATCAGTACCATCTGCAGGTGTTCTGGTTGGATTATGTCATTGCCAGATTTTTTTGCATGAGTTTATTTCTAATGTGAAGATTATTAAGTCCTACAAGACATCCAATCCCAACAACTCCACTTGGCCTCTATTATAACATCTTGAATGAGATGCAGTCCAGTGCTTGAATGTTAGCTTCGTGGCATTAATGGATGAGCTGTTCTGACTTTAAACACCCCTAGTTTACGCTAAAAAAATGATTTGTTTTGAGACCTATATGACCTTGCATGTTACGTTGAAACTTTGCTTATGATGGTTCAGACATTTAATGCTTGTAATGTACTGCACATCAAATTCAAATGATTATCTTGTTGTGTTGAAGCTAATTATCACTGAGATAACCAAGTTCATGAGTTGCAAGCTATTTTTATCTTCTTAATGAATGGAGAAATAGTTTATTTTTTTCTATCCTTGAAGTGGGTTTGAAAATCGGAGCATTCTTAAAGTTCTTCATGGGGAAAAAATTGGTACTCTCTTTCACAAGAATGCGAATTTGTGGGAATCATCTAAGGATGTTAGTGCTCGTGAGATGGCTGTTGCCGCAAGAGATTGTTCAAGGCGTCTACAGGTATATATCTTTGTCAAATCATACGTAATTCTTGTCCCTCTGTTATGCCCAGTGGAGTTACACACTATTTCAAGTTTTAGCTCACTATTTTTGCTCACCCGTGATACTAGTCTGATACCATATGTTTGTTTGAAACAGAATTTGTCATCAGAGGAACGGAAAAAGATATTGCTAGATGTTGCAGATGCTTTGGAGGCAAATGAGGATTTAATAAGGTCTGAGAATGAAGCTGATGTAGCTGCGGCCCAAGTTGCTGGATATGAGAAGCCTTTGGTTGCTAGATTGACTATAAAACCAGGAAAGGTGGACCCCTCATTTTCCTTGCCAAATTAACTGATTTGTTAAATATCTGACACTTCTCTTTTCTTATGTATGTTGTCTTGTTTAACTCATATTATATTTTATGTTTTTGCAGATAGCAAGCCTTGCAAAATCTATTCGTACCCTTGCAAATATGGAAGACCCTATAAACCAGATACTTAAAAAGACAGAGGTGAATGCCAGCCTTTTTAATAGAAACTCTTTTTAATAGAAATCTGCTATGAGATTTCACAGAAATTCTAGATTCTAGATGATATATCCATAGCGATTTTAACAAAAAGATTTCCCCTTTGCCAGGTTGCTGATGATTTAGTTCTTGAGAAAACATCTTGCCCATTAGGTGTTCTCTTAATTGTTTTTGAGTCCCGACCTGATGCCTTGGTTCAGGTATTTTGTTCTGGCAATGCACTGTGTTCCATTCTTTTCCAGAATACATATACTTCCAAGTAACTAATTTTGTGTCATTGTTGTTAGATTGCATCTTTGGCAATTCGAAGTGGTAATGGTCTTCTCCTAAAAGGTGGAAAAGAAGCTATCAGATCAAACACGATATTGCATAAGGTATTATCCTTTTATCTTGTGGTTAAAATTGCTTTCTGGTTTTGCTTTAACTGTTGTAAAAAACATCGATTTATTCTTTTCTAGGTTATAACTGATGCTATTCCTCGTAATGTTGGTGAAAAACTTATTGGCCTTGTTACAACTAGAGATGAGATCGCAGATTTGCTAAAGGTGTGTATGCAATTCTATATTTTCAAAGCGTTGATACTACCAATTTGGCTAAACCCGTAATACACTGTGCAGCTTGATGATGTCATTGATCTTGTCATTCCAAGAGGAAGTAATAAGCTTGTCTCTCAAATCAAGGCGTCAACTAAGATTCCTGTTCTTGGGCATGCTGGTAAATTCTGTTTGAACTCAAGTTCTTACCACTCTTATAGCTATGGCTTTATTGGATGTTGAGTTTTTTTTTTCTTTTTGCTATTTCTGACATTCCATATTTCCCCACTGCAGATGGTATATGCCACGTATATATTGACAAATCAGCTGACATGGATATGGCAAAACATATTGTAATGGATGCAAAAATTGATTACCCAGCAGCCTGCAATGCAATGGTATCTATCCAGTTTGCTACCGTGTATAGTATTCAAATAGATTGCTTTTACAGTTTCAGTTACTTTTTGGAGTATCTTTCACTGAATATTTTGGACAATTTCAAATTCTCTTCTAACCATGATGCTCTGGTTGCAATTCTTCTCTGGCATCTGAAAAATGCATTTAGTACTGTTGAGATTATTACAGCCCCTCCACTTCTATCTCATGCAAACTATTTTTATTGATAGATGATAGTTATAACTGCACTTTTGAATTGTTTAAATTGATTTATAACTACTTATATTGTGATTGCATAATGCTTATTCTTACAAAGTAGTAACTTCCTCTTTCCTTTGTAAGAAAATTTAGCTACATATCTTGATAGTCTTCTACTGTTTTCAGCATGTTGATAATTCCACCTTATAATTTTTCTGAACATCATGTAGCCATTTTTTATATTCAGATAACAGCCTATTTTACATGTATGTTCTGCAGGAGACCTTACTAGTTCATAAGGATCTTATGAAGAGTCCAGGCCTTGACGACATATTAGTAGCACTAAAAACAGAAGGTTTGTTTTTCTACTCTCTTATACTATAGAAACGGCTCCCCTCTGAAGCAATTTTGCTCAATACCATCACAAACAGTTGCAACTTTAAATTACCAACCACTGTGATTTAATGGTGATAAATACCA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA017932