BGIOSGA019354
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA019354 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J013151G13, full insert sequencecDNA |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA019354, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1430_B02.6 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA019354-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA019354-PA |
| Length |
11846 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:6971738..6983583 |
| Sequence Coding Region |
6971738..6971829,6972394..6972679,6972759..6972837,6972915..6972964,6974233..6974430 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:6971738..6983583 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:6971738..6983583 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCAGGGCTCTCAAAAGTCAAAAGTGAGGCATGCCATCTCTCTCAGCGGTGGGCGCTAGATACAGATCTAAGGGAACAAGAGGGAGGACTGTTACAGATGAATCAGCCTGAGGTTAACGGTTTGTTATGTGTTGGATTGCATCAAACAGATGGGGGTGACGAATTGTATGCAACTGAATGTCTAAAAATGAACCAGGGTTCTTCACATGAAACAAACAAGTTGGATGCAGTAATGTCAGCTTCAACAATGCACAGTGATCATAACAATGCTAATGCATGCGTAGATGATTACCAACATACAAAGATGATGGCAGGAATTCAACCTATGGAGGAAGTTGGTTTTGGCTGTACGCAACCCTTTGAGCTGCAATCACAAGGGATAGTACCTGATTCTGAGGAAGAAAGCTTGCCATCTAGCCCTGAAACTTCTTCAACATCCAATTATGATATGCCTGATTTAGCTGAGCAAAACTTGGAGCATATTTACAATGTTTTGGGTGAAATGGTTGATAAGGAAGGGCCAGTTGTACTTAGTCCAGAGTATGTGATGTGCGGCACAACTTCGCATGTGGAACCTCGCTTAACTTTCTCAGCAGACGGATTCAAGATCGAATACTGGGATTCTTGTGAAAATGATGAGATGGCAGCTCAATATTGGAAAATTTCTGATATTACCTGCATTGATTGTAAATGGGCACAGAGTGTTGGATCTGTCTTAATAACTCTCCATGTTGGATCCGGCACAGAAACTGGAAATTCTAGTCATGATAGAATACAGTTTTGTCTTATTGATTCACAGTGGCCAAGGAAACAGCAAAACATTTGGCATCTTGCATCAAGATACCAAGAAATATGGAACAATATTCCATCGGGTGATTTTGCATCAGAGAATTGGAACATTGAACCCAGTTTGTTTTTCCCTAAGCAATACTTTTCTGACACTGAAGAATTTGAAGATGTTATCTATCCCAAAGGAGATCATGATGCTGTTTCCATTAGCAAAAGAGATGTTGAGCTGCTGCTACCTGAAACATTTGTCAACGATACAATAATTGACTTTTATGTCAAGCACTTGAGCACAAGAATTGAACCCGCTGAGAAGCACAGGTATCACTTCTTTAATAGCTTCTTTTTTCGCAAGCTGGCTGATCTTGACAAAGATCAAGGGAGAGCTCCAGAAGGTAGAGCAGCTTTCCTACGTGTACGCAAGTGGACTCGTAAAATAAACATATTCACGAAGGAGTTTCTGTTTATTCCAGTAAACTTCAACTTGCATTGGAGCTTAATTGTCATTTGTTATCCTGGAGAAGTGGAGACATTTAAAGATGGTGACACAAATATCTCTGCAAAGATTCCATGTATACTACACATGGATTCTCTCAAGGGAAGTCATAGTGGACTGAAGGATATCATCCAAAGTTATTTATGGGAAGAATGGAAGGAAAGGCATCCTGAATCAGCATCAGATTGTTCGGACAAGTTCTTAAACTTGAGGTTTATCTCCCTCGAGCTCCCTCAGCAGGATAATTCATTTGATTGTGGCTTGTTCTTACTCCATTACGTGGAACTCTTTTTGATGGATACTCCGAGAAGCTTCAATCCTTTGAAGATTGACTCGTTCGCTAACTATCTTAGTGATGATTGGTTTCCACCTGCTGAAGCTTCTCTCAAGCGTTCATTGATTCGAAAATTAATCCATAAGCTGTTGAAAGAGCCTTCTCAAGATTTTCCCAAACTAGTCTGCTGTAGTGAGCAGCTGGATAAAACACATGGGAGTGAGAACGCTGAGCTAGAACAAATGAGTGAGAATGCTGAGCGAGAACAAGCTAAAGAGCTCCCAGCTCAGATGTGCACTGATGGTGAACCTGATTCAGTTGGCACCATTCTTGAAACACAGCAACCATCCATATCAACATGTTTCAATGATTCTGATGAAAACGGCCCACCTGTTTCTGTACACAACCTACATAAGTTGGAGGTATGCTCTGCAAACAAGGATGCCATCGTCTGCTTGTCAAATCATGATGAGAAAAATGAGTCACCTCCTGCAGATTCTTACAATCATCTTGATTTGAGATCATGCGACTCAGAAGAGGCTGAGACAGCCAAGGGATCAGCTGGTGTTGTGAAAGATCCGAATAGTCATAAGGAGCCTTTGCTGGATTCTCTGGATAATAACCAGGATATTTCCATCCAAGCTGGAGCTGAGATGCATGACAGTATGGACTCCAAGTTATGTTCGATCTCCAATAATGCTGACTTAATGGCTAGCGAGGAACGTTCGTTAGACAAGAACACCAATGAAAATGAGGAGCACAATCGAACCTCAGAAGATATCGTAGAATCTGTCATGATGCTTGGCGGCAGCAAAAGTGACACTGAACTTGATGCAGAACCAGAAAGGACTGCAGGTGAAGCTGAGGTTCGGAATTGTGATCATTCTAAGGACATAGATTATATTGCATTAGGTGATATCAACAAAGATGCTGCTAAGCAATCTTTAAATAGGAATATTGTTGAAGCTGAGGACATTAAATGTGAAGGTACTCTTGTGGATCATACAGTGGTAGAAGATGCAACTCCATATAATGTGAATGAAACTAGTGCAAGTGCCGACAAGATCAATGATAATGAGCATAATGTTTCATCTGAGTTGAAAGAAGGAAATAACGGCAATGGTATAACCACTTCAATTTCCTGTGAAATGGAAGATAGAAGCATTGACAATTTAATGGTAGGTGATAGCAGAAACGGAACAGATGAAACTCGTGCAGATGGCCAAGAAGCTCACGATAACTCTGCAACAGCTGAGACAGTTCCTTGCGAAGACAATGCAACAACCAGCATAACTGATGCTGAGATGCCACACGAAGATAGCACATGTAGCGTGAAGGGTGAAGCAATTTCGGATAACACAGCATCTGATGCCAAAAGACCTCTGCCTGATAGCACCTACATAGAAGATATACCTGACGACAAGTGCTTGCAGAAAGATGATGGCGGGGGTGATGAAGCAAAAACAGAGCGGCACTACAAGCGACGGAAGTTTCTGGTCTCTGAAGCAACATCTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGLSKVKSEACHLSQRWALDTDLREQEGGLLQMNQPEVNGLLCVGLHQTDGGDELYATECLKMNQGSSHETNKLDAVMSASTMHSDHNNANACVDDYQHTKMMAGIQPMEEVGFGCTQPFELQSQGIVPDSEEESLPSSPETSSTSNYDMPDLAEQNLEHIYNVLGEMVDKEGPVVLSPEYVMCGTTSHVEPRLTFSADGFKIEYWDSCENDEMAAQYWKISDITCIDCKWAQSVGSVLITLHVGSGTETGNSSHDRIQFCLIDSQWPRKQQNIWHLASRYQEIWNNIPSGDFASENWNIEPSLFFPKQYFSDTEEFEDVIYPKGDHDAVSISKRDVELLLPETFVNDTIIDFYVKHLSTRIEPAEKHRYHFFNSFFFRKLADLDKDQGRAPEGRAAFLRVRKWTRKINIFTKEFLFIPVNFNLHWSLIVICYPGEVETFKDGDTNISAKIPCILHMDSLKGSHSGLKDIIQSYLWEEWKERHPESASDCSDKFLNLRFISLELPQQDNSFDCGLFLLHYVELFLMDTPRSFNPLKIDSFANYLSDDWFPPAEASLKRSLIRKLIHKLLKEPSQDFPKLVCCSEQLDKTHGSENAELEQMSENAEREQAKELPAQMCTDGEPDSVGTILETQQPSISTCFNDSDENGPPVSVHNLHKLEVCSANKDAIVCLSNHDEKNESPPADSYNHLDLRSCDSEEAETAKGSAGVVKDPNSHKEPLLDSLDNNQDISIQAGAEMHDSMDSKLCSISNNADLMASEERSLDKNTNENEEHNRTSEDIVESVMMLGGSKSDTELDAEPERTAGEAEVRNCDHSKDIDYIALGDINKDAAKQSLNRNIVEAEDIKCEGTLVDHTVVEDATPYNVNETSASADKINDNEHNVSSELKEGNNGNGITTSISCEMEDRSIDNLMVGDSRNGTDETRADGQEAHDNSATAETVPCEDNATTSITDAEMPHEDSTCSVKGEAISDNTASDAKRPLPDSTYIEDIPDDKCLQKDDGGGDEAKTERHYKRRKFLVSEATS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..92#657..942#1022..1100#1178..1227#2496..2693#2770..2827#3603..3711#4468..4536#4899..5027#5185..5385#5464..5519#5601..5694#8040..8130#9175..9294#10287..10634#10752..11846#ATGGCAGGGCTCTCAAAAGTCAAAAGTGAGGCATGCCATCTCTCTCAGCGGTGGGCGCTAGATACAGATCTAAGGGAACAAGAGGGAGGACTGTGAGTTAGAAGCCACACCACGGGCTATTCTTAACACAGTCAGTAGAAAAGTAGCCATCTCGGTTTTTTTCTCTCTTGTGAACAGGAGCAAACAATTAAAATGTGGGTTTTCTAACCTTTCACATACTTGTAGGAGGGTTTATATATATATATATATATAAGTTACAGTGAAGAAAATCAAACTGTGAATCATCTGTAATTTTTTTTAATTATTCTTTGCAGGTTTCCAATTTTTATATATTTATTGCTAAGAAATTGTGATGTTTACAGAAACTGAATCCCTCTCAGCCCTCACTATTCTCTACCCTTTTACATAACATGTCATTCTGTGTGTTAGTTTGTGACATCATTGAGGTTTACTGGTTTAATGATTTACAATTGTTTTTGTGCTATAACCATATCGTTTTTTAGTAATACCCTCCTTGTTAATGCGCATTTTACTTCTCGGACCTCTTCTCCTAATGTATTTGATTTAGCAGTCAATGAGATAATATAAGCTCAGCTGGTGGCGATCATCTAGCACATAATTTCTCATATTCTTTTCACTGTGTCGTATGCTGTCAGGTTACAGATGAATCAGCCTGAGGTTAACGGTTTGTTATGTGTTGGATTGCATCAAACAGATGGGGGTGACGAATTGTATGCAACTGAATGTCTAAAAATGAACCAGGGTTCTTCACATGAAACAAACAAGTTGGATGCAGTAATGTCAGCTTCAACAATGCACAGTGATCATAACAATGCTAATGCATGCGTAGATGATTACCAACATACAAAGATGATGGCAGGAATTCAACCTATGGAGGAAGTTGGTTTTGGCTGTACGCAACCCTTTGAGCTGCAATCACAAGTATGCATTTTTAATGCTAATGTATTTATACAACTAGTTATTCCTTTTCTACTACTGCAATATTGTTATTATTTATCAGGGGATAGTACCTGATTCTGAGGAAGAAAGCTTGCCATCTAGCCCTGAAACTTCTTCAACATCCAATTATGATATGCCTGGTGATATGGCCAACCCTTCTTCTTTTTTTTTGCTTTGTACTGTGTGCATCCTGGTAATAATTGTTGTGTAATTTCAGATTTAGCTGAGCAAAACTTGGAGCATATTTACAATGTTTTGGGTGAAATGGTATGTATCGATAATGTATTTAATTTTAAATGTATGGTTATAGTTGATATTGATTAATTCAGTTTTAGTTCTTCAGTAAGATTGAAGCAATTGCATAATTGTTAGCACTTAAGCTGCGAAATATGTTTACAACAATTTACCAGGAAAAACCAATTTGCTGTAGCACTAATGTTTTATAGTTCCATTTACTGCTTCCTCACATTGGCATGGTTCAAGTATTGATGTTTTGCTTACAAACAAGCTAGTTACTTTAACTTAGATTGAACTACCTGAATTGTTGGAATTGGGCGGAATGCTATATCTTGCTGTCTCATTTATGGTCATATGCACCGAGTTATATATTGTGATAATTTTCTTAGACGACATGTTCAGGCTACACTTGTATCATCTTGTTTTTTTATTACTAGCATATTGTCCGTGCGTTGCAACGAAATTTTAATTAAAGAAAATTTATCATTAACCCATTATTACCATTATTTTCTGCATATATTATCTCTTAGTTTCTGCATATATTTTTTAGTGACATGTGGAACCTTTGGTCCCACACTATCGTTTTCTCTTCCAAAAAAGATGGGAGTTGGTGATGGGGTGGTGGTAGATTCACCACTCACTACCACCAGTACTCCCTTTTAAAAGAGTATAGATTATATCCTATGCATTGTCCACACCATAGCAAGATAATAGAATGCCCTCTCTTTCCTTGAAGAATACTCCAAACTTTTAAGTTCTTCAGATGCTTCTTTCTTTTTAGAGTAAATTTCATAAAACTACATGTAAAGTTGTCTACGTTGCAGAAAACCACATATACTTTGACACTTGGCATGTTAAGTACATATATTTTGGTCGTGTAGTTTCACAAAACCACACTATCGATGAATGGATTCACTCGCGAGATGATGTGGTTGTTTCACATAGGACAAGGACATGGCATCCTATTACCAGCCATCACACAAAATTAACAGGATGCCACGTCCCCATCCTAGATGGAACAACCACGTCATCTCACGGGTGAATCCATTCATCGATAGTGTGGTTTTGTGAAACTAAACTACCAAAATATATGTACTTAAGTGCCAAGTGTCAAAATGTGTGTGGTTTTATGGAACTTGAACCGTAAAACATGTAGTTTTGTGAAATTTACTCTTCTTTTTAATATTACCTTTTGATCTTTGTCGCATATTATTTTTTGATAATATGATGGACTGAAAATGTTGGTCAGAGTCCTGACTTTTAAGAACTTCATTGCCCCTAACATTCTTCAATTACAGGTTGATAAGGAAGGGCCAGTTGTACTTAGTCCAGAGTATGTGATGTGCGGCACAACTTCGCATGTGGAACCTCGCTTAACTTTCTCAGCAGACGGATTCAAGATCGAATACTGGGATTCTTGTGAAAATGATGAGATGGCAGCTCAATATTGGAAAATTTCTGATATTACCTGCATTGATTGTAAATGGGCACAGAGTGTAAGCAGTTTGTTTATTTAGTTATTATTGCCTCCCGTTATTTTATATAGCTTAATACTGGTTTATTTCTAATCAGGTTGGATCTGTCTTAATAACTCTCCATGTTGGATCCGGCACAGAAACTGGAAATTCTAGTATGCAATTTTTTTATTGTGCTTGTGGTCAAGATATTATATTTCAGATTTGATATTCTTTTCCTTATGCTCCGAAGCTAATGAAATTTACTGGTTCATATGTGACAGCGATGCATGTTAGGCATGAAATAGCACTGACTCTGTTGGTTTATTGGTTGCCGATTTAGACCTCTGATTTTGTTTTTCAGTTTTTTCTGAAAATACAAGCATTACCAAAGTACTTAAGTATTTTGTTTGTTTGGTTGATTTTGCTTTAATGCAGTTTTAATGACTTACAAGACGGCAAGACTAGAGCTAAATGTAAAATTTCTTCTCTATTTTGTAGAAAATGTAGGTTCCTGGACTTATATTCACTAGAAAGTGGAAACACAATACCATCATTGAGAAATAGTACAATAGTTATAATTTTAATGCATAACAATTTCCATTTGTTTGGTGAGGTTTTATTTTTTTCTTTGCACAGCCCTATTATTAACTAGCCTGACATGACTAAGAACAGTATGTTTGGTGTTTTCTCTTAATATCTTTCTAAGCAAGAATAATTTTATGAAGTCTTGCTTATTTTATGTTGTGAGATTTTGTTTCAGCTTACCATCTTGTTTCGGTTGCATGTAGTAAACTAGACTCTAATTTAGCACCGTTTAGAAACTATCCACTTTGCTAACAGATGCATGCAAGAATACATAGGTAACATGGATGATAATTTTTGAACTTCGGATTTAGATATTCCTTCATGTTTGTTACAGACTAATTTTCTTGTCTTGTTATCCTGTAGGTCATGATAGAATACAGTTTTGTCTTATTGATTCACAGTGGCCAAGGAAACAGCAAAACATTTGGCATCTTGCATCAAGATACCAAGAAATATGGAACAATATTCCATCGTAAGCTTTCTACTGATGGTTTGGTTTGTGTGTGCATGGGTTGTTCATATGCATTTTCATCAATTCATGATTTTCACTACAACATAGAGCTGCTAATAACCTCATAACGATGCATCATTAAGTTGGACACATTCATTTTTGATATTTTCCGTGCTATTCATGATTGCAAGGATAATACTGACTATCAGGGGTGTTAACTCTGAACTTCTTAGCTCAGAACAAATACTGGTCATACCAAGTGCCTGCCCGTATTTTAGCCTGTGTTTGCCAGGTTGCTAGGTTCTACTTGGGTTCCAGATTCGTTGTTCTAGGATAGGTCACATCCTATCCTAGGTTGAATTATTTCGGGATGGAGGGATTAGAATTGATGAAATAATAATTTAAGTTGTTTATAATTTTGTGGTAAGAGTTCTGTTATAAACGACTTTTCAGATTAGGTATGCCACAAACTCTGAGATGCTATGCAATATGTATTTTGGTATATATTATTTCATTAGTTCTGGGTTGGGGTATGGATATCAAGTCTTAAATATGAGCATATATTATGACAGATAATATTATTTTGCATTTTGAGGGAACATTTACATCTAATTCACTTTATGCTGACCGTTGCAGTTGAATAATTGTGGTGTACCTATATCCATTACATTCTTATTGTGAAGTTTGCTCTGTATTGTTAAAGTAATTCCGATTTTCAGTTGTGTTATTTTTATCATTGCTATAACAAAAAGCTTATGTAACTTCATGTATTTTCAGGGGTGATTTTGCATCAGAGAATTGGAACATTGAACCCAGTTTGTTTTTCCCTAAGCAATACTTTTCTGAGTGAGTATTTTACACACGTTTATCCTCGGTCTGTTTTCTGTTGTTTACAGTTGAACAATCTTAATATCAATGCTACAGGTTCATCTTCAGTGCTCATATGAAAGCGTTTTTGTTGATAAATTCCCAGCACACTTCATTCTTTTTTCTATCATGAGTTCCTGATGATAAAAATGCACACTTCTCATATCAAACATTTTTTTGTAGTACCTGAAATTGATTTTACTATCTGTGGTTCTATTTCCTGTAGAACAGAGGTGTCTGCATTTTTTCTCATTTG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