BGIOSGA019425

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA019425

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA019425, complete gene.

LocusTag

OsI_19040

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA019425-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA019425-PA

Length

11426

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:9199262..9210687

Sequence Coding Region

9199262..9199340,9204264..9204801,9205460..9205836,9206059..9206191,9206227..9206355
,9206601..9206672,9207201..9207355,9207454..9207677,9208007..9208133
,9209157..9209225,9209317..9209500,9209646..9209781,9210367..9210687

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:9199262..9210687 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:9199262..9210687 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCCGTCCTCTTCTGCCGCCGCTCTTCTCCTCCAGCTCCAGCTGCTGCTCGTGATATCGCTCTCCACTGCTCAGCCTGGTTTCATTAGCTTGGATTGCGGGGGAGATGGTGATTTCACAGATGACATTGGGATCCAGTGGACTTCCGATGACAAGTTTGTGTATGGTGGCAAGACGGCAAACCTCTCAGTCCAGAATGATCTCCCGAAGCAACTCAAAACCGTACGCTATTTTCCAGTAGACGACAGGAAATATTGCTACACCATGAATGTCAGCGAAAGAACACGGTACCTAGTTAGAGCTACTTTCCTCTATGGAAACTTCGAAAACAGCAATATATTCCCTAAGTTTGATCTCTCCCTCGGAGCAGCTCCATGGACAACTGTTGTAGTTTATGATGACACTACCCCAGCAGTGGTGGAGGCAATTATCTTGGCTTCTGCTCCAACACTCAGCGTCTGCCTCTCAAATGCCAGTACAGGACAGGCGCCGTTTATTTCCACTCTTGAGCTTCGGCAATTGAATGGCTCCCTCTATGAAACTGATTATGAGAATCAGTTCTTTCTTAAACTCTCTGCAAGGATAAATTTTGGTGCAGAAAGTAATGCATCTGTCAGGTACCCTGACGATCCATTTGATAGAATATGGCGATCTGATTTAGTGAGGAGAGCAAATTACCTTGTTGATGTTGCTCCAGGGATGGAAAGAATATCAACTAAAAGGCACATATCCATCAGAACTGATGGTGAAGAACCACCTGAAGAAGTCATGCGAACTGCAGTAGTTGGCCAAAATGGATCCTTGACCTACAGGCTTAATTTGGATGAAACCCCAGGAAATTCATGGGCATACGCTTATTTTGCAGAAATCGAAGATTTAGCCCCAAATGAAACTAGAAAATTTAAGTTAGCGATTCCAGAAATGCCCGAATACAGCACACCGACTGTTAATGTAGAGGAAAATGCTCCGGGAAAGTATCGGGCGTATGAAGCAGCGAACAATATGGCTATCTTGGTATCACGGTATCCTCAGGAAAGTTGGGCGCAAGAGGGTGGTGACCCATGCTTACCAGCATCATGGTCCTGGATACAATGCAGTACAGAAAAAGCGCCCAGGGTATTATCAATTTGTTCTTCACAATGTTTAGAGTTTTGGAAAGACAAGAATTATTTTCTTTTCCGCAGAACATTATCAGGAAAGAATATAACAGGAAGTATCCCTGTGGAACTAACAAAGCTACCTGGGCTGGTTGAATTTCACCTTGAGGACAATCAATTAACTGGTGCACTGCCTTCTTCTTTGGGTGACCTACCTAACCTGAAACAGTTCTTTTCAGGGAACAGTAACCTTCATGTGGCACACAATACCATTACTCACCCTGTAATAATTATTGTATGTGTGGTGATTGGGGCCTTTGTGTTACTTGTTGCTGCTGTTGGATGTTACTTGTTTGCATACAACAGAAAGAAGAAACCGTCAGATGCGCCAGCAAAACAGTTAAGTTCACCATTGAGTGAAGTAACCACGGAATCGGTGCACAGATTTGCTTTATCTGAAATTGAAGATGCTACTGACAGATTTGGTAGAAGAATAGGTTATGGAGGATTTGGCATAGTATACTATGGAAAGCTTGCAGATGGAAGAGAAATCGCAGTCAAGCTTCTCATAAACGACTCCTATCAGGGCACCCGAGAATTCTTGAATGAGGTAACTTTGCTTTCCAAAATACATCATAGAAACCTGGTGAGCTTCCTTGGTTACAGTCAGCAAGATGGGAAAAACATACTTGTGTATGAATTCATGCATGAAGGAACACTAAAAGAGCACATTCGTGGAGGACCTGCTTATGTAAAAGTAACTAGCTGGGTCAAGCGTCTGGAGATAGCTGAAGATGCCGCAAAAGGAATAGAGTATCTCCATACAGGATGTTCCCCAACTATCATCCATAGAGATCTCAAGAGCAGTAACATTCTCCTTGACAAGAACATGAGAGCCAAAGTTGCAGACTTTGGCATATCGAAACCTGTGGTTAGTGGTTCCCATGTATCAACCATGGTTCGAGGAACATTTGGATATCTAGACCCAGAGTACTATGGCTCACAGCAGCTAACAGAGAAGAGTGATATCTATAGTTTTGGTGTCATTTTACTGGAGCTAATCTCAGGCCAGGAGCCAATCTCAGATGACCACTTTGGGCCTCACTGTCGTAGCATTGTTGCATGGGCTACCTCACACATCGAGAGCGGGAACATCCACGCCATCATTGATCAGTCGTTGGACACTGGCTACGATCTGCAGTCAGTGTGGAAGGTCGCGGAGGTGGCAATAATGTGCCTGAAGCCGACGGGCAGACAGAGGCCATCCATGTCGGAGGTTCTCAAGGAGATCCAGGATGCCATTGCCCTCGAGCGGGGAGGACGGGAGCTTGTCCCCAGCATCCAGCACCCCGTGTCCAAGTGCTCACCTTCTGTAAACATGGACAGTGTGGTATTGGAGCAGAATTCGCGGTTCGATGAGCTGCTTGAGCTGCCAGGTCTCAGGTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPSSSAAALLLQLQLLLVISLSTAQPGFISLDCGGDGDFTDDIGIQWTSDDKFVYGGKTANLSVQNDLPKQLKTVRYFPVDDRKYCYTMNVSERTRYLVRATFLYGNFENSNIFPKFDLSLGAAPWTTVVVYDDTTPAVVEAIILASAPTLSVCLSNASTGQAPFISTLELRQLNGSLYETDYENQFFLKLSARINFGAESNASVRYPDDPFDRIWRSDLVRRANYLVDVAPGMERISTKRHISIRTDGEEPPEEVMRTAVVGQNGSLTYRLNLDETPGNSWAYAYFAEIEDLAPNETRKFKLAIPEMPEYSTPTVNVEENAPGKYRAYEAANNMAILVSRYPQESWAQEGGDPCLPASWSWIQCSTEKAPRVLSICSSQCLEFWKDKNYFLFRRTLSGKNITGSIPVELTKLPGLVEFHLEDNQLTGALPSSLGDLPNLKQFFSGNSNLHVAHNTITHPVIIIVCVVIGAFVLLVAAVGCYLFAYNRKKKPSDAPAKQLSSPLSEVTTESVHRFALSEIEDATDRFGRRIGYGGFGIVYYGKLADGREIAVKLLINDSYQGTREFLNEVTLLSKIHHRNLVSFLGYSQQDGKNILVYEFMHEGTLKEHIRGGPAYVKVTSWVKRLEIAEDAAKGIEYLHTGCSPTIIHRDLKSSNILLDKNMRAKVADFGISKPVVSGSHVSTMVRGTFGYLDPEYYGSQQLTEKSDIYSFGVILLELISGQEPISDDHFGPHCRSIVAWATSHIESGNIHAIIDQSLDTGYDLQSVWKVAEVAIMCLKPTGRQRPSMSEVLKEIQDAIALERGGRELVPSIQHPVSKCSPSVNMDSVVLEQNSRFDELLELPGLR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..79#5003..5540#6199..6575#6798..6930#6966..7094#7340..7411#7940..8094#8193..8416#8746..8872#9896..9964#10056..10239#10385..10520#11106..11426#ATGCCGTCCTCTTCTGCCGCCGCTCTTCTCCTCCAGCTCCAGCTGCTGCTCGTGATATCGCTCTCCACTGCTCAGCCTGGTGAGTGATTCTTTTTTATATATAAAACCCGGCCTCAGCTATATACAACGGTATATGCAGCCAATGGTGAGTGAATATAACCATTAGGGAAACTACTTCATTTCTGCAGTCCTTAATTTACTTGGGACTCCTTTTCGAACCGATATAACGGCCTTTACAATTGAGACTGGATGGACCTGCAGTGGAGTGGGTGTTGGCAGAATTTCATTTGCTCCGGTTAGAGTAACAATGCAGTCATAAGTCACAGTACACCACCTCATAAAATAGCTATCATAAAATTGGTGCTGATGCTAGCTATCACTGAACCGGCAGTGATAGTCTGGTCTAAACATTGAGTTTTGCAGGTGTGAATACGTGCTCAGAAGGCTTCTTTTTTATTTTTTTATCACATGTACGATTTCTCACAATAGACGCAACCCATCAAGAAAAAGGGAAGGAAGAAGCAGTAAAATCACGGGGTGAATCTACTCACAGAAGCATAGTGCCAAACTCCAGTCTAAAGAGCAGCTTCGCATCGGGCTACGTCTACCACCGCTTGAACTGGGACGAGCTAGTGCACCATTGAGACACGGGTATATATATTTATAGCAGTCTAAAAGGGTTGCGTAACATTAGACAAAAGTGAAAACAAAAGACATAAGGATGGACGGAGTACTCTTCTTCACGTTTTTCAACTGTACACAAAGCCTCTCCTCTCCTCCCTTTTCATATAGCCAATTCTTATCCTATCTTAGTATGAAGTTACAACTCACTAAATACTAAAGCTTAACATGCCAATATGTCACATCATCATCGACAAACAATTATTATATTTAAAAATCATGCAACATGCTATATTATCTGTAATTTTATAATTTATTAAGTTTTAGAGCTTTTAAAATACAAGCATGTTAAATTATTATCCCACATAATTCACATGATATTTCAATATATCTCTTCATCATTTTTTAATTATAATATCCTATATACCTATATAGTTCATTATCACTTAGTTAATGTTATTTCTCTCTACTCTCATTAAGCCATATCACATAAATTGTTTTTAGACTTTAGATAATTAATTTATGATCCAAATTATCTCCCTCCTTTTTTTATCCCATTAAGTCATATCACCTCAATTATTTTTAAGCCCTTTGATGATTAATTTATGGTCTAAAGTATCTTCATCATTTTCTTCTCTCGTAAAACCACATCACCTTACTTTTACATTTGAATCATTATTCTATATACTATTTAACTTTAAATTATCACAAAACATATCAACTTACATAAGCTTATATTGTCTAGCTATCTTACACGTTATTTTTACTTATTGTTATCATAATAAACTTTCGTAGCAACCCGTGGGGTTTCACCTAGTATATAGAAAGTAGGGTGACGTCCAATTAGTGTATTGAGCTGGCCTTGATGGGCCAAAACCTCAGTTTCTCAATACCCCCTTGATCCTTCACCACATATTGCTTATGTCTCATTAAAACTCCATAAAAACCTAGTGGGAAAAATTTGGAGAAAGAGTACATAGCATACATTCTATGTGTTGCACGGATAACGGATTACCTCGTTAAAAACCTTTATAAGAAATTACAGGAAAACTTATGTAAGGGAAAAAGTTTACAAGCCAACCAATTACTCTTATTGGGAACTTTGTCATTCCAGACTAAGTTTGGGAAGTGCGTCAACGAAATTCTATTCTTGAATTTTGCACTTCTCTACGTCTCAACATCCCGATCCCCTAGATGCATCTCTCAAAAAAGGATGACGATAATGAATAGTGTATAAATCTGTGAGATTATCAAAGGACACGGTATGCAATACTTTAATTACATTTGTCTTATGATATTCGTGAGCATAAAAGAACTTGGGTTTCATATGCTTCGTGAGATTGCTTTTCACGTAACCAATTTGCACTTTGCGTAACACGGGTTGCATTATCTCATAGATAATTGTAGGGGTCTAGATAGTGTTCAATTCACATAATTGCTGAATGTGGTGAATCATCATGCGGACCCATGCACATTCGTGAGAGACTTTGTATAGTGTGATGATTTCTGAGTGGTTCATTGAAGTTGCTAATTGGCTTTGACGATTTCCAAGAAATTATTGTTCCTCCACATAGGAAAACATAGCAAGTCTGTGACTTGGCTGTATGTGGGTCTAACAGGTACCCAGTATGTCCATATCCTATCAAGGTGAGATCCCGGTTCTTTCTGTAGATAGTCCCATGTCCTTACTTCCTTGAAATAACAGAGGATGTCCTTGAAGAGCGATGAATGGATGATGCAAATTTGGATAACGGAGATAATGCTTGCTCTCTCTTAGTCCCCTTTCACCTCTATTATACGGAGTGTCGTCGAGCTCAGCCAATTCGATGTCCATTTTGTCCCACGAACGACTATCAAGTCTCAGGTACTCATAGGTTTTCATCGCCAACCAGACCGTCCTCAAGGACGGCAAGGTTGACCGTAGGTTTTCATCGCCAACCATATCGTCCTCGAGGACAGCAAGGTTGACCGTACAGATAGCAAGTGAAGGACAATGGCCTTCGACGAAGCATTCAACAGTCAAGAAGTAGGAGCTGGATCCAATTGGATTTCCGAGCAACCAACAACACTACAGAGTACGAAAGACATCTCGTTGGACTAAGAGCAGCCGCGTCACTTGGGTTCAAATGACTAATTATGAAAGGGGACTCAGAACTAGTCACCAACCAAGTACGCAAGGATTACAAATGCTCTAATCCCGAATTGTCCAAGTACCATGCAAAAAGTAAGAAAGTTGGAGCATAGGTTTGACGGGTTCGAAGTGCACCATGTCTATTGCAAAGACAATGCTAACACTGACAACCTCGACTGATTAGCTTCTAGACGAGAGCTGGTGGAAACCTGGCACATTTCTAGAAGTATTAACCAGTCCATCAGTTAAGGTTTTTCCTAGACGACTACATCGATAGCACCACCAATGTTGGCTCGGGGGCTACTACTCAAGTTGACAGAATCTATGCAAACATCTAGACTACTCAGGATTAGCCTACACCACTTATCGATTTCCTCAACACTGACAAGTTACTAGAAGACGACACAGAAACAGAAAAAAAACAACTCTCACGACAAGCCACGACCTATTGTACGATTAGGGACGATATTTACAAGACAGGCCACAAATGGAGTACTGCTAAAGTGCATCACTTCTGACGATGGCAAAGAGTTGTTTCTCGACATCCATGAAGGAATCTACAGGTACACGTCGACAGGCGAATACTGGTTGGGAAAGTTTTCCGACAAGGTTTTTACTGCCCAACAGCTTCCCAAGACACTTCTGACATGGTACAACGGTGTGAAGCTTGTTAGTTAATAGCAGACACACCAAGTTACCAGCTCAAGCTGCCCAAACCATCCCTCTGTCCTGGTCATTTTTGTGCCAGGGGCTTGACATCCTCGAACCTTTTCCATGAGGACAAGGTGGCTACAAAATTCTTATTCGTGGCTATTAAAAATTCACTAAGTGGATATAAGCGAAGCCAACAAGAGAAATGAAAACTGAGCAAACCATCAAGTTCATCAAAGAGATATTCTACCGATATGGGCTCCCAAATCAGATATTGACTGACAACAGCTCCCAATTCACAAGTGGCGCCTTCCAGTATTACTGCTTGGAACTTGCAGGCGGCGATGTGCATCGTAGATGATGCCACGGCCGCCGCGGATGGGGGCGGCGTCGCCTCCTTCCTCTCCTCCCACCGCAACCGCCCCTGTGTGTCACCCTCCCACTCCACGACTCTCACCTCCTCCTCCTCCTCGTCGTCGTTGTCCTCATCCTTCTCTCACTTCCGGCGGCTGCGGATGTATGCTCCACCTCGCCGCTTGGGCGCTCGCCGCCGTCGTGCCATACCCCGACCGCGTTGCCCGCCTCACCGCCACGCCTGTCGCCGGTCATCGGCCACTGCCCGCCACGCCCGCCAGCTGAGGCCGTCCTCGAGAGGGAGGAAGAGGGGAAAGAGAGGGGGAGAGAATATGACAGTGGGGCCGTGTCAGGGGTATTTTGGTCTGGGAAAAAAATAAAATTGAGCAAAAACATTTCTATTCACGAAAAAGAACGAAAATATTATTTTGGTAAATACCACTCAGTTTAGGATAACATTATCGTGAATAACTTTGAAGCGATGGCATTCCAACGAAACCACTGCGACTGTGTAATCCCAAATTTCTCATTTTCAACCCCTCCCTCCAGCTCCGACCACCACCAGTGCCGCCATCCAAAATCCTCACTCAAGTCAAGGCTACCGGCGCTAGACAACATCACCTCCGGCGACCAGCGCCGCCCTTCCCTAGCCCTACCGCTGCCGACCTTCCCTCCACCCTCGGCCACCGGTGCTGCTCATCCGGGTCGTCCCCAGCCTCCATCAGGCGCTTCCTTTAGCCCCCGGAGACCGGTCACCGTAGAGCCTCCAACGCCGCTACCTCCTCCAACCGGCGCTGCCCTAGCCTCCTCCACTACCACTAGTGCTTCCCCTTCCCGGCCCGCTGCACCTGCACGATTCCATCTAGCTAGCAGGCAGGCACAGATAGGAGAGGTCGCCGGGGACAGTGGGTGCTGGGAAGGGGCGGCGCTGTGATTGAGGGGAAAGTGAGGAGGCCAACTCCATGGCTGGAGGAATTGCAGTTTTACCTCTCCACACATATTGGGATTCGATTATTTGTTGCTACATTGTTATTCACCTAAATGTTCCATGTGTCATTGTTATGCGGTGGCAGCATAATCGATTC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External Link(s)

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