BGIOSGA020105
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA020105 |
|---|---|
| Description |
BGIOSGA020105 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020105, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA020105-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA020105-PA |
| Length |
4573 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:25815233..25819805 |
| Sequence Coding Region |
25815233..25815308,25815391..25816389,25816477..25817240,25817315..25817473,25817842..25818013 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:25815233..25819805 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:25815233..25819805 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCTTCTTTTTCTTGTCCAGGGAAAAGTTCAGGTTGTAATTAACGTGCACAAGGCAGCGCTGCAATTTATTGATGGTGTAAAACGATACCCCCTACCCAATGAACTTATTGAAGAAGGATTTTGTATCAGTTCAGATGAACTAGCAGCAATTGCTAACATGCGTGAAGATACTACAAACGTCAGGATGCATGGTGGAATCAATGGAATATCTAGAAAAATCAAAGCATCATTGGAAGATGGTATCAGCGAAACAGATATAGCAACCAGACAGATGCTGTATGGAGCTAACAGGCACGCTGAGAAGCCCCCTAGAAGCTTCTGGATGTTTGTCTGGGATGCATTGCATGACTTGACGCTGATTATTCTAGTGGTCTGTGCTCTGGTTTCTCTAGTGGTCGGCCTCGCCACCAAGGGATGGCCGATGGGTATCTATGATGGCCTTGGCATAATACTCAGCATTTTGTTGGTGGTACTAGTTACAGCATCCAGTGACTACAGGCAATCACGGAAGTTTATGGAGCTGGACCGTGAGAAACAGAAGATATATGTCCAAGTCACCAGAGATAAGAAAACCAAGAAAGTATTGGTTCATGACTTGGTTGTCGGAGACATCTTGCATCTTTCTATAGGCGATGTGGTTCCTGCAGATGGTCTGTTTATATCTGGTGACTGCCTAATGATAGATGAATCAAGTTTGTCTGGTGAGAGTGAGCCAGTTAATATTTCTGAAGAGAGGCCTTTTCTTCATGCTGGGAATAAAGTAGTAGATGGGGCAGCTAAGATGCTTGTTACTGCCGTTGGTACGCGTACTGAGTGGGGCAAAATCATGGGTACTCTGAATGGAGATGGTGTGGATGAAACTCCTTTGCAAGTTAAGCTTAATGGCGTGGCTACAATAATTGGCCAGATTGGATTGGTGTTTGCTGTGCTAACATTTTTGGTACTTCTAGCGAGGTTCTTGGCTGACAAGGGAATGCATGTTGGTTTGTTAAATTGGTCTGCAAATGATGCATTGACAATAGTCAACTACTTCGCTATTGCAGTCACAATCATTGTTGTCGCAGTCCCTGAGGGTTGGGATGGGGATGTCAAGTTTGTTGGGGACAAAAAAAATTCTGAGCTAAAAAGCACGATTTCAGAAAGAGTTATGGCGATCCTTATACAAGGCATATTTGTGAATACTGCGTCTGAAGTGGTGAAGGGAGACGATGGAAAAAATACCATCTTAGGCTTGGCTACTGAAACGGCATTATTGGAGTTNGGCTTGAGCTTGGAAGAACATTTATATGATGACTACAATAAGTTGACTAGAATAAAAGTAGATCCTTTTAATTCAGTTAAGAAAAAGATGTCTGTGACAATACAATTACCTAATGGAGGCATCAGGACCTTCTGCAAAGGTGCGTCAGAAATTATTCTGGAACAGTGCAATACTATCCACAATACTGATGGAAATATAGTACCGCTGTCAGAAATGCAGAAGCATAATGTATTAAATATAATCAATTCGTTTGCTTCTGAGGCATTGAGAACACTTTGCATCGCATTTAAGGATATGGATGAATTTCCCAATGATCAACCTATATCAGATGATGGTTACACACTAATAGCAGTTTTTGGTATAAAGGATCCAGTCCGTCCTGGTGTCAAGGATGCAGTAAGGACCTGCATGGCTGCTGGTATTAGAGTAAGAATGGTGACGGGAGACAACATCAACACTGCTAAAGCTATTGCCAAGGAATGTGGAATATTAACGGAGGATGGAATAGCAATAGAAGGACAACAGCTTAACAATAAGAGCTCAGATGAACTGAAGGAACTCCTACCAAAAATTCAGGTAATAGCTCGCTCCTTGCCTATGGACAAATACAAATTGGTGACAAGCCTGAAAAGTATGTATCAAGAGGTTGTTGCGGTGACTGGTGATGGAACCAATGATGCCCCAGCACTGCACGAGTCAGATATTGGACTAGCAATGGGTATCACTGGAACTGAGGTTGCAAAAGAGAGCGCTGATGTTATAATAATGGATGACAATTTCGAAACCATTGTAAATGTTGCTAGATGGGGCCGTGCAGTTTACTTAAACATCCAGAAGTTTGTGCAGTTCCAGCTTACAGTTAATATTGTGGCTCTGATTGTGAATTTTGTCTCAGCGTGCATCATAGGGAGTGCACCACTTACTGCTGTTCAGTTGCTATGGGTGAACATGATTATGGATACGTTGGGAGCCTTGGCCTTAGCCACAGAACCACCAAATGACGAAATGATGAAGAGGCCCCCTGTTAGGCGAGGAGATAATTTTATCACTCGGATTATGTGGAGAAATATTCTTGGCCAAGGTTTGTATCAGCTCCTTGTGCTGGCTACTCTAATGGTTATTGGAAAGAAACTCCTTAGTATTGAAGGTCCTCAATCTGATAAAACCATCAATACTCTCATATTCAACTCTTTCGTCTTTTGCCAGGTTTTCAATGAAATAAATTGTAGGGAGATGGAAAAGATCAATGTCCTCCAAGGTATCTTCAGAAACTGGATCTTTGTTGGTATATTGACAGCTACTGTCATATTCCAAGTGATCATAGTAGAATTTCTTGGCACTTTTGCAAACACTGTACCATTGAGCGGGGAGCTGTGGCTGCTCAGCGTCGTCATTGGCTCAATTAGTATGATCATCTCTGTTATCCTCAAGTGCATTCCAGTTGAATTTAATAAGACAAATACTAAACCCCATGGTTATGAGTTGATTCCTGAAGGCCCAGAGATTCTATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLLFLVQGKVQVVINVHKAALQFIDGVKRYPLPNELIEEGFCISSDELAAIANMREDTTNVRMHGGINGISRKIKASLEDGISETDIATRQMLYGANRHAEKPPRSFWMFVWDALHDLTLIILVVCALVSLVVGLATKGWPMGIYDGLGIILSILLVVLVTASSDYRQSRKFMELDREKQKIYVQVTRDKKTKKVLVHDLVVGDILHLSIGDVVPADGLFISGDCLMIDESSLSGESEPVNISEERPFLHAGNKVVDGAAKMLVTAVGTRTEWGKIMGTLNGDGVDETPLQVKLNGVATIIGQIGLVFAVLTFLVLLARFLADKGMHVGLLNWSANDALTIVNYFAIAVTIIVVAVPEGWDGDVKFVGDKKNSELKSTISERVMAILIQGIFVNTASEVVKGDDGKNTILGLATETALLEXGLSLEEHLYDDYNKLTRIKVDPFNSVKKKMSVTIQLPNGGIRTFCKGASEIILEQCNTIHNTDGNIVPLSEMQKHNVLNIINSFASEALRTLCIAFKDMDEFPNDQPISDDGYTLIAVFGIKDPVRPGVKDAVRTCMAAGIRVRMVTGDNINTAKAIAKECGILTEDGIAIEGQQLNNKSSDELKELLPKIQVIARSLPMDKYKLVTSLKSMYQEVVAVTGDGTNDAPALHESDIGLAMGITGTEVAKESADVIIMDDNFETIVNVARWGRAVYLNIQKFVQFQLTVNIVALIVNFVSACIIGSAPLTAVQLLWVNMIMDTLGALALATEPPNDEMMKRPPVRRGDNFITRIMWRNILGQGLYQLLVLATLMVIGKKLLSIEGPQSDKTINTLIFNSFVFCQVFNEINCREMEKINVLQGIFRNWIFVGILTATVIFQVIIVEFLGTFANTVPLSGELWLLSVVIGSISMIISVILKCIPVEFNKTNTKPHGYELIPEGPEIL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..76#159..1157#1245..2008#2083..2241#2610..2781#3290..3588#4268..4573#ATGCTTCTTTTTCTTGTCCAGGGAAAAGTTCAGGTTGTAATTAACGTGCACAAGGCAGCGCTGCAATTTATTGATGGTGTGGTCTCAACTAATTATTTCTGGTTTCTGCTCTTATCATAATCACAATATGTCATTTCACCTTATATCTAATGATGCAGGTGTAAAACGATACCCCCTACCCAATGAACTTATTGAAGAAGGATTTTGTATCAGTTCAGATGAACTAGCAGCAATTGCTAACATGCGTGAAGATACTACAAACGTCAGGATGCATGGTGGAATCAATGGAATATCTAGAAAAATCAAAGCATCATTGGAAGATGGTATCAGCGAAACAGATATAGCAACCAGACAGATGCTGTATGGAGCTAACAGGCACGCTGAGAAGCCCCCTAGAAGCTTCTGGATGTTTGTCTGGGATGCATTGCATGACTTGACGCTGATTATTCTAGTGGTCTGTGCTCTGGTTTCTCTAGTGGTCGGCCTCGCCACCAAGGGATGGCCGATGGGTATCTATGATGGCCTTGGCATAATACTCAGCATTTTGTTGGTGGTACTAGTTACAGCATCCAGTGACTACAGGCAATCACGGAAGTTTATGGAGCTGGACCGTGAGAAACAGAAGATATATGTCCAAGTCACCAGAGATAAGAAAACCAAGAAAGTATTGGTTCATGACTTGGTTGTCGGAGACATCTTGCATCTTTCTATAGGCGATGTGGTTCCTGCAGATGGTCTGTTTATATCTGGTGACTGCCTAATGATAGATGAATCAAGTTTGTCTGGTGAGAGTGAGCCAGTTAATATTTCTGAAGAGAGGCCTTTTCTTCATGCTGGGAATAAAGTAGTAGATGGGGCAGCTAAGATGCTTGTTACTGCCGTTGGTACGCGTACTGAGTGGGGCAAAATCATGGGTACTCTGAATGGAGATGGTGTGGATGAAACTCCTTTGCAAGTTAAGCTTAATGGCGTGGCTACAATAATTGGCCAGATTGGATTGGTGTTTGCTGTGCTAACATTTTTGGTACTTCTAGCGAGGTTCTTGGCTGACAAGGGAATGCATGTTGGTTTGTTAAATTGGTCTGCAAATGATGCATTGACAATAGTCAACTACTTCGCTATTGCAGTCACAATCATTGTTGTCGCAGTCCCTGAGGGTCTACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGACCACGAACCACATGATTGTTGATAAGGTTGGGATGGGGATGTCAAGTTTGTTGGGGACAAAAAAAATTCTGAGCTAAAAAGCACGATTTCAGAAAGAGTTATGGCGATCCTTATACAAGGCATATTTGTGAATACTGCGTCTGAAGTGGTGAAGGGAGACGATGGAAAAAATACCATCTTAGGCTTGGCTACTGAAACGGCATTATTGGAGTTNGGCTTGAGCTTGGAAGAACATTTATATGATGACTACAATAAGTTGACTAGAATAAAAGTAGATCCTTTTAATTCAGTTAAGAAAAAGATGTCTGTGACAATACAATTACCTAATGGAGGCATCAGGACCTTCTGCAAAGGTGCGTCAGAAATTATTCTGGAACAGTGCAATACTATCCACAATACTGATGGAAATATAGTACCGCTGTCAGAAATGCAGAAGCATAATGTATTAAATATAATCAATTCGTTTGCTTCTGAGGCATTGAGAACACTTTGCATCGCATTTAAGGATATGGATGAATTTCCCAATGATCAACCTATATCAGATGATGGTTACACACTAATAGCAGTTTTTGGTATAAAGGATCCAGTCCGTCCTGGTGTCAAGGATGCAGTAAGGACCTGCATGGCTGCTGGTATTAGAGTAAGAATGGTGACGGGAGACAACATCAACACTGCTAAAGCTATTGCCAAGGAATGTGGAATATTAACGGAGGATGGAATAGCAATAGAAGGACAACAGCTTAACAATAAGAGCTCAGATGAACTGAAGGAACTCCTACCAAAAATTCAGGTTTAGTTGTACTCTCTTGTTTTCTTTTCATTAATTAAATGCGAATATAAGCTAAATCTATGTCCCAAGCTCAGGTAATAGCTCGCTCCTTGCCTATGGACAAATACAAATTGGTGACAAGCCTGAAAAGTATGTATCAAGAGGTTGTTGCGGTGACTGGTGATGGAACCAATGATGCCCCAGCACTGCACGAGTCAGATATTGGACTAGCAATGGGTATCACTGGAACTGAGGTATCTATGAATGTTTTTCGGTAATTTATGTTGTTTTATTCCTCTATGACCTTAATATGTTCGGTTTGAGCGTGTCTTGAAGTGAGAACTGGGAAATGCCCTTTAGTCTAAACCAATTTTCTACAAGGGCTTATCTATATCCTGACTTAATAATAATATTAGCTGTATTTTTTAAAAACATATTCCTAGATGTTTAATATTGTCAGTGCTAAAAAAAGGAGCAAAAGGTAAAAAAATACAATTTAATTATTTTGCATAAGGTCGATTTCCTTGGCTGTAACAGTATTCATCATTGTTTAGTGACATTTGATTTTCCGTGTATGATATATCTGTGGACAAGTTGTGATGCAAGTTTTATCTGTTTGCAGGTTGCAAAAGAGAGCGCTGATGTTATAATAATGGATGACAATTTCGAAACCATTGTAAATGTTGCTAGATGGGGCCGTGCAGTTTACTTAAACATCCAGAAGTTTGTGCAGTTCCAGCTTACAGTTAATATTGTGGCTCTGATTGTGAATTTTGTCTCAGCGTGCATCATAGGTATTAGCACACTTGCTACCACTCTAATATTATTGATCTAATGATGACTGTTTGAAATGAATGTGTATTGTTTTCTAGAATAAATTCGTATGCATTTTATTTGGAATGCACATGCAACTTATGATATAATATTTCCTTTTTGCTACACATTTTAATAATAAAGTCATATATATTGTTATTATGGCTGGAAATAGAGGATTGATAGGGTAGATCGCCCTCAAGTCGCTGGCTTCTCCGGAAGACCGAGGCTTTGATCTGTTTGGCTTGGTGGGCAAAATCCTTAATATCTTTATTGCTTAAGTCCCTAATACAATAGCAGGCCCCCTTTATATACTAGGTGCCAGTCTAATATTTAGGAAATCTAAGACAAACTAGGAATAGGAAACAGAATCCTAAACCAACTAGAATTAGATATATCTACTGATTATTCCTATTCCTATTCCTATGGTATTTGATTCCATAACGCCGGTCTATAATAATTGTCCTCTCTTCTTCCCTTTACTTGAAGGGAGTGCACCACTTACTGCTGTTCAGTTGCTATGGGTGAACATGATTATGGATACGTTGGGAGCCTTGGCCTTAGCCACAGAACCACCAAATGACGAAATGATGAAGAGGCCCCCTGTTAGGCGAGGAGATAATTTTATCACTCGGATTATGTGGAGAAATATTCTTGGCCAAGGTTTGTATCAGCTCCTTGTGCTGGCTACTCTAATGGTTATTGGAAAGAAACTCCTTAGTATTGAAGGTCCTCAATCTGATAAAACCATCAATACTCTCATATTCAACTCTTTCGTCTTTTGCCAGGTATGTGAACTACAAGTCCCTTTTACATGCAAATGAGTCAATTTTGTTGTTTTTGTCTATGGATTTTATTTATGTTTGATATTTCAAGTTCTCATATTATAATTGACAGGCTATCATTTACATTATTCTCGGCCATTTCAGATGTCATGTTCACTTTGTAGAGGCTAAGACATTTAATTCTGTGCAAAGCTCATTGACATGTGATATCTGATAATAATTTTCAATATGCCATGGACTCTCTGATGACTTCAGCAAACCATAGAAAATAATCATGTAGTAATCAGTATATGTTTTTCCATTTTCGTTAGAAAAACGATCCAGACAAATTTAATAATTTTCAGAACAAAACAAAGCTTTTTCCGTGCGCATTTCACATATCCTGATGCTATGGTTCTATAAAATGCAAGTGCAAAGTACAGGCAATATTCATTAAACAAGTGATCTATTGTGGAAATTAGGAATCAGTGCTTTATTTTAATGGTAATTTTACCATCCTTGAGAAGGTATCGGGAGGTAACACATTTTCTAGTGTAAAATTTGGTACATTCAGGTACTAAAATACCTTGAGTATAAAAAAGTTTTGTGTAAAATTTAGGTACCTTGAGGTACTTTCTCAAGGAAGGTAAAATTTCTCTTATTTTAACGGTAAGTTTCATCTGACATGTTACCATGCTTCCAGGTTTTCAATGAAATAAATTGTAGGGAGATGGAAAAGATCAATGTCCTCCAAGGTATCTTCAGAAACTGGATCTTTGTTGGTATATTGACAGCTACTGTCATATTCCAAGTGATCATAGTAGAATTTCTTGGCACTTTTGCAAACACTGTACCATTGAGCGGGGAGCTGTGGCTGCTCAGCGTCGTCATTGGCTCAATTAGTATGATCATCTCTGTTATCCTCAAGTGCATTCCAGTTGAATTTAATAAGACAAATACTAAACCCCATGGTTATGAGTTGATTCCTGAAGGCCCAGAGATTCTATAG</dnaseqindica> |
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