BGIOSGA020330
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA020330 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020330, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_20922 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA020330-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA020330-PA |
| Length |
13502 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:28896968..28910469 |
| Sequence Coding Region |
28896968..28897348,28897463..28897597,28897685..28897798,28897912..28898064,28898159..28898259 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:28896968..28910469 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:28896968..28910469 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGGCGGCGCAGGGCCTTGCGCTGAAGCTGCGCGCCGCGCCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGTGGCGTCCGCGGGGAGAAGCGGCGCCGCGCGGCATCGGCGACCGCGGCGGCGGCGGCGCGGCCTCGCCACGGCGCCATGTCGCTGGAGGGCGGGTTCCTCGGCGGCGCGCTCCCCGCCGAGGACCGGGTGGCGCCGCGGGCATCGGCGTCGCGCCAGGCGGAGGCGGGGGCTGGGGCGGGGGCGGCGCGTCCTCCTCCCAGGTCGATGTCGAAGATCCCCGAGAGCAGCATTGGGCTGTACGACCCCTCCATGGAGCGCGACTCCTGCGGCGTCGGCTTCATCGCCGAGCTCTCCGGCGAGTACAACCGCAAAACGGTCGACGACGCCATAGAGATGCTCGAGAGAATGGCTCACCGTGGCGCCTGCGGCTGCGAGAAGAACACCGGAGATGGCGCAGGCATCCTCATCGCTCTGCCGCACAACTTCTTCAGAGAGGCAAACCTACTTGAAGTCACGAAGGACGCAGGTTTTGAGCTTCCGCCGCCTGGTGAGTACGCCGTCGGGATGTTTTTCATGCCCACAGATGACAAACGCCGTGAAAAGAGCAAGCTTTTGTTTCGTGAGAAAGCAGAGTTGCTGGGGCATACCGTCCTCGGCTGGCGCCGGGTTCCCACAGACAACTCGGGCTTGGGTCAATCAGCGGTAGATACAGAACCAGTGATTGAGCAAGTGTTTGTCACCAAAAGTGCAAGTTCAAAGGCTGATTTTGAGCGGCAGATGTACGTCCTACGGAGGTTCTCAGTTATGTCCATACGAGAAGTTCTAGGCGTCAAGAATGGCGGACCAAAAGATTTCTACATGTGCTCTCTATCTTCAAGGACCATTGTTTATAAGGGTCAGCTTAAGCCAAGCCAACTCAAGGGGTACTTCTTTGCAGACTTAGGCGATGAAAGCTTCACAAGTTACATGGCACTGATCCACTCAAGATTTTCCACGAACACCTTCCCTAGTTGGGATCGAGCGCAACCAATGCGTGTTTTGGGGCATAATGGCGAGATCAATACCCTTAGAGGGAACAAGAACTGGATGAAGGCACGTGAGGGTCTCTTGAAGTGCGAGGGACTAGGTCTAACAAGGGATGAAATGTTGAAACTTCTGCCGATAGTGGATGCTACATCTTCGGATTCAGGTGCAATCGACAATGTTCTTGAGCTTCTCATACAATCTGGAAGAAGTGCGCCAGAGGCTGTCATGATGATGATCCCTGAGGCGTGGCAAAACGATGTTAACATGGACCCTGAGAGAAAAGCTTTGTATGAGTTCTTTTCAGCACTTATGGAGCCTTGGGATGGACCAGCTCTAATCTCATTTACTGATGGCCGCTACCTTGGTGCGACCCTTGATCGTAATGGTTTGAGGCCAGGCCGGTTTTATGTGACCTACAGTGGCCGTGTAATTATGGCTAGTGAAGTTGGTGTGGTCGATGTTCCTCCTCAAGATGTTTCAAGAAAGGGTAGGCTAAACCCTGGAATGATGCTTTTAGTTGATTTTGAGAACCATTGTGTTGTGAATGATGATGAATTGAAGAAAGAGTACTCCAAAGTTCGTCCATATGGAGAGTGGCTGAAAAGACAAAGGATACAACTCACAGATATCATAGAATCTGTAAATGAAGCAGAGAGAATTGCACCGAGCATTTCGGGTGCACTTCCAATTACAAAGGAGAACAAAGCAGATATGGGTATCTGCGGAATTCTGACTCCGCTGAAGGCTTTTGGGTATACAAGAGAAGCCCTTGAAATGCTGATGCTACCGATGGCCAAAGATGGACAAGAAGCTCTTGGATCAATGGGAAATGATACTCCTCTAGCTGTGATGTCAAACAGAGAGAAGCTGACTTTTGAATACTTCAAGCAGATGTTTGCACAAGTTACAAACCCACCGATTGACCCGATCCGGGAGAAAATTGTCACATCTATGGAGTGCATGATTGGTCCTGAAGGTGACTTGTCTGAAACAACAGAGCGGCAGTGCCATCGCCTCACGCTTAAGAGTCCTTTACTGAATACAAATGAAATGGAGGCTATTAAAAAGATGAACTACCGGGGTTGGCGCAGCAAGGTGCTTGACATAACTTATCCTAAAAAGAATGGCAGGATGGGCTTAAAACAGACTTTAGATAAAATTTGTGCTCAAGCACGTGAAGCTATTCATGAGGGCTACACTATTCTAGTTCTCTCTGATAGAGAGCGTGTAGCTGTCAGTTCCCTATTGGCAGTTGGAGCTGTCCATCAGCACCTTGTCTCACATCTTGAGAGGACACGCATAGGATTGTTAGTTGAATCTGCTGAACCTCGCGAAGTGCACCATTTTTCCACCCTTATTGGATTTGGTGCTGATGCTATATGCCCTTATTTAGCTATAGAAGCAATATGGCGGTTGCAAATTGATGGGAGGATTCCTCCTAATGATGGGAAACCTTATACACAAGAACAACTTATCGAGAAATATTTTTATGCTTCAAACTATGGAATGATGAAAGTTCTTGCGAAGATGGGAATATCCACTCTGGCATCTTACAAAGGTGCTCAGATCTTTGAGGCCCTTGGTCTTGCTTCGGAAGTGGTCAGCAAGTGTTTTGAAGGTACTCCTAGTAGAGTTGAAGGTGCAACCTTTGAAATGCTTGCACAAGATGCTCTTCGTCTCCATGAGATTGCATTCCCATCAAGAACTTTACCTCCTGGAAGTGCAGATGCAAATGCTCTTCCCAACCCTGGGGATTACCATTGGAGGAAAAATGGAGAAGTACACCTTAATGATCCTTTTTCCATTGCAAAATTACAAGAAGCAGCACGGATTAACAGCAGGGAAGCATACAAAGAATATTCTAGGCGCATTTACGAGCTGAATAAGGCATGTACTCTGCGTGGCATGCTGAAATTTAGAGAAATTCCAAACCAAATTTCCTTGGACGAGGTAGAACCTGCAAAGGAGATAGTGAAGCGGTTCTGTACTGGAGCAATGAGTTATGGATCCATTTCCTTGGAAGCTCATACTTCCCTGGCTGAGGCTATGAACACACTTGGAGGAAAATCTAACACAGGTGAGGGAGGGGAACAACCTTGCCGTATGGTGCCTCTTCCTGATGGATCAAAGAATCCAAGAATAAGTGCAATCAAGCAAGTTGCCAGCGGAAGATTTGGAGTTTCCATCTATTATTTGACTAATGCAGTTGAGGTGCAGATAAAAATGGCTCAGGGTGCTAAACCTGGTGAAGGTGGTGAGCTACCAGGCCACAAGGTCATTGGTGATATTGCAGTCACTAGAAATTCTACAGCTGGTGTAGGGCTCATTAGCCCACCTCCTCACCACGATATATATTCTATTGAGGATCTCGCACAACTTATCCATGACCTTAAGAATGCAAACCCAGGTGCCAGAATCAGCGTCAAACTAGTCTCTGAAGCTGGTGTAGGAATTGTCGCTAGTGGTGTGGTGAAAGGACATGCAGACCATGTTCTGATCTCTGGACATGATGGAGGCACTGGAGCCTCCAGATGGACAGGGATTAAAAATGCTGGACTTCCTTGGGAGCTTGGATTAGCTGAAACACACCAGACTCTTGTGGCCAATGGTCTCCGTGGCCGAGCTGTTCTTCAGACAGATGGACAGATGAAAACTGGTAGAGATGTTGCTGTTGCTTGTTTACTTGGAGCAGAAGAATTTGGATTCAGCACAGCGCCATTAATCACACTTGGCTGCATTATGATGAGGAAGTGCCATACCAACACTTGCCCTGCTGGTATTGCTACACAAGATCCAGTGCTCCGCGCAAAGTTTGCTGGGAAGCCAGAACATGTCATAAACTACTTCTTCATGCTTGCTGAAGAGGTACGAGAAATCATGGCACAGCTTGGCTTCCGCACTGTTAATGAAATGGTTGGGCGATCGGACATGCTTGAGATCGATCCCAAAGTACTGGAGGGCAACGAGAAACTTGAAAACATTGATCTCTCACGGCTGCTGAAACCAGCTGCTGAAATTAGCCCTGGGGCTGTTCAATATTGTGTTGAGAAGCAAGATCATGGCCTCGACATGGCATTAGATAACAAACTCATAGCCTCCTCAACAGCTGCCCTTCGAAAAGGTGTTCGTGTTTTCATTGAGACACCAGTACGGAACATTAACCGAGCTGTTGGTACTATGCTCAGCCATGAAGTCACAAAACGGTATCACATTCATGGATTGCCATCAGATACCATCCATATTAAGCTGAATGGAAGTGCTGGCCAAAGTTTTGGTGCTTTTCTCTGTCCTGGGATCACTCTTGAGCTTGAGGGAGACAGCAACGATTATGTTGGTAAGGGACTATCTGGTGGAAAGATTGTTGTGTATCCACCAAGAAATAGTCGATTTAATCCACAAGACAATATTGTGATTGGTAATGTGGCTTTATATGGTGCTACAAAGGGAGAGGCATATTTCAATGGTATGGCGGCAGAAAGGTTTTGTGTCCGCAATTCAGGAGCTCAAGCAGTAGTTGAAGGGATTGGCGATCATGGATGTGAGTACATGACAGGAGGTACAGCTGTTATTCTTGGAAAAACTGGTAGGAACTTTGCAGCTGGCATGAGTGGAGGTATTGCTTATGTTTATGATGTGGATGGGAAGTTCAGTAGCCGTTGCAACTATGAGTTAGTTGACTTGTATGCTGTAGTTGAAGAGGATGACATCACAACATTGAGAATGATGATACAACAGCACAGACTTCATACACAAAGTGATTTGGCCAGAGATGTACTCTTGAATTTTGATACTCTCCTCCCAAAATTTATAAAAGTATATCCAAGGGATTACAAGCGGGTTTTGGATAAACTAAAAGAAGAGAAGGCTGCTAAAGAAGCAGAGCAAAAGGCAAGAGAAGTGGTGGATAAGAAGCCAGTTGAAGTAATTCAAGCTCCAAATGGCATTTCAGTAAAGACAGA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|
| Protein Sequence |
<aaseq>MSAAQGLALKLRAAPAAAAAAGGVRGEKRRRAASATAAAAARPRHGAMSLEGGFLGGALPAEDRVAPRASASRQAEAGAGAGAARPPPRSMSKIPESSIGLYDPSMERDSCGVGFIAELSGEYNRKTVDDAIEMLERMAHRGACGCEKNTGDGAGILIALPHNFFREANLLEVTKDAGFELPPPGEYAVGMFFMPTDDKRREKSKLLFREKAELLGHTVLGWRRVPTDNSGLGQSAVDTEPVIEQVFVTKSASSKADFERQMYVLRRFSVMSIREVLGVKNGGPKDFYMCSLSSRTIVYKGQLKPSQLKGYFFADLGDESFTSYMALIHSRFSTNTFPSWDRAQPMRVLGHNGEINTLRGNKNWMKAREGLLKCEGLGLTRDEMLKLLPIVDATSSDSGAIDNVLELLIQSGRSAPEAVMMMIPEAWQNDVNMDPERKALYEFFSALMEPWDGPALISFTDGRYLGATLDRNGLRPGRFYVTYSGRVIMASEVGVVDVPPQDVSRKGRLNPGMMLLVDFENHCVVNDDELKKEYSKVRPYGEWLKRQRIQLTDIIESVNEAERIAPSISGALPITKENKADMGICGILTPLKAFGYTREALEMLMLPMAKDGQEALGSMGNDTPLAVMSNREKLTFEYFKQMFAQVTNPPIDPIREKIVTSMECMIGPEGDLSETTERQCHRLTLKSPLLNTNEMEAIKKMNYRGWRSKVLDITYPKKNGRMGLKQTLDKICAQAREAIHEGYTILVLSDRERVAVSSLLAVGAVHQHLVSHLERTRIGLLVESAEPREVHHFSTLIGFGADAICPYLAIEAIWRLQIDGRIPPNDGKPYTQEQLIEKYFYASNYGMMKVLAKMGISTLASYKGAQIFEALGLASEVVSKCFEGTPSRVEGATFEMLAQDALRLHEIAFPSRTLPPGSADANALPNPGDYHWRKNGEVHLNDPFSIAKLQEAARINSREAYKEYSRRIYELNKACTLRGMLKFREIPNQISLDEVEPAKEIVKRFCTGAMSYGSISLEAHTSLAEAMNTLGGKSNTGEGGEQPCRMVPLPDGSKNPRISAIKQVASGRFGVSIYYLTNAVEVQIKMAQGAKPGEGGELPGHKVIGDIAVTRNSTAGVGLISPPPHHDIYSIEDLAQLIHDLKNANPGARISVKLVSEAGVGIVASGVVKGHADHVLISGHDGGTGASRWTGIKNAGLPWELGLAETHQTLVANGLRGRAVLQTDGQMKTGRDVAVACLLGAEEFGFSTAPLITLGCIMMRKCHTNTCPAGIATQDPVLRAKFAGKPEHVINYFFMLAEEVREIMAQLGFRTVNEMVGRSDMLEIDPKVLEGNEKLENIDLSRLLKPAAEISPGAVQYCVEKQDHGLDMALDNKLIASSTAALRKGVRVFIETPVRNINRAVGTMLSHEVTKRYHIHGLPSDTIHIKLNGSAGQSFGAFLCPGITLELEGDSNDYVGKGLSGGKIVVYPPRNSRFNPQDNIVIGNVALYGATKGEAYFNGMAAERFCVRNSGAQAVVEGIGDHGCEYMTGGTAVILGKTGRNFAAGMSGGIAYVYDVDGKFSSRCNYELVDLYAVVEEDDITTLRMMIQQHRLHTQSDLARDVLLNFDTLLPKFIKVYPRDYKRVLDKLKEEKAAKEAEQKAREVVDKKPVEVIQAPNGISVKTEKVMNEEPSSRPSRVSNAVKYRGFIKYEREGTSYRDPNERVKDWNEVAIELVPGPLLKTQSARCMDCGTPFCHQEGSGAGCPLGNKIPEFNELVHQNRWHEALDRLLETNNFPEFTGRVCPAPCEGSCVLGIIDNPVSIKSIECAIIDKGFEEGWMVPRPPLRRTGKRVAIVGSGPAGLAAADQLNKMGHFVTVFERADRIGGLMMYGVPNMKADKEGIVQRRVELMAKEGVQFIVNAHVGSDPLYSVEKLRSENDAIILACGATKPKDLPIPGRELAGIHFAMEFLHANTKSLLDSNLEDGNYISAQGRKVVVIGGGDTGTDCIGTSIRHGCTNLVNLELLPEPPRKRAPDNPWPQWPRIFRVDYGHQEATSKFGKDPRSYKVLTKRFIGDENGNVKALEVIRVEWGKVNGRFQFKEVEGSEEIIEADLVLLAMGFLGPEATVANKLGLEQDMRSNFKAQFGNFATNVEGVFAAGDCRRGQSLVVWAITEGRQAAAAVDNYLSKDDEGETNGTEDIAVSSEGLVQPVVA</aaseq> |
| Gene Sequence |
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