BGIOSGA020411

From RiceWiki
Revision as of 16:30, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA020411

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020411, complete gene.

LocusTag

OsI_21088

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA020411-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA020411-PA

Length

5595

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:29982308..29987902

Sequence Coding Region

29982308..29984080,29986306..29986340,29986504..29987902

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:29982308..29987902 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:29982308..29987902 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCCGCCACCGCCAGCTAGAACCCACCCGAACCCTCCCCTCCTCCACCTCCTCGCCTCCCACCGCGCGCCGCAGCCGCTCCCGCTCACGCCGGCGCACGGCCACCTCCCGGCGCGGAAGCGTCCCCGCGGAGTCGGCTCCGCAGCGGCGCCGCCGCCGCCGCGTGCCGCCGCCTCCGCGGAGGCCACCTACTCTGACCGGAGCGCCGCGCTGCGGGCGCTCTGTAGCCATGGCCAGCTGGCGCAGGCGCTCTGGCTCCTCGAGTCCTCCCCGGAGCCGCCCGACGAGGGCGCCTACGTCGCGCTGTTCCGGCTCTGCGAGTGGCGCCGCGCGGTCGACGCCGGGATGCGGGCGTGCGCGCGCGCCGACGCCGAGCACCCGAGCTTCGGGCTCCGCCTCGGGAACGCTATGCTCAGCATGCTCGTCAGGTTCGGGGAGATATGGCACGCGTGGAGGGTGTTCGCCAAAATGCCTGAGAGGGACGTCTTCTCCTGGAACGTCATGGTAGGCGGGTACGGCAAGGTGGGCTTCCTCGAGGAGGCGCTGGACCTGTACTACAGGATGCTGTGGGCAGGGATGAGGCCGGATGTCTACACGTTCCCCTGCGTGCTGCGTACCTGCGGGGGCATCCCTGACTGGAGGATGGGGAGGGAGGTGCATGCTCATGTGCTTCGATTTGGTTTTGGAGACGAGGTCGATGTATTGAATGCTCTGGTGACCATGTATGCCAAATGTGGGGATATTGTGGCGGCGAGGAAGGTGTTTGATGGAATGGCCATGACAGACTGCATATCATGGAATGCGATGATAGCTGGGCATTTTGAGAATCATGAGTGTGAGGCAGGGTTGGAGTTGTTTCTCACCATGCTGGAGAATGAGGTACAACCGAATCTCATGACAATAACCAGTGTGACTGTTGCATCTGGAATGTTGTCTGAAGTGGGTTTTGCAAAAGAAATGCATGGGTTTGCTGTAAAGAGAGGTTTCGCCATTGATGTTGCATTCTGTAACTCGTTGATTCAGATGTACACCAGTCTCGGGAGGATGGGGGATGCAGGTAAAATATTCTCAAGAATGGAAACTAAAGATGCCATGTCATGGACTGCAATGATATCGGGGTATGAGAAAAATGGTTTCCCAGATAAAGCCCTTGAAGTTTATGCACTGATGGAATTGCATAATGTAAATCCTGATGATGTTACAATTGCAAGTGCCCTTGCTGCTTGTGCCTGCTTGGGGAGGTTAGATGTAGGCATCAAATTGCATGAGCTTGCTCAGAACAAGGGATTCATCAGGTATGTTGTCGTTGCTAATGCGCTCCTTGAAATGTATGCTAAATCCAAGCACATTGATAAGGCTATTGAAGTATTTAAGTTCATGGCTGAGAAGGATGTGGTATCATGGAGTTCAATGATTGCTGGATTTTGCTTTAACCACAGGAGTTTTGATGCTTTGTACTATTTCCGGTATATGCTAGGACATGTAAAACCCAATTCTGTTACATTTATAGCTGCTCTAAGTGCTTGTGCTGCTACTGGGGCTTTGAGATCTGGTAAGGAAATCCATGCATATGTTTTAAGGTGTGGTATTGGATCTGAAGGTTATGTACCCAATGCTCTTCTAGACTTGTATGTGAAATGTGGCCAGACAAGCTATGCTTGGGCACAATTCAGCGTGCATAGTGAAAAGGATGTTGTCTCTTGGAATATAATGCTTTCTGGTTTTGTAGCTCATGGGCTTGGAGATATTGCTTTATCACTCTTTAACCAAATGATGTACACCAGTCTCGGGAGGATGGGGGCATGCAGTGCCCTTGCTGCTTGTGCCTGCTTGGGGAGGTTAGATGTAGGCATCAAATTGCATGAGCTTGCTCAGAACAAGGGATTCATCAGGTATGTTGTCGTTGCTAATGCGCTCCTTGAAATGTATGCTAAATCCAAGCACATTGATAAGGCTATTGAAGTATTTAAGTTCATGGCTGAGAAGGATGTGGTATCATGGAGTTCAATGATTGCTGGATTTTGCTTTAACCACAGGAGTTTTGATGCTTTGTACTATTTCCGGTATATGCTAGGACATGTAAAACCCAATTCTGTTACATTTATAGCTGCTCTAAGTGCTTGTGCTGCTACTGGGGCTTTGAGATCTGGTAAGGAAATCCATGCATATGTTTTAAGGTGTGGTATTGGATCTGAAGGTTATGTACCCAATGCTCTTCTAGACTTGTATGTGAAATGTGGCCAGACAAGCTATGCTTGGGCACAATTCAGCGTGCATAGTGAAAAGGATGTTGTCTCTTGGAATATAATGCTTTCTGGTTTTGTAGCTCATGGGCTTGGAGATATTGCTTTATCACTCTTTAACCAAATGGTAGAAATGGGAGAGCATCCGGATGAAGTTACATTTGTGCTTATGTGTGCTTGTAGTAGGGCTGGAATGGTTATTCAAGGCTGGGAGCTTTTTCACAGGAGGACTGAGAAATTTTCAATAGTTCCAAATCTCAAGCACTATGCATGTATGGTAGATCTATTGAGTCGTGTTGGGAAATTAACAGAAGCTTACAACCTCATAAATCGAATGCCTATCAAACCTGATGCTGCAGTGTGGGGAGCCTTGTTGAATGGATGCCGGATCCACCGACATGTTGAACTTGGCGAGCTTGCTGCAAAAGTTATCCTTGAGTTGGAACCTAATGATGTTGCATATCATGTTCTTCTGTGTGATTTATATACTGATGCTGGCAAATGGGCTCAAGTGGCTAGAGTGAGAAAAACCATGCGAGAGAAGGGATTGGAGCAAGATAATGGATGTAGCTGGGTTGAGGTTAAGGGAGTAACTCACGCATTTCTTACAGATGATGAATCACATCCACAGATAAAAGAAATAAATGTTGTTCTACATGGCATATATGAGCGAATGAAAGCATGTGGTTTTGCTCCTGTTGAGTCCTTAGAAGATAAAGAAGTATCCGAGGACGACATCTTGTGCGGTCACAGTGAAAGATTAGCTGTAGCTTTTGGTTTGATCAATACTACACCTGGTACCACTATTTCTGTCACAAAGAACCGATACACTTGCCAGAGTTGTCATGTGATATTCAAGGCAATTTCTGAAATTGTTCGAAGAGAGATAACTGTTAGAGACACTAAGCAATTACACTGCTTTAAGGATGGAGATTGTTCATGTGGAGATATAGGATATGGATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPPPPARTHPNPPLLHLLASHRAPQPLPLTPAHGHLPARKRPRGVGSAAAPPPPRAAASAEATYSDRSAALRALCSHGQLAQALWLLESSPEPPDEGAYVALFRLCEWRRAVDAGMRACARADAEHPSFGLRLGNAMLSMLVRFGEIWHAWRVFAKMPERDVFSWNVMVGGYGKVGFLEEALDLYYRMLWAGMRPDVYTFPCVLRTCGGIPDWRMGREVHAHVLRFGFGDEVDVLNALVTMYAKCGDIVAARKVFDGMAMTDCISWNAMIAGHFENHECEAGLELFLTMLENEVQPNLMTITSVTVASGMLSEVGFAKEMHGFAVKRGFAIDVAFCNSLIQMYTSLGRMGDAGKIFSRMETKDAMSWTAMISGYEKNGFPDKALEVYALMELHNVNPDDVTIASALAACACLGRLDVGIKLHELAQNKGFIRYVVVANALLEMYAKSKHIDKAIEVFKFMAEKDVVSWSSMIAGFCFNHRSFDALYYFRYMLGHVKPNSVTFIAALSACAATGALRSGKEIHAYVLRCGIGSEGYVPNALLDLYVKCGQTSYAWAQFSVHSEKDVVSWNIMLSGFVAHGLGDIALSLFNQMMYTSLGRMGACSALAACACLGRLDVGIKLHELAQNKGFIRYVVVANALLEMYAKSKHIDKAIEVFKFMAEKDVVSWSSMIAGFCFNHRSFDALYYFRYMLGHVKPNSVTFIAALSACAATGALRSGKEIHAYVLRCGIGSEGYVPNALLDLYVKCGQTSYAWAQFSVHSEKDVVSWNIMLSGFVAHGLGDIALSLFNQMVEMGEHPDEVTFVLMCACSRAGMVIQGWELFHRRTEKFSIVPNLKHYACMVDLLSRVGKLTEAYNLINRMPIKPDAAVWGALLNGCRIHRHVELGELAAKVILELEPNDVAYHVLLCDLYTDAGKWAQVARVRKTMREKGLEQDNGCSWVEVKGVTHAFLTDDESHPQIKEINVVLHGIYERMKACGFAPVESLEDKEVSEDDILCGHSERLAVAFGLINTTPGTTISVTKNRYTCQSCHVIFKAISEIVRREITVRDTKQLHCFKDGDCSCGDIGYG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..1773#3999..4033#4197..5595#ATGCCGCCACCGCCAGCTAGAACCCACCCGAACCCTCCCCTCCTCCACCTCCTCGCCTCCCACCGCGCGCCGCAGCCGCTCCCGCTCACGCCGGCGCACGGCCACCTCCCGGCGCGGAAGCGTCCCCGCGGAGTCGGCTCCGCAGCGGCGCCGCCGCCGCCGCGTGCCGCCGCCTCCGCGGAGGCCACCTACTCTGACCGGAGCGCCGCGCTGCGGGCGCTCTGTAGCCATGGCCAGCTGGCGCAGGCGCTCTGGCTCCTCGAGTCCTCCCCGGAGCCGCCCGACGAGGGCGCCTACGTCGCGCTGTTCCGGCTCTGCGAGTGGCGCCGCGCGGTCGACGCCGGGATGCGGGCGTGCGCGCGCGCCGACGCCGAGCACCCGAGCTTCGGGCTCCGCCTCGGGAACGCTATGCTCAGCATGCTCGTCAGGTTCGGGGAGATATGGCACGCGTGGAGGGTGTTCGCCAAAATGCCTGAGAGGGACGTCTTCTCCTGGAACGTCATGGTAGGCGGGTACGGCAAGGTGGGCTTCCTCGAGGAGGCGCTGGACCTGTACTACAGGATGCTGTGGGCAGGGATGAGGCCGGATGTCTACACGTTCCCCTGCGTGCTGCGTACCTGCGGGGGCATCCCTGACTGGAGGATGGGGAGGGAGGTGCATGCTCATGTGCTTCGATTTGGTTTTGGAGACGAGGTCGATGTATTGAATGCTCTGGTGACCATGTATGCCAAATGTGGGGATATTGTGGCGGCGAGGAAGGTGTTTGATGGAATGGCCATGACAGACTGCATATCATGGAATGCGATGATAGCTGGGCATTTTGAGAATCATGAGTGTGAGGCAGGGTTGGAGTTGTTTCTCACCATGCTGGAGAATGAGGTACAACCGAATCTCATGACAATAACCAGTGTGACTGTTGCATCTGGAATGTTGTCTGAAGTGGGTTTTGCAAAAGAAATGCATGGGTTTGCTGTAAAGAGAGGTTTCGCCATTGATGTTGCATTCTGTAACTCGTTGATTCAGATGTACACCAGTCTCGGGAGGATGGGGGATGCAGGTAAAATATTCTCAAGAATGGAAACTAAAGATGCCATGTCATGGACTGCAATGATATCGGGGTATGAGAAAAATGGTTTCCCAGATAAAGCCCTTGAAGTTTATGCACTGATGGAATTGCATAATGTAAATCCTGATGATGTTACAATTGCAAGTGCCCTTGCTGCTTGTGCCTGCTTGGGGAGGTTAGATGTAGGCATCAAATTGCATGAGCTTGCTCAGAACAAGGGATTCATCAGGTATGTTGTCGTTGCTAATGCGCTCCTTGAAATGTATGCTAAATCCAAGCACATTGATAAGGCTATTGAAGTATTTAAGTTCATGGCTGAGAAGGATGTGGTATCATGGAGTTCAATGATTGCTGGATTTTGCTTTAACCACAGGAGTTTTGATGCTTTGTACTATTTCCGGTATATGCTAGGACATGTAAAACCCAATTCTGTTACATTTATAGCTGCTCTAAGTGCTTGTGCTGCTACTGGGGCTTTGAGATCTGGTAAGGAAATCCATGCATATGTTTTAAGGTGTGGTATTGGATCTGAAGGTTATGTACCCAATGCTCTTCTAGACTTGTATGTGAAATGTGGCCAGACAAGCTATGCTTGGGCACAATTCAGCGTGCATAGTGAAAAGGATGTTGTCTCTTGGAATATAATGCTTTCTGGTTTTGTAGCTCATGGGCTTGGAGATATTGCTTTATCACTCTTTAACCAAATGGTAGAAATGGGAGAGCATCCGGATGAAGTTACATTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGATGGAAAAATGCGGGAATAATCATAGAAGATCACTCTTTACCTTATCTTGCGGTGGATGTTGGATACGACAAAAGGATCTTGGTTGCGCAATGCGTTGGTGAGGACCTGTCAAAATTACGAGAGTACCCATGAATGGTAGACGTGGTGCCAAGTGGAGTGATGTCACTCTAGCCTATCTTACTCTATGGTGGATGCTGAAAACAACCAAAAAGTGAGTTGTTTTTTCTCCCACCAATTTAGGCCGTGAGCCAGTGACTAGTATCATTGTCTCATATAGTCACGTCCCTGGCGCAAGTAGTCTAAAGAATATGATCGATTTGGATTAACCATATTAAGGTTGTAATGCATGTTGTCTGAGTAACATGTTGTTCTCCAAATTATAATAAAATGTAGTTTCCGTTCATTCGTGTGGGTGAATGGCGGACATGGATCCTCTACATTACTACTGGTGCAGTCACACTCATTGACCGATGCTTTTAATTCAGAGGATCCCCATGTGTGAATGTCGCTCCTGATTGATCTCTCCTTTTGGTAGGAATTAAATGTTAGATCGGTAATCTTTAAAAAGAATCCTTTAAAATAGATAGTGTATTGGGACTTACACGTTGAGATCACAAATTTATCTGATTTTAATCAAATTCCATTTCCAAAAATTCAGATTTCCTCAAAATGAAACAAATTGGATTTCACAAATCTCGTCTGAAATTCATGAGATTTTGCATCTTGCTAAGGATCGCATTTCAACCCTAAAATGAAAATGAAATCTACTCATCATGCAACACCTAAGAGTGGGCCTTGATCTTAGCCACACGGTGTCGTCAGTGAGGTGCACGGGAATTGTGAAAGTAGCCATGAATTTAAGATGTGGTGCCAATGGGAGTAAGGTCATTCCAACCTAGCTTAATCACCGGTTAATGTTGAAAACAACCAAAAGACCTTCTTCGCATGGTGTAGTTGGTCATGATGCATGCAAAATTATGAGAATAATCATGAATGGAAATAGGATGCTAGTCAAAGTGAGATCACTCTACCTAACTCTGTGGTGGATGCTGGATATGACCAAAAGATCTCAGTCACACAATGCGTTGGTGAGGGCTCGTGGGAATTGTGAGAGTAGTCATGAATGGGAGACATGGTGTGGAGCACAATGCGATCAATTTAGACGAAGCAGATTAAAGTTGTAATGCGTTTTGAGTAACATGATGTACTTCGAATTATAATAGAATGCTATTCCGGTTCAGTAGTACTTATTAACTACAACTGGTAATCCAAAAAAAAATTCCCATTGGTGAATGTTAATCTCTTCTTGGTAACAATAAAAAAATAGATCGATAATCTTTAAAAAGAATCCTTTAAAATAAGTATTGCAGACTTATAGGTTGGGTTCACAATTTTGTTTGATTTTCATTAAACTCCATTGCAAAAGAAACCATATTTCCTCAAAATGAAATAAATTGGATTTCACAAATATCGCTCAAAATTCATGAAATTTTGCATCTTGCTAAGGATCACATTTTGACCCTAAAATGAAATTGGGAACCTACTCGTCATGCAACACCTAAGAGTGGCCTTGATCTTAGCCACGTGGTGCCATTAGTGAGGCGCATGGGAATTGTGAGAGTAGCCATGAATTTAAGATGTGGTACCAATTGGAGTAAGGTCACTCCAACCTAGCCTAACAATGGTCAATGTTGAAAACAACCACAAGACCTTGGTCGCATGGTGTCGTTGGTCATGACGCATGAAAAATTGTGAAGAGTAATCATGAATGGAGATAGGATGCTGACTAGAGTAAGGTCACTCTACCTCAACTCTGTGGTGTATGCTCAATATGACCAAAAGATCTCGGTCATACAGTGTGTTGGTGAGGGCTTTGGGAATTGCGATAGTAGTCATGAATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAGTTGTTTCTCACCATGCTGGAGAATGAGGTACAACCGAATCTCATGACAATAACCAGTGTGACTGTTGCATCTGGAATGTTGTCTTGAAGTGGGTTTTGCACAAAGCAAATGCATGGGTTTGCTGTAAAGAGAGGTTTCGCCCATTGATGTTGCATTCTGTAACGTCGTTGCATTCCAGATGTACACCAGTCTCGGGAGGATGGGGGCATGCAGGTAAAATCATTCTCCAAGAATGGAAACTAAAGATTGCCATGTCATGGACTGCAATGATATCGGGGTATGAGCAAAAATGGTTTCCCAGCATAAAGCCCTTGCAAGTTTATGCACTGATGGAATTGCGATCAATGTAAATCCTGCATGATGTTACAATTGCAAGTGCCCTTGCTGCTTGTGCCTGCTTGGGGAGGTTAGATGTAGGCATCAAATTGCATGAGCTTGCTCAGAACAAGGGATTCATCAGGTATGTTGTCGTTGCTAATGCGCTCCTTGAAATGTATGCTAAATCCAAGCACATTGATAAGGCTATTGAAGTATTTAAGTTCATGGCTGAGAAGGATGTGGTATCATGGAGTTCAATGATTGCTGGATTTTGCTTTAACCACAGGAGTTTTGATGCTTTGTACTATTTCCGGTATATGCTAGGACATGTAAAACCCAATTCTGTTACATTTATAGCTGCTCTAAGTGCTTGTGCTGCTACTGGGGCTTTGAGATCTGGTAAGGAAATCCATGCATATGTTTTAAGGTGTGGTATTGGATCTGAAGGTTATGTACCCAATGCTCTTCTAGACTTGTATGTGAAATGTGGCCAGACAAGCTATGCTTGGGCACAATTCAGCGTGCATAGTGAAAAGGATGTTGTCTCTTGGAATATAATGCTTTCTGGTTTTGTAGCTCATGGGCTTGGAGATATTGCTTTATCACTCTTTAACCAAATGGTAGAAATGGGAGAGCATCCGGATGAAGTTACATTTGTGCTTATGTGTGCTTGTAGTAGGGCTGGAATGGTTATTCAAGGCTGGGAGCTTTTTCACAGGAGGACTGAGAAATTTTCAATAGTTCCAAATCTCAAGCACTATGCATGTATGGTAGATCTATTGAGTCGTGTTGGGAAATTAACAGAAGCTTACAACCTCATAAATCGAATGCCTATCAAACCTGATGCTGCAGTGTGGGGAGCCTTGTTGAATGGATGCCGGATCCACCGACATGTTGAACTTGGCGAGCTTGCTGCAAAAGTTATCCTTGAGTTGGAACCTAATGATGTTGCATATCATGTTCTTCTGTGTGATTTATATACTGATGCTGGCAAATGGGCTCAAGTGGCTAGAGTGAGAAAAACCATGCGAGAGAAGGGATTGGAGCAAGATAATGGATGTAGCTGGGTTGAGGTTAAGGGAGTAACTCACGCATTTCTTACAGATGATGAATCACATCCACAGATAAAAGAAATAAATGTTGTTCTACATGGCATATATGAGCGAATGAAAGCATGTGGTTTTGCTCCTGTTGAGTCCTTAGAAGATAAAGAAGTATCCGAGGACGACATCTTGTGCGGTCACAGTGAAAGATTAGCTGTAGCTTTTGGTTTGATCAATACTACACCTGGTACCACTATTTCTGTCACAAAGAACCGATACACTTGCCAGAGTTGTCATGTGATATTCAAGGCAATTTCTGAAATTGTTCGAAGAGAGATAACTGTTAGAGACACTAAGCAATTACACTGCTTTAAGGATGGAGATTGTTCATGTGGAGATATAGGATATGGATGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA020411