BGIOSGA020686
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA020686 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020686, complete gene. |
| LocusTag |
B1153E06.4 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA020686-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA020686-PA |
| Length |
4322 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:29879849..29884170 |
| Sequence Coding Region |
29884042..29884170,29883609..29883687,29883486..29883526,29883248..29883326,29883038..29883142 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:29879849..29884170 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:29879849..29884170 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGCGGCCCAATGCAACGCTCGTCGCAGCCACAGTTTATCTCTAGCGTCGAGCGGAACAATCAATCGAATGGTCCTGGCACTCCTCTTATTGACAGCATAGATGTTGATCAGATTGTTATTCCAGAGAAAAATAGTTGGAAGAACCTATTTTCATACATAGGGCCCGGATTTCTTGTCTCTATTGCGTATATTGATCCTGGAAATTTTGAGACAGACCTACAGGCTGGAGCACAGTACAAATATGAGCTTCTTTGGATCATACTTATTGCGTCATGTGCTGCTCTTATAATTCAATCACTTGCAGCTAGGCTAGGAGTCGTGACTGGGAAGCACCTGGCCGAGCATTGCAGAGCTGAATATCCAAAGGCTACAAATTTCATATTATGGATTCTTGCGGAACTAGCTGTAGTTGCATGCGACATTCCTGAAGTAATTGGAACTGCTTTTGCTTTGAACATGCTCTTTAAAATCCCTGTGTGGTGTGGTGTTCTGATAACTGGACTCAGCACTCTGATGCTACTGTTACTACAACAATATGGGGTCCGTAAACTGGAATTTCTGATAGCTATTCTGGTGTCATTAATAGCAACTTGTTTCTTAGTTGAGCTTGGGTATTCTAAACCAAATTCTTCAGAGGTTGTGAGGGGCCTTTTTGTTCCTGAACTTAAAGGGAATGGAGCCACAGGTCTTGCTATCTCACTACTTGGTGCTATGGTGATGCCGCATAATCTTTTTCTCCACTCAGCATTGGTACTATCAAGAAAAGTGCCACGGTCAGTTCATGGGATCAAAGAGGCATGTAGATTCTATATGATTGAAAGTGCATTTGCCCTCACGATAGCGTTCCTCATTAACATATCTATCATATCTGTTAGTGGTGCTGTCTGCGGGTCAGATAATTTGAGTCCTGAAGACCAGATGAATTGCAGTGATCTTGATCTTAACAAAGCTTCGTTTTTGTTAAAGAATGTCCTCGGAAACTGGAGCTCAAAGTTATTTGCAGTAGCCTTGTTGGCGTCTGGCCAGAGTTCTACAATTACAGGAACTTATGCGGGACAATATGTCATGCAGGGGTTTCTAGATCTTCGGATGACACCCTGGATACGGAACCTTCTAACTAGGTCCTTGGCAATTCTGCCAAGTCTGATTGTTTCGATAATTGGAGGTTCCTCAGCAGCTGGACAGTTGATTATCATTGCATCGATGATACTGTCATTTGAGCTTCCTTTTGCTCTAGTTCCACTCCTAAAATTCACAAGCAGCAGGACAAAAATGGGGCAGCACACAAATTCAAAAGCCATTTCTGTGATAACATGGGGAATTGGTTCGTTTATCGTTGTCATCAACACCTACTTCCTGATAACAAGCTTTGTCAAGCTGCTTCTCCACAACGGTCTATCGACTGTATCCCAAGTATTCTCCGGGATATTCGGTTTCCTGGGGATGCTCATATACATGGCTGCAATTCTCTACCTCGTTTTCCGGAAGAACAGGAAAGCTACCCTGCCATTGCTGGAGGGCGATTCGACGGTCCGCATAGTAGGTCGCGACACGGCCACTGAAGGAGAAGGTTCTCTTGGCCATCTGCCCCGGGAGGACATCTCCAGCATGCAGCTTCCTCAGCAGCGAACTGCTTCTGATCTCGATTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSGPMQRSSQPQFISSVERNNQSNGPGTPLIDSIDVDQIVIPEKNSWKNLFSYIGPGFLVSIAYIDPGNFETDLQAGAQYKYELLWIILIASCAALIIQSLAARLGVVTGKHLAEHCRAEYPKATNFILWILAELAVVACDIPEVIGTAFALNMLFKIPVWCGVLITGLSTLMLLLLQQYGVRKLEFLIAILVSLIATCFLVELGYSKPNSSEVVRGLFVPELKGNGATGLAISLLGAMVMPHNLFLHSALVLSRKVPRSVHGIKEACRFYMIESAFALTIAFLINISIISVSGAVCGSDNLSPEDQMNCSDLDLNKASFLLKNVLGNWSSKLFAVALLASGQSSTITGTYAGQYVMQGFLDLRMTPWIRNLLTRSLAILPSLIVSIIGGSSAAGQLIIIASMILSFELPFALVPLLKFTSSRTKMGQHTNSKAISVITWGIGSFIVVINTYFLITSFVKLLLHNGLSTVSQVFSGIFGFLGMLIYMAAILYLVFRKNRKATLPLLEGDSTVRIVGRDTATEGEGSLGHLPREDISSMQLPQQRTASDLD</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..129#484..562#645..685#845..923#1029..1133#1410..1519#1797..1978#2063..2132#2374..2547#2871..2975#3517..3648#3790..3885#3972..4322#ATGAGCGGCCCAATGCAACGCTCGTCGCAGCCACAGTTTATCTCTAGCGTCGAGCGGAACAATCAATCGAATGGTCCTGGCACTCCTCTTATTGACAGCATAGATGTTGATCAGATTGTTATTCCAGAGGTATGTTGTATGTGGGTTTTAGTTCTTGATTGGTTCTGAACATAGCACATGCCACAATGTTGCTAAATCAGTTGATATAGGTTATGAAAATAGCAAAACTGTCTCCATGCCAAGCATCCAAGATTTACAGTTAGGCCCATTCTTTTCTTTTTCAAGATAAACCTCCCATGTGCATCTGCTGTAGCAATGTGTACAATATGCAGTGTGTAGTTTCAAACCTGAAGTGCATGGGAGGTTAAAAATGGAAGGAAAGCACCAACCTAGTCAATTTGTTATGCTGTCTTTTTAAATATCTTGATATTTTTCACTTCAGGATGAAGAAACTAACTACTGGTTGTTATATGCTATTGGCAGAAAAATAGTTGGAAGAACCTATTTTCATACATAGGGCCCGGATTTCTTGTCTCTATTGCGTATATTGATCCTGGAAATTGTAAGATAGCTGGATTTGTTGTTCACTCCTATTAAATGAGTATTCACAGTGATCATGACCAAAAGAATCTCTCATCTTGCAGTTGAGACAGACCTACAGGCTGGAGCACAGTACAAATATGAGGTGCATTACTACTTCTCTTCTTTATAGCTACTTCTTTTATAGTACGTATCATATCTTCTTTCTCATAAAGCATGTGACCCTTGAAATTGAATGTATGCTATTCAGATATGTCATGCTTATCTTTAACAAAGAACCACAACCGTTTTCTTTTGTTGCCAGCTTCTTTGGATCATACTTATTGCGTCATGTGCTGCTCTTATAATTCAATCACTTGCAGCTAGGCTAGGAGTCGTGACTGGTCAGTATCATGAGCCTTGCGACACCTGTCTTTGTTTAATGGAGTATCGTTATTTCCTTTCACATGGACACTGCTAATCATTAGTTAAGCTTTTCCATATGATAGGGAAGCACCTGGCCGAGCATTGCAGAGCTGAATATCCAAAGGCTACAAATTTCATATTATGGATTCTTGCGGAACTAGCTGTAGTTGCATGCGACATTCCTGAAGGTACCAGAGTGTAAAATTTTGAGCTTCTGTTGCATGACTTGCGTTTTGCATTTAATGAGTTGCAGATCTAATTGAAGTATAAAGTTCAGCTGTTTCATGATATTGCAGACAGTGTTATACTAGTCCTAAAGCAAATCTGAATTGAAAATAGCAATTTGTGATGTGGAACCATTCAATTTGTGATAGGGAAAATAACAAGACATCTGCAACTATATGCTTCATATTGCATCTACCCACTATACCTAACCAGCCTCCATGGTTGCTTGTTCTTTTCAGTAATTGGAACTGCTTTTGCTTTGAACATGCTCTTTAAAATCCCTGTGTGGTGTGGTGTTCTGATAACTGGACTCAGCACTCTGATGCTACTGTTACTACAACAATATGGGGTAAGAACATGTCCTGATTTTATTTCACAGTATTTGGGACCAGTTAATATTTTCCCTTAAATTTCAATGCCAAAGAAAAATTTAGCCTTTCCTTTTACTTGAAATATCGATACAGTATGATACTTGCCACTGCCATATAGCAGCACACTACTTAGAGGATCCTTGTCAGCACAAATTTTGAAGATCACTAACACAATTGCATTAGTTAACAGACAGTGTTTTGCATTTGTCTGGTTCGTGTAGTTGCTCATATCGCATATGATTTGTTTTTGTGCAGGTCCGTAAACTGGAATTTCTGATAGCTATTCTGGTGTCATTAATAGCAACTTGTTTCTTAGTTGAGCTTGGGTATTCTAAACCAAATTCTTCAGAGGTTGTGAGGGGCCTTTTTGTTCCTGAACTTAAAGGGAATGGAGCCACAGGTCTTGCTATCTCACTACTTGGTGCTATGGTGATGCCGTGAGCTTCCTGTCCACCCCTTTTGTCCCAAACATATCTTTAACTTTCGACAAAAACATTTTCCATGTATTATTCTTATTACAGGCATAATCTTTTTCTCCACTCAGCATTGGTACTATCAAGAAAAGTGCCACGGTCAGTTCATGGGATCAAAGTAATGTCCAACTTCCTTTATTGTATCCATTTATTGTTATTGTGATTTTGATCTTAATTACTATCCTTCATGTGCCTGAATTTATATTTTCTGTTCTATCCTGAAATTTTGTATATACAGTTTGAGTGTGTCCAGTCACATGCTAAATATTATCTAAGAAATATTGGCATGCAGATGACATAAAAATAACATCGTCGTGATTAAATAATTAATTTATTTCGACCAATTCACTTTCTTGCAGGAGGCATGTAGATTCTATATGATTGAAAGTGCATTTGCCCTCACGATAGCGTTCCTCATTAACATATCTATCATATCTGTTAGTGGTGCTGTCTGCGGGTCAGATAATTTGAGTCCTGAAGACCAGATGAATTGCAGTGATCTTGATCTTAACAAAGCTTCGTTTTTGTTAAAGGTTGGTCCACAGTTTTGTGTTATTCATATTATTGTATTTGAAACTATAGGATAGACTGTTCATTTTGAGTTAGAAAATATTTATGGTTTTGTTATAGACAGCGTTATATGTATCATGTGATAAGTTGGACATATGCACCTAACTGATTTATGAGATCTTATTATTTGACAAAAACACCTTATGAACCTTATGTCTTCTTTCGAAGGTTCCTATGTTACTGCTTTTTCCATGTAAATTGTGCAGAAACAATTCTGAAATTATCTTTGTCAATTTCTGTATTGTAATTTATAATCTGATCCATATTATTTTATATGTTGTTATAGAATGTCCTCGGAAACTGGAGCTCAAAGTTATTTGCAGTAGCCTTGTTGGCGTCTGGCCAGAGTTCTACAATTACAGGAACTTATGCGGGACAATATGTCATGCAGGTTATGCACATCTTGTACTGAAGTCCTAACTTTCAACTAGGAATTTTAGTGGTAGACCAATATCTTGTTGTATAATTACCCACGGAGGTATTCATAGTTATACATATAATCACTAGGAATTTTAGTTGAGCTTTTTAAAGTTATAAAATTGTAAATAAATTATAAAATTAGGTTTGAATGTCTGCCAGCATTGCTACTTTGGTAGAACTAGTTTTTCCTGTTGAATCAAGTTGCAAAACAATGCAAGGAAATACGGAGATTGGGGCGCAACCATAGACATTTGCAGCTTAATCATGGTCAATTAGGTTGTGGAAAAAAATGGATAGAGGCGATAGGTAGCTTAGGGCACTACCTTTTGCCCAGTGTCCCACATCATGCCAATATAGGTTGCTGCTTCCTTGCATATTTCTAAATGTTCAACCAAGATAGTCTTACTCTTTACTCTTCATAGTTCTTTTTGGCCTGTAAAGGAAAAGCAGTATTTCCAGATGTATGAAATGTAATCTTCTAGGGGCTGACATTTACTGATTTCTTCATTTAGGGGTTTCTAGATCTTCGGATGACACCCTGGATACGGAACCTTCTAACTAGGTCCTTGGCAATTCTGCCAAGTCTGATTGTTTCGATAATTGGAGGTTCCTCAGCAGCTGGACAGTTGATTATCATTGCATCGGTAATTGCTAAAATTTACTATTTCAAAGTATAATACATTCATCCTTCTGATAATCTATAATGAACTTCAATGCACATGAGAATTAAATTGCTCCATCCCATATGTCAACTTTTAACTAATGCCTTACTTTATTATGCACAGATGATACTGTCATTTGAGCTTCCTTTTGCTCTAGTTCCACTCCTAAAATTCACAAGCAGCAGGACAAAAATGGGGCAGCACACAAATTCAAAAGCCGTAAGTTGTTCTCCCTAGAATACAGAAATATATAGCAGCAATGCCACTATGACACATCTGAAATGTTTTTTTTTTCCTGAATGCAGATTTCTGTGATAACATGGGGAATTGGTTCGTTTATCGTTGTCATCAACACCTACTTCCTGATAACAAGCTTTGTCAAGCTGCTTCTCCACAACGGTCTATCGACTGTATCCCAAGTATTCTCCGGGATATTCGGTTTCCTGGGGATGCTCATATACATGGCTGCAATTCTCTACCTCGTTTTCCGGAAGAACAGGAAAGCTACCCTGCCATTGCTGGAGGGCGATTCGACGGTCCGCATAGTAGGTCGCGACACGGCCACTGAAGGAGAAGGTTCTCTTGGCCATCTGCCCCGGGAGGACATCTCCAGCATGCAGCTTCCTCAGCAGCGAACTGCTTCTGATCTCGATTAG</dnaseqindica> |
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