BGIOSGA020750

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA020750

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020750, complete gene.

LocusTag

OsI_23984

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA020750-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA020750-PA

Length

8380

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:28833889..28842268

Sequence Coding Region

28842239..28842268,28841209..28841248,28840544..28840668,28840141..28840209,28839807..28840049
,28839526..28839703,28839310..28839442,28839017..28839179,28838545..28838692
,28838362..28838462,28838042..28838197,28837287..28837355,28837052..28837189
,28836805..28836933,28836002..28836149,28835856..28835866,28835627..28835767
,28835400..28835525,28835242..28835307,28834393..28834717,28834080..28834309
,28833889..28834002

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:28833889..28842268 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:28833889..28842268 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCCCCATGCTAGATCCGCCACTGGGGAGAGTTTGAGCGCAGATTTTATTGGTCTCATTTGGTGGCTACTATGTTTATCCTTAACAACCCTCAGTGGATTGGAAATATGGCGGATTGAAAAACTGCAAGCTGTTCCAGTTCCCAAGGAATCACATGGGAGATTTTTCACAGGAGATTCCTATGTGATATTGAAGACAACCGCTCTTAAAAATGGTTCTTTTCGGCATGATATCCATTATTGGCTTGGTAAAGATACCAGTCAGGATGAAGCTGGTACAGCTGCAATCAAGACTGTGGAATTGGATGCTGCTCTTGGTGGACGTGCTGTTCAATACCGTGAAGTACAGGGGAATGAGACAGAGAGATTTCTTTCATATTTTAAACCTTGTATTATACCAGAGGAAGGTGGAATTGCATCTGGTTTCAGGCATACTGAAATCAATGAACGGGAGCATGTGACAAGGTTATTTGTCTGCAGAGGAAAGCATACAGTCCATGTCAAAGAGGTTCCGTTTGCAAGATCATCGCTGAACCATGATGATATATTTATTTTAGATACAAAGTCCAAAATATTCCAGTTCAATGGATCGAATTCAAGTATTCAGGAGAGGGCTAAAGCCCTTGAGGTTGTGCAATATTTGAAAGACAGCAACCATGAGGGCAAATGTGACGTAGGTTCAGTTGAGGACGGCAAGCTGATGGCAGATGCTGACGCCGGTGAATTCTGGGGTCTCTTTGGTGGATTTGCACCTCTTCCAAGAAAAACCTTTTCTGATCTTAATGGAAAAGATTCTGCTTTCTCTTCGAAGTTGATCTGTCTAAATAAGGGTCAGACAGTACCAGTTGATTTTGATGTTCTAACAAGAGAGTTGCTAGATTCAACAAAGTGCTATCTGCTAGACTGTGGATCTGAAATTTATGTCTGGATGGGTAGAGAGACACCACTCGAAGAGAGGAAACGGGCAGGATCTGCTGCAGAGGAATTACTTCGTGAAGTAAACAGGCCAAAATCTCATATTGTTCGTCTCATGGAAGGATTTGAGACTGTCATATTCCGATCAAAATTCAGTAAATGGCCTAAGAAAGCTGATGCTGTTGTGTCTGATGAGAGCAGAGGAAAAGTTGCAGCTCTTCTTAAGCGGCAAGGATTTAATGTTAAGGGTCTTGCAAAAGCTGCTCCTGTGAAGGAAGAGCCTCAACCTCAAATTGATTGCACAGGCAACCTGCAGGTTTGGCGTGTAAATGGCACTGAAAAGACATTCCTTTCATTCTCTGAGCAATGCAAATTCTACAGTGGGGACTGTTATATCTTTCAATATAGCTATCCTGGTGAGGAAGGCGAGGAGTGTCTCATTGGTACTTGGTTCGGGAAAAAGAGTGTTCAGGTTCGCCTTTATGAAGGAAAGGAACCAGCTGAGTTTTTCTCAATATTTCAGAACCTGGTTATCTTCAAGGGTGGTGTTAGTACTGGGTATAAGAAATTTGTCTCAGAAAACGGTATTGAGGATGACACATATTCAGAAAATGGGGTTGCCCTTTTCCGGGTTCAAGGCTCTGGACCAGAAAATATGCAAGCCATTCAAGTTGATACGGCTGCTACCTCGCTGAACTCTTCTTATTGTTATGTACTACATGATGGAGATACACTATTTACATGGATTGGGAATTTAAGCTCGTCAATGGATCAAGAGCTTGCTGAGAGGCAGCTGGATGTGATCAAGCCAAATCTTCAGTCCAGAATGCTCAAGGAAGGGTCAGAATATGATCAGTTTTGGAAGCTACTTGGAGTCAAGTCAGAGTACCCCAGCCAGAAGATTGCAAAAGATCAAGAAAGTGATCCTCATTTGTTCTCTTGTACTTTTTCAAAGGGAGTGCTTAAGGTTAGAGAAATATTCAACTTTACTCAAGATGATTTGATGACGGAGGACGTTTTTATTTTGGACTGTCATTCATGTGTCTTCGTATGGGTTGGACAACGTGTGGACACAAAAATGCGAGCACAAGCTTTGAGCGTTGGAGAGAAATTTTTAGAACTTGACATTTTGATGGAGAACTCATCACAAGAAACACCAGTTTATGTCATCACTGAAGGGAGTGAGCCCCAATTTTTCACCAGGTTCTTCACTTGGGACTCTGCAAAATCAGCCATGCATGGAAACTCATTTGAAAGGAGGTTATCTATAGTGAAGGATGGAGTAAAACCAAAATTAGATAAACCTAAAAGAAGGCCAACGACATCATCATCACACACTGGACGATCCAGTGTACCTGATAAATCTCAGCGCTCCAGAAGTATGTCGTTCAGTCCTGACCGTGTAAGAGTCAGAGGAAGATCCCCAGCATTCAATGCATTAGCTGCTAACTTTGAGAACCCAAATGCTCGGAATCTATCAACACCTCCACCAGCTATCAGAAAACCATCTCCGAAGTCCCCCTCTTCAGATCCTACAAAGCCACCTCAACGAGCTGCTTCAATTGCTGCAATTTCTGCTTCTTTCGAGCGACCTAGGCCAACTCTGATACCAAAGTCAATCAAAGCGAGTCCTGATGTAAACAAGCCCCAAGTTGAAGCAAGCAAGCCTAAACCAGAGGCAAATGGCAAGGATAGTACCCCTTCAAAGGATAGCCCAACAGTAACTCCAACGATACAGGAAGATCTGAAGGAGGGACAGCCAGAAAACGAGGAAGGGCTCCCAGTGTATCCATACGAACGCTTGAGGACATCTTCCATCAATCCTGTGACAGACATTGATGTGACTAAGCGTGAGACATATCTATCTGCGGCGGAGTTCAGGGAAAGGTTTGGGATGACAAAGGAAGCTTTTGCGAAGCTACCAAAGTGGAAGCAGAATAGGTTAAAGATTGCCCTTCAGCTGTTTTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPHARSATGESLSADFIGLIWWLLCLSLTTLSGLEIWRIEKLQAVPVPKESHGRFFTGDSYVILKTTALKNGSFRHDIHYWLGKDTSQDEAGTAAIKTVELDAALGGRAVQYREVQGNETERFLSYFKPCIIPEEGGIASGFRHTEINEREHVTRLFVCRGKHTVHVKEVPFARSSLNHDDIFILDTKSKIFQFNGSNSSIQERAKALEVVQYLKDSNHEGKCDVGSVEDGKLMADADAGEFWGLFGGFAPLPRKTFSDLNGKDSAFSSKLICLNKGQTVPVDFDVLTRELLDSTKCYLLDCGSEIYVWMGRETPLEERKRAGSAAEELLREVNRPKSHIVRLMEGFETVIFRSKFSKWPKKADAVVSDESRGKVAALLKRQGFNVKGLAKAAPVKEEPQPQIDCTGNLQVWRVNGTEKTFLSFSEQCKFYSGDCYIFQYSYPGEEGEECLIGTWFGKKSVQVRLYEGKEPAEFFSIFQNLVIFKGGVSTGYKKFVSENGIEDDTYSENGVALFRVQGSGPENMQAIQVDTAATSLNSSYCYVLHDGDTLFTWIGNLSSSMDQELAERQLDVIKPNLQSRMLKEGSEYDQFWKLLGVKSEYPSQKIAKDQESDPHLFSCTFSKGVLKVREIFNFTQDDLMTEDVFILDCHSCVFVWVGQRVDTKMRAQALSVGEKFLELDILMENSSQETPVYVITEGSEPQFFTRFFTWDSAKSAMHGNSFERRLSIVKDGVKPKLDKPKRRPTTSSSHTGRSSVPDKSQRSRSMSFSPDRVRVRGRSPAFNALAANFENPNARNLSTPPPAIRKPSPKSPSSDPTKPPQRAASIAAISASFERPRPTLIPKSIKASPDVNKPQVEASKPKPEANGKDSTPSKDSPTVTPTIQEDLKEGQPENEEGLPVYPYERLRTSSINPVTDIDVTKRETYLSAAEFRERFGMTKEAFAKLPKWKQNRLKIALQLF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..30#1021..1060#1601..1725#2060..2128#2220..2462#2566..2743#2827..2959#3090..3252#3577..3724#3807..3907#4072..4227#4914..4982#5080..5217#5336..5464#6120..6267#6403..6413#6502..6642#6744..6869#6962..7027#7552..7876#7960..8189#8267..8380#ATGCCCCATGCTAGATCCGCCACTGGGGAGGTGAGAATTTAGATTCGGTTTGTGAGTTTTCCATCTGCTGTGCCTTTTTTTTTTTCGCGGAAGCGAAACTTTGATGCCTTTTTGGTGTCGGTTCCATTTTCTGATTCGGGTTTTCGGAGTACGCCAGATTTGGGTTCCAGCAGTTTTTGATTTGCCGTGCAAGGTGACTGTAGGTTGATGTGTGCCGGAACTCTGCGATCATGCGAGTTTCCTTGTGATATTTTTGGTTTTTGGATTTAGTGAGCTGGATGTAGAATTTTTTGTCGGATCCTAGGACGTCGGGTTTAGTCAATTGGATTCTGTGGCTTGAAGTTGCACAAAAAACGACACATATATTCCGTTTTGTTTTTAGCTTTTTATTACCGGGAACTGATCGAAACCAGCGTCTGGTTTTTTTGGCTGCAGCATAAAGATACCCAAACCGATGTTTCTCTTTTCTGGTACTGTGTTCTGATTGGCGATTGTTTTCTCAAGGATGTCCATTATAGAATCCTTGTGCGACGTTGCCATTAGGGGCTATGGAGTATGGTTTGATCCAGGCAGCTCCATAGAATCCTGGAATTGTGTCAAGACACGGTCCTTGTCACAAATACCAGAGTCAATTCTCTGGACTTTGGTGAATATTAGCTGCTCATTTCAGTGCTTGTGCTTGTAGCCATGTGCTAGACTGTATGATCAGTTTTTCATGAGCAATTCTTGGTGTATTGTTTTAGCTGAATAAAATTGGATTTGATTCGTCCAGGGTGACCCCAGCTTGTTAGCTTTTTTGTGATATATGCTCAGAATTCTGGGTATTGAGTGTCTATCAGGGCATCAGAGCACGTCGTAGGTCCACCAACTGTTGAACATTTCATCAGTAAAGAAAATGAGTTTTACCTATACTATGTCGTAGAGAAAATGAGTTCTATACCATATGATGGTATGATGTTGCTGCCAGAGCCACCAATTAGAATGCAGTGAGCTGTTTGGACTGGGTCTTTTTGTGTGTAGAGTTTGAGCGCAGATTTTATTGGTCTCATTTGGTGGCTACGTAAGTAAAAACGAATATTTATTTGTATGGATATTCTTGTTCAAGAGTGTTTTGAATTGGTCTGCCTTTGAGCTACAAAGCTTGCATTGTTGCAAATGGAGTCTTCGCTAAGTTTACTTAGAGATTTCCTTTTTTTTTTCCAGCACACATTTTCTTCTCTCCTGAAGCAAAAATCACCCAAGACCAGCCCTACAAAACCTAGGGGTTCTATGGCTGTTTCAATGAGGGAAGTGGATGCGGTCTTTCAAGGGGCTGGTCAAAAAGAGTATCCTTCAGCTATTTTGCCATTTTCACTTCTTTAATACATTTCCATTTAAAGAATGTCATACATATTCAATTCTCTCAATTCCGTTGCGTGCTATTGTTGAAATGATGAAGCCCATTATATCCAATAGAACATTCTTGCCATGCTTTCACTAAACACGAATTCCTATGAGAAAACATTCAACTGAATGCAAGTGGAGATATTAAACTAACATGGTGCTGCAGTATGTGCGCTTAGTTCCATTTCTTTACTTGATGACTGTTAACATATCCCAGTATGTTTATCCTTAACAACCCTCAGTGGATTGGAAATATGGCGGATTGAAAAACTGCAAGCTGTTCCAGTTCCCAAGGAATCACATGGGAGATTTTTCACAGGAGATTCCTATGTGATATTGAAGGTACAATAACTTTACACAAAAAGTCTGCTGTCTGATGTCAACCCTTCAATTTTGTAATTGTTTACACATGAACTCTTAAGTACATTAGATTTTTTTTTTTTTGGTTCCCATGAGCAGCAATTCTTCATACAAGAAGGAGTTATATCTTCTCTCCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTGTTTACTATTTTGGCATCTTGTTTCTGCTATATAATTATAGGTGATACTCTGTTTGCATTTAAAGTAGGAACAGTCCTGTTGTGAATAATTTTATGCTATGGTGGAATTCTGATTAGTACTAACTATTACCTTTATCATTATGACAGACAACCGCTCTTAAAAATGGTTCTTTTCGGCATGATATCCATTATTGGCTTGGTAAAGATACCAGTCAGGTTTGTTTTTAAATTCTAAGCTCTTGTCCATTTTGCTGAGATCCTAGATAATAAATTAGCGTTTTTAATTTACACTTCAATTAATGAACAGGATGAAGCTGGTACAGCTGCAATCAAGACTGTGGAATTGGATGCTGCTCTTGGTGGACGTGCTGTTCAATACCGTGAAGTACAGGGGAATGAGACAGAGAGATTTCTTTCATATTTTAAACCTTGTATTATACCAGAGGAAGGTGGAATTGCATCTGGTTTCAGGCATACTGAAATCAATGAACGGGAGCATGTGACAAGGTTATTTGTCTGCAGAGGAAAGCATACAGTCCATGTCAAAGAGGTGAGAGTTTTATATGATTCGTACATTTTTGCCATTTTATCCTTGTTTGGTGATAGTTACCAAATAGTAAAATACATATGCCACGTTACTTTTTTCCCTACAGGTTCCGTTTGCAAGATCATCGCTGAACCATGATGATATATTTATTTTAGATACAAAGTCCAAAATATTCCAGTTCAATGGATCGAATTCAAGTATTCAGGAGAGGGCTAAAGCCCTTGAGGTTGTGCAATATTTGAAAGACAGCAACCATGAGGGCAAATGTGACGTAGGTTCAGTTGGTAAGTTTATATTTGAGTAAAAAGGTCTAGATGGATGAGGTCATACCTTTTTCTTTCAGAATTATAACTGATCCTTCAAACAGAGGACGGCAAGCTGATGGCAGATGCTGACGCCGGTGAATTCTGGGGTCTCTTTGGTGGATTTGCACCTCTTCCAAGAAAAACCTTTTCTGATCTTAATGGAAAAGATTCTGCTTTCTCTTCGAAGTTGATCTGGTAATATGTCGTAGGGACAAATCCTAGGGCAATTTTGTTATCTTAACATTAAATGCTATCTTTTCTAAAGTTTGGTTACTATATGTCTCTTTTTGCTTCTGATGAAACACTAGTTTCTTTTTATTTTCAGTCTAAATAAGGGTCAGACAGTACCAGTTGATTTTGATGTTCTAACAAGAGAGTTGCTAGATTCAACAAAGTGCTATCTGCTAGACTGTGGATCTGAAATTTATGTCTGGATGGGTAGAGAGACACCACTCGAAGAGAGGAAACGGGCAGGATCTGCTGCAGAGGTAACATTATCTTCTCTCTGATTTCTGACTTTAAGTTCATTGGATGGCTTGTCATAATTTAACCGCTCAAATTAATGACATGCAGTACCATGATTGGGTGATCTAGCCTCTGTTTAGTTCATAGCCAGATCGTCTCTCTCCACAAATTAGGATGGTATCTCCAGTGTTGCATATTATTAATCCTAATTTAGTTATCTATCATCATAATAATATGGAAACCTGGCATTCTAAATTCTCTTTTTTTTGACTTCTTTCTCTCTATATCTTTCTCTCGCTCTTTCTCTCTCCTTGAAGATGCAGAAATTCTCACTGTCATTTATGCAGGAATTACTTCGTGAAGTAAACAGGCCAAAATCTCATATTGTTCGTCTCATGGAAGGATTTGAGACTGTCATATTCCGATCAAAATTCAGTAAATGGCCTAAGAAAGCTGATGCTGTTGTGTCTGATGAGAGCAGAGGAAAAGTTGCAGGTTAGCATATATCACAGATCATCCTTGTTTATTTTCTTTCAGTACTGAAATATGTTGGTAAATATTTTTTCTCTCTCTGTAGCTCTTCTTAAGCGGCAAGGATTTAATGTTAAGGGTCTTGCAAAAGCTGCTCCTGTGAAGGAAGAGCCTCAACCTCAAATTGATTGCACAGGCAACCTGCAGGTCTGCAAACTTTTTTCCTTGCTTAAGATTTTTAGTGCTTAAGATTTTTAGTGACATCACATTTATCTATAAATTGTTGCATTTTCTTTTGTTGAACTCTTCTGTAAATAACAAATATACATGGAACAATATGCTGCTAAAAATTTAATGGCTGTATCTTGTAGGTTTGGCGTGTAAATGGCACTGAAAAGACATTCCTTTCATTCTCTGAGCAATGCAAATTCTACAGTGGGGACTGTTATATCTTTCAATATAGCTATCCTGGTGAGGAAGGCGAGGAGTGTCTCATTGGTACTTGGTTCGGGAAAAAGAGTGTTCAGGTAACATTTGGATGTATTTCCCATCCATTGTAGTGATTTTAAACGCTGATGGTAATCCATAACAGTCATGCATGTATTGATGACTGATTAAGGTGAATTAGTGAAGTATGACTTGCAACCCCAACTTGTTCTCCCATCTAAAAGGCAAAGCATTTGAGCTGTTGAGCAGCTGTTTGTACTATGTTCTTTTTTAAAATGGATATCTTAACTCATGCAGTGCAAAGCAGTGCACTATCAAACTATTGAGATGCCAACAAGGCATTTGGCACAGTGACAAGTGGGAATGTATTTGCTCATCTTTCTCTCTTATGTAGAACATGAGCAGTAGATTTTTTAGAATATACTTATATTCTCAAAATTAGTCATACTACACCAGTCAGTCACTATTGATGAGTATGAGGTAGTACCTAGTTTCTTGAAATTTGTTCATTTCTTGTTATATTCAATTCTATCTGTGAATTGAGGGTAGATTAATCACTCTATATCTTGATTGCTCAAGTTGGAGAATTATCTAATTTCATG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External Link(s)

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