BGIOSGA021705
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA021705 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021705, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_22078 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA021705-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA021705-PA |
| Length |
6870 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:6080144..6087013 |
| Sequence Coding Region |
6086935..6087013,6085971..6086100),complement(6085812..6085883,6085641..6085712),complement(6085484..6085555 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:6080144..6087013 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:6080144..6087013 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGACGCCGGCGCCGGCGGCCGCCTCCTACCGCGCTCTCGTCGCGCTCCTGCTCGTCGCCGTCGCCGTTGCCGATGATGGGTCGACGCTGCTGGAGATCAAGAAGTCCTTCCGCAATGTGGACAACGTACTGTACGATTGGGCCGGCGGCGACTACTGCTCGTGGCGCGGCGTCCTCTGCGACAACGTCACCTTCGCCGTCGCCGCGCTCAACCTATCCGGGCTCAACCTCGGAGGCGAGATCTCTCCGGCCGTCGGCAGGTTGAAGGGCATCGTCTCGATTGACTTGAAGTCGAATGGGCTGTCTGGGCAGATCCCTGATGAGATTGGCGATTGTTCATCACTAAAAACTCTGGATTTGTCTTTCAATAGCTTGGATGGGGACATTCCGTTCTCAGTATCGAAGCTGAAGCACATTGAGAGCTTGATATTGAAGAACAACCAACTGATCGGAGTGATCCCATCAACGCTCTCACAGCTCCCAAATTTGAAGATTTTGGACTTGGCACAGAACAAACTGAGTGGAGAGATACCAAGACTGATATATTGGAACGAGGTTCTTCAATACTTGGGATTACGCGGTAATAATTTAGAAGGCAGCATCTCCCCAGATATATGCCAGTTGACTGGGCTTTGGTACTTGGATTTGTCTTACAATAAACTTTCTGGATCAATTCCTTTCAACATTGGTTTCCTACAAGTTGCTACACTATCTTTGCAAGGGAACATGTTTACTGGTCCTATTCCATCAGTTATTGGACTTATGCAGGCTCTCGCTGTACTGGATCTGAGTTACAACCAATTGTCTGGTCCTATTCCATCGATACTAGGCAATTTAACATACACTGAGAAGCTGTATATGCAAGGCAATAAGTTAACAGGTCCAATACCACCTGAGCTTGGAAATATGTCAACCCTTCATTACTTAGAACTTAACGATAATCAACTTAGCGGGTTCATTCCTCCAGAGTTCGGAAAGCTAACAGGGTTATTTGACTTAAACCTTGCAAACAACAACTTTGAAGGTCCAATCCCTGATAACATAAGCTCATGTGTGAATCTCAATAGCTTCAATGCTTATGGCAACAGATTAAATGGGACCATTCCTCCTTCATTGCATAAACTTGAGAGCATGACTTATTTGAATTTGTCATCAAATTTTCTAAGTGGTTCTATTCCTATTGAGCTATCGAGAATCAACAATTTGGACACCTTTAACTTGAGCAACAATGGTCTAGTAGGATTCATTCCTGCAGAAATTGGCAACTTGAGGAGTATCATGGAGATTGATATGTCCAACAATCATCTTGGCGGTTTGATTCCTCAAGAACTCGGAATGCTGCAAAATCTGATGTTGTTAAATCTCAAAAACAACAACATAACTGGGGATGTCTCTTCACTGATGAACTGCTTCAGCCTCAATATCTTAAATGTATCCTATAATAATTTGGCTGGTGTTGTACCTACTGATAACAACTTCTCACGGTTTTCGCCTGACAGCTTTTTGGGTAATCCAGGACTTTGTGGATATTGGCTTGGTTCTTCGTGCCGTTCATCTGGCCATCAACAGAAACCACTAATCTCAAAGGCTGCAATACTTGGAATTGCCGTGGGTGGGCTTGTTATCCTCCTGATGATCTTAGTAGCGGTCTGCAGGCCTCATAGTCCACCTGTTTTCAAAGATGTCTCTGTTAGCAAACCAGTGAGCAATGTTCCCCCCAAGCTGGTTATCCTTCATATGAACCTTTCCCTTCTTGTATACGAGGATATAATGACGATGACTGAAAACCTGAGTGAGAAGTACATCATTGGGTACGGAGCATCCAGCACGGTTTATAAATGTGTTTCGAAGAACCGCAAACCAGTGGCAGTAAAAAAGCTATATGCCCACTATCCACAGAGCTTCAAGGAATTTGAAACTGAGCTTGAGACTGTTGGTAGCATCAAACACCGGAATCTAGTCAGTCTTCAAGGATATTCCCTATCTCCTGTTGGAAATCTTCTCTTCTACGATTACATGGAAAATGGAAGCCTCTGGGATGTTTTGCATGAAGGTCCAACTAAGAAGAAAAAACTTGATTGGGAAACTCGTCTACGAATTGCTCTAGGTGCGGCCCAAGGCCTTGCTTATCTTCATCATGACTGTAGCCCACGGATAATACACAGGGATGTGAAATCAAAAAATATACTCCTTGATAAAGATTATGAGGCACATCTTACAGACTTTGGCATTGCTAAGAGTTTGTGTGTTTCAAAAACTCACACGTCCACCTATGTCATGGGAACTATTGGCTATATCGATCCTGAGTATGCTCGCACCTCCCGTCTCAATGAAAAGTCTGATGTCTACAGCTATGGCATTGTTCTGCTTGAGCTGCTGACCGGAAAAAAGCCAGTGGACAACGAGTGCAATCTCCATCACTTGATCTTGTCAAAGACGGCTAACAATGCTGTCATGGAGACAGTCGACCCGGACATTGCAGACACTTGCAAGGATCTTGGTGAGGTCAAGAAGGTGTTCCAGCTGGCGCTCCTTTGCACCAAGAGACAACCATCGGATCGGCCGACAATGCACGAGGTTGTGCGCGTCCTGGACTGCCTAGTTCGTCCCGACCCGCCACCGAAGTCCGCACAGCAGCTGGCCATGCCGCAGCGGCCTGCTGTCCCGAGCTACATCAACGAGTATGTCAGCTTAAGAGGCACCAGCGTGCTCTCCTGCGCCAACTCGTCGTGTACTTCCGATGCTGAGCTGTTTCTCAAGTTTGGCGAGGTCATTTCTCAGAACACAGAGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTPAPAAASYRALVALLLVAVAVADDGSTLLEIKKSFRNVDNVLYDWAGGDYCSWRGVLCDNVTFAVAALNLSGLNLGGEISPAVGRLKGIVSIDLKSNGLSGQIPDEIGDCSSLKTLDLSFNSLDGDIPFSVSKLKHIESLILKNNQLIGVIPSTLSQLPNLKILDLAQNKLSGEIPRLIYWNEVLQYLGLRGNNLEGSISPDICQLTGLWYLDLSYNKLSGSIPFNIGFLQVATLSLQGNMFTGPIPSVIGLMQALAVLDLSYNQLSGPIPSILGNLTYTEKLYMQGNKLTGPIPPELGNMSTLHYLELNDNQLSGFIPPEFGKLTGLFDLNLANNNFEGPIPDNISSCVNLNSFNAYGNRLNGTIPPSLHKLESMTYLNLSSNFLSGSIPIELSRINNLDTFNLSNNGLVGFIPAEIGNLRSIMEIDMSNNHLGGLIPQELGMLQNLMLLNLKNNNITGDVSSLMNCFSLNILNVSYNNLAGVVPTDNNFSRFSPDSFLGNPGLCGYWLGSSCRSSGHQQKPLISKAAILGIAVGGLVILLMILVAVCRPHSPPVFKDVSVSKPVSNVPPKLVILHMNLSLLVYEDIMTMTENLSEKYIIGYGASSTVYKCVSKNRKPVAVKKLYAHYPQSFKEFETELETVGSIKHRNLVSLQGYSLSPVGNLLFYDYMENGSLWDVLHEGPTKKKKLDWETRLRIALGAAQGLAYLHHDCSPRIIHRDVKSKNILLDKDYEAHLTDFGIAKSLCVSKTHTSTYVMGTIGYIDPEYARTSRLNEKSDVYSYGIVLLELLTGKKPVDNECNLHHLILSKTANNAVMETVDPDIADTCKDLGEVKKVFQLALLCTKRQPSDRPTMHEVVRVLDCLVRPDPPPKSAQQLAMPQRPAVPSYINEYVSLRGTSVLSCANSSCTSDAELFLKFGEVISQNTE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..79#914..1043#1131..1202#1302..1373#1459..1530#1641..1712#1792..1863#2148..2219#2459..2527#2622..2693#2794..2865#3018..3089#3171..3242#3334..3405#3486..3557#3709..3780#4013..4084#4162..4233#4323..4391#4476..4547#4634..4707#4795..4923#5100..5447#5632..6005#6502..6870#ATGACGCCGGCGCCGGCGGCCGCCTCCTACCGCGCTCTCGTCGCGCTCCTGCTCGTCGCCGTCGCCGTTGCCGATGATGGTGGGTGGATGGCTGGCTAGCTAGCTGGCTGTTGGTTTTCGGTTTTGGTTGGTTTCTTGCTGGGGGGAGTGTGTGGTTTTGTGTACTGGGGAGCAGAGAGATTCAGGGGGGAGTTGGTTTGATGGGATTAGTATTTTATTAGTGTTGCAAGTACTCTTCCTTTTTGGAGGCATGGTGATTCTCTTGTGGGTGATAGTCCTACTACTATTTTTTATTGTCCTAAGATCTCCCTAAGAAGAGTCTAATACTTTAACTAATCCTTGTGAGTGAGTTGTGACAAGTGCCACTTCCATCTCTTCTCTTCCTTCTTGTACTAGAACACAGTTGCTGGCATTTTGTTTATGGTGGTGGTAGCCACTAGGTAATCCACCAATATTTCATAATGTGATTCTTTTTTTTTTCACTTTCTGTTTTGTTCTACAAGGGACTCCGTTCTGCTTTGGTATTCTGTTACTTATCAAGAAGTCGTCTGGCCATTTTTGAATCTTTGTGCTCATTGTTCAAGGAAGGAGCTTTATTTCTTCTTTTGTATGTTACTACCAATCTGATGAGCCGAATGCTGCTGCCCGCGTCAGGAATCTTTAGGCTTTGTAGCAACCTTTTACTTTACTATTGTGCTGATTTTTGTGCTTTCCAATCTGATGTTCTTGAACTCTTTTTTTTTTTTGTCTTGAAGGCTAAGAAACATAAATCTTTATTTATTAGTACTACTACGTAAATAGATTTTTTCCGGGGCGAACAAATCTGTGCAGATTGTGCTGTTCTAGAATCCATTTGCTGTTGCAGGCTTGCAGTTTGTGATCTGTGTTCTAATGTGGCTGTATTTGCATTCAGGGTCGACGCTGCTGGAGATCAAGAAGTCCTTCCGCAATGTGGACAACGTACTGTACGATTGGGCCGGCGGCGACTACTGCTCGTGGCGCGGCGTCCTCTGCGACAACGTCACCTTCGCCGTCGCCGCGCTGTAAGAAGAACACCACCGAGTTCGCTACTTTTCTTGCTGACAAGTCCACTGGTTCGTCACTGATCATGCCTGTTGATTGCAAAGCAGCAACCTATCCGGGCTCAACCTCGGAGGCGAGATCTCTCCGGCCGTCGGCAGGTTGAAGGGCATCGTCTCGATGTATGGAAGACGTGGTGGTGTACTTTGTTGTTGTTTGGAAATGTGGCTTGCTGGTGCTTGGACTCGCAGTAACTTGTGAGCTTGGGTTTGTACCTGCAGTGACTTGAAGTCGAATGGGCTGTCTGGGCAGATCCCTGATGAGATTGGCGATTGTTCATCACTAAAAACTCTGTGAGTTGTGTGGAGTGTGGACGGCATTATCGATTTCTTCTTAACTTACGGAGAGAATGTGGGTTGATACATGTGTTTGGTTCAGGGATTTGTCTTTCAATAGCTTGGATGGGGACATTCCGTTCTCAGTATCGAAGCTGAAGCACATTGAGAGCTTGTATGGCCTATTCTTGCTGGAATTCATTTATTATAAGCAGTGTTGTATGGACATGCCGATCGTGTTCTGTGAAATAGTTTTATTCATGTGCCGGTGTTGTGGTTTTCTAGGATATTGAAGAACAACCAACTGATCGGAGTGATCCCATCAACGCTCTCACAGCTCCCAAATTTGAAGATTTTGTAAGTTGCGCGAAACTTCTTATTTTTGTGGTGTTTAATTACCGTGCTCCCAGTTTTCTAATTGTTGTGTGCCCTGCAGGGACTTGGCACAGAACAAACTGAGTGGAGAGATACCAAGACTGATATATTGGAACGAGGTTCTTCAATACTTGTAAGTCATCCTTATTTTGCGCTGGAAGTTTGAAGATTGTGCAGTAGTTCTAGTATATCAGTATTTTATTGTATTTTAGTTATGTACCTACTTGAATGCGATTTCTTTTTTTTTCTTTTTTTTGAAAATCATTTGAATGTATTTAAGAGCATGTCAAAAGTTTGTTAAGCTGGTAAAAATCTATATTGACTTTATGTGAATTCACTAGCATTTTACGCAAGTTGCGTTATGTAAAATACTCATATTTTTTTTATGAATTGTGGCTGAATTAATATTATCCTCAGGGGATTACGCGGTAATAATTTAGAAGGCAGCATCTCCCCAGATATATGCCAGTTGACTGGGCTTTGGTACTTGTGAGTATATGCATACTATGTTTTCGGCAAAATTTGCCTCGAGTCCACCGTATTGTACTTATGTTTCAATCATTTGGACCAGTGACGTAAAGAACAACAGCTTGACTGGGCCGATACCAGAAACCATTGGGAACTGTACAAGTTTTCAGGTCTTGTACGTATTTGCAGCTTACCCCTCTTAATTACAACTTTTCTGCTTCTGTGTTTGTGAGGTTTTCCTAACATTTCTTTCATGTTAGGGATTTGTCTTACAATAAACTTTCTGGATCAATTCCTTTCAACATTGGTTTCCTACAAGTTGCTACACTGTATGTGGTGATTATCTTGACAAAAAAAAAACTCAATTAAATGTTTAATACAGTTTTTGCTGATCTGCATGATTATTCACATTGTTTGAATTAGATCTTTGCAAGGGAACATGTTTACTGGTCCTATTCCATCAGTTATTGGACTTATGCAGGCTCTCGCTGTACTGTAAGTACAATGATGAACTGAATATTCATCATACAATTGGTTATTGATAAATGAAGCTTTCAAGATATTTTAATTCATCAATATAACTTTACTCTTCCAGGGATCTGAGTTACAACCAATTGTCTGGTCCTATTCCATCGATACTAGGCAATTTAACATACACTGAGAAGCTGTAAGTTTTCTTTTCTCCTAAATCGTTAGGTTGTGAATATTTTCCCTGATAGATTTTCTACTGCCAGTTCATAGTTAAAAAACAAAAGCCTTAGAAGGTTCTGCTTAGGAATATTTCTTGTGTAAATTAATATGTTATATTTGTTCCAATAGGTATATGCAAGGCAATAAGTTAACAGGTCCAATACCACCTGAGCTTGGAAATATGTCAACCCTTCATTACTTGTAAGTGCACGTTTTATTTTATTCCCATAGCATATTCTGATTTGTTGTGACCTGATTTATGTCATTGTTGACTAATTTCAGAGAACTTAACGATAATCAACTTAGCGGGTTCATTCCTCCAGAGTTCGGAAAGCTAACAGGGTTATTTGACTTGTAAGCTCTTTTTTCAAACTCTTCAAAATTTGTTATGTTTTCTATAATTTATTAGTAAAACAAGCGGCTTATCTTACTCTTTGCTTCACAGAAACCTTGCAAACAACAACTTTGAAGGTCCAATCCCTGATAACATAAGCTCATGTGTGAATCTCAATAGCTTGTAAGCATGATTTAATTATAATTGTTATGGTGGAACTTACAATTTCAGATGCATGTATCTAATGTGGATTTTCTTTACAGCAATGCTTATGGCAACAGATTAAATGGGACCATTCCTCCTTCATTGCATAAACTTGAGAGCATGACTTATTTGTAAGTTGTAACAATTTTAATTTCTTAAATTGTGTTGTTACATTATTTTTCCTTTTGAACTTCTATACTTGTTTAATTTTTGTATTTCACATAGAAAAACCTTGTTTCCCATGTTTGATTAGTACCATATGTTCATCTGTTCTTTTCTTAGGAATTTGTCATCAAATTTTCTAAGTGGTTCTATTCCTATTGAGCTATCGAGAATCAACAATTTGGACACCTTGTAAGTCCTGTTAGCTCCATCTATGAATTCGAAAATATCTGTTCTATCCTATTGTGTGTGTGATGAGGTACCTGTATCAGGGATTTATCCTGTAACATGATTACTGGCCCAATTCCATCAACCATTGGGAGTTTGGAGCATCTATTAAGACTGTAGGTTTTGTTGTCCCCATCTTGTATGTATCTATTATAGTGTCTTACAGTGTTTGATGTTATTGAACTTGTTTGTTCAGTAACTTGAGCAACAATGGTCTAGTAGGATTCATTCCTGCAGAAATTGGCAACTTGAGGAGTATCATGGAGATGTAAGTATTTGCTTAGGTGTGAATTTTTTAACCATCTAGTCCCATAGGTACTATACCCCATATTTGTGGTTTTTCAGTGATATGTCCAACAATCATCTTGGCGGTTTGATTCCTCAAGAACTCGGAATGCTGCAAAATCTGATGTTGTTGTAAGTAGTACCTTTCATGTCAGCCTTCTTTTTAAACCCATAAGGACATTGAATCTGTAGCCTGAGAGACATCTGTCTATCATTCTCAGAAATCTCAAAAACAACAACATAACTGGGGATGTCTCTTCACTGATGAACTGCTTCAGCCTCAATATCTTGTAAGTTGAATAACCAGAAAATTTTTGAAGCATATGCTCCAGTATATGTTTTTTGCTCACATTATCTATCTGTTTTATGATCAGAAATGTATCCTATAATAATTTGGCTGGTGTTGTACCTACTGATAACAACTTCTCACGGTTTTCGCCTGACAGGTAGTGTGCTCCATCATTTCCATCACTATCATGTTCATTTACTCAGCCTTGGAAATAGCAGTTTAACAATGTGATACTTTTCTTAGCTTTTTGGGTAATCCAGGACTTTGTGGATATTGGCTTGGTTCTTCGTGCCGTTCATCTGGCCATCAACAGAAACGTAACAAATA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