BGIOSGA021758
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA021758 |
|---|---|
| Description |
Glutamate receptor |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021758, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_21964 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA021758-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA021758-PA |
| Length |
8141 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:5043935..5052075 |
| Sequence Coding Region |
5051742..5052075,5045500..5046734),complement(5045109..5045427,5044609..5045015),complement(5043935..5044318 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:5043935..5052075 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:5043935..5052075 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGAGCTCGCGGTCGCGGCTCGCTCTTGGCCGGTACGATACTACTACTAGCTATGTCGTCTTCTCCTTGCTGCTCGTGCTCGCCGGCGTTGCTGCTGCTGCGGTGGCGGGGGCGAAGAGCGCCGCCGCAGTGCGGGTCGGCGTCGTGATGGACCTGACGAGCGACGCGACGAGCGACGCGGGGAGGAAGAGCGCCGCGTGTGTTTCCATGGCGCTCGACGACTACTACTACGCCGCGCAGGCGCACGACGCCGACGCCGCCGCCGCCGCCGCGCGGGTGGAGCTGTTCGTCAGGGACTCGCGCGGGGATGTCGTCACGGCAGCGGACGCTGCTAATGATCTGATCACGAATGATCAAGTACAAGCCATCATTGGACCTCATACTTCAACTGAATCTGAGTTCATCGCTTACCTTGGGAACCACACGCACACTCCAATCCTCTCTTTCGCTGAGACCTCTGCAGTTGATGTACCTTTCTTCCTACATACTGCACCCAGTGACTCCATCCAGGTTGCACCTATTGCTGCCATCCTTGATGCGTTCAACTGGCGAGCAGCAGTTGTGCTGCATCAAAACTCACCTTCTGTAGCTAGCATTCTACTGGATCTTGTTTACGCCACTCAGGGTTACAACATACGTATCATGGATAGGGTGGCTTTGCCGATCGATGCGACTCAAGACTACCTCGACAATGTGCTCCACAACCTCAAGGAGATGCCTACACGGGTGTTCATTGTGCACATGCTCCCAGATCTTGCTTCGAACGTTTTACGCCAGGCGAATGTTGTTGGTATGATGTCTGATGGCTATGTTTGGATAGCCACTACAAGCATTGGCAGTGTGGTAGATAGCCTCAGTTCAGACATGATTGAAAAGATGCAGGGGGTTGTTACCCTCCGACCTTATGTGCGTGAAACAGGCCATGTCATGAAGTTCATATCAAGACTCAAGGCAAGGTTTTGGATGGAGAATCGGAGCATTGACAATGTGCACAACCCAAGCGTGCCTCTACTCTGGGCGTACGACACAGCATGGGCTCTTGCCACAGCAGTCAATTTGGCCAATGTGTCTAGCTCAACACCTGGAGCAACACTTCTCGGTGCTCTGCTCAACACAACATTTGACGGGCTGGCTGGGAGGTTCAGGTTGGTTAATGGTCAGCTGCAATTATCAGAATTCGAGATTGTTAACATCATTGGTAAAGGTGCAAGGACAGTGGGGTTCTGGACACCAGAATCAGGGTTTTTTAAGAATCTGAAGAACATTAGCGAAAAAGGGCTGAAACAAATCATCTGGCCTGGTGATGTAGCAATTGCACCGAAAGGGTGGAATCTGTCACCGAATGGGCAATTTCTTCGTATCGCCGTACCTTCGAAACATGGGTTCCCGCAGATTGTGGATGTCTCCTACAGCCCAACAACCAACAATTATGTTGTCAAAGGCTATTGCATTGATGTTTTTGATATGCTCATGAAGAACCTGCACTACCCAGTGGCGTACCAATATGAGCCAATTGGTAACAGATTGAGTAATTATGACAGCCTTCTTAGTCTAGTGCATGAAAAGTTGCAGAAAGTTGATGCTATGGTCGGCGATACGACAATTACGGTGAGCAGGATGAATAAGGTGTCCTTCACAATGCCCTTCACTGAAGTGGGGCTGTCTATGGTTGTTGCAGTGAAGAAAGAAGCAAGCTGGAGCATGTGGATCTTCCTGCGGCCGTTGTCGACTACCCTCTGGATCGCCAGCCTTGCCTTCTTCTTCTTTACCGGATTCGTTGTTTGGGTGCTTGAACATCGAATTAACCCTGAATTTCGTGGCACGCCTTGGCAGCAGTTCGGCATCACCTTCTACTTTGCCTTCTCGACTCTAGTTTTCTCCCACAAGGAGAAGCTGGAGAGCAACCTGTCAAGATTTGTGGTGATCATATGGGTGTTTGTCGTGCTTATTCTGACCTCAAGCTACACGGCAAGCCTGACATCAATGCTGACGGTCCAGCAGCTCCAGCCGGCAGCAACCAGTGTCCAAGATCTCCTAATAAACGGCAACTATGTCGGATATCAGAAGGGCTCCACCGTGGTGCGCTGGCTTGAGGAAATGGGCTTCCACAAGGAGAATTTGCGCGGTTATGCCTCGTTGGAGGAGTATGATGATGCCCTTCGGAGGGGTTCTGAAAATGGTGGGGTATCTGCTGTATTTGATGAGATACCTTACCTGAAGGCCTTCCTGTCAAAGTATTGTCAAGGTTACACCATGGTTGGCCCGACCTACAGGTTGGGAGGCTTTGGATTTGCATTTCCGATAGGATCACCGATAGTGCACGACATATGGCAAGCCTTCATGCTGCCCTCGGTGCAGGAGGAGATGGCACGGATAGACAGGAAATGGTTCGGCGACACACAAACCTGCGAGGGCAAGAGCAGCGGCGTCGACTCGTCATCATCCAGCCTTGGGTTCAGCAGCTTCAGTGGGCTGTTCTTCATCAGCGGCATCACCTCTGGCCTTGCGCTCCTTGTCCACCTTGGCATTCTCGCCTACCAGAAGCACGACGAGCTCAGGGCTGCAGTTGCTGGCATCATCAGGGCAGCATCACAGAGGATGTGTTTGTTACTCCGACGCCTAAGATCGGAGCCAGAGGTAGATGTTCTTCATGGAGGCGACACGGTGAGCCTCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASSRSRLALGRYDTTTSYVVFSLLLVLAGVAAAAVAGAKSAAAVRVGVVMDLTSDATSDAGRKSAACVSMALDDYYYAAQAHDADAAAAAARVELFVRDSRGDVVTAADAANDLITNDQVQAIIGPHTSTESEFIAYLGNHTHTPILSFAETSAVDVPFFLHTAPSDSIQVAPIAAILDAFNWRAAVVLHQNSPSVASILLDLVYATQGYNIRIMDRVALPIDATQDYLDNVLHNLKEMPTRVFIVHMLPDLASNVLRQANVVGMMSDGYVWIATTSIGSVVDSLSSDMIEKMQGVVTLRPYVRETGHVMKFISRLKARFWMENRSIDNVHNPSVPLLWAYDTAWALATAVNLANVSSSTPGATLLGALLNTTFDGLAGRFRLVNGQLQLSEFEIVNIIGKGARTVGFWTPESGFFKNLKNISEKGLKQIIWPGDVAIAPKGWNLSPNGQFLRIAVPSKHGFPQIVDVSYSPTTNNYVVKGYCIDVFDMLMKNLHYPVAYQYEPIGNRLSNYDSLLSLVHEKLQKVDAMVGDTTITVSRMNKVSFTMPFTEVGLSMVVAVKKEASWSMWIFLRPLSTTLWIASLAFFFFTGFVVWVLEHRINPEFRGTPWQQFGITFYFAFSTLVFSHKEKLESNLSRFVVIIWVFVVLILTSSYTASLTSMLTVQQLQPAATSVQDLLINGNYVGYQKGSTVVRWLEEMGFHKENLRGYASLEEYDDALRRGSENGGVSAVFDEIPYLKAFLSKYCQGYTMVGPTYRLGGFGFAFPIGSPIVHDIWQAFMLPSVQEEMARIDRKWFGDTQTCEGKSSGVDSSSSSLGFSSFSGLFFISGITSGLALLVHLGILAYQKHDELRAAVAGIIRAASQRMCLLLRRLRSEPEVDVLHGGDTVSL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..334#5342..6576#6649..6967#7061..7467#7758..8141#ATGGCGAGCTCGCGGTCGCGGCTCGCTCTTGGCCGGTACGATACTACTACTAGCTATGTCGTCTTCTCCTTGCTGCTCGTGCTCGCCGGCGTTGCTGCTGCTGCGGTGGCGGGGGCGAAGAGCGCCGCCGCAGTGCGGGTCGGCGTCGTGATGGACCTGACGAGCGACGCGACGAGCGACGCGGGGAGGAAGAGCGCCGCGTGTGTTTCCATGGCGCTCGACGACTACTACTACGCCGCGCAGGCGCACGACGCCGACGCCGCCGCCGCCGCCGCGCGGGTGGAGCTGTTCGTCAGGGACTCGCGCGGGGATGTCGTCACGGCAGCGGACGCTGGTACGGCTTTTTTCCGCGGGCCGAACTTTTAATACTCCGACAAAGACGGTTTTAACTTGGATCAAAGTTAAATTGCTTTAAGTTTGATCAATTTATAGAAAATAGTAACATTTTTAACCTAAGACAAATTTATTGTGAAAATATATTCAATTATTGATTTGATGAAACTAATGTCGTATTATAAACATTTTTATATTTGTATGTAAACTTAGTCAAATTTAAACAATTTAGTTTTGACTAAAGGCAAAACGTCTTATAACCTGAAACACAAACAGAAGGAGCAGGCACTTGTACGGACATTTTTATTCTTGCTTTAGTACTCCACCCATCCCAATAATATCTAGGAGACTAGAATTGGATAGGACATATCTCAAGTATATCCAAATGAATTTTGTTATATGTATGACCGAGCTATACAACTCGTGCCCGACTGTGTCATGTCTATCAATCACTGGGCTTGTTTACTACTCCCTCTGTCAAAAAAAAAAGACAACCTAGGAGCGGATGTGACCTCTCCTAGTACGACGAATCTGGACAACTCTCCGTCCAGATTCATTGTACTAGGAGGGATCACATCCCCTCCTAGGTTGCATTTGTTTTGGGATGGAGGGAGTACTATGCAGGCCTAGACATGCAGCATCGATGTCTATACATACACTAGTTGGATATAAACTATATACATAAGTCGGACGTATAGTAATTTTCATCTAGATTCATAGGATTAAGATGTATTTTATTCAATCCTAGACTATTATATTTTGATATAGAGGGACTAAAAGATAGAGGGACTAGCTAGGAAGTTATGTTCAAACTGCATGCTATTTTGTTGCACTCTCCAATGAACTCATTAATTTTGGCTCGCTATATTCCATTCATCTTCTATATGTTATTAATATTTTATATCGATAATAAAATTCAGATCAATAACGTAGTGCCACGTCAGAGAGAGATGAGATAGCTAGGGAGCCAAAAGTGGCTTATAGGTGAAAATAGAACGATTATGGCTTGTGGGAAAGATATATATGAGAGAGTAAAATTGATACTGGTACTTCGAATCTTAAACTGTAAAAAGAAAAACGAAAAGTGTTGTATCCACCTGTTTATCCCATAATATCAAACATATATTAAAATCTATTACAAATCCACCAACAAACCTTATTAAAGATTGGTTATCAATTTTAAGAGCTTATTTCAGTTCAAAAAAAATTTTAAGAGCTTACAAGTAATATTGCATTTTTCTTATATATCTTTTTTAACACTCCAATTGCCTCCTTAAATTTAATATCATGAACTAGAGATACAAATAGATGTAAGTTCCTGAATTTAATTTTGAGGAAAAAAGATGAGATAGGATATGGGATCAGTGATATGTTATCCTACACTACTTGTAACCGGTTCCGAATTTTAAAAAAAAATATATGAGTTAGGATAAGGAAAATATCATCATTCAACCATGTCCGATCCGATTTCACCCATACTCCTTAGTCCCTACATCTTGGAGGGAGGGATTGAAGCAAAAATAGGGAATGTAGGGAACATGATATGTAGCCATATGTTAAATATGGGTGAAAGAGAATAAAAATGTGTCCATACGATTGTTACAGATATGAAATAGTTCTCACAACATCAAATAAATCCCTACTAATTATAAAAATTAGGGTTCAAAATTCAAACCCCCGAGCATTCAAAATGTACACTATAGTATGCTATGATGACAAATAAGATGTATTTTTTGAGTTTTATGTTTAGATAGACAACTGTTTTCTAAAGACACGAGTATTGAGTTGAATACCTACCTATAATCGGACACAGATTTTTTTGCACCTAGGACTACTAATTTTAAGTATAAAGCTCCCCTATAATTATGCTGCTGCTCTTAATTTCTACCTGAATCCGAGCATTGAAGCAAGTTCTTTATCGCACCGTAACTGAGTCTCTCCTTGCAGCTCTGACCAATCCATCCCTCATTGCAAATAAGCACTCCTTCCTCTTTGGTTGTATGTCCATTTTTCTTGATGTCTGGCTTACCGGGTCTAGTGCAACCGCACCATTATTTGCATACGACTTAAATAGATTAAAAAAATTGGTAGTATTGATCAATCAATACAAGAAAACGGAATGTCCTTGGCGACCATACGATTTCTTTGGCGGTCGAAAATTAGCCGCCAAGATTAGTCTTTAATTTGGTGGTTCGAACTAGCCGCCAAGCATACACATATTAATTGACGGTTGTTTACAAGCACCAAGGTTGGAAAGCTTTCCTTGTCTGTTGCTATACTTGGTGGTTTTCATGCTATACTTGACAATGATATTCTGTTTTCTTGTAGTGAATGGCGCAAATCTATACATAAACATGTAAGGCTAAAGTTGATATAATTAGAGAAAAAAATAATAAAATCAGACTAGGAACATTACATCTACGGCACAAATAAAATTTGTTATTTTTCTTTCTTTATATATAGATTGAATTTTGATGTGTATGTTTGCACGGTGGTTTATATCATCTTTATATATCTCTACTATTATAAAATTAAAGATGTTTTTGTTGGTTCTTGGGTACGTCATCCGTGTATGAGTCGGTTTTTAAATTTATTTGTTTTTAAAAATACATATCCGTATTTGACTCGGGTTTTAAATTTGTTCGCTTTTGGAAATATAAAAGGAATCGTATAAAAATTGAAGATGTTTTTGCCGGTTCTTTGGTACGTCATCCGTGTATGAGTCGGTTTTTAAATTTATTCATTTTAGAAATACAGATCCGTATTTGAGTTGGGTTTTAAGTTTGTTCGCTTTTGGAAATATAGAAGGAGTCGTATAAAAATTGAAGATGTTTTTGCTGGTCGTTTGGTACGTCATCCGTGTATGAGTCGGTTTTTAAATTTATTTGTTTTTGTAAATACAAATCCGTATTTGAGTCGGGTTTTAAGTTTGTTCGCTTTTAGAAATATAGAAGAAGTCATAAAAGAAATCTCTTAAAAAAAACTCACATGCTTAACTTGACATGAATTTCTTGAAAAATATATATCCAAGCGAATTCTCGCAGTGAATTTCACATTGAACAATAATAAGATTAAAATAGCCTTCATCCGTTGCAACGCACGGGCATTTTTTCTAGTCATATTAAAATAAATGAAATATTTACATAATAACTATATATAGGTAACAAAATACTTTCCCACCTATAATTAAGCGACATATTTTATCTGATTTTGGAATGAAGAGAAAAAAAAAGCAAAACAAACTGACAAATTAGGACTGGAAATAGACATTCTGTCCATCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACTCTGCACATTATCTACTATCGCCGTATCCCGTAGCCACTCTGTAATCTGCATACATCTGCTGCTACTAGGGATGGCAATTTTACCCATGGTCCTGGTATCCGTGGATAACCGACCCGATGGGTACGGGCGTGGGTGTGACTTTTTACCCATGGGCACGCCCGTCCGAAACCCGAAGACATTATGGGTAATAGGCGGGTTTAATTTTTTACCTGTGGATAACCCATGCCCGACCAGATAGATATGTATTACTCCCTCCGTTTCACAATATAAGTCATTCTAGCATTTCCCATATTTATATCGATGTTAATGAATCTAGACATATATCTCTATCTAGATTCATTAAGATCAATATGAATGTGGAAAATGTTAGAATGACTTACATTGTGAAACGGAGGAAGTAACTAATTTTAACTCATTTCTTAATTCTTATACCATTTCTCTCGGTTCATTTGTGATGCTAAATAATACTAAGTTGTGATGTAATTCAAATTATCGTTGATAACCGATAATTTGGTAAATTATTGATTTTATTTCTCTTTGTTAAATTACATATCTTTCAAGTTATTATTCATATGAGATCCATTGGGTACCCGCCGGACATACCCGTGCCCGCCGGGCATGGGTACGGACACGGAGTTTTGCCCGTTAACTCTAGTGGGTAGGGTTTAGGCAGGCAATGTCGGGCATCGGGTCGGGCATGGTTTTGCTCTACCCGTGCCCGACCCGACCCATTGCCATCCCTAGCTGCTACCAAATCCCCCGAAATTTTATTGGACTGGTTGTGCCGGCGATCGCCGGCGGCGGGAGGTAGAGAGGCAGATTTTGGGGGGAAAGTTTAGGCTGATCTGTGAGTACTACATTTAAAGGAGATATGGCGGACGGGGAAGACGCCCCGTCGAGAGCTCCGATGGGCGGTGGCCCTTGGCTGCTGCCCGCCGCGGTCTTGAACAGCGGATCAGCGGAGGTCCAAATTCCATGGCCACCGCGAGCTGCGAGCATAAGAAGCAGCCGTCGGTATCTTTTGTTTTGGCTGATTTAGGTGCGTATCCATCTTTCTTTCGAGCTGAGTTTCTTTGATCTTTAATCAGTATATAGAACGGAAGAACATCAACAGGTAATTTCCTAGAAAAACAAACAATAACGGAAGAACATCATCAGCAGGTAATTTCCTAGAGAAAAAAACAATGTGTGTAGGGTACATAGGTGCCACTCTGCACTTCTGCACTGATGTGGTCAATTCCTTGTCCATAGAGAAGATGTGGTTCTTGTCAACTAATGTTGTTGAGAGCAACTGAACA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