BGIOSGA023388
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA023388 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA023388, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_23945 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA023388-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA023388-PA |
| Length |
8369 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:28309400..28317768 |
| Sequence Coding Region |
28309400..28309438,28310835..28311061,28312726..28312964,28313807..28314026,28315645..28315757 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:28309400..28317768 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:28309400..28317768 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTCTCGTAGTGGTACCGCCCGGCCAAATGCTACTGTATTTGCTGTACGGGCCGGTGGTGGGGAAGGTGGTGCAGGAGTGGAGGGAGCAAGGGAGGTTGCCGCTGGGGACGTCGTGGTGCCTCCACCTCATCCTCCTCCTCGCGCTCCGGTCGCTCACCTACCAGCTATGGTTCTCCTACGGCAACATGCTCTTCTTCACCCGCCGCCGCCGCGTCGTCGACGACGGCGTCGACTTCCGCCAGATCGACACCGAGTGGGACTGGGATAACATGGTGATCATGCAAACCCTAATCGCGGCGGTGCTGGTCACCAGCCGTGTCTTCCCTGCCACGTCGGATCTCTCGGCGTGGGACCTACGTGGGTGGGCCATCGCTGTGGTGCTGCACGTGGCCGTTTCAGAGCCGGCCTTCTACTGGGCCCACCGGGCCCTCCATCTGGGCCCACTCTTCAGCCGGTACCACTCCTTGCACCACTCCTTCCAAGCCACCCAAGCTCTCACAGCTGGGTTCGTGACGCCATTGGAGAGCCTGATCCTGACGCTGGTGGCGTGGGCCCCACTTGCAGGGGCCTTCATGGCGGGACACGGCTCCGTGAGCCTGGTCTATGGACACATCCTCCTCTTCGACTACCTCCGGTCCATGGGGTACAGCAACGTCGAGGTCATCTCACACAAGACCTTCCAGGATTTTCCCTTTCTCAGATACCTCATCTACACACCATCGTATCTTAGCCTACACCACAGGGAGAAGGACTCCAATTTCTGCCTGTTCATGCCTCTCTTTGATGCCCCTGGGAGGGACCCTCAACCCCAAGTCTTGGCAGCTTCAGAAGGAGGAAAGAACCATCGGGTGCCGGACTTTGTGTTCCTGGTGCACGTGGTGGACGTGGTGTCGTCGATGCACGTGCCATTCGCGTTCCGCGCGTGCAGCTCGCTGCCGTTCGCGACGCACCTCGTCCTTCTCCCGCTCTGGCCCATCGCCTTCGGCTTCATGCTCCTCCAGTGGTTCTGCTCCAAGACCTTCACTGTCAGCTTCTATAAGCTCCGCGGCTTCCTCCACCAGACCTGGAGCGTGCCCCGCTATGGCTTCCAGGTCACACGTTTCATCCAAGCCTCAAGGCTGATTTCCATTGAACTGTATTTCATCCCTTCGGCGAAGAAGGGCATCAATGAGATGATCGAGCTCGCGATCCTGAGGGCGGACAAGATGGGCGTCAAAGTGCTCAGCCTTGCTGCACTCAACAAGAATGAGGCGCTCAATGGGGGTGGCACGCTGTTCGTCCGCAAGCATCCCGACCTGCGGGTGAGGGTGGTGCACGGCAACACCCTGACGGCGGCGGTGATCCTCAACGAGATCCCCGGCGACGTCGCGGAGGTGTTCCTCACCGGTGCGACGTCGAAGCTCGGCAGAGCCATCGCTCTCTACCTCTGCAGGAAGAAGATCAGAGTCTTGATGCTGACACTGTCAACGGAGAGGTTCATGAATATTCAGAGGGAGGCCCCTGCGGAGTTCCAGCAGTATCTGGTCCAGGTCACCAAGTACCAGGCTGCACAGAATTGCAAGACGTGGATCGTGGGGAAGTGGCTGTCGCCGAGGGAGCAGCGGTGGGCGCCGGCGGGGACGCACTTCCACCAGTTCGTGGTGCCGCCGATCATCGGGTTCCGGCGGGACTGCACGTACGGGAAGCTCGCCGCGATGAGGCTGCCGGAGGACGTGGAGGGGCTGGGGACGTGCGAGTACACCATGGGCCGCGGCGTCGTGCACGCGTGCCACGCCGGCGGCGTCGTCCACTTCCTGGAGGGGTGGGACCACCACGAGGTCGGCGCCATCGACGTCGACCGGATCGACGCCGTCTGGAACGCCGCGCTCAGGCACGGCCTCACGCCGGCGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MALVVVPPGQMLLYLLYGPVVGKVVQEWREQGRLPLGTSWCLHLILLLALRSLTYQLWFSYGNMLFFTRRRRVVDDGVDFRQIDTEWDWDNMVIMQTLIAAVLVTSRVFPATSDLSAWDLRGWAIAVVLHVAVSEPAFYWAHRALHLGPLFSRYHSLHHSFQATQALTAGFVTPLESLILTLVAWAPLAGAFMAGHGSVSLVYGHILLFDYLRSMGYSNVEVISHKTFQDFPFLRYLIYTPSYLSLHHREKDSNFCLFMPLFDAPGRDPQPQVLAASEGGKNHRVPDFVFLVHVVDVVSSMHVPFAFRACSSLPFATHLVLLPLWPIAFGFMLLQWFCSKTFTVSFYKLRGFLHQTWSVPRYGFQVTRFIQASRLISIELYFIPSAKKGINEMIELAILRADKMGVKVLSLAALNKNEALNGGGTLFVRKHPDLRVRVVHGNTLTAAVILNEIPGDVAEVFLTGATSKLGRAIALYLCRKKIRVLMLTLSTERFMNIQREAPAEFQQYLVQVTKYQAAQNCKTWIVGKWLSPREQRWAPAGTHFHQFVVPPIIGFRRDCTYGKLAAMRLPEDVEGLGTCEYTMGRGVVHACHAGGVVHFLEGWDHHEVGAIDVDRIDAVWNAALRHGLTPA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..39#1436..1662#3327..3565#4408..4627#6246..6358#6576..6877#6924..7031#7557..7763#7844..7954#8040..8369#ATGGCTCTCGTAGTGGTACCGCCCGGCCAAATGCTACTGGTACGTACTGTGGTACTCCCGCAGTTGCACATCAATTCAATTAGTCACATTGATATGAACAACATATTATATCTGGCCAGTAGTTTTAATTAATAGTACGTAAAAAGATGCATGCATGTCATCCTAAAATACTATATATATCCGTTCGTAAAAAGATGCATGTCCTCCTAAAATACATGAAATCAAAACGTAAAATATTGAATTGTTAATTGATGCAAAAATAATAGGACTTAAAAATTGAAAATTCTGTCAGTAGATTTTCCATGAAAAACTCTTTTATATAGCTATAATTTAATATTTTATAAATATATATGTATAGTTTGACAAATTAATGGTAAACGTGTGCATTAGGGACGACTACTACCGATGTCCAAAACATCATACTTTTGAGAAGGGATGTAATTCGTCCATTGTGAAATATAAGGCACTTTTTTTAACTCTAAACTATAACCTTTTTCTTTATTTTCGTTAGCACGTTTTTAAAACAATTATACAATGTATTTTAAGATCTTTAAGTTTATTTTTTTTAAAATATATACTTTTAAAGTTTTGAATAATTAATATTTAATTATTTATGAGCTAATGGATTACCTATAAAAAATATACTCGGTATTTTAGTAATTCAACTGTCCGTAAAAAAATCGTTGATGTACTGTTAACCTTTTCAAGTACATGCATGCATGCACGCTCGGCCAGAGTACGTATTACTGTTTATTGAAAGAAAAAAACATTCAATATGAGAGAAGGACTCTCATATCGAAACTTATTAAAAAAAGTGAGGCTCGAACTTAAATCGACTAGCCCACATCTTACGGTATTAGCCGAAAGACTGGGTCTTTCTACCGTTTATGTGACTACGTCTTTTTGTTTTTTTAAGAAGAAGAAAAATAAGAAGAGGAGGAGTAGTGAATTAAGGCAGCGCTCGAGCTGGCTAACCACTGCCAGAGTTGGAAAATAGGAAGGTTGCCATTGAATTCTCTGATGGACTTTTCGCTCCTCCCTCTTGTTATAAATAGGGGAGGGTCTTGGCGTCCCAAGAATCATAGGTGGGTGACAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCTCTCCATTCTTCCCAACCCAGCAGTTCTAGCTAGCTAGCTATCTAGTTCATCATCCCCATCCACCGAGCTCGATATCCCTGGCCATGGCCATCTCCATGGCCTCTCCCTTGTCTTCTTGGCCTTGGGCATTCTTAGGCTCATACAAGGCAAGCACACTTGATCAACTGCTGCTTCAATTCTTTGTATATATATACATATCATTGCAACAAACAATTAGTATATATGTGATATAATGATGAACTGATCATGAATTCATGATATGCATTAGCAATGGCTGTTTGGCTAATTGATGGATGGATTGTGGATGATATATATGCAGTATTTGCTGTACGGGCCGGTGGTGGGGAAGGTGGTGCAGGAGTGGAGGGAGCAAGGGAGGTTGCCGCTGGGGACGTCGTGGTGCCTCCACCTCATCCTCCTCCTCGCGCTCCGGTCGCTCACCTACCAGCTATGGTTCTCCTACGGCAACATGCTCTTCTTCACCCGCCGCCGCCGCGTCGTCGACGACGGCGTCGACTTCCGCCAGATCGACACCGAGTGGGACTGGTAATTAATAATAGTAGTAGTAGTAACTTTTTTTTTACCTCCCTCTACTTAGTTGATTACTGTTCTCGTTTGGCTTTTTGTGATCGGGTCATGGTTATGCGCTATCTAAAAGGTACTGTAGATGATTCTCTGTGTAAGTATCTGTGTAAGTACTTTGGGTCTCTGTTTATAAACAGCAGCATAACTTCAGCTTTTAATTCTTCTTTGAAGTCGATCGGTAGTATTTACTGCTCATGTCCAAGACAGTAGTAATTGCAGATAGATTCCTCCTGGCTAGGAAGCTACAAGTACGACCAAATGTAATGGATGACCCGTTTCATCATGCTATGAACACGAAGCTGGTGTTTAGATTATGGATGTAAAGTTTTGGTGTGTCACATCAGATATTACATACGGTGTCGCATGTGGTATTCGGGTACTAATAAAAAAAACTAATTACATAATCCATTAATAAACTGCGAGACAAATTTATTAAACCTAATTAATATATTATTAGCAAATATTTACTGTAGCACCGCATTGTCAAATCATATAGTAATTAGGCTTAAAAATTTGTCTCGCAAATTAGTCGTAATATATACAATTAGTTATTTTTTAGCCTATATTTAATAATTCATACAGATGTTCAAACGCTCGATGTGACATGCGAAAGTATGATGCTGCCTACAGGCCGGCTATGATTAATTGGCTAGCCGACTCACACATATCTACAGTTTACATATATACTTTAAACCGCTAGGAATAAATATATAAATGTTCTATTAACATCTTTTTCATGTATTTCTCTACGTCTTATCGACCTTAACTCAACCAAACCAAACACAGGCTTAATAAAGTCTGAATGGAGGACCAGCCAATTAATGAAAATTAAGTTTCGGTTTAATCTATTATACTCATATAGTAGTATAGTTAGCTCCTTTTTGGGTTTAGATGTGCCATGAGGCCCATGATATATATGGTGTATCAAATTATGCATATATCCCGGTCCATAGCTTAAGACCATGAAGTGTTGAAGACCATATCACGATTGGAGGTTGGGAGTAAATGCTCGCGCAATAACTCCATCTGCATTTCGGTGGCCGTGTTGGTCTCGATTGCGAAGTGAGCGAGCGAGTACCAGTAGCAGCATGTCGTAACGTGGTGCCATTCAAAGCGCACGAGATCACGGACATGTGGCACGTGGATTCAATGGCAAATTATTTATCACCATTTATAAGAGTGGAAAATAATTAATTATTCATCGACACATCACACCACGCTTGCTTTTGCTAATGCACCTTGACAAACCATAAACCATGTACAATTTGCTCCTACCTCCGTCACAAAATATTACTACTATGTAGAATGGGTCAACAGATCTATATGAAATCTTCGTTCACAATCGTTGTTTTAGGATGAGTCAAAATATTCGTTGTTATTCTATCTCAAGATATTCTAGACTATAAAACTCACCATCATTGTATCGTTGTTGTCGGATCTTCTCTAGTGGACGAAGAGAGTTCAACTTGTCTACGATGGTTGAATGCCACTTCCATGCTCTTATTATCTCAAAAAATATATATGTAAATCATGTATGATATTATCCCATTTTGATTGTTATCATTAATGTGATGTGAGATATCTTTGAGTCTGTCATTTAATTTGGATGATCTTTTTTTTTTCAGGGATAACATGGTGATCATGCAAACCCTAATCGCGGCGGTGCTGGTCACCAGCCGTGTCTTCCCTGCCACGTCGGATCTCTCGGCGTGGGACCTACGTGGGTGGGCCATCGCTGTGGTGCTGCACGTGGCCGTTTCAGAGCCGGCCTTCTACTGGGCCCACCGGGCCCTCCATCTGGGCCCACTCTTCAGCCGGTACCACTCCTTGCACCACTCCTTCCAAGCCACCCAAGCTCTCACAGGTAACAATAATACCCTGAAATTAAAGCTCTCTTCGTACAGCTCCAACTCCTAAATATAACTTCAGAACTTGAGTCTGGAGTGGAGTTATGAAGAAGAGCTTTACCCAACTCCACTCTTAATTTTGGTGGAGCTGCAACTGTTTGGCTGAGCTCAGCTATACCAAACAGCCCCTAATTTTCATCTACAAACTTTATTAATTACTCCCTCCATATTTTAATGTATGACGCCGTTGACTTTTTAATCAACGTTTGATCACTCGTCTTATTCAAAAATTTTATGCAAATATAAAAATACTTATATCATGCTTAAAGAACATTTGATGATAAATCAAGTCACAATAAAATAAATTCTAATTATACAAATTTTTTGAATAAGACGAAAGGTCAAACGTTTGTCAAAAAGTCAACGGCGTCATACATTAAAATACGGAGGGAGTACCTATTAGCGTCTAATTTTATTTTGGGAGTACCTATACATCTTTCGAAATACTTTTATGATTGTATCACACAGATTTTTAATCTTTAGATTAAAATCTGATAGATATAATAAAAAGTAAAAAGCAATTAAGAAACACCATAATGGACACTAAATTACCATATCCTCAAGAAAAAGACCAAATCCAATACAAAATTTAAAATTTACATGCGAAGATTCAAAAATTACAGTGTAACTTATAAAAGTTACAGTGTAAGTTTCATAAATTACACTATAACTTACAAGAGTACAAGAAAATACACTGTAAATTTGAGTGAGAAAATCGAGTGAAAAATCTTTCGAGTGAGATATAGCAAAATCGTTTCGTTTTTAATGATGTGTTTAATTAACTGCTTGATTAATGCAGCTGGGTTCGTGACGCCATTGGAGAGCCTGATCCTGACGCTGGTGGCGTGGGCCCCACTTGCAGGGGCCTTCATGGCGGGACACGGCTCCGTGAGCCTGGTCTATGGACACATCCTCCTCTTCGACTACCTCCGGTCCATGGGGTACAGCAACGTCGAGGTCATCTCACACAAGACCTTCCAGGATTTTCCCTTTCTCAGATACCTCATCTACACACCATCGTGAGTCCTCTAATTTACATACTATTCATAATATCATCCAAACTGATCCACTATGTTCCCTTACCTCGCTCCACTAATTTATATTTATTCAAATTAGGCCATATTTGATTTAAACTACTAAACAGATTGTTGACAAATTAAATATTTCAAAAAATAAATTTAACAGTAGCTTAAAACAAGTTGTCTAAATAATAGGCTTCTTTTCTTGAAAAAAATATTTTGTGAAGTGCAAAGCAAACAATTTGTTAAAATAT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