BGIOSGA023470
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA023470 |
|---|---|
| Description |
Glutamate receptor |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA023470, complete gene. |
| LocusTag |
P0547F09.3 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA023470-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA023470-PA |
| Length |
4863 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:30202797..30207659 |
| Sequence Coding Region |
30202797..30203064,30204537..30205882,30205960..30206237,30206507..30206538,30206631..30207037 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:30202797..30207659 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:30202797..30207659 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGCGGCGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGTTGGTGGTGCTGTGGCTGGCGGTGGCGGCGGCGGGGGCGGGGGCGGGGGAGCGGCCGAGCGAGGTGTCAATCGGCGCGCTCTACACCTACGACTCGGTGATTGGGCGCGCGGCGGGGCTCGCCATCGAGCTCGCCGTCGGCGACGTCAACGCCGACCGGACCGTGCTGGCCGGGACCACGCTCAGCCTCATCTCCCAGGACACCAACTGCAGCGGGTTTCTTGGAACAATCGAAGCATTGCAGTTAATGGAGAAAAACGTGGTTGCTGTCATTGGTCCACAATCCTCTGGAATAGGCCATGTTATTTCACATGTCGTTAATGAGCTACATGTTCCTCTTTTATCGTTCGCAGCAACTGATCCAACACTTTCTGCATCAGAGTATCCGTACTTTTTAAGGAGTACCATGAGTGACTACTTCCAAATGCATGCCGTTGCTAGCATCGTTGACTACTATCAATGGAAAGAGGTCACTGCTATTTTTGTTGATGATGATTATGGGAGAGGTGCGGTGGCAGCCCTTAGTGATGCGCTTGCATTAAGTCGGGCAAGAATTTCATACAAAGCAGCGATTCCTCCAAATTCAAATGCAGCTACAATCAATGATGTACTGTTTAGAGCAAACATGATGGAATCAAGAGTGTTTGTTGTGCACGTCAATCCTGACGCAGGGATGAGAATATTTTCTATAGCTAACAAGCTCAGGATGATGGACAGTGGCTATGTCTGGATAGTAACCGATTGGCTAGCTGCTGTCATGGACTCCTCCATGTCTGGAGATCTTAAAACCATGAGCTATATGCAAGGATTAATTGTTCTTCGTCAGCACTTCCCTGATTCTGAAACCAAGAGGGAGTTCATATCTAAATGGAACAATGTAGCTCGTAATAGGAGCATTGCTTCTGGCTTGAACTCATATGGTTTTTATGCTTATGACTCGGTTTGGATTGTTGCCCGTGCTATCGATCAACTTCTCGATAATGGGGAGGAGATAAATTTCTCTGCAGATCCAAGGTTGCATGATTCAATGAACAGCACACTGCGTCTCTCAGCCCTCAAGTTATTTGATAGTGGTGAGCAGTTGCTACAGCAACTTCTCCTCACAAACTTTACAGGCCTAACAGGCCAGCTCCAGTTTGATTCAGACCGCAATTTGGTACGCCCAGCATATGATATCCTTAATATCGGTGGTTCTGTGCCCCATTTGATTGGCTATTGGTCTAATTATTCTGGACTTTCTGTTGCTGCTCCTGAAATTCTATATGAGAAGCAACCAAATACATCTACGAGTGCGCAGCGGCTTAAAAATGTGGTATGGCCGGGTCACTCTGCTTCTAAGCCTAAGGGCTGGGTTTTTCCAAACAATGGGCAGCCTCTGAGAGTTGGTGTTCCAAATAAACCAAGCTTTAAGGAGTTAGTGTCACGTGATACTGGCCCTGATAATGTGACTGGGTACTGCATTGAGATATTCAACGCAGCAATTAAACTTCTCCCGTATCCAGTTCCTTGCCAATTCATAGTAATTGGGGATGGTTTAAAGAATCCTAACTATGATGACATTATTAACATGGTTGCTGCCAATTCCCTTGATGCTGCTGTAGGCGACTTTGCTATTGTGAGAAACAGGACAAAGATTGCAGAATTCTCACAGCCTTATATTGAGTCGGGGCTTGTGATAGTAGTGCCGGTGAAAGAAGCAAGTTCAAGTGCCTGGGCTTTCCTTAAACCCTTCACATTAGAAATGTGGTGTGTAACAGGTGTTCTTTTTATTTTTGTCGGAATAGTTGTTTGGATTCTTGAACATCGGACCAATGAGGAGTTTCGAGGCTCTCCAAGACGGCAGATGATAACAATATTTTGGTTTAGTTTCTCAACAATGTTTTTTGCACACAGACAGAACACTGTAAGTGCGCTTGGGCGGTTTGTGCTGATCATATGGCTGTTTGTCGTGCTGATCATCAATTCAAGTTATACTGCTAGTCTGACGTCGATTCTCACAGTCCAACAGCTTGCAACTGGAATAACTGGGCTTGACAGTTTGCTTTCAAGTGCTTTACCTATTGGATACCAGGCTGGAAAGTTTACTAGAAATTACCTGATTGAAGAGCTCAATGTTCCTGAATCTCACTTGGTACCGCTAAACACAATCGACGAGTACGCTGATGCCCTTAATCGTGGACCCAAAGATGGTGGTGTTGCTGCAATTGTTGATGAGATGCCATATATCGAGATCTTCCTGTCATACCATTGTAACTTCAGAATTGTAGGACAGGAATTCACAAAGGAAGGATGGGGATTCGCATTCCAGAGAGATTCTCCTCTTGCTGCAGACATGTCAACTGCAATCCTTCAACTTTCAGAGAGTGGCCAGCTACAAAGAATACATGACGAGTGGTTCTCGCGGTCGAGCTGCAGCTCTGATGACAGTGAAATGGGAGCAACCAGGCTCGGCCTCGGAAGTTTTTGGGGCCTCTTTCTTATGTGCGCTCTGATATGCGTATTCGCTCTCGTGATGTTCTTTGCAAGAGTCTGCTGGCAATATTCCAAGTACTCAGGTTCTGAAGAACCTGATGAGCCCAAAGACGATAGTGCTGGCACCGCCGAGATTGCAGCTGAAGCCGTTGCTGAAATGCAGCGGAGGAGGCCAAAGCGTCTTGGTAGCTTCAAAGAACTCATGCAGTTTGTTGATAAAAAGGAAGAAGAAGTCAGGAAATCGATGAAGCGGAGACCAAGTGAGAAAGATAATCAGGGTGTTGGTTCTTCAGATGCGCAGTCAGTGGCTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGGAAAAAAAVLVVLWLAVAAAGAGAGERPSEVSIGALYTYDSVIGRAAGLAIELAVGDVNADRTVLAGTTLSLISQDTNCSGFLGTIEALQLMEKNVVAVIGPQSSGIGHVISHVVNELHVPLLSFAATDPTLSASEYPYFLRSTMSDYFQMHAVASIVDYYQWKEVTAIFVDDDYGRGAVAALSDALALSRARISYKAAIPPNSNAATINDVLFRANMMESRVFVVHVNPDAGMRIFSIANKLRMMDSGYVWIVTDWLAAVMDSSMSGDLKTMSYMQGLIVLRQHFPDSETKREFISKWNNVARNRSIASGLNSYGFYAYDSVWIVARAIDQLLDNGEEINFSADPRLHDSMNSTLRLSALKLFDSGEQLLQQLLLTNFTGLTGQLQFDSDRNLVRPAYDILNIGGSVPHLIGYWSNYSGLSVAAPEILYEKQPNTSTSAQRLKNVVWPGHSASKPKGWVFPNNGQPLRVGVPNKPSFKELVSRDTGPDNVTGYCIEIFNAAIKLLPYPVPCQFIVIGDGLKNPNYDDIINMVAANSLDAAVGDFAIVRNRTKIAEFSQPYIESGLVIVVPVKEASSSAWAFLKPFTLEMWCVTGVLFIFVGIVVWILEHRTNEEFRGSPRRQMITIFWFSFSTMFFAHRQNTVSALGRFVLIIWLFVVLIINSSYTASLTSILTVQQLATGITGLDSLLSSALPIGYQAGKFTRNYLIEELNVPESHLVPLNTIDEYADALNRGPKDGGVAAIVDEMPYIEIFLSYHCNFRIVGQEFTKEGWGFAFQRDSPLAADMSTAILQLSESGQLQRIHDEWFSRSSCSSDDSEMGATRLGLGSFWGLFLMCALICVFALVMFFARVCWQYSKYSGSEEPDEPKDDSAGTAEIAAEAVAEMQRRRPKRLGSFKELMQFVDKKEEEVRKSMKRRPSEKDNQGVGSSDAQSVA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..268#1741..3086#3164..3441#3711..3742#3835..4241#4378..4863#ATGGGCGGCGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGTTGGTGGTGCTGTGGCTGGCGGTGGCGGCGGCGGGGGCGGGGGCGGGGGAGCGGCCGAGCGAGGTGTCAATCGGCGCGCTCTACACCTACGACTCGGTGATTGGGCGCGCGGCGGGGCTCGCCATCGAGCTCGCCGTCGGCGACGTCAACGCCGACCGGACCGTGCTGGCCGGGACCACGCTCAGCCTCATCTCCCAGGACACCAACTGCAGCGGGTTTCTTGGAACAATCGAAGGTCAGTTCATTGCTTCTTGATTATGCTAGCTGTGATGTGGAATTCTTTGAAAAAGTAATGGTTTTGATTGGACCCTTTTGATTTTCCATGGACTCGAATTTTGAGTGAGCTGATGAGTTCTCCTCCACTGACAGAGTGACAGTATTCTAATCTGATTGGATTGGTATTGGGCTTTATCCCAATTACCAACCAGCTAGGTACAGTTAGAAATTTGATGAAGAAAATAGTGTTAAGCTTAATTTAGTAGCTGAATTTGCAAAATGAGTGAAATGATGATGAGTGAGTGAGTTGCTGTGACCCAAGAAAACTAATTTGGGGAGAAGTTTCAATCTTGTTTCTGGACTGGTTCATCTATCTAGTCCCCTTTGCCCTTTAGCAACTTTAGCATAAGACTCACTGATAGTGGTGGAGATGAGGGAAGCACAATCTGACCACCATAGTCCATACTGTTCCTGGTATGGTGGTGGATGTAAATTATTGCAACTGCAATCAGCAAGCCCTTTTATAAAATCAAAAGTTAGTTGCTACTTGCTACTAAACGTCAGAACTTACACGTTGGAGTTGATTATTGGCATTGCCTAGTTGCTTTTGATAACATATTGTGCAGTACTTGGCCTTTGGTCACATGTATGAAGAAACTTGTTCCATTCGATTCGTTTTAAAGTAATCATATTGGTTATTTCATTTCACTTGTAGTAGATAATTTAGTTATGTTGTCAGTGTCTTTCCTTTTTATATATTCACTTCTGTTGTTGGGCACAACAAATTCAGAGGAACTAAATGTTGACTAGTGACTATGACAAAAAGAATTCAGCTGTGAAGCATTATTTGCACTTTGATGTCTTAGTATATAACTTGGTCAAGCTTCGTTTAACCTCTAATTTAATACAATAACTTGCTTGCACGCGTTTTGCATGATTCCTCAATAATGCTTTAGTTGGAAATATTTGAAACAACTGTTTTGTTGAACTTTTGATGGCGTTGTCCTTTCTTGAGAATTGCGCTAACCTGATTGTCCTGGCAATGAAAGGAGAACAGACAAAAAGCATACTGGTACAATGACATCTCAAGTGCCATAACTCATGAGATTGCTTATGTTCCTTATGATGCAAGAAACACATTAAAGAGCACCCAATTCTTTACTTTATTCTCATGCCACATTCTTTTTTCTTTTTGTGGCATGTGTCGGCAACAGCATAACTAAATTATTTGTGTGAGCATCATCAAAAACAGATATTCAAGACACCAATAGCCATATTTTGAACCATAACTGCTTTGCCTATTGCTTTTAGACAAAAAAAATATATTTGCATAATACAAATCAATAGTAGTATCTTATACTATGTGAGCAGAATGAAACTGTTGCCGGTTCTTTCTTTACATACAAATTCAGCTTCAATTTGTCAATTATTATAGCCGGTAATCACTTGAATTGTCCATGAACTGATTCATAAAGCATTATTTTGTTACAGCATTGCAGTTAATGGAGAAAAACGTGGTTGCTGTCATTGGTCCACAATCCTCTGGAATAGGCCATGTTATTTCACATGTCGTTAATGAGCTACATGTTCCTCTTTTATCGTTCGCAGCAACTGATCCAACACTTTCTGCATCAGAGTATCCGTACTTTTTAAGGAGTACCATGAGTGACTACTTCCAAATGCATGCCGTTGCTAGCATCGTTGACTACTATCAATGGAAAGAGGTCACTGCTATTTTTGTTGATGATGATTATGGGAGAGGTGCGGTGGCAGCCCTTAGTGATGCGCTTGCATTAAGTCGGGCAAGAATTTCATACAAAGCAGCGATTCCTCCAAATTCAAATGCAGCTACAATCAATGATGTACTGTTTAGAGCAAACATGATGGAATCAAGAGTGTTTGTTGTGCACGTCAATCCTGACGCAGGGATGAGAATATTTTCTATAGCTAACAAGCTCAGGATGATGGACAGTGGCTATGTCTGGATAGTAACCGATTGGCTAGCTGCTGTCATGGACTCCTCCATGTCTGGAGATCTTAAAACCATGAGCTATATGCAAGGATTAATTGTTCTTCGTCAGCACTTCCCTGATTCTGAAACCAAGAGGGAGTTCATATCTAAATGGAACAATGTAGCTCGTAATAGGAGCATTGCTTCTGGCTTGAACTCATATGGTTTTTATGCTTATGACTCGGTTTGGATTGTTGCCCGTGCTATCGATCAACTTCTCGATAATGGGGAGGAGATAAATTTCTCTGCAGATCCAAGGTTGCATGATTCAATGAACAGCACACTGCGTCTCTCAGCCCTCAAGTTATTTGATAGTGGTGAGCAGTTGCTACAGCAACTTCTCCTCACAAACTTTACAGGCCTAACAGGCCAGCTCCAGTTTGATTCAGACCGCAATTTGGTACGCCCAGCATATGATATCCTTAATATCGGTGGTTCTGTGCCCCATTTGATTGGCTATTGGTCTAATTATTCTGGACTTTCTGTTGCTGCTCCTGAAATTCTATATGAGAAGCAACCAAATACATCTACGAGTGCGCAGCGGCTTAAAAATGTGGTATGGCCGGGTCACTCTGCTTCTAAGCCTAAGGGCTGGGTTTTTCCAAACAATGGGCAGCCTCTGAGAGTTGGTGTTCCAAATAAACCAAGCTTTAAGGAGTTAGTGTCACGTGATACTGGCCCTGATAATGTGACTGGGTACTGCATTGAGATATTCAACGCAGCAATTAAACTTCTCCCGTATCCAGTTCCTTGCCAATTCATAGTAATTGGGGATGGTTTAAAGAATCCTAACTATGATGACATTATTAACATGGTTGCTGCCAATGTATGTCCTTGGTCTTTGCTCTTTCTTCTTCGAAAAGTTTGATTTTATTCCTCTGATTTGTATTTATTTTCTTGTAGTCCCTTGATGCTGCTGTAGGCGACTTTGCTATTGTGAGAAACAGGACAAAGATTGCAGAATTCTCACAGCCTTATATTGAGTCGGGGCTTGTGATAGTAGTGCCGGTGAAAGAAGCAAGTTCAAGTGCCTGGGCTTTCCTTAAACCCTTCACATTAGAAATGTGGTGTGTAACAGGTGTTCTTTTTATTTTTGTCGGAATAGTTGTTTGGATTCTTGAACATCGGACCAATGAGGAGTTTCGAGGCTCTCCAAGACGGCAGATGATAACAATATTTTGGTACGTTTCCGTTGCTCCTCTTAAGGATATGTCTATTTTTTGTTAAAAAGAAAAGAATGTGGTTATATCATAGGCCAGCATATCTTTCTGGAACCAGAACTCAGACTGGGAGCATTTGTGAAACCTTATTCAATGGAGGCAAAAAAAAAACACCTTTATTACTTTTTTTTTATTCGTGAGCAACAAATAGTTTAATATTTTTATCTTGTTAATTTGTGTAAATATTAATAGTAAGAAAGTAACAGATTATTTTTTTTCTTCCTTTTCAGGTTTAGTTTCTCAACAATGTTTTTTGCACACAGTAAGTCCATTAGATGCATTTTATGACATCGTGTTAAACTATTCCATGTTTTCCCATTTCAATGGACTTATATATCATCCAACTCACTTCAGGACAGAACACTGTAAGTGCGCTTGGGCGGTTTGTGCTGATCATATGGCTGTTTGTCGTGCTGATCATCAATTCAAGTTATACTGCTAGTCTGACGTCGATTCTCACAGTCCAACAGCTTGCAACTGGAATAACTGGGCTTGACAGTTTGCTTTCAAGTGCTTTACCTATTGGATACCAGGCTGGAAAGTTTACTAGAAATTACCTGATTGAAGAGCTCAATGTTCCTGAATCTCACTTGGTACCGCTAAACACAATCGACGAGTACGCTGATGCCCTTAATCGTGGACCCAAAGATGGTGGTGTTGCTGCAATTGTTGATGAGATGCCATATATCGAGATCTTCCTGTCATACCATTGTAACTTCAGAATTGTAGGACAGGAATTCACAAAGGAAGGATGGGGATTCGTATGTTCACTATCCTTCATCCTTCACCTTTCCTGGGCACTCCTGCCCTTGCATCTAAATTCTGAACTAAGCATAATCCCCATGTCTTGTACTGTGGACGGAACAATTTAATCTGCTTTGATGTTTTCCTTTGCAGGCATTCCAGAGAGATTCTCCTCTTGCTGCAGACATGTCAACTGCAATCCTTCAACTTTCAGAGAGTGGCCAGCTACAAAGAATACATGACGAGTGGTTCTCGCGGTCGAGCTGCAGCTCTGATGACAGTGAAATGGGAGCAACCAGGCTCGGCCTCGGAAGTTTTTGGGGCCTCTTTCTTATGTGCGCTCTGATATGCGTATTCGCTCTCGTGATGTTCTTTGCAAGAGTCTGCTGGCAATATTCCAAGTACTCAGGTTCTGAAGAACCTGATGAGCCCAAAGACGATAGTGCTGGCACCGCCGAGATTGCAGCTGAAGCCGTTGCTGAAATGCAGCGGAGGAGGCCAAAGCGTCTTGGTAGCTTCAAAGAACTCATGCAGTTTGTTGATAAAAAGGAAGAAGAAGTCAGGAAATCGATGAAGCGGAGACCAAGTGAGAAAGATAATCAGGGTGTTGGTTCTTCAGATGCGCAGTCAGTGGCTTAA</dnaseqindica> |
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