BGIOSGA023678
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA023678 |
|---|---|
| Description |
BGIOSGA023678 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA023678, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA023678-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA023678-PA |
| Length |
10008 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:27406093..27416100 |
| Sequence Coding Region |
27415798..27416100,27414631..27414696,27414321..27414512,27414154..27414219,27414025..27414066 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:27406093..27416100 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:27406093..27416100 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCTGCGCGCCGCGGCGGCCGCCGCCGCCGTCTTCCCCTCGCGGTTCGCCGCCGCGCCGGCCGTGGCGGCGGTTGAGGAGGTCAGGTCGCCGCTGCTCAGGGTTTTGGGGGCGCTCCGAGGCGGCCGGGTCTCGACGCTCGGGAGGAGGGCGCGCTTCTGCTCCAACTCCGCCGGGAGCGACTCCGAGGCGGCGGCGGCGGAAGCTAAGGCCGAGGATGCGGTTGCTGCGGAAGGGGAGGCGGACGGCAAGGCGTCTTCCGCCATCGTGCCCACCGTCCTCCGCCCTGAGGACTGCCTCTCGGTCATAGCACTGCCTCTCCCACATCGTCCACTCTTTCCTGGATTTTATATGCCGATCTATGTAAAGGACCAAAAGCTGTTGCAAGCCTTAGTAGAAAACCGCAAAAGATCCATCCCATATGCTGGAGCATTTCTTGTGAAGGATGAAGAAGGTACTGACCCAAATATTGTGACCAGCTCAGATTCAGATAAAAGCATTGATGATCTTAAAGGGAAGGAGTTGCTGCAGCGCCTTAACGAAGTTGGTACACTTGCTCAGATAACTAGCATTCAAGGGGATCAGGTTGTGCTACTTGGTCACCGTCGTTTAAAGATAACCGAAATGGTTCAGGAGGATCCACTTACAGTAAAAGTTGACCATCTTAAGGAAAAACCGTACGATAAGGATGATGATGTTATAAAAGCAACTTCATTTGAAGTTATATCCACCTTGAGGGAGGTTCTCAAGGCAAGTTCCCTTTGGAAGGATCATGTGCAAACCTACACACAGCACATGGGTGATTTCAACTACCCACGGTTAGCTGATTTTGGTGCTGCTATTTCTGGTGCCAATAAGTTTCTTTGCCAGGAGGTGCTTGAGGAATTGGATGTATATAAGCGTCTAAAGTTAACTCTTGAGTTAGTCAAGAAGGAGATGGAGATTAGTAAGTTGCAGCAATCCATTGCAAAAGCAATTGAAGAAAAAATAAGTGGGGATCAGCGGCGTTATTTATTGAATGAGCAACTTAAAGCAATCAAGAAGGAGCTAGGTTTGGAGACTGATGACAAAACAGCATTGTCTGCAAAATTTAGGGAGCGGATTGAAGCAAAGAAGGAGAAATGTCCTGCTCATGTTTTGCAAGTCATTGAAGAAGAACTCACAAAGCTTCAGCTGTTGGAAGCCAGTTCTAGCGAGTTTAATGTAACAAGGAATTATTTGGACTGGTTGACAGTATTGCCATGGGGAAACTATAGTGACGAAAATTTTGATGTACATCATGCTCAACAAATCCTTGATGAAGATCATTATGGGCTGAGTGATGTCAAAGAGAGAATATTGGAATTTATAGCAGTTGGCAAGCTAAGGGGAACTTCACAAGGAAAGATCATATGTCTTTCTGGGCCACCAGGAGTTGGTAAAACTAGTATTGGTCGATCAATTGCACGTGCGCTGAACAGGAAGTTTTACAGGTTTTCTGTTGGAGGTTTAGCTGATGTGGCAGAAATCAAGGGGCATCGGCGTACGTATGTTGGTGCAATGCCAGGGAAGATGGTGCAATGTCTTAAATCAGTTGGAACAGCAAATCCTCTAGTATTGATTGATGAAATCGACAAGCTTGGGAGAGGGCATTCTGGTGATCCAGCCAGTGCATTGTTGGAACTTTTGGACCCTGAGCAGAATGTTAATTTTCTTGATCACTACCTTGACGTTCCTATTGATCTATCCAAGGTCCTTTTTGTTTGCACAGCAAATGTTATTGAGATGATACCAAATCCATTACTGGACAGGATGGAGATCATTGCAATAGCTGGTTATATAACTGATGAGAAGATGCATATTGCTCGGGATTATCTAGAGAAGAACACAAGAGAGGCTTGTGGCATTAAACCTGAACAGGCTGAGGTTACAGATGCTGCTCTTCTTGCCCTTATTGAAAGTTACTGCCGAGAAGCAGGAGTGCGGAATCTTCAAAAGCAAATTGAGAAAATTTACCGCAAGATAGCTCTGCAACTTGTTCGCCAAGGGGTATCAAATGAGCCAACTCAAGAAGCTGCCATTGTAACAGCGAGCGAAGAACCTAATGGTGGCGATAGTGCAAACAAGTTGAAAGATGAGACTATGGAGGATCCTGCTACAGAGAATGCTGCAATGACCAATGCTGATACTGCCTCAAAGGAAGCTAGCGAATTAGATTTACTGAAGAGAACAGTCGATCATGATGTGCATCCAGCTGAAACACCCAAAGAAGCTGTTTTAACTGATTCAGCCCTATCGACAGACAAGTTGTGCACACCAGAGGGCAACAAGGATATGGAGGGAGCCAAGGAAGAGTCAGCTGATAAGGCAGTTGAGAAGGTAGTAATTGATTCGTCAAACCTTGGAGATTATGTTGGGAAACCTGTTTTCCAAGCTGAGCGAATATATGAGCAGACTCCTGTTGGAGTTGTCATGGGTTTAGCTTGGACTGCTATGGGTGGTTCTACTTTATACATTGAAACAACGAAAGTGGAGGAAGGAGATGGGAAAGGTGCACTTGTGCTGACCGGCCAGCTTGGAGATGTCATGAAGGAAAGTGCTCAGATTGCGCATACTGTTGGTAGAGCTATATTACTAGATAAAGAGCCAGAAAATCTGTTCTTTGCAAACTCAAAGGTACACTTGCATGTTCCAGCAGGGTCCACCCCTAAGGATGGCCCCAGTGCTGGATGCACCATGATCACATCAATGTTGTCCTTAGCTATGGGAAAACCTGTTAAGAAGGACCTTGCGATGACGGGTGAAGTAACATTAACTGGCCGAATCCTTCCAATTGGCGGGGTCAAAGAGAAGACCATTGCTGCCAGGAGAAGTGCAGTAAAGACAATCGTATTCCCAGCAGCGAATAAAAGGGATTTCGATGAGCTTGCTCCCAATGTGAAGGAGGGTCTTGAAGTTCATTTTGTTGATACATACAATGAAATATTTGATATAGCTTTCCAGAGTGAGACTCAGACAGAAACAAGCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLRAAAAAAAVFPSRFAAAPAVAAVEEVRSPLLRVLGALRGGRVSTLGRRARFCSNSAGSDSEAAAAEAKAEDAVAAEGEADGKASSAIVPTVLRPEDCLSVIALPLPHRPLFPGFYMPIYVKDQKLLQALVENRKRSIPYAGAFLVKDEEGTDPNIVTSSDSDKSIDDLKGKELLQRLNEVGTLAQITSIQGDQVVLLGHRRLKITEMVQEDPLTVKVDHLKEKPYDKDDDVIKATSFEVISTLREVLKASSLWKDHVQTYTQHMGDFNYPRLADFGAAISGANKFLCQEVLEELDVYKRLKLTLELVKKEMEISKLQQSIAKAIEEKISGDQRRYLLNEQLKAIKKELGLETDDKTALSAKFRERIEAKKEKCPAHVLQVIEEELTKLQLLEASSSEFNVTRNYLDWLTVLPWGNYSDENFDVHHAQQILDEDHYGLSDVKERILEFIAVGKLRGTSQGKIICLSGPPGVGKTSIGRSIARALNRKFYRFSVGGLADVAEIKGHRRTYVGAMPGKMVQCLKSVGTANPLVLIDEIDKLGRGHSGDPASALLELLDPEQNVNFLDHYLDVPIDLSKVLFVCTANVIEMIPNPLLDRMEIIAIAGYITDEKMHIARDYLEKNTREACGIKPEQAEVTDAALLALIESYCREAGVRNLQKQIEKIYRKIALQLVRQGVSNEPTQEAAIVTASEEPNGGDSANKLKDETMEDPATENAAMTNADTASKEASELDLLKRTVDHDVHPAETPKEAVLTDSALSTDKLCTPEGNKDMEGAKEESADKAVEKVVIDSSNLGDYVGKPVFQAERIYEQTPVGVVMGLAWTAMGGSTLYIETTKVEEGDGKGALVLTGQLGDVMKESAQIAHTVGRAILLDKEPENLFFANSKVHLHVPAGSTPKDGPSAGCTMITSMLSLAMGKPVKKDLAMTGEVTLTGRILPIGGVKEKTIAARRSAVKTIVFPAANKRDFDELAPNVKEGLEVHFVDTYNEIFDIAFQSETQTETS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..303#1405..1470#1589..1780#1882..1947#2035..2076#2306..2428#2632..2730#3274..3339#3420..3506#3826..3865#3971..4142#4225..4349#4641..4771#4855..4959#5152..5265#5934..6101#7315..7416#7989..8288#8886..9404#9820..10008#ATGCTGCGCGCCGCGGCGGCCGCCGCCGCCGTCTTCCCCTCGCGGTTCGCCGCCGCGCCGGCCGTGGCGGCGGTTGAGGAGGTCAGGTCGCCGCTGCTCAGGGTTTTGGGGGCGCTCCGAGGCGGCCGGGTCTCGACGCTCGGGAGGAGGGCGCGCTTCTGCTCCAACTCCGCCGGGAGCGACTCCGAGGCGGCGGCGGCGGAAGCTAAGGCCGAGGATGCGGTTGCTGCGGAAGGGGAGGCGGACGGCAAGGCGTCTTCCGCCATCGTGCCCACCGTCCTCCGCCCTGAGGACTGCCTCTCGGTGCGCGCTCTACTCGTTTGGATCATAACCGTTTGTTTAGTTGCTTGCAGTAGCCAATAGCAACCCGATGCATTTGTGTCCTAAGTAATTGGAGAATGTGTAATTTGGTTCCAAAGAGTAAGCATGGAAGGCCACTCCCTTGATTGGATATCGTAAGTCCATGGCTCAATCTGAGCATGGAAACACTTTGGTCTAAAAGTTAGCTCATTATTTTGTAATGCTAAGGTAGAGTTTCTTTGGTTTGGATCAACTAGGTTAGTGTGATTGCCTTGAATGAGCTGCACAAAGAGTTCAGTACCTCAGCATGGTTTCTCCTTCCTTTTGAGTGCTCAAACATGGTGCCTTTCTATTTATTAGGGGAAAGAAAGAGGAAAATGCTGATTGCTCACTGAGGGATTAACATGTTGTCCTGAACTGTAGTTTAGTTCAGTACTGTTTTCTAATTTGAGAAAAGTCACTGGTGTGATGCTTGGTAATGCATTATGAAAGCTTGCACCCCTCTGAAAAGTGTTGTTCAATTGAATAAATATTCCATCTACTTATCACATATTAATGGGCACAAGAACGAAGAAACACCATGAAATAATTATTCTGCCGTTATGAAGTGGGAGGCGATTGGGAAGGAGAGCTCATTTGTTACTTGGAGTGATACTCATGAGGATATACTAGGAAACATTGAGAAAAAGTGCCTCCAAACTGTATAATGGAGTACATATGATATTTCGATGACAAATTTGAATAGCTCAAAAACTTGCATTGGTGCCAAATGAAATGCACAATCTATTTAGGACTAAAGTGAGCAATTCATTTGAGGTGTGATGAAGGATCAAAATAATTATAATTTGATTGTAGTCTTTTGAGTAGCTATTTGAACTCATGCCATGTCTTGAAAATGGGTTTTCTACCAATAAGTCTAGAAGGGTATCATGCTCTCTCTTTCTCTGTTATCAAGGGAGGGCTTTGCTGTCTTTCCATCATTTTTTAGATCTAAACGTCTCCCTTCAGATTATTTGTTATTTATTTAACAGTTCATATTTTTCATAACATGGTTCTGCTAGTTGTATCCTTCTCTTACTTTATTATGCTTACTTTTTCAAATAGGTCATAGCACTGCCTCTCCCACATCGTCCACTCTTTCCTGGATTTTATATGCCGATCTATGTAAAGGTATGTCGGCGCTGAGAAATTTGCCATTGGTTAAATCAATTTCACTTTTCCGTATCATGCTACCTATTCATTTCCCTTCTTAATGATGTGTTTTTCCTGCTTTTTATAAACCCCTCAGGACCAAAAGCTGTTGCAAGCCTTAGTAGAAAACCGCAAAAGATCCATCCCATATGCTGGAGCATTTCTTGTGAAGGATGAAGAAGGTACTGACCCAAATATTGTGACCAGCTCAGATTCAGATAAAAGCATTGATGATCTTAAAGGGAAGGAGTTGCTGCAGCGCCTTAACGAAGTTGGTACACTTGCTCAGGTAAATGACTTTTTCTAAAAGACTTTGGGCATGAGTTCTTCCACTGTCTTGTCTCAAGCTGTGCTCTGTTGCTCCGTAAATAGCTTGTGTTGTCTCTGTAGATAACTAGCATTCAAGGGGATCAGGTTGTGCTACTTGGTCACCGTCGTTTAAAGATAACCGAAATGGTAAGATACATTAGTTTTTGCTTGCTATTCAATTCTTGTGGGTTTATGTTGGTAACTTAGTTTTCACCAAGATACAAAAAACTGTAGGTTCAGGAGGATCCACTTACAGTAAAAGTTGACCATCTTAAGGTAATTCTACAGTGCCACCACCGATTCTCATGTTTTATTTTGTATTTCCCATTATAAACATGCTCAGAGAAAAGAAGAAAGAGTGTTGTTTTTCGAAACTGAAGAAAGTCAGTTGCTGTTCTGAAGAAACTTTGTTTAGCCTTGATTTCACTATGAAATAAATGCGAGATTGCTATTTACTGCCGGGAGGTGCCTTGCAATTTTGGATCATTTATCTTGTCCTTTACAGGAAAAACCGTACGATAAGGATGATGATGTTATAAAAGCAACTTCATTTGAAGTTATATCCACCTTGAGGGAGGTTCTCAAGGCAAGTTCCCTTTGGAAGGATCATGTGCAAACCTACACACAGGTGTGACCTGACTTCTGACTTCTTACAAAACCAAATATAGGTCATTAAAACAGAGACTCTAACCAGTTGTGTAAGAACTGGCACAGAGTTAATTGGTTACAAGTCCATTATCTTTTTCACAAGCAATGGTAATTTACAAATTTATTTTCTTGGATGCCATTGGATACACACTACATTCTGAATGTCTCATTTCCTTGGTTCAGCACATGGGTGATTTCAACTACCCACGGTTAGCTGATTTTGGTGCTGCTATTTCTGGTGCCAATAAGTTTCTTTGCCAGGAGGTGCTTGAGGAATTGGATGTAAGAAACTTTCTTAAATTCCACTTCTTTTACCTTTTACTTTTACACTCTGGATTAACACCCTAAACAATCTTGATATTTTTTTTCAAGCCTATGACAATCTATCCATTGAATACTTTCTGTACCTTTTCATTCATTAAATGTTTCAAGACTGTAGAAATTGTGCATCACCATGTGCGCTGGTTGTCTCATTTGTGCTATAATTTTACTCTATACTCCAAAGAATTTTCTCTCTGACTTATTGAACATAATTTTTTTTGTTAAAAAATTCAGCAGATATGATACTGATTTTGAAATTTATTTTGCATATACTGCAAATCTGCAAAGAAGCACAACTTATTCCCTGATCTAGCAAATTCTCTTTCCAAATGCACCAATAGTCAATAGAACATTGGGTATATGAATACGTTTTGAAAATGCATTATGGAACATATCAGCACAGCTTCTCTTACCAGCACTCTTCTAGAAGTTCTTGAAGATTCCACATTCTTTATACCATTTTCTTGGTCTATTTCAGTCCAACTATTGCACTTTTTGGAACAGGTATATAAGCGTCTAAAGTTAACTCTTGAGTTAGTCAAGAAGGAGATGGAGATTAGTAAGTTGCAGGTAATTCATTCTTCTATCTCCAGCCTTGGTTACCATTGCTTGGTTGAGCATTTGTGGTGACCAATACACTTCTTTTCCAGCAATCCATTGCAAAAGCAATTGAAGAAAAAATAAGTGGGGATCAGCGGCGTTATTTATTGAATGAGCAACTTAAAGCAATCAAGAAGGTACTCCATCATATAGTGTTTCTTGTATAAAGTTACTTTTGTTACATTTCTATTGTTGAATAATTACTTTTGTAGAATTTGGCACTCCGATTGCTGATGACACCATTGCTTTTCATAGATTAGCGGAATGGGCAATAATCCCTTGCCTATTCTAGAACTACAGAATTACTAACGTTGACATCTGATATTCAGCCGTGTGCTCTTGAAGACTTGAACTGTATATATTCCATGCAAAATGGGAAATATAATCATTGTTGCCTTCTAGGTTGATCTGGTTTTATATAGGCTCATAATTACTCTGCATATCTGATGCTTTCAGGAGCTAGGTTTGGAGACTGATGACAAAACAGCATTGTCTGGTTTGTGATTCAGCTGTTCTTATTGGCTTTGTTTTTTTTTATTGCCCAGAGAACTTGACATTTCTAGTGGACGATTCAAAATTGTCCTTCATTTATGTGTTGCAGCAAAATTTAGGGAGCGGATTGAAGCAAAGAAGGAGAAATGTCCTGCTCATGTTTTGCAAGTCATTGAAGAAGAACTCACAAAGCTTCAGCTGTTGGAAGCCAGTTCTAGCGAGTTTAATGTAACAAGGAATTATTTGGACTGGTTGACAGTATTGCCATGGGGAAACTATAGGTTTGTATATATCTGCTTTCTTTGTGAAAATAACAAATGCGAGATGCCTGTGCTTTATGCAGTATTTACCCTTGTATTGCAGTGACGAAAATTTTGATGTACATCATGCTCAACAAATCCTTGATGAAGATCATTATGGGCTGAGTGATGTCAAAGAGAGAATATTGGAATTTATAGCAGTTGGCAAGCTAAGGGGAACTTCACAAGGTTTGATTACTCTTAACTATTACCTTTATTTTTTGTGCTTGATTATCCCATTTATCTGCTGGTGTAGAGCTTGTAGACATTGATGTGTTCTAATTGCATTCTCTGTTGCATCATATTAATGAAAATTGACATCTAGTAGTTCTTTTCCTCTCATTACTTGATAATGCTGTATGACAATTCACAAGGCTCTTGCTAGATTGTAGCAGTTGACCACTGAATTAATGCTCACTTGATGCCTAAGTGCCATATCTTGTTTTTGAACTAATAACTTTGTTGGATCATTTATGACAGGAAAGATCATATGTCTTTCTGGGCCACCAGGAGTTGGTAAAACTAGTATTGGTCGATCAATTGCACGTGCGCTGAACAGGAAGTTTTACAGGTTTTCTGTTGGAGGTTTAGCTGATGTGGCAGAAATCA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|
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