BGIOSGA024189
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA024189 |
|---|---|
| Description |
Translation initiation factor eIF1 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024189, complete gene. |
| LocusTag |
P0681F05.112 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA024189-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA024189-PA |
| Length |
15898 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:18845995..18861892 |
| Sequence Coding Region |
18861875..18861892,18861426..18861617,18861048..18861320,18859799..18860017,18859238..18859298 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:18845995..18861892 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:18845995..18861892 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGTCCTCGTCTCGAGTAAGGGTTGGCAATCTAGTCCCCCTCAATGAAGGAAATGCGAGCTCGTCAAATGGATCGGTGTCAAGCATTCCTATCTATCTGGGTGCCAATGTTGTAGGGAGGAATCATTTGGTGGTCGTCGACAAGAGAGTCAGCCGCAAGCATCTGAGCCTACATGCCTCGGCGGATGGTTCCATTGAAGCGGTAGTGGAAGGACCAAATCCTATCATTGTTCGATCTGAGGGCCAGAGGAGGAAGGTCTGTGCTCAAGAGAGAGTAAAGATTGCACATGATGATGTCCTGGAACTCATCCCTGGTGAATATTTTGTGAAGTATTTGAATGTGGGCGATAACCATAAAAGTTCCACATCAATGGGTTCAAGTGATTTTAAAAAGGGGAAGAGGCTCTGTGAGGATGATACTGTAGTTATCAAAAGAAATCGTCAGATTATGGAAGATGAGGCTTTGGCAAGAAGTTTACAGAAAAGCTTTGCAGAAGAAAGTTCAACTATTTCCGGTTTGGGTTGTGATCAAATGTTAAGTTCACTTGATAGTGCTGGTTCTTCTGAGAGAAATAACGAGAGAATACACTCTGTTGATTATCTGAAAGATGTACTTTCATTGACTTTTCGGCTCATGCGTGTTCAAGGTCTTCCTTCATGGACTAATACTTCCTCAGTTACCATTCAAGATGTCATACAGGGTGAAGTGCTTCTTGCTGTACTCTCAAATTATATGGTGGACATGGAATGGCTGCTTACAGCATGTCCAAGCTTAAGGAAAGTTCGACATGTCCTAGTTATACATGGAGAAGATGGTGCATCAGTGGAGCTTCTGAAGAAAGTGAAGCCAGCCAATTGGATCCTTCACAAGCCTCCACTTCCAATTTCATTTGGAACACATCATTCAAAGGCCATGCTGCTTGTATATCCTCAAGGGATTCGTGTTGTTGTGCACACAGCAAATTTGATACATGTCGACTGGAATAACAAAACTCAGGGGCTATGGATGCAAGATTTTCCCTGGAAAGATGCAAAAGATGTGAATAGAATTGTTTCCTTTGAAAACGATTTGGTTGATTATCTGAGTGCAATTAAGTGGCCTGAGTTCAGGGTAAATTTACCAGTGGTTGGTGATGTCAACATCAATGCAGCATTCTTTAGGAAGTTTGATTATAAGAGCTCATTGGTCAGGTTGATTGGATCCGTTCCTGGTTATCATGTTGGCCCCAATATTAAAAAGTGGGGTCATATGAAGCTTAGGAGTGTTCTTGAAGGGTGCACATTTGAACAACAGTTTTGCAAGGCTCCCATGATTTATCAGTTCTCTTCCTTGGGGTCACTTGATGAGAAATGGATGAGTGAGTTTGCATGCTCACTATCAGCTGGTAAATCAGATAATGGTTCACCTTTGGGTATTGGTAAACCACTGATTGTCTGGCCTACAGTGGAGGATGTTAGGACATCAATAGAGGGTTATGCAGCTGGTAGTTGCATTCCAAGCCCTCAAAAGAATGTTGAAAAAGATTTCTTGAGGAAGTATTGGGCCAGGTGGAAAGCGGACCATGTGGGTCGTTGTCGTGCGATGCCTCACATAAAAACTTTTACTCGATACAATGGTCAAGACATTGCATGGTTTCTACTAACCTCGGCAAATTTAAGCAAAGCTGCTTGGGGTGCGTTGCAGAAGAATAATACACAACTGATGATACGCTCATATGAGTTAGGTGTACTGTTCTTGCCCAAAACTCACCAATCTGTACCACAATTTTCATGTACGGGGAAGAACAATTCAAACCTGAATAACCTGGCCCCTGGGAAAGAGATCAAAACCAAACTGGTCACACTCTGCTGGAAAAGCGACGAAGAAAAAGAACAATCCACGGAAATTATCAGATTGCCAGTGCCATATCAACTTCCTCCAAAGCCTTACGGCACAGAAGATGACCCATGGTCTTGGGACAAGAGGTACACAAAGAAGGACGTGTATGGTTCAGTCTGGCCGCGCCATGGAGGCATCCAAGCCAAGAAGAGGGAGAGCACCAAGGACACGCGACTAGCAGAAGCCGAGCGACCGCCTTCTCGATCCATATCTTCCGGTCGAGTTCTTGGTCGATCTCTTCCCTCCTCCACCTCCTCCTCACAGGTTCTTGGTGTAGCTTGCCACTTTCACCAGCAAAGTTTCATGTCTGATCTCGACATTCAGATCCCAACTGCCTTCGATCCCTTTGCTGAGGCCAATGCTGGAGACTCTGGTGCGGCTGCAGGATCAAAGGACTACGTTCATGTACGCATCCAGCAGCGTAATGGCCGTAAGAGCCTGACCACTGTCCAGGGATTGAAGAAGGAATTCAGCTACAACAAGATCCTTAAAGATCTCAAGAAAGAGTTTTGCTGCAATGGTACTGTTGTCCAGGACCCAGAGCTTGGCCAGGTCATTCAACTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAACGTATCAAATTTTCTTGTTCAGGCCGGCATTGTGAAGAAGGAACACATCAAGATTCATGGTTTCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASSSRVRVGNLVPLNEGNASSSNGSVSSIPIYLGANVVGRNHLVVVDKRVSRKHLSLHASADGSIEAVVEGPNPIIVRSEGQRRKVCAQERVKIAHDDVLELIPGEYFVKYLNVGDNHKSSTSMGSSDFKKGKRLCEDDTVVIKRNRQIMEDEALARSLQKSFAEESSTISGLGCDQMLSSLDSAGSSERNNERIHSVDYLKDVLSLTFRLMRVQGLPSWTNTSSVTIQDVIQGEVLLAVLSNYMVDMEWLLTACPSLRKVRHVLVIHGEDGASVELLKKVKPANWILHKPPLPISFGTHHSKAMLLVYPQGIRVVVHTANLIHVDWNNKTQGLWMQDFPWKDAKDVNRIVSFENDLVDYLSAIKWPEFRVNLPVVGDVNINAAFFRKFDYKSSLVRLIGSVPGYHVGPNIKKWGHMKLRSVLEGCTFEQQFCKAPMIYQFSSLGSLDEKWMSEFACSLSAGKSDNGSPLGIGKPLIVWPTVEDVRTSIEGYAAGSCIPSPQKNVEKDFLRKYWARWKADHVGRCRAMPHIKTFTRYNGQDIAWFLLTSANLSKAAWGALQKNNTQLMIRSYELGVLFLPKTHQSVPQFSCTGKNNSNLNNLAPGKEIKTKLVTLCWKSDEEKEQSTEIIRLPVPYQLPPKPYGTEDDPWSWDKRYTKKDVYGSVWPRHGGIQAKKRESTKDTRLAEAERPPSRSISSGRVLGRSLPSSTSSSQVLGVACHFHQQSFMSDLDIQIPTAFDPFAEANAGDSGAAAGSKDYVHVRIQQRNGRKSLTTVQGLKKEFSYNKILKDLKKEFCCNGTVVQDPELGQVIQLQGDQRKNVSNFLVQAGIVKKEHIKIHGF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..18#276..467#573..845#1876..2094#2595..2655#3574..3650#3728..3985#4684..4773#5516..5650#6144..6293#6590..6693#8757..8810#8902..8992#9129..9206#9292..9433#9517..9585#14095..14229#15231..15305#15391..15602#15694..15747#15854..15898#ATGGCGTCCTCGTCTCGAGTAAGTTGCGTTCTGTATTATCTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGCGCGTGCGATTTTTTTTGGGGGTGTGGTTTTGGCGATGATATGCGCGTGCGATTTTTTCTCCCCGGGTGGGTTTGGGGATGGGAGGCGTGATTAGAATCAGCGAATCGCTTCAGTGCATTGCGCTGTATTCTGATCAGTGTTTTTCCATAGGAGATTTAAGATTTTGTTGTTGAGCTGATGTGTGAAAACTGGTGTATTGCTTAGGTAAGGGTTGGCAATCTAGTCCCCCTCAATGAAGGAAATGCGAGCTCGTCAAATGGATCGGTGTCAAGCATTCCTATCTATCTGGGTGCCAATGTTGTAGGGAGGAATCATTTGGTGGTCGTCGACAAGAGAGTCAGCCGCAAGCATCTGAGCCTACATGCCTCGGCGGATGGTTCCATTGAAGCGGTAGTGGTGAGTGTGATAAGGCATGGGGATATTCCAATTAACTGCGCAGTATTGTTCTGATGGCTTTTTTTTCAGAAAATAACTTGTTGTTCATTGGCATTGGATGTGCAGGAAGGACCAAATCCTATCATTGTTCGATCTGAGGGCCAGAGGAGGAAGGTCTGTGCTCAAGAGAGAGTAAAGATTGCACATGATGATGTCCTGGAACTCATCCCTGGTGAATATTTTGTGAAGTATTTGAATGTGGGCGATAACCATAAAAGTTCCACATCAATGGGTTCAAGTGATTTTAAAAAGGGGAAGAGGCTCTGTGAGGATGATACTGTAGTTATCAAAAGAAATCGTCAGATTATGGAAGATGAGGCTTTGGCAAGAAGTTTACAGGTAACTTAAGTACTTAACCTTTCTAGTTGCACTGCCTGTATTGTGCAGTTTATTTAACTTAGAAGAGAGCAATCCATGGTTTTCCGTGGATCATATTTCCGTTTAGTCTGATCATGGCTTAATCTGGGCAATGCTGTAGTTTTAATATAACATAAATGATCCTAGTGCTGGACATAGAATACTTAGGGCACGTTTGGATCTAAGGCTAGCATTAGCCTAGCCTGGCCTGGCAAGGCCCAGCGTTTGGAACCATAAATATATCGCAGCTTCTGGGGGCAAGCTAGCCCTATGGGCAAGGAAAAGCTCGCTCGCAGTGGAGAGCCAATTCGGCTCTCCTTCGATGACAAACTTCTCTTTAGACTAACTAACTGCCCGTCAAAAACTAAACAACCAAACAACTCAGTAAAGCAAGCCTAGCAACGCAGCAACAACCTGGTTTGCCTAGCTGGGCTATAGCTCAAGGTGACAAACAACCAAACATACCCTTAAAGAATGCCTTTAAAAGAAGGGATTTTCCAGTGTATATTCTGATAACTTTATCGTGGATAAACTAATTTAAATTATGTCAGACAATTGTTTATGAAATTGATCAGTGGCTATCTTTATATATTTCTGGTAGGAAAATAAAGTCTTTACGTCTTAATTCATAGACTCCAGGCTGTGACACTGAAAGATCCTGATTCATAAATATACCACTGAAAGATCCTGGTACACTTAAATACCATCCAAAGGTGCAAGCGTTTAGAAATGTACTTATCTGTGGTGAATATTTATCAAATAGTATCTAAGTATTGGATGTTTGGATTTGCTTTCTGAAACTCAGCATTGGATATGCTATCCTTGTATGCTTCTGTTGTTTAGTGTTGGCATATTTTATATTTTGCATTGTAAAAAATGGTGCCCCTTAGCTTGCTGAATATTAGTTTAGCTGTATGTTTTCTTTCCTTGTGTGAAATTACCAGTATACTATTGAATTGTAGTATAGTACATTACCATCTTAGTTTCATTACTATTTCCTGTCCTATTCCAGAAAAGCTTTGCAGAAGAAAGTTCAACTATTTCCGGTTTGGGTTGTGATCAAATGTTAAGTTCACTTGATAGTGCTGGTTCTTCTGAGAGAAATAACGAGAGAATACACTCTGTTGATTATCTGAAAGATGTACTTTCATTGACTTTTCGGCTCATGCGTGTTCAAGGTCTTCCTTCATGGACTAATACTTCCTCAGTTACCATTCAAGATGTCATACAGGTATCATCCATTTAACAGGAGCTCTTGCGGAAGTTATGTGGTTGATTTCGTTTAACATGGCGTGCCACAACATCTTTTAGATATGATCTGTTCAGGACACAAATGTTGCATAAGAACAAATTTCTTAGCCTGCTCATCATTACCAACATATTTGTTCAAAAAGAAAATCATTACCAACACAAACTCTTGCTCATATACCATTTGTGATTTATCACTATATAGCCTCAACTCATGTAGTCTGCTGTTTGAAAGATGGAATTGTTCTCTAGTTGGACCTTGTAAAGATTTCTGTCTATATTGTCAATGGTATCGTGTATGGTGGGGGAGCAAAGGCTAGTTCTTATTCTGCTGATCTGTTCAGTTTTCAGGGATACTGTGTTGCATATCATTTCCCAACCATTTCTCTAAAACAAATGTTCTCTTATGTTCACACTCTATTCATGCATTGCCAGATTCATCAAAGAAGTATACTAGTTCTTACATGATGAATGAATTATTAGGGTGAAGTGCTTCTTGCTGTACTCTCAAATTATATGGTGGACATGGAATGGCTGCTTACAGGTGGGTTATTGTGGTGGAAATCATACAAGTAATATTGTTTGTCCTTGTATGAGGGCTGCTTCCTTTTTACCATAAGTAGTGACCTTTTTTGCAAACAAAATAAATTTGGCGCCTCTGCCACTTTACAGTTTCAGAAGTCAGAACACTCAATCATGAAACCAACTACGATCCTGTGCTATTTATATTTGTCTGCTCCTTTTAATTTTTTTTGTACTGCACAATTAATACTAAATTCTACGTGCTTGTTGGTAAGAGGAAAAGCAGTCCTTTCTTTGTTGCTGAAAGTAATCTGCCACATTTTTTTCATTGAATAAGCATTTAGTTTCTGCCATCCTGGTAGCTTTCCCCTCAATGTTTTGTTTGCTGTAACTATTCATTGGTATAATTCTTTTTGAAGTGAAAGTAGCTGCTGGTAACAACCTAACTCATCTCATATTCTTCATTACTGATAAATTGATGTAACTATATTGGTCACTCTCTATTGGTTTCTAGAATCATAGTCATTTATGTTATTGATTTACCTAAATTGTTTCCTGTGCAATAATTTTGGAAGCTCATCTTTCTGAGCCTCTATGGCTAGGATTACAATTTGTATGTTTACTAGTTAATTGTAAAGCATAATATATTTGTGGAATAAAAAAACTGGACTACAAAGATAAGCAAAACATGTACTTTTGGCCTTTTATTTTGCTATTTTTGATTATGATTCTCATTTGTCTTCTATTTTCCACTACTTCATGTATCTTTTTGTTGACATGCACTTAGTTATGAAATGTATGTATTTACTAAGGAGTTTGGCAACCAGTGCCCATCTGTGTTCCCTATGCTATGTGGTGAAATATCACTGTGCTTTCTTTTCCAGTCATTGCCATTATCTACATCCTTTAGTTTTAATGTAAATAACATTGCACTGTGCAGCATGTCCAAGCTTAAGGAAAGTTCGACATGTCCTAGTTATACATGGAGAAGATGGTGCATCAGTGGAGCTTCTGAAGGTGACAACATTACTAGAGTAATTCATGATATTTTTGTATTTCCTTTTTCTGATCTCATATTCATGGTTGGGTGACAGAAAGTGAAGCCAGCCAATTGGATCCTTCACAAGCCTCCACTTCCAATTTCATTTGGAACACATCATTCAAAGGCCATGCTGCTTGTATATCCTCAAGGGATTCGTGTTGTTGTGCACACAGCAAATTTGATACATGTCGACTGGAATAACAAAACTCAGGGGCTATGGATGCAAGATTTTCCCTGGAAAGATGCAAAAGATGTGAATAGAATTGTTTCCTTTGAAAACGATTTGGTTGATTATCTGAGTGCAATTAAGGTAGCAGCTAGCAGGGCACTTGTCTTTTCTTCTTGATTAACGTATCACTCCAATTGTGTTTCACTTTTTTAGAAAAGAAGTTAAATGTTGTTTTCTTACTGATATATTTTAAATTATCATCATAATGTGTTTTGCCGGAGGTTACCAGAATAAAAATTAACAAATAACCGTGCACTTCTCGAACAATCACAGTTAACACTGGCAACTTCTGTTTCTACTCTTCTGCTACTCAATAAAAAGAAATCATATTAAATACTACTGAATTGGTTCACAAGGGGATCCACTGTTCTCATGTTAGTAAAACACTGAATTGGTAAAATATGCATATCATGATTTTGTTAGAGAGAGATCTTGGAATTGCTGGCAACATGTTGCAAACTTATAGTAAGACAGTAGCTGTCTCATTGCTAAAAGCAATGAGCCATGTTAAAGAATACCTTAAAATAAGTATAATGAAAGTTTCAGCAAATCACAAAACATGGTCTTATTTTCTGTGGAACATTGTACAGAGTTCTGTAATAAGTACCTCTAAATTGGAGTGAATGAAAATAGGATGTCTCGGGCTGTCTAGCTTCGAAAAGCCCCAGTTCATTCTAACTATTACTTTTGTTCTAGTTTAATTCCCCTACCGTTGCAGTGTACTAAACACATCTTCTCTATGTATGTTGTAATGTATTATTCTCTTCATGACAATGCAGTGGCCTGAGTTCAGGGTAAATTTACCAGTGGTTGGTGATGTCAACATCAATGCAGCATTCTTTAGGAAGTT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