BGIOSGA024296

From RiceWiki
Revision as of 16:51, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA024296

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024296, complete gene.

LocusTag

OsI_26030

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA024296-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA024296-PA

Length

8216

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:16280682..16288897

Sequence Coding Region

16288815..16288897,16286093..16286191,16283174..16283267,16281977..16282065,16281056..16281089
,16280682..16280786

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:16280682..16288897 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:16280682..16288897 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGGTCTTGCCTGGAGCTGCGGGTTTCGAGGAGGACGCACTGGGGTTTCTCCCCCCGCGGTCGCGCCGACGATGGAGCAGGTGCATTCCAGAAAGCTGTAGCAGCAGAATCGCAGTGGAGGCAATTGATCACAGGAAATATGCTACTGGAAGATTAACTGTCAAGAAAGACGCTATAAGGCGTTGCCGCAGTCTCCGCCATTCGCTGGTCTACCTCAACCGACGTTCGTCCCCGAACACCCGCTGCTTCGACGCCCTCAGTTACTTCGCCCAGGTTCCTGAGGTCTTCTACTATGCTGAAAAGGCTATGCTTAACCCAATAGCTCCATTGAGTGGTCAAGAGGCACAATCTCTAAAGCGACGGATAGGTGAGGCTGCGGAAGCCTTCACGATAGAGGACAAGATGGAAGTGGGGCTGCAGCCTACAGGGATGCCATGCACTTCAATGATGCTGCGGGCTGCGGCTTGCTGCTTGCTTGCAATTGTTCTGGAAATAATCTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEVLPGAAGFEEDALGFLPPRSRRRWSRCIPESCSSRIAVEAIDHRKYATGRLTVKKDAIRRCRSLRHSLVYLNRRSSPNTRCFDALSYFAQVPEVFYYAEKAMLNPIAPLSGQEAQSLKRRIGEAAEAFTIEDKMEVGLQPTGMPCTSMMLRAAACCLLAIVLEII</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..83#2707..2805#5631..5724#6833..6921#7809..7842#8112..8216#ATGGAGGTCTTGCCTGGAGCTGCGGGTTTCGAGGAGGACGCACTGGGGTTTCTCCCCCCGCGGTCGCGCCGACGATGGAGCAGGTACGGATCATCCCTGCCTCTTGAATTAAGCCAACTTTTTGTTTGGATGATAGGATGAGGGTGGATGGAATGAGATTAATTAACTAGTCCCTCCGTTTCATATTATATTCCCACCGTTTCATATTATAAGACGTTCTATCATTTTCGACATTCATATAGATGTTGATGAAGTATGTATGCATATAAATGTGGATAATGCTAGAAAGTTTTATAATATGAAACGGAGGAAGTAGTAATTATAATACCTTAATTGGCATAATATTACCTAGTTATACACTTACCAGTAGGAATTAATACTTGTCAACACTAGTCTTACCATGCTAATACCATTAATCATACCTAATCAACTCACTAATCATGCACTAATCAGCATTCTAAACAAGGTGGATGGCTTCATCCGGCCAAAAGAACCGGATTCTTTCATCCAACATATTGAGAGAATATTCTCTTTTCTAGGCCGCCCCATCCATCCTACCCTCAACCAAACACTAAAAAAAAAAATCGTGAGACCATCTCCCATCCAGTACCATCCATCCAACCAAACGCACTCTTAGCGTCTGATTCCGCACACTTGTGGGAAATTTTTTAGTAGGCGCGATAGAGAGGGATGCGCGATTTTTTTCCCCATTTTATTCGAGAGGAGAAAGAAGGGTGTTTTTTTTCTTCCTTTCAGAGAATGTCAGAAATTCAGAGTAGCAGCCGGTGGATTCGTGAAATATTCTACTCTCTTGTCTTGGGGGAGGATCAAGAACGTGCAGGTAGCTGAGGATTTGGAATTGAATTTCTTTTCCTCTTCACCTTGATTAGCGATTTTTTTTTGCGTGTTCAGTTTTGTCCCGTCCAGTATAATCAACAGATTCTAATTGCAAGAATCCATGGGGGGATCCAAGAAACTCTAATTACACTTCCCTAGCATGTAGCTAGGGAGATGGTGGGATCGGATTTTATTTATCAGCTGTTCTGGGAATCCTAATTTTTGTAACGTGGGCAATACAGGTTCTGTGCTTTGTAACTGAACTCTTTAGACATCGCTTTGTACATGTTGCGTGCTGTCAAGATCATGAGCGACTCCACTAAAAATGAAAAAGATCATGAGTGACTCAATTTTGATAATTTTTATCTCCTAATGTAGGAGCATTGGAACTATACTATCTTTAATTTGCTCCTTACATAAATGTCAAAGTTCAGAGTTGAATCCTTGCTAGCACTAGGCTCCCAAGATTATGTATGGCTTGTATGCAACTTTCGACATCAATTGGCCTTTTTGTGTTTAGATAATTTGGGATCAACTTTTTTTTTGTCATAATGGAAATAAATCCAGCACCTACATGAAGGATTATATTGCTGAATGCTGAGTCAAGTCACCTGTTCTTTACTGTAACAATAACTTGTTTTGTTGCGGCGGTTATCTGGCAATGTTCATTTACATTAGCCATAAATGTACAAGTTCATATAAATTTTGAATCCATCACAGTTGCAGTTCTTTTGGTAATATAGTAACCCCGAGAACTATTTTAGTCACAAGGTACTTTTTTACTCATAAGTCATTTTTCATTGGAAAAGATATAAGAGTGTATGTTCATACACATTGCCCAATACCCTTGCAGTGTACAAACAAAGCACACCTTGACTTACACTTGCAGTTGCAGTTGCAGTATTTTGGTATACAAATATTCTGTTTCTTCCTAGTGACATATACCAAACTAAGTTACTCTGTAGGCATTTTTCTTTCAACTGCTTTACTCTTAAGTCCCTTTTCTTTTTTTTGAAAGATGTATAAGAGATGAAGGTATCTGACAATTTGTCAGGAGGGCCGGCCTCATTTGTCACAGACTTGCCAAACAAGCTTTCAAGTTTCTCTGTGTTATCTAGGTACCTTTGCAATTTATCACCCAATTCTAATACCTGAAAATCTTCTTCAATGTGTCGCTTAGTTGTAGATTGATTCCTGAGTGCCCGCAGCAATCTTATAGTGGAAAATATTAAATTTTCTCATTTCTTAAACTACGTTTAGAAGTTCAGTTATTAAAAAAAATCCGAGTAGCGAATGTTGATCAGTATATCTTGTATGCGCATTTTCAATATACATACTTAAAATGTGGAAGTAGAACATTTTGGTGTAATCCATAATTGTTGCACAATAGATAATATCAGTAAGCTCCCAGTTTCTGGCCAATTTACATGATGGCCACTTTTTTTTTTCAATCCAAACTGCCAGAGGCTAACGTTTTATCCACTATGTAGTGCTAGGCTGGTAGCATCCTTGAGCATATAGGAATCCAGGATTCTGATTGAACTTGGGAGCTTTGGGCCTGGTCAGGCCATACATCACTAGCTATGATTAGAACCAACACTTTTCTCTACTTTGAAGTTTGAACATTCTATTGCGTCATTTTCATGCTGTATGCAATATACGGTAAATTTTTACCTTGGAAAATGTTCAATCAAGTGAAAAACTCTGAATTTTGTTTTTCAGAACATCACCCCAAAGCATTTAGGAAACTGGAACTACCTGGAATCATGATGGAAACTAAACATTAGGAGTGCGTATGAGTATGACTGCACAGCTAGTTGAATACACCTGATTTGATTTCTGCAGTGTACAAATGTGTCCTTGCTTCAGGTGCATTCCAGAAAGCTGTAGCAGCAGAATCGCAGTGGAGGCAATTGATCACAGGAAATATGCTACTGGAAGATTAACTGTCAAGAAAGACGCTATAAGGTATTTACCCTCGGTTTAGGCCTTGTTTAGTTCCCAAATTTTTTTTTCCCAAAAACGGCACATCGAATCTTTGGACATATGCATGAAGCATTAAATATAGATAAAAAAACTAATTACACAGTTTACATGGAAATCACGAGATGAATTTTTTGAGCCTAATTGGTCCATACATGATTAGTCATAAGTGCTACAGTAACTTACCTGTACTAATGACGGATTAATTAGGCTTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTTCAGACGAGTTATTGAATTAGTTTTTTCTTCGTGTCCGAAAACCCCTTCCAACATCCGGTGAAACGTCCGATGTGGTACCCAAAAATTTTCTTTTCACGAATTAAACACACCCTTAGTTGTAAATAACATAGCCTCAGTCCCTCTAAATCTCTAATAATTGTCATTACATACCATTTTCCCTTGCACACTGAAGTTGGTTTTTTTACCCGTACTACTATTCTGTTTTTCTCGTCTGCCTATACTGTATGCCAGTCAGAACTCGGAACTCAAATAGGAGTTGAAAACATGGATAAACATAGGTATGTGTGACACGTGTTAGCTAAATGATGATATATCCACTGTAGCGTTGTGTATAAGGATGATTTAATAATACATATATACATGATCTTGGCATTTGGCGCATGCATGACACGGAGAATTAACCTGACCATCATGCACAGTTTCTATGTGCTCTTGCATGTAGGTATATGAACAAATCAGCTAGACTGGAAAGGCCGGCAAACCTTTATATTTCATGTGACTTGTTAGCTACATATTTCATGTCATGGATGGATGTCTATATGCAGCATTAACTTTCTTTGGATGATCGCTACGTGAAGTCGCTGCAAGATACACTAAGAAACCTTCTTTACTCCCGGTTGGTAACCCCCTTTTAATCCCGGGTTTTCAACCGGGAGTAGCAATCCGGGACTAAAAATGGGTATCTTTAGTCCCGGTTAAAATAACCGGGACTAAAGATTTAGTCCCGGTTGATAACAACAACCGGGAGTAAAAAAGAGGGAACTTTAGTCCCGGTTGGTAACATCAACCGGGACTAAAGTTACGATCTTTAGTCCCGGTTGGTAACACCAACCGGGACTAAAGATCCCGGGGAGGCCTGACAAGCCCTGACAGCATTTGAACCGGGACTAAAGATGATCTTTAGTCCCGGTTGGTAACCGGGACTAAAGATCAAATATGCCTGTTCTTTAGTCCCGGTTTTTATTGCAACCGGGACTATTGTGAAAATAGCCCGACCTACGAAAGATGGTTTCTCCACCAGTGATACGTACAGCTTGGGTAAACTGGATGGGATCGACGGTGCCGATCAATCGATCGAGCAGTGATGCCAAGAAGAATCTCGACCCTCTGAGGCTCTAATCCAGTAGAGTGCGCGACCGGTTAATCATCTGATGCTTTAGACACTACTCCCTCCATCCCATAATATAAGGGATAATAGTTAGATGTGACACATCCTAGTACGAATATGGACAGTATATAAGGCATAATAGTTGGATGTGACACATCCTAGTACGAATATGGACAGAATGACAGATCTGTCCATATTCGTACTAGGATGTGTCACATTTAACTATTATCTCTTATATTATGGGATGGAGTGAGTACATAATCAGGTTAATTAGCTATGCAGATTGCAGAGCATGATCTGTTTCGATCTACGCTGGTTTTGAGAATTAACCATGCATTGCATGCGCTGGATTTAAAAGCCATTCACGCATCTGTATCTTCAAGAATCATAATCCACTTGAGTTGCTGCTGTATTAGAGAGTTGGCCGGTCGGTTGAAATTTGCTACTACTGCTGTAGTAGATGCATGATCGATGAATATGTCACCGGAGGAGATAAGAGCCTAACTCGTGGATTGATGGAGGCTTTTTTCTGGATGTAGGAGCAGCTATGAAAATATATAGCTTTTCGTGTGTGAATTCAGTAGAGTTTTTTTCTATGTTAATTAGCTGTTTGGATGAATACGTTTTATGCCTCTTGAGAAAATGTCAAGAGATACCATACTTTTCCTTTAGAATGAGCTATATATGAAATTCAATGCTGTTGAAGGGAGAGAATTTCTACCCCTCAAATTGTGTGGGAAATGAACCACGTATCATTTCTCTCAGAAGAAACAAATATGGATATGGTGATGTATAAAAATGTGGAATTATATTGAATTTTTTTTCTTTTTTAAAACGTCAAGCGTGCTATGGTTCCACACGGTTTATCACCGAAGATAAGTTGGATACAACTATTCTAACGTAAAGTTAAAAAGATAGCTTATCACCAAGGAGCATAGGACCTATATTTAAGGGACCACGCGTCAATGAAACACATCCATCTAACATATACTCCCTCCGTCCCAAAATATAACAATTTTTAGTTCATAGTCTACAACAAAACAACCATGGGGAGACGCTTTATTTAAGCTATAGAGACGTTTTAAATCATCTCCACATCTATTCTATCCTATAATTCACCAACTCATTCTTACACCTACGTTACTCATTTATCAAATCCAACGGTCCACCTGCGTTTGATCTAACGTCTCAGATCGGCTCCCTATTCTCACACGCGGAATCCTCCTCCCATCGTCCATCGCGAGTTGTGACGCAATGCGTGCTCCCCCTCCCTTGTCGCAACCCTAACCCATCTGCATCTCCATCCCCGCGCCGCCGCGACGCCCCTCCAAAGGTGGTTCCCGAACCCACGCTGCTCCACACCCTCAGCTGCTTCGCCCATGTCGTCGGACGCCACTCCAACGGTGGCCATCTCGGATCCACTTTGACCGATGGCCTCTCCGTAGGCGTTGCCGCAGTCTCCGCCATTCGCTGGTCTACCTCAACCGACGTTCGTCCCCGAACACCCGCTGCTTCGACGCCCTCAGTTACTTCGCCCAGGTCATCAGTTGGTGGTGACGGGCGGCCACGGGACCAATGGGATGATGTCGTGCAGGACATGATCGCGATCGGCAACGGGCCGGGCCGCCTTGATTATTGGTACGTGCTTCACCAATTGCTTGATTTTTTCCTGCAGGACTTGATGAATTGCTTGAGTACAGCCTGCCAAGTGCTCGACAAAGTGCTAACACAGGAGATTAAGCAAATATTTTTTGAACTACTCTCAAGAGTGAATAGTTAATAATTGATATCCTGTAGGCTAATATTTTCTATATACTGTAACTTGTTTTCAAAATTCTCGGTGGATGTCAAACCTTGATACTATTCTAATTTCTAAACAGTTGTCGCGTACTAGGTGGGTGAGAACCCGATATATCAAAGCACTTCTAAGATCGATACGCTCCTGACATCAACTCGACATTCTATTTGTTAATATTTCTAACATTCCTTTGTATTTCTTCATGTATAAAATCCTCAGCAGGAGAGTGTATATTTTTTTTGTGATCTGGGAGGGAAGGAATGATTCCTACTCCACATTTTCGTAAAAAAAAAAACTACTTGCACTAAAATTCCTTGATATAAGACATTTTTTTTCTATTTATACATATTTCCAATCATGTGTTACATAGAAGGCTAAGGGGGAAAGTGTTGGCACATGAAGCTATAATGATTTGGTTGTGCAAGTTAAATCCCAATTTTTTTCATTCCTGACTTTGAATGTTGATACTGCGATGGAAGATACATGTTATTGTGCAAGCTAAATCCCACTGTTGCATTTATGCATGGTTAATTGCATTGCCTGCTATTTTGATGTACACAACTTGATTGCTAAAGCTTGATGAAATGCTCTGTAGTCTTATGGAATTAATATATGATTTTCAGGGCTTTAGTAATAAATTTGGATCACTAATTTTCCTGATGCTCAGTTTGAGAACATAGTACTGTCCATCTCTAACAATGTACTACGTGTATTGTCCATATCTGCCTTGATAATTTTTAGTGTAACTTGATCAAACATCTACTGTAATATGCACTTGATAATTTTAATTTATGTATATTTGTGCAAGGCTTGGATTAACTATATAATTTAATTTATGTATATTTGCAGGTTCCTGAGGTCTTCTACTATGCTGAAAAGGCTATGCTTAACCCAATAGCTCCATTGAGTGGTCAAGAGGCACAATCTCTAAAGCGACGGTGTGTGAGGGCTTTGCAGCAGATATTTAGTCTATGTGACCATGGCAGGGAAGCACACAGTGATGTGGAGCTTAATGACTTTCAGGTTTGTATTCACTAGGCTGTTGCTTTCTGTAGTTAATACTAGGCTAAATAGTGCTTTTTATTGCCATTCTGTTATTTTCATTCATGTTAGAGGGATTATCTTATATTTTGATTGTTTCTTACAGAAATATTCCACATGTAAGATAAGGCCTTGTTTAGTTCCCATCCCATCACATCGAATGTTTGGACACATGTATGGAGTATTAAATGTGGAAAAAAAAATTACACAGTTTATGTGTAAATTGCGAGATGAATCTTTTAAGCTTAATTGCGCCATGATTTAACAATGTGGTGCTACAGTAAACATTTGCTAATGATGGATTAATTAGGCTTAATAAATTCATCTCGTCGTTTCCTGGCCGAATCTGTAATTTGTTTTGTTTTTAGACTACGTTTAATACTTCAAATGTGTGTCCGTATATCCAATGTGATAACCAAACCCAAAATGTTTCCCCAACTAAACAAGGCCTAAGCATGGACAATATATAACTACAGATCAATTTGGGAAAACTTGGTTGACATACACCTGCACTTAAATTGGCGGTAATCCAAGATTAAGGTGCTGATCAGTGGTCGTATCATGAGGTTGAGATACATGTAGTTGTTGCGGTGTATAGTACCTTTGCTCCAGTATGTTTATGTGGTAAATGGTCTGTACCATGTCTATTTGCATTTTTTTTGTCTGACTACGTTCTACTGATTTTATGAAATTTGGCAAGTATAATAGGTATCTAAAAATAGATTGGGCTTATGAATTGCGTTAGCTAGGCGATTGATCAATACTAAAATGCTCAATTTTGCAGGATAGGTGAGGCTGCGGAAGCCTTCACGATAGAGGTCAGTTCTGCATTTCTGAGGTGATTCTTGTTACTTGTGCATTTATAGGGACAAGTTATGCATTTCTCCATGCTCAAATGTACATATACGCACTATTGAGTGGAATTTAATTCTGGTGTTTCTGTAGCATTGAATCCTATTTCATACAGCAAATTATTCCTATATATCATGTCCTTGCTGCTCCAGACATATCAGTCTAAAATGTTAAGCATAAATTTGCTAAAGAATGTGCTTTTGCTATTTCTGATGACATCATATTTAACTTTCAGGACAAGATGGAAGTGGGGCTGCAGCCTACAGGGATGCCATGCACTTCAATGATGCTGCGGGCTGCGGCTTGCTGCTTGCTTGCAATTGTTCTGGAAATAATCTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA024296