Os06g0135000
| Gene Name |
Os06g0135000 |
|---|---|
| Description |
Similar to PPLZ12 protein |
| Version |
NM_001187658.1 GI:297724446 GeneID:9270731 |
| Length |
10373 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0135000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:1879538..1889910 |
| Sequence Coding Region |
1888455..1888733 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:1879538..1889910 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:1879538..1889910 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>tacttgttagtgataagcagtttattatttgtaccgttatatattatatgccatctttgtaaaaaaagactgttctgtagtctatacatcgaacatattcttatggttgatatcatccctgatacttctgtacgcagagcaatgaatgacataaatgcaggtattattccctttcaagtatatatggtacttctttcagtctgtgcaacctgcatgatgtttattagtctatttaatgttgtaatgttttctgaagtaataatctgtcagacttcttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>YLLVISSLLFVPLYIICHLCKKRLFCSLYIEHILMVDIIPDTSV RRAMNDINAGIIPFQVYMVLLSVCATCMMFISLFNVVMFSEVIICQTS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8918..9196#agcaaagtttcctttccccaatcaatcgccaatccccctcctcaatctctcctcctattttctcctctcgccgccgtttcgcctggcaaatctgcatgccaagccgcgatgccatgccatggcaaggccaggatgggtctgaatttgtcgtgtcatatccactcgagtcgcgagttggccggacgccgaggagagtagccgcggatctgactgcatgacgcggtcagcgggcctggattcctacgaaaggagccgcctttgatctataatcggtgagtttcttttggtgcatctagttccctatggtcggatttttgatctagtataaactttctgccttttagttatgcgtgtcctttcttgaataggaggaatatgaaggattaaataccttaacaactgccaaggcaccattgttctctacggtgcagaagcgagcctaaagtgccgctcattttggtttataatcggtgagatcttcacattctatgtccttaaggtttctcaacatgggatatttcatatgatgtgattttattatgttgaattaatctgcaaacttgctgctttgttccattttttgtcctcaacattaatccacaagattagagtttgttggtatgtggaaacaatagtaatgctattctcattttggttgctcacgatcctattaagtcggttctccatttttgcgtaatgcttgctattcaaagtgcactgataggaaacaaattgtattttaaattctttcacaaccctactgcgggcttccgtaggaacaattccttcatgtctaacttctagtgtaactctggggtgatggggtgcgactgcccttcaaacttctggtgtaactctggggtaatgtgggtaacttctggtgttatatgatcttcgattgacaacaaactcctgcggaaaaaggcattactcttagcaaacggtcgataggaagtcagtatgaagaaaacaatagagtaccttaccctttttactgtattaatgatcagatgtttctgtcggtgttagcaggtcttcagatgactgtttctgtcggtgttagcaggttttcagatgactacaaactcttgtggaaaaaaacattagtgttagtagctggctggcaagcactaagtagtcattacaaatacaacaatagagtaatagtaatttgcccgtgctaacgctacggtatatttagtatgtttccccaaaacaaaataattcaaaaatagtatgtttttaaatttttgccaaagggagtagtaaatctagatggagcaactaattgcatcttacagatatgcgcaaaaaaaaggtaaattgtgaatatttgcaaatgtatcaattttgtaacatgaattgtctcatttctttcccaaaaggaaagatctaataatttttttacccacaaattgcacacattacatcttgtcaatctcaaattcctatccataaattttacaatcagaacttcacgtttaacgacctacaaatctctgcccatgtctctctgtcccagatccgcgcataacccatcaacacattttcctagaggatgtggatcactcccacaactcatcacccaagaagtgcacctaggtgacacgcatattgttatcctaggattgttgcagcaacatatttgatagtaacatggtaaatttaatgttatgtgcaacctcatttaacagctcaacttttataatattaacaaaaatcaatattttacggtacattacttattgacatgtttactcatttgtaaaataaatttaaaagcattgtacaatacaatcatgcatttcatcattgcacataatattttaatcagaaaattgcaccagaaagcaacgtacatgacaaagcacaaaaagtcatattattcattattggaccatttgctcaggtgatcaacagcatactaattagctagaaacaacaatagagtaacttacttgtctgacataccatttggtgttaatggtcagatgttcatgatggtgttatatgatcttcgaatgacaacaaaatcctgtggaaaaaggcattaactttagcaaacgctcgataggaagtcagtatgaatacaacaatagagtaccttactgtatttaatgttactgggtattaatgatcaaatgtttctgtcggtgttagcatgtcttcagctgactacaaacttttgtggaaaaaagtattagcgttagtcgccggctggtaagtactaagtagtcagtacaaatacaacaatagagtactactccgtccatttcaggttataagacattttgactttggtcaaagtcaaactgtttcaagtttgactaagtttatagacatattaatatttatagtactaaattagtttcataaaatcaataattgaatatattttcataataaatttgtcttgggttgaaaatgttactatttttttctacaaacataatcaaacttaaaacagtttgacttcgaccaaagtcgaaatgtcttataacctgaaacggagggagtagtaatttgcccgtgctaacgctacggtgataattagtatgttccccaaaacaaaataattcaaaaattgtatgtttttaaatttttgccaaagggagcagtaaatctagatggagcaattaattgcaacttacagatatgcgcaaaaaaggtaaattgtgaatatttgcaaatgtaccaatattataacatgaattgtctcatttctttcccaaaaaggaacatctaataatttttttatccacaaattgcatacattacatctggtcaatctcaaatttctatccgtaaattttacaatcagaacttcacatttaacgacctacaaatctctgcccatgtctctctgtcccagatccccgcataacccatcaacacattttctagaggatgtggatcactcccagaactcatcacccaataagtgcacctaggtttcatgcatattgttatcctaggattgttagtgcacctagttttcacgcatattgttatcctaggattgttgcagcaacatagttgataataacacggtaaatttaatgttatatgcaacctcatttaacggctcaacttttataatattaacaaaaatcaatatttaacggtacattacttattgacatgtttactcatttgtaaaataaatttaaaagcattgtacaatacaatcatgcatttcatcattgcacagaatatcttaatcagaaaattgcaccagaaagcaacgtacatgacaaagcacaaaaaggcatattattcattattggactatttgctcaggtgatcaacagcatactaattagctagaaacaacaatagagtaacttatatgtctggcatagcattgggtgttaatggtcagatgttcatgatggtgttatatgatctttgactgacaaaactcctgcggaaaaagaatttaccttagcaaacggtcgataggaagtttactgggtattggatgaacagatgtttctgtcagtgttagcaggtcttcagctgactacaaactcttgtggaaaaaagtattagcgttagtagctggctgttaagtactaagtagtcagtacaaatacaacaatagagtatgtagagtacgttaccatatttggctgttagattgtgttagctatcaggtgttccaattggtgctagcagattagcgactgtttcctctagtgtctttttaacaggggaactgtgcttgtttgggtattttttagcttgaggtttggctttcttcgcttcactgttggctttcttcgcggccttgctagcctccattgcctttttcgcttgtagttgttgtgctcgaaggcgaagcagattcatcctctctaaattctgtttgcggtgttgtttagcatgtgccttttcttgtacagatggtacccaatcgtcgatcccgcactccttgcagtacacgtactttaatccgtctctgttgtcagccatcctgcagttctgcaatatgtcaaattattgttgcatatctgctggcttctcgtctcacaagtctttaatactcattaatattaagaagttgattacaggttgcaaagatattaggtgccagaatgcttaaggctgtgtttagttcacgccaaaattggaagtttggttgaaattggaatgatgtgatggaaaagttggaagtttatgtgtgtagaaaagttttaatgtgatggaaaagttaaaagtttgaagaaaaactttaaaactaaacacggcctaagtaagcagtccagcaatgcggtatgcgaaattattcacccaagtcataatatagaaagtgacagaatgataagcagttcagcaatgcagtatgtcaaattattatgtcatccaagtcattacaaagaggttacagaatgcagagaaagatagtactaggtgacagattgataagatgttggtggcatatgcgcttataagctagggaattcaggaagcgcataatcgataccacacgttgataggtctgtatcaaatcagatacaggcatcgctgcagcctagtttaatggcatgtaggtagattgtttttttttttttttgacagagaggccacggtggaaaacacatgcgacccttaacaaaagaacatctgggatgcgacaattaagctagggtttgacaattttctaacgaagttgtaataatcccaaagcacgggcaaaatcagatctccacgcgacgccgacgcgaccagaccacgctagagaggcggtggcagcagccgtcgtaatcgaagacgagaggaggttgaactggagaatcatggtgcgggtgcgtggatcaggcgagcgtcgaggcggtggagaagtagggcgcttcgtacgcctcgcggagccgggtctccacctcgtcaaccctttggccggcgagtgcgtcgctggcgctctctctacccgcgtccaatccaatccctcgacgtccgtgtcgagaccaagaccaagaccaaaggtttcttcggcgcccgttcccttctcgataacgctgtctttttgttcgttttttttaactagcaaaaatacccgtgcgttgcaacgggtaaaaaaattctaataataatatacgtttttcatgtataatcatgtcaatgacaatgtttctattttaacgagcggcttgtttttttataaacagtgttttttttcttgcgcgattttctcaaaccatttttcagaaaaggcgcatttctttctaatagttttttcctaccatgttttttttgctttttcacttacgaagaaaaccatatttttctcctttttttgcttttcttttctcgtgtgttttttcttgttttctcccacgtttgtttgcttgtttttttcgaaggatcttttttgcttttttcaaatacaggagaatatatgacaaaataaagccacatagtagatggcaaaaaatcgatggatcctatccgactcaagcgtccatcaatttagcttttttctgacagttttttcagaacgattttttttaatagacggtgtttttttcttgcacggttttttaaaacaattttttagaaatggcgtgttttttcgacagttttttccttgcatgttttttttaaaatattttaccgacaatggaaataatttttctcgcgcgtctttttattttttttattgatgatggagaacctttttagcgtgtttttgcgcttttttctgacttttgcctcacacgttattttaaccgtttttattttctcatgcattttctctttttaaatagttagattagagatagagaagagatatatactggttagaaatcagattttgtttcgccctttccattttttctctcttgcattttttattttatacgaaccagctttttattttttacgaaccattttttcaccattttcttaggaaatcgaacgaacttttttagatgtttttttgcctttataggaatcagacttttattctgtttttaaaggattcgaatctagtttttttttgtcaccactttttttttgccttttatatgaatccgatttttttccgtcggatctacagtttttttggccactcaggaaaaaaaacttttgttgttgttgtttttctttattttcttttttgtgcagcttttcttttttccttttatgcacctatctgtctttgttctctttctcttttattattttttttagcaaaaacaacctcaagtagcttgttgcaagattatagggactcaaatgtaaatataaaaaatacagggactcaaatataaaagtacaaatctaaaaattaaaatcatataaaaatggaatgctctctacatgtagattccgtttttgctaacagatcttcaatccggcacattaatttttttcaccaatctgagtcagacttttttttttttgcttttctttttctttttatgcacctttctgcctttgttctctttctcttttattttttttaacaaaaacgacctcaagtagcttgttgcaagattatagggactcaaatgcaaatataaaaattacagggactcaaatataaaagtacaaatccaaaaattaaaatcatataaaaatggaatgctcttgacatgtagagtccgtttttacaaacagatcttcaatccggcagatcaatttttttcaccaatctgagtcagactttttttttggttgatataggagttggacttatttttttttatcggacaaacatggttttttcgccttttttctgtggatcggactctgtccggttttttttggtttttttcgccttttttttctgtatcggactctgtccgcttttttttggtttttttcgcccttttttctggatcggacttctttttccgttctggttttttattggataaacctggtttctacccggtttttttcacccggtttttttgacggacgatggaagcacctcttattttttaagtagtagagatagagattatagggtagcccctatacgtgttactacgctagatcgatccactaggaaggttcaatcccgctggtgagggatttattagttatcttatctggcgatctgctcttccgattctagatcagtaaaggtttctcggacctgacaagatcccatcatactggatgctagctttggtttctggattctctattgttgaagtttttagctgatgctattttggcatgtttccttgtatatggtgcgtaatgcatggccgaatggtcactggcagcgtattgtgcatgacagattgacaggttactgattcctactttaggcccctgcgtgcttgatccatcgtgtaggttcaatcctagccaggttgtttgaaatatttgtgaagtatcggtgctagattgtcttttaagccttgttcgtttaatccctctcgtgagaattgagagggatttgaatgggatttattcttcaatccccaccaattcctctgtcttcgggattaaacgtacaaggtctgtcttcggattaaatgaacaagaacttaagggaagtggtacatctaatgagctttaagtctgttgatgtctccatgacagtaaaagactgttccgtacttattgtatataaaactaaccctgagaaattaggtttacgaaaaagcatcattgactacatgaatgacttatttgagcagtgaatgttggtttttcttttccccattttctgagagattgttttggtaggctgtccatggtagcccaattaatcacgcattgtaactatgtgattgtctagatctagtgcttttcaatgaagtgaaatattattttcattgatggaacttactgtcatttcttgctttttttcgttacttgatggaacttcaatcttcttttcttctgcaggattagtctttgttcagctgatctgcgcaatccaataccgagtcgtgaaggaacatgctgatgatgcattctatgaattgcagaatccccaacagcaaattcaggcctatgcctttgatggtaaactattaacattgagcaattaaatagttgcccatatcaaattattgactcaaagcttaatcactttcccctcgaacttagtggtcctggccctagttccaagaatgaatcttgatgacctttttgagtaaaagaatgatgtggtgaagactgtacttgaggagcttgaaaaggtaactcaagtgcctgtttttactgagtccagctctctaggattaagttgatcggctgattatgcaaactccagtaaggcaaatcattgtttttccttgtttgcatgtattgcattctgccatggtcccagggacgaagctagcatcaaaacaagggggtgcactaccattgaaaatctaaaaaatttcagtacaacactgtacattctagtgtttttaagtgagaaattagaaatttggggggttcatgtgcaccccccaagcatagtgtagcttcggcactgcatggtccatcattccatgtaccgttgtcatcctgtcaggattctaaatctagtcaaacacatttttgtgttagctgaagtattattctctctttttttttctcttgtgcacctatttgcatgttgaaagagttggaatctttgtttggtatacattttaagcatgttatttcgttacccacaattcatactattcttccaagattggtttacatgcttatgtggaattctagtcccagaatactgtttgatggaacttggctgtatcaaaaggaaatctggcattgggctgtctgcatcgcttatctttcgttggaaacttacgtgcttaccaaattttaaactctgtgattgcttcttcctcaagtgttggatattccattcatgataaccaatgctctctctgttcgttctaagttccattcctaatgtgtagttttgtcctcaaacatttttttatcttagtacttgttagtgataagcagtttattatttgtaccgttatatattatatgccatctttgtaaaaaaagactgttctgtagtctatacatcgaacatattcttatggttgatatcatccctgatacttctgtacgcagagcaatgaatgacataaatgcaggtattattccctttcaagtatatatggtacttctttcagtctgtgcaacctgcatgatgtttattagtctatttaatgttgtaatgttttctgaagtaataatctgtcagacttcttaattgatgattataagctctctctctctctctcttctacttatgcttcgtttgctttgttttccgatgcttgtagtgtttggagtagctgctgtgaagctagcccacaacgtgggtaaggttgtctgtttggggggtgggtgtgttttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttggtgtttgggggggggggggggggttctggctctgcatagcacattttagaaccattgtcaagtatgtagcctactgcaacttgcataggaccaaagggtgatgtttctgtgtagagaagttagatggcgatgagtcaatgacttgaattagaaatgctctaggtgaaagggaaaggaacagatctagaactacaattggaattaggccaatcaagtacagaccactgaaactgaagacttgaggggctaatctttgctaattaattattcagtcttagaatcatggctaggatcatatataacctaactaattaatctgaactagaaaacaagctgaactaactattcttaggtagctagtttgcttttgccaactctggacgcttgtgcggtttctcctgttgtcctgcatgatgctagactattgatcattgctgattgctcatacagtcgcactggtatattgctgtagtagaccacatatatattataatgtttcatgttcagttacctttcatgttatctccatgtgtgctcataactagttaactcctgtcacagcccaaagtcttcagcttgcaagtgtctacaaaggggaagcagaaaagattcttctggtgaagaaatcagaagcagaggcaaaaatacctttctggtgatggcattgctaaacagaggcaggctgatggcctgagacagtaccacagcaaaagaagtcatggacctaatcatggtcacgcagtactttgacaccataaaagaacttggggatggctcgaagaacacaacggtgttcatacctcaaggcccaggccatgtcaaggatatcagcgagcaaatccggaatggtatgatggaagcgtcaagcaacaatgtgtaaattgtagcgattcacagaacaaggttggggatggttcagatgggaggagcctgttgtttataatgaatatattaccttttgtttatagcctgttgtcaagcaacactagcaccttttgtttgc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
